Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08068 LG2 2570917 2578619 PREDICTED: protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   plant-type cell wall organization, root epidermal cell differentiation, protein phosphorylation, secondary metabolic process, root epidermal cell differentiation, cell growth, developmental growth, root morphogenesis, developmental growth involved in morphogenesis, developmental growth involved in morphogenesis, protein phosphorylation, cellular component biogenesis, root epidermal cell differentiation, protein phosphorylation, plant-type cell wall organization, cell morphogenesis, protein phosphorylation, protein phosphorylation, cell differentiation, tissue development, root morphogenesis, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane
Molecular Function   enables   transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, protein binding, protein binding, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, protein binding, protein binding, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, protein binding, transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 2570932 3_prime_UTR_variant
T/G 2571023 3_prime_UTR_variant
G/C 2571159 3_prime_UTR_variant
C/G 2571183 3_prime_UTR_variant
G/A 2571205 3_prime_UTR_variant
T/C 2571214 3_prime_UTR_variant
C/T 2571504 downstream_gene_variant
C/T 2571699 synonymous_variant p.Arg624Arg
G/C 2571714 downstream_gene_variant
T/C 2571766 downstream_gene_variant
C/T 2571891 downstream_gene_variant
G/A 2572181 downstream_gene_variant
T/A 2572184 downstream_gene_variant
A/C 2572250 downstream_gene_variant
T/A 2572310 downstream_gene_variant
G/C 2572559 missense_variant p.Ser539Trp
C/A 2572776 downstream_gene_variant
C/A 2572873 downstream_gene_variant
A/G 2572926 downstream_gene_variant
T/A 2573068 downstream_gene_variant
A/T 2573090 downstream_gene_variant
T/C 2573211 synonymous_variant p.Leu501Leu
T/A 2573377 missense_variant p.Lys446Met
A/G 2573465 downstream_gene_variant
T/A 2573478 downstream_gene_variant
T/G 2573641 downstream_gene_variant
G/A 2573790 synonymous_variant p.Gly425Gly
T/C 2573862 synonymous_variant p.Ala401Ala
G/A 2573866 missense_variant p.Pro400Leu
T/G 2573925 synonymous_variant p.Ser380Ser
G/T 2573964 synonymous_variant p.Ser367Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08068.1
MVEFRRLLLLLCITSCILCWMPNGATSATDPNDATAVRLLFQNLNSPSQLGWPVNGDDPCGQPWKGISCSGNRVTEIKLSNLGLTGSLPYGLESLTSLSTLDMSGNSLGGSIPYQLPPYVQRLNLAYNNITGTVPYSISNLNALTDLNLGHNQLQQGLAVNFLNLSALSTLDLSFNSLIGDLPQTMSSLSHITTLNLQNNQFTGTIDVLANLPLDNLNVENNNFTGWIPDQLKDINLQSGGNGWSSGPAPPPPPGTPPVPKRNKHHQSGGGSNTTPDVSDSSSSSVDTGKKSGIGGGAIAGIVVSVIVVGAIVAFFLVKRKSKKTSSDLEKLDNQSFAPLPSNGVHEEKSEQTSSVSDMKTFDTSASINLKPPPIDRHKSFDDEEFSKKPTIMKKTVTAPANVKSYSIADLQIATGSFSVDHLVGEGSFGRVYRAQFDDGEVLAVKKIDSSVLSNDLSDDFIEIISNISSLHHPNVTELVGYCSEYGQHLLVYKFHKNGSLHDFLHLPDEYSKPLIWNSRVKIALGTARALEYLHEVSSPSVVHKNIKSANILLDAELNPHLSDSGLASYIPNADQILSHNVGSGYDAPEVALSGQYTLQSDVYSFGVVMLELLSGRMPFDSSRPRSEQSLVRWATPQLHDIDALGKMVDPTLKGLYPVKSLSRFADVIALCVQPEPEFRPPMSEVVQALVRLVQRANMSKRTFSSSDHGGSQRGSDEAALREI*


CDS Sequence:
>Vu_08068.1
ATGGTGGAGTTTAGAAGGTTGTTACTGTTGCTGTGTATCACTTCCTGCATTCTTTGTTGGATGCCCAATGGTGCTACTTCTGCTACAGATCCAAATGATGCTACTGCTGTGAGACTTTTATTTCAAAATTTGAACTCACCATCCCAGCTTGGTTGGCCTGTTAATGGCGATGATCCATGTGGGCAACCTTGGAAAGGCATTTCTTGTTCAGGCAACCGTGTTACAGAGATTAAGTTATCTAATCTTGGACTGACTGGGTCGTTGCCTTATGGATTAGAAAGCTTGACATCTTTGAGCACCCTAGACATGAGTGGCAACAGTCTTGGCGGCAGCATACCATACCAGCTCCCTCCATATGTGCAGCGATTAAATCTTGCTTATAATAACATCACAGGGACTGTTCCTTACTCTATTTCAAACTTGAACGCTCTTACAGACCTGAATCTTGGTCACAATCAGCTCCAGCAAGGACTGGCTGTTAACTTTCTTAATCTTTCTGCCCTCTCTACATTGGATCTCTCGTTCAATTCTCTAATTGGTGACCTCCCTCAGACCATGAGCTCACTTTCACACATAACAACCTTGAATCTGCAAAACAATCAGTTTACGGGCACTATTGATGTCCTTGCTAATCTTCCTCTGGATAATCTGAATGTGGAGAACAATAATTTTACTGGATGGATACCCGACCAGTTGAAGGATATAAACCTACAGAGCGGTGGTAATGGATGGAGCTCCGGACCTGCACCCCCACCTCCTCCTGGTACACCTCCCGTACCTAAAAGGAACAAACACCACCAGTCTGGAGGGGGAAGCAACACTACCCCAGATGTCAGTGACAGCAGCAGCAGTTCAGTTGACACGGGCAAAAAGTCCGGTATAGGAGGTGGCGCCATTGCTGGAATTGTAGTCTCTGTCATAGTTGTTGGGGCAATAGTAGCATTCTTTCTGGTGAAGAGAAAATCCAAGAAGACATCTTCAGATTTAGAAAAGCTGGACAATCAATCCTTTGCTCCACTTCCCTCAAATGGAGTGCATGAAGAGAAGTCAGAGCAAACATCCTCTGTTTCAGACATGAAGACCTTTGATACTTCTGCCTCCATAAATCTTAAACCCCCACCTATTGATCGACATAAATCATTTGATGATGAAGAGTTCTCCAAGAAGCCCACAATTATGAAGAAGACTGTAACAGCTCCTGCAAATGTGAAATCATATTCTATTGCTGACCTGCAGATTGCTACTGGTAGCTTCAGTGTGGATCATCTTGTTGGCGAGGGGTCTTTTGGGCGTGTGTACCGTGCTCAATTTGATGATGGAGAGGTTCTTGCAGTGAAGAAGATAGATTCATCTGTCCTTTCCAATGATTTGTCAGATGATTTTATAGAAATAATTTCAAACATCTCCAGTTTGCATCATCCAAATGTGACAGAGCTTGTAGGTTATTGCTCAGAGTATGGACAACACCTCTTGGTCTATAAATTTCATAAAAATGGATCACTACATGACTTCCTTCATCTACCAGACGAATATAGTAAACCACTGATATGGAATTCCCGTGTCAAGATTGCTTTGGGTACTGCGCGTGCTTTAGAGTACCTACATGAAGTTAGTTCGCCATCAGTTGTTCATAAGAATATTAAATCAGCCAACATATTACTTGATGCAGAGCTTAATCCTCATCTTTCAGATAGTGGATTGGCTAGCTATATTCCAAACGCAGACCAGATATTGAGTCATAATGTTGGATCTGGATATGATGCTCCTGAAGTTGCGTTGTCTGGTCAGTATACTCTGCAAAGTGATGTCTACAGCTTTGGGGTTGTCATGTTGGAACTTCTCAGCGGACGGATGCCGTTTGATAGCTCAAGGCCAAGATCTGAGCAGTCTTTGGTTCGATGGGCAACACCTCAACTCCATGATATTGATGCATTGGGTAAAATGGTTGATCCTACATTGAAGGGGCTATATCCTGTTAAGTCTCTTTCTCGATTTGCTGATGTTATTGCCCTTTGCGTGCAGCCGGAGCCTGAATTCCGACCACCAATGTCAGAAGTGGTTCAAGCACTGGTGCGATTAGTGCAGCGAGCTAACATGAGCAAGCGAACATTTAGCAGTAGTGATCATGGAGGATCCCAACGAGGAAGTGATGAGGCAGCTCTACGGGAGATCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08068::LG2:2578619-2580619(-)
AATGAATATGCTCACAGGAGCATATTCATTAATACAGATTTATGAGTGGCTTATAATGGAAAAATATTATGTACAAATTAAAAAAGGAATTTTATCATCTTGTAACTTGACTTTCATACGTATAATATACATATTTTAGGATGAATTTATGGCATTGGACAATCTTCTCAATGGAAATCTTTATTTTCTCTCTCATATAAGCTTTTATGAAAAAGTTCATCCTCATGTTTTGATAGAAAAATTTACTATTTTTAGAAATTCAAATTCATTTAATTTGAATTACTTTCATCTCAGTCGATTAGTTTTTAAATACTTTATTTAAATAAGTTGTTTAAAATTTATTACATTATAATTTTCTAATTTTAAAATAAAGTATTTCAATTGCATTAAATGCAAATATCACAACTTCAATCTTTGCAAACATTTACTAAAAACCATTACAAAGTTGACAACAAATCCAGTCAATATAATAATAATAATCTTACTCACGTTATTAAAAAAATAATAATCTTACTCACAAATTATTAGAAGATCGAAAACTACTATTAAGTCTAATTTATTTATAAACTGTCATCAATGTATAGGAAAAATAAATAATTAGAACTGTTTGGCTAATAAATCCATGATTGTCAAATTAACAACATTCCATGTACAATGATTTGTAATTATACAATAATGTAAAAATATTTAAACCAATATTCAAGCTTAGACTTTATTATAAGTTGTCACTTCAAACCTTGGCAAAATTTTTCATTTACCACCTTCTTTAATATTGAATTATTTATCTTTTACCATCACTACTATAGCTTTTAATAAATTGCCCTATTTTAAAATGAAAATAATATTTTAAAATTAAATAAGCAATTTAATATTACAATATCTAAAAATATATCTACTACGTACAAAATAAAGAATTATAAGTAATATGTGAATTTATGTTATTTTACTTTTGTGAACAACTATAATAACTACTTTTATAAAATATTTTAAATTTAAAAACATATTTAACAACTTTTCCATATTTAAATTATATTTTATTGTCAATAACAAAACGGTTAAATGCTAATACTCTTCTTTAAAGATGAAAAATTATGATATAAGAAAGTTATTAATATAACAATTGAAATTAATTTGAACATTATTTTAAAAGATTAAATCACATATAAGATAAAATACCAATAAAATTTATTATTTTAAAATTTCGAGTTTAATTAGTGTCTCCTCCGTCATTTTTATTCGTATCAATTCATTATGCGATTATATGAAAGATAATATACGTTTTAATCTCTATTAATTACTTTATTTTGCTAAGTTTCTTTTTTTTACTATGTGGAACAATATCACTACGTTGTTCTATAGTAATAATTTAGACAGCACATACCAATATATGTTACATCAATGGAAAAGAATTACGTTACATCATAATTAAATAGTAATTTCCGAAAACAATAAAGTACATAAAAATTAAAAATTAAAGATGTTATTCAATCCGAATCACAACCTAGAAATTATTGAACACTCATTATTACCCCCAAAAAACGGTCTTTAAAATAGGTGGCATTAGTTCAAACGTCTTTTTCCATTATTATTCTGTAATTAGAAAAAAAGATAATTCCATCATTAAAATTAGACAAAGATGAATGTTTTGCGTCACTTGCTTTCTTTTTAGTAATTTATTAAATTTTGCATGACATCATTTCAAGTAATTGGTTTCTTTGACTTTCCTTCTTCAGCTTTGTCATAGCCGTTGGCATGAAAGCCACATATACCAATACTCGCTTATTCACCAATACGTATATACAGACATAAATACATAACAGAAAATAAATATTATTGTATAATAATAAATTTGTAGAAACGTGTCTTTCATTCGTGTCCCTGTACTGTGAAGGCTACTTAAATTGTCTTGAAAGAAAAATCCAACACAGAAAAATCCAGAAAAACCAATCTTCACAAAAATTTTCTTTCTTACTTCCCATCACAACTTCTAAGGGAAAATC


Gene Sequence:
>Vu_08068(-)
ATTATTACTTATAGTAATAGTGAGGTACTATTATTGAAGTATAAATTTAGTTTTATGTATACGAGTACTGTGAGAGGCACTGTGACTGTGATAAAGTAAATAAAATTTCCATGGCTTTGGATTCTTTTGGCAATTCGTGCTGGCCAGCTTTACTTGGCTATGGGGGGCAGCATTAGTATAGACCCATAAAATAATCAGAGAGAAAGATTAGAACTTGCTGAAAAGGGGTGACTGAAAAACCCTTTCAGCTTTCTGGGTAGGAAGGATTTTGTGAGAGATGGTGGAGTTTAGAAGGTTGTTACTGTTGCTGTGTATCACTTCCTGCATTCTTTGTTGGATGCCCAATGGTGCTACTTCTGCTACAGATCCAAATGATGGTTAGTCTCTTCTTTCACTTCACTTCACTCTATTTCTCTGTTTGTTGCTTTTTGCATTGTGCTATTCTTGTAAAAACTTGCTTTCTGCCATCGTTTCACTTATGTGCTTTGAACTGTCCAAACAATTTGTTTGGAGTTTTTAGTTTTCCTTTATTCTGAAACAATGGGAAGCTTTGTAGCTGATCTATTCAGTGGCTCACATCACATCAGTTCTATTACCGTGATTGTTAGTGCTTTAGACAGTTTGTTGGTTTTCTCTACGAAGTACCGCTTGCGTTGCATGCCTATGGTCTCGTCAAATGAATTGTATTTTTCCTTTCCAGTTTGCACAATATGTTCTGTGCACTTGATTGTCGGTTCTTACTACTTTGTAATTGGTTACCTTGCCTTGCGTCATTTCTAAGGTTTATGTTCTTCCAAGTGCTGAATAAGTCATTATCAATCCTAAAGTTCTCTAACAGTCTTCTGCATTATTCGGTTGTTGATGGAAGTCTCACTTCTTTCTTTTCCGTGTATATAGCTCTTACCCTTCAACTTTTTTATAAGGAAAATTTTCAATTTTTCCCCTCTACCTCCCTGTTCAACTTTCATCAACTGTGGATCATATGCCAAAAAATATGTAGTAGTAGTGAACACAAAGTCTGAGAAAAATGTGCTGCTTGTTTTAGTAATCACTTTCTGATATTTTAAGGCTTTATGAGGTGTTTTTTGTGTGCGTTTTATAGTTTGCCGACACTCTTGGTCTTTCCTTTTTCACCCCCTTACGTTGACTTCTTATCTTCAACATCTCGTGTTCAGTTTGATGTACAAGTAAATCATGCGTGCGTTATATTTCGCAATCAAATAAAGCTAAAAATTCTCAAATGTAAGCAAAGAAGTGTACTGAATGGTAATGTTTACAACGCACTGGAGCATGTGCGTTATTTTATTTTTTTTGTGGCGAGCCCTCTATGCTGCAGCTGCCCTTCTGGACTTCGGAACCATCCTTTATAGTAGCACTCAGCAAGCCCTTGTCCCGTGAGGATAAATGCTTTAATAGCTTGAGCAGTAACGTGGAAATGTGATAACTTCACCTGTGCTTAATTCCAAAATTCTTGTCAATGTTGTATGTGGACTTCTTTAATCTTATCTCTCAAATGGCACATTTTAGATCTGCCATATTTCAAATATGGGATTTGGGCAGTTCATACGAAGTGATTAAAAATAAACCAACTACTGCAATGGACTACTTGGCCATTCTAACTTCTGATTGGCAAATCACTAACAGAATCTTGTAGGGTTTAGGTTTCTGTTTAAGGTTTGAGTACCCATTAAATAGCTTGTTTTTACCCTTTTTTGTATTATATAGTTCATGTCTAGTTTAATGCTGTACAATTCCTTATTTGTCTTGTGTTGTCCACATCTTTAAATCCTCAACAAGCAGCCAGCATTGCTTTTGTGACCCTTCAGAATATCTAGAATGTTTGCTTGATGAACATCTGATGATTTTGAATCTCATTTGCATCCCTAAATACGGACTTGTATGGGTGCATTATGATCCTTCAAATAACTGGGTTTTGTACTGGCCCGATGATATAATTTTGAAAGGTTTTTCTTCAGGTGCCTAATATTTGGTGATGCTATTTTAACTAACATTATGCACACAAAAACAATTACTAATCTTCTATCCATACTACTTCCACCCAGGAAATTATGATGTACCATTCTGAGAATCCTTGGTGAAAGTTGGGTTTCTTTTTAGTTTCTACGCTTTGGTATTTATAAACTTGCAACTTTTATAGTCTATGAATAACCAAGTAATTGTCAGAAAACATTTTCTTAATCCGTATTCATGGCTAAGGTCCAAATTATTCACTTTTGTTTAGAAGTAGTATATTCAAGGATTCTATCATAATGAACTAGTTTTGCCTGAAGAGAAATCTATACCCTGAAATATGTAAATGGATCATGTTGAGGCCATAACCTATTAGATAATGAAAAACCATAATACATGTATTAGGTTTACTGAATATTTTTATTTTTGGAATGTTTTCTGCAGCTACTGCTGTGAGACTTTTATTTCAAAATTTGAACTCACCATCCCAGCTTGGTTGGCCTGTTAATGGCGATGATCCATGTGGGCAACCTTGGAAAGGCATTTCTTGTTCAGGCAACCGTGTTACAGAGATGTATGGTCCCACTCTTCACTTTATATAATTTGATCATTACCTTTAGGCTTTGTTGCTTATTTTTAATGACTATTGTTTGTGACTTCTCAGTAAGTTATCTAATCTTGGACTGACTGGGTCGTTGCCTTATGGATTAGAAAGCTTGACATCTTTGAGCACCCTGTAAGATTAATGGTCTCGTTCCTTACATATATTCATTGCTATCATTGTGTGACCTTGTAAACTTTTGTAGAGACATGAGTGGCAACAGTCTTGGCGGCAGCATACCATACCAGCTCCCTCCATATGTGCAGCGATTGTATGTTTCAATTAATATGGGGTTGTTACTCTTCAGTGTATTTTATTTATGATATGATTTGTAACGTTCTTAGTTCTTTGTGTGCAGAAATCTTGCTTATAATAACATCACAGGGACTGTTCCTTACTCTATTTCAAACTTGAACGCTCTTACAGACCTGTGTGTAATTTTCTTCTTGTAAATTTACATAGTTGCACTGTATTGACCACCACTACAAACACCTCAAATAATTTTTTATTTTTTTTTATGCAGGAATCTTGGTCACAATCAGCTCCAGCAAGGACTGGCTGTTAACTTTCTTAATCTTTCTGCCCTCTCTACATTGTGAGAATTTGTCTTGCCCTTCAGCTGCATAAAAACAGTAGTCTAAATGGCTTTCAAGTTATTGTTACCTTTCTATAAAGATTTGACCCTTTTCATCTTATATATGTTTTGATAATGCTTTTTTAGATGAATTACTATTATGCAGTTGAATAGTTTTACAGTATTAGTTCTAATTGCATTTCAAGACATTTTGCATGTGAAAAGAATACATATATATGTGCTGTTGAAATATGTTTCATGTGATATGGTTTTGGTAATTTCATTATTTACATGCGGCTACTTTTGATCCTTGGTAATACCAAACAATTGTGAGCCAAGTGGGCTTATATTTTTTCCTTATTACAGGGATCTCTCGTTCAATTCTCTAATTGGTGACCTCCCTCAGACCATGAGCTCACTTTCACACATAACAACCTTGTAAAAATACTGACTGTTGGTGTTTTCTGTTAGTATATTACATTTTATTGATTGCATTCTAAGTTAATTTGTTTATATCTGGGCAGGAATCTGCAAAACAATCAGTTTACGGGCACTATTGATGTCCTTGCTAATCTTCCTCTGGATAATCTGTGCGTCTCTGTTGTATCATATGACATAGCTCCTTTCCTATATTTCCAAAATGAAAAACTTGAAGCCAATTGTATTTATTGTCTTAAATTATTCTCAGGAATGTGGAGAACAATAATTTTACTGGATGGATACCCGACCAGTTGAAGGATATAAACCTACAGTAAGCATTTCTCATTGTCAGCAATTTGGTAATTCGGAATCAGATTTTCATCATAAATTTCTGTGGAGCTCTAATATTTGGAAAATTTAACATTAGGAGCGGTGGTAATGGATGGAGCTCCGGACCTGCACCCCCACCTCCTCCTGGTACACCTCCCGTACCTAAAAGGAACAAACACCACCAGTCTGGAGGGGGAAGCAACACTACCCCAGATGTCAGTGACAGCAGCAGCAGTTCAGTTGACACGGGCAAAAAGTCCGGTATAGGAGGTGGCGCCATTGCTGGAATTGTAGTCTCTGTCATAGTTGTTGGGGCAATAGTAGCATTCTTTCTGGTGAAGAGAAAATCCAAGAAGACATCTTCAGATTTAGAAAAGCTGGACAATCAATCCTTTGCTCCACTTCCCTCAAATGGAGTGCATGGTCTGCATCTTGCATACTATTTCAAGATATTTTTTCTTTAATGATGAGGGCATCCTTATTGTTGTGTTTTCTAGATAAATTTATAATTATATTGCCAAACTTTACTGTTTAAGAACAAGACCAACTTGTCCTTTATTTGCTGTTATATATTGCCGGTCAGTCTTTTTTCTCTAGTAATCTGGTTATTACCAAATTAAAGTTTGCAATTCAAAATTTGGCATATTATTTTTCTTTTCAACTTTATTATCCAAATTGACATATGTGCCATAATGCAGAAGAGAAGTCAGAGCAAACATCCTCTGTTTCAGACATGAAGACCTTTGATACTTCTGCCTCCATAAATCTTAAACCCCCACCTATTGATCGACATAAATCATTTGATGATGAAGAGTTCTCCAAGAAGCCCACAATTATGAAGAAGACTGTAACAGCTCCTGCAAATGTGAAATCATATTCTATTGCTGACCTGCAGATTGCTACTGGTAGCTTCAGTGTGGATCATCTTGTTGGCGAGGGGTCTTTTGGGCGTGTGTACCGTGCTCAATTTGATGATGGAGAGGTATTTCTTAACCTGTATTACTATAATTTGACTTTGTCTGATTCCAATGACAAGGGTTAGTATGTCCAGATTATTGTCATCAATATATAATATTCGCCAAAGAGGATCAAACCTGTGTATTA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