Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08039 LG2 2348055 2350192 hypothetical protein DEO72_LG11g3381
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 2348163 synonymous_variant p.Thr491Thr
A/T 2348258 upstream_gene_variant
G/A 2348268 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08039.1
MDNNCNNYSDSFHSPLIGNYIEPDPALIYILNDQPNVQQRNAQQNDPFIVEQDHVSFTGLTIQDVSTHSDNDFTIGGVPNLVNGGWSTRKRKFPYMDSMIEDHPVHGDNTFSNELQFWPPGPFDIDIDASFDPFLHNLIDRDISIFDLSNDELIAPSSQQNALPQHQHAVPGQQNALCKQPNAPPQNQNLYPFGLEQIHVPILNPTFQDQSLHVNYNFATGEVPNIDMEGPSRRKVKQPMAEHPLLKHGILNEEDVVALDHWPPSPKSLSCSCCQILRQIIHTDVRKVRDSWIAWGDWPCDIPRSGYDTGCFGLKSIEQIRSFLVAYCKDQTRLGFVTLDDPLSAYYDTICTGLDWAEHNDGDDDLSPLNGTEPESDSEPEPEPESVPEPETVSEPDLVPEPGNAEASTARPKPKRNMAVQRKRVPKMTMNDLSPFFHLTIRDAADKLEVSDSVVKKISRLGNLKRWPQRKLQSLAKDVRVLRKALDSPYEGTRQRVRQEIQRLQLEMVAICGGVTPTGIEIIQFEEE*


CDS Sequence:
>Vu_08039.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08039::LG2:2350192-2352192(-)
ACATACATATATATATATATATATATATATATATATATAATATAATAAAACAATATTGGTTAACACTACTGGGTCACGTTATACAGTGATTGATTTATTTTTTCTTTTTCAATAAAATTACTTAATTTTCTTTCATTGAATCTCTTCGCAACGTTTGTTAACAACGACTCTCTTATATTCTGTTTTAACATAGAATTTGATATTTTAAGTCGTTTCGGTGTAAGAAACGAAACAGGCCATCCAGTTTAATTTTAAAAAAAAAATCAATAAAACTGTTTTTTTTTAAATCGATTAGTAAAAAACTGATAGTGAGTGGCTCGATGAAAATATTCTTTAGGGTGTGTTTAGTTGGAGGTAATTGAGGGAGAGTGATTGGGGGAGAGTGATTGAGTGGATTTGAGAGGATTTGAGGGTGATTTTTGTGTGTGTTTATTTGAATGGATTTGAAGGTAATTGAAAGTGAATTTTGGGTTGAAGTTTGTGAGAATTAGTGTAGGATTTGATTGATGTGACAGATTTAAAAAATTAGTTTAATTGGTAGAAATTAAAGATTACCAAAATGTCCCTAACTATTAAAGTAATATAAAATGTTAATTTTTAATGTTAAAGAAAGGAAATTAATTAATAATAATTAAAATTAATTTTAAAATATTAAAAAAATTATAATGTAGTAAAATAAATTATTAATGTTATATTTAATTTTAGAAATGTTTATAAGAAAAAAAAGAATTAAAATTAATTATTAAAATGTAAAATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATTATTGATTATTACTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTTTATTTTGAGTGTCATTTTTTTTTATGAAGTATCTGGTTCCTCATTTTAATAATTCCTCTTATTTACAACCAAATTTCTCTTTATTTTGTGCTGGCTCTTGGGATTGCTTGAACATGCAGAGATGTGTTGGTGATAGTGGATCTCTGGCCGGAAGCCAAGACAACTGGATCCTCCACCTTTGTGGCATTTAATCCAGCATCCACCACCAAAGCAACTTCCAGCTTCGTCGAACATGGCGCTTGCACCTCCACCACGAAGCTTCAAAGCTTGGAAATGCTCCAGCGCTGGAACTGAAAACACTGGCAGTCAAACGTCAGCTTCAGCCACTATTCTTCATCTTGTTCGGCTTCAAACTTCATCTTCAACCATCATCTTCATATGGAATCAGTTATTTCATAGTTAGAATCGATGCACGTAAGCTTCAGGACTTGGACTGGAATTATATAATAGGCAAAGGGTAAAGAAGATATTGTATCGACAATCCTTCCAAATCGTCGCACTCTTGCGGGTGATGAAAATTTTATAAATCTCGCAAATCCGCGCCTTACGTCTCCCGCAAATCCACTCCTTTCATCTCAAACGAACATAAAAGAAATCGTATTTCTTCGCTCTCAAATACTCTTGAACAGTACTTTCTGTTGAAGCGAACACACCCTTAAGAAAGAGGTATTTTATGATAAAATATTCCGTACAATAATAATTTCTTTTTCTTAGTAAAATATCTAAATGACCACTGATATTTTGATTTATTGGACACAATGTATCAATGCAAATCACATATAAAAGTGTTTTGACGTGCATCACATATAAATCATCTCAAGATGGATCATAGAAGATCATCGGACTTTTTTCGTACTGAGATCAAAACACACATCTTCATTTCTCACCACCATTAGTTAAAGCATGGCAGAACCAACCAATGATGAAGGGTTATAGAGGAAAGTCTCTTAGTAATAGTTTTTCATAACAATCAACAAACTTCAAATTTTTCAACGGTCAATAACTGTCAGTTGCGCCCCTATATATTTCTCATGCATTCCATCAAAATTGTCTGTAAGAACACTAGTTGTCTCAATTACCAACAAATCGTGTCTCAGTGGCGGCGCTGTGTTTTTGGCGCCGCTACTACACACATTTCCATTTTTTCCACAGTGATTAAGGGTGTTTTTCTCC


Gene Sequence:
>Vu_08039(-)
ATGGATAATAATTGTAATAACTACTCCGACTCATTTCACAGTCCACTTATCGGTAACTACATCGAACCAGACCCTGCACTTATCTATATATTAAACGACCAACCCAATGTACAGCAACGAAATGCACAACAAAATGATCCTTTTATCGTTGAACAGGATCATGTTTCCTTCACTGGTCTAACGATTCAAGATGTATCCACGCATAGCGATAATGATTTCACCATAGGAGGAGTTCCTAATTTGGTAAACGGGGGTTGGTCGACGAGGAAGCGTAAATTTCCCTACATGGATTCAATGATTGAAGATCATCCCGTGCATGGCGATAATACTTTTTCCAACGAACTTCAATTTTGGCCTCCTGGGCCGTTTGATATTGATATTGATGCCTCATTTGATCCATTTCTTCATAATTTGATCGACCGGGACATCTCAATTTTCGATCTATCCAATGATGAACTCATTGCACCCTCTTCTCAACAAAATGCATTGCCCCAGCACCAACACGCTGTGCCAGGGCAACAAAATGCACTTTGCAAACAGCCAAATGCGCCGCCTCAGAACCAAAATTTGTATCCCTTTGGCCTTGAACAGATTCATGTACCCATTTTGAATCCAACTTTCCAAGATCAATCCTTGCATGTCAATTATAATTTTGCAACTGGAGAAGTTCCTAACATTGACATGGAGGGTCCATCAAGGAGGAAGGTTAAACAACCCATGGCTGAACATCCATTATTAAAGCATGGTATACTGAACGAGGAAGATGTGGTAGCACTTGACCATTGGCCCCCGTCACCAAAGTCACTGTCTTGCTCTTGCTGTCAAATTCTTAGACAAATAATTCATACAGATGGTAATTAAGTTTATACACAAATATATATTAGCCAGTACGTTTTTCGTCCTCGTTTTCATTTTCTTTAAATTTTAAACACTCCGCAGGTTTTAAGTTCGAAAAGTTAGAGATTCATGGATCGCTTGGGGTGATTGGCCATGCGATATTCCACGTTCAGGATATGACACCGGGTGGTGAACCTCCAAGAGAAGTTTATCAAATGATAAAGCAAGTTCTAACTTCCATATGTGTTGCTTTGGTGGAACTATATATTTATTTGCATTGAAGCATGAACATGTGTTTAATTATTCAAAACAATCATTGTGAATTAAAGTCATAGTTTTTAGTTGCTATATCTGTCGTTATTAACCTTCATCTTTTCTGGTATTACCAGTTTCGGCCTCAAAAGCATAGAACAAATAAGGAGTTTCCTGGTAGCATACTGCAAGGACCAGACAAGATTAGGGTTCGTCACTCTGGATGATCCGTTATCTGCATATTATGATACCATCTGCACTGGACTTGATTGGGCTGAACATAATGACGGGGACGATGACTTGAGTCCACGTTGGTCTTCTTCTCTTAATTCTCAAGTTTCTCTTCGACCAATAATGACAGTTTCACTCTGAATTTTGAATATTTTTTTCTCCTGTAGTTAATGGCACAGAGCCCGAGTCTGATTCTGAGCCCGAGCCCGAGCCCGAGAGTGTTCCGGAGCCTGAGACTGTTTCTGAGCCAGACCTTGTTCCCGAGCCTGGTAATGCAGAGGCTTCAACTGCTAGGCCTAAGCCTAAACGTAATATGGCAGTTCAGGTAAGAGTTTTTGTTTTCTAGAGAAGTTTTGCGTTTGCGCGTAAATACCACTTGTTTTAATATTGTCTTTTATTTTTTTACGTTACACAGAGAAAGAGAGTACCAAAGATGACAATGAATGATTTGAGCCCTTTCTTCCATTTAACTATCAGGGATGCTGCAGATAAATTGGAGGTAAGCGACTCTGTGGTGAAGAAAATCAGTCGCTTGGGAAACTTAAAAAGATGGCCACAAAGAAAGGTTAGATTTGTTGTTTGATTTTCTGAACATCATGGGATTCTTTTTGGATTTATCACTATATAGGTGTTGATGTGTTCAGCTGCAAAGCCTTGCGAAGGATGTGAGAGTGTTGAGAAAAGCATTGGATTCGCCCTATGAAGGGACTAGGCAGAGAGTTCGACAAGAAATTCAACGACTCCAACTAGAAATGGTAGCGATCTGTGGTGGAGTTACCCCAACCGGAATAGAAATTATCCAATTCGAAGAAGAATAG