Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08038 LG2 2338619 2346962 uncharacterized protein LOC114163720
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 2343891 downstream_gene_variant
T/A 2343917 downstream_gene_variant
G/T 2344036 downstream_gene_variant
T/A 2344052 downstream_gene_variant
A/T,* 2344105 downstream_gene_variant
A/T,* 2344107 downstream_gene_variant
A/T,* 2344109 downstream_gene_variant
A/T,* 2344111 downstream_gene_variant
A/G 2344127 downstream_gene_variant
T/G 2344209 downstream_gene_variant
A/G 2344418 downstream_gene_variant
C/T 2344478 downstream_gene_variant
A/G 2346671 synonymous_variant p.Leu98Leu
A/G 2346725 missense_variant p.Phe80Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08038.1
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CDS Sequence:
>Vu_08038.1
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Promoter Sequence:
>Vu_08038::LG2:2346962-2348962(-)
GGCCTCAAAAGCATAGAACAAATAAGGAGTTTCCTGGTAGCATACTGCAAGGACCAGACAAGATTAGGGTTCGTCACTCTGGATGATCCGTTATCTGCATATTATGATACCATCTGCACTGGACTTGATTGGGCTGAACATAATGACGGGGACGATGACTTGAGTCCACGTTGGTCTTCTTCTCTTAATTCTCAAGTTTCTCTTCGACCAATAATGACAGTTTCACTCTGAATTTTGAATATTTTTTTCTCCTGTAGTTAATGGCACAGAGCCCGAGTCTGATTCTGAGCCCGAGCCCGAGCCCGAGAGTGTTCCGGAGCCTGAGACTGTTTCTGAGCCAGACCTTGTTCCCGAGCCTGGTAATGCAGAGGCTTCAACTGCTAGGCCTAAGCCTAAACGTAATATGGCAGTTCAGGTAAGAGTTTTTGTTTTCTAGAGAAGTTTTGCGTTTGCGCGTAAATACCACTTGTTTTAATATTGTCTTTTATTTTTTTACGTTACACAGAGAAAGAGAGTACCAAAGATGACAATGAATGATTTGAGCCCTTTCTTCCATTTAACTATCAGGGATGCTGCAGATAAATTGGAGGTAAGCGACTCTGTGGTGAAGAAAATCAGTCGCTTGGGAAACTTAAAAAGATGGCCACAAAGAAAGGTTAGATTTGTTGTTTGATTTTCTGAACATCATGGGATTCTTTTTGGATTTATCACTATATAGGTGTTGATGTGTTCAGCTGCAAAGCCTTGCGAAGGATGTGAGAGTGTTGAGAAAAGCATTGGATTCGCCCTATGAAGGGACTAGGCAGAGAGTTCGACAAGAAATTCAACGACTCCAACTAGAAATGGTAGCGATCTGTGGTGGAGTTACCCCAACCGGAATAGAAATTATCCAATTCGAAGAAGAATAGATTGTGGTCAATGTTTTCCTAATTTTTTTTTGTTTCTTTGTGACGGTCTGCTTGGTTTATGACTTTTCACGGTGGTGGTGGTGGTGATAACGAGTGAGTTTTTTTTTATATATAGATTTTTTGTTTTGATAACAATAAGATTATCTTTTCAATATTTTTGACATTATCACGAATTCGTTTTTATATCTAATTAAGTCAACCTCTAACAGATATTTAAGTTATAAGATACTGTAGACCTCACTCAGCGAAAAACCAAACATGGCAGTTCCAATTAAAATAATAATAGTTTGAGACACTTTTGCTTTAACATTCAAGTAGTGGTTCCACAGATAATTTGTTTTAGGAAAATAATTATTACACACCTAAATTTTTTATATTTATTTGATATTATTTTACTTATTTTTTATTTTTTGAAAAAATACAAAATTATATAATTTTTTAGATCATTTTATCCGTATCAAATGAATCTAAAAGTGTGTCATGATATTATTTCTAATCAAGTTACATCATCTTAAAAATCACTAACATATCACGGTATCAAATGAATGGATTTGACAAGTATTTGTTCTTTTCGAATTATAGAAACTTGTTGAAACTGTAATAATTATATAATAGAAAATGGGTGTTTTACTTTGATGAAAATTTCACTGACAAAAATAAATGGAATGTGTGAGGTCTATTAATCATATAAAAACTAATAATAATAATTGAATTTATTAAAACAAAATATAGTCTTTATCCTTATTTGACTTGGCAGCTATCAAATTAGTTGTATATGTGTGATGATTAATGATACTATGGCACATTTTTACGTTAATTTGATATAGGTTACAAAGATAAAATAGTAAAAAAATGTAAACTTATGTATTGTTTTAAGAAAAAATAAAATAAAAAGTAAATAAAGATAATGTTGAATAAATGTAAAATATTTAAATGTGTGAAAGAATTTTACTCATCTGCTATGTATAGAAATTATTTAAATTGATTAATTTTAAATTTATATTTTGTATAAATTGATTGTTTTATGATACGAGCTTGTGTAAAAGTCATTTAAAGGGCAATATTTGGAGGGAAAGAAAAGTGTGGCAGTAG


Gene Sequence:
>Vu_08038(-)
ATGGCTCGGGCATTTGGAGAAGTCATAGCAAAACCTTCTTCTTCTTCCCTGTCTTCTTCATCCAGCATTCCAAATCGAAATCTCTGCCTCATAACATCCATCACCTCAATCCTTCAAAATCTAAATCCCCAAATCCCAGATTTCTCATCTCTCAATAAATTTTCTCCTCACCTCACCCCGAACTTGGTCATTCAGGTGATCAAGAACCAAAAGAACCCATACCACGCTCTTCACTTCTTCAACTGGGCCTCCAACCCCAACCCCAACCCTAAGAACTACTCCCACACCCCTTTATGCTACGCCGCCATCACCGACCTCTTGCTCTCCCACTCCCTCTTCTCCACCGCTTACTCCCTTCTTCACCACTCCAACAAACTCTCTGACTTCCTTATCTGCAGATTCATCCACGCTCTCGGTCACTGCGGCGATATCAGGGGCGCCGTTCACTGGTTCCACAAAGCAAAAAACTTGGGAAGAGAACACTGCGTCTACTCATGCAACGCCATCTTGGGCGTCCTCGTCAGAGCCAACCGTGTCAATTTTGCCAAGGCCATCTACAATCAGGTTCTCTCAGAAGCTGTGGTAGAACCCGATGTTTACACTCACACCATCATGATTCGTGGGTTTTGCAAAGTGGGGATGGTCGAGAGTGCGCGCAAGGTGTTCGACGAAATGCGCTGCGAACGCAACATTGTTACTTATAACACTTTGATCCACGGGTTTTGTAAGAAGGGTGACATGGAGGGTGCGCGGTGGGTTTTTGACAGATTGGTGGAGAGTAAGAGTTGTGAGCCGGATGTGGTGAGTTTCACCACTTTGATTGATGGGTATTCGAAAATAGGTGAATTCCAAAAGGCGGTGGAGTGTCTGAAGCAGATGACGGAACGAGGGTGTTCTCCGAATGTTGTGACCTACAATGCCTTGGTTGAAGGTCTTTGCTTGAGCGGAGAAGTGGATGAGGCAAAGATGATAATGGGTAGGATGCGGTTGAATGGTTTGACAGATAATGTGGCCACAAACACTAGCTTGTTGAAGGGGTTGTGTATTGTGGGAAAGTCCGATGATGCTTTTAAGCATTTCAGGGAAATGGCTAGTCGGGGGATGAAGCCGGATGTGAAAGCCTATGGGGTTGTTGTGAATGAGTATTGCAAGATTGGAAAACCAAGAGAAGCAGTCTCACTTCTGAGAGAAATGGTGACGAGGGGTGTTAAGCCAAGTGTGTCAAGCTTCAATGCAGTGTTTAGAGTTCTTGTGGATGAGGGGAAGATTGATGAAGGAGTTCTTCTTTTGAAGCAGATGAGTCGGATGGGAAGCTCACCCAACTTCTTGTCATATTGCATATTGGTATGTGGACTCTGTGAAGTGAAGAGTAGGATGCAGGCAGTTGAAGAGCTTGTTTCAGACATGCTTCAGAATGGGCATAACCTGGACGCGACTATGTATAACTGCTTACTTCAGGGATATTGTGAAGACGGGGATGAAGAAATGGCACTAAAGACATATTATGACATTATGAACAAGAACTTTGTAATCAAGCAAGACGTTTTCAGCACATTTGTGAAGGTGATGTGTGCAAAGGGGAAATTGAAAGAGGGGGATACAATCTTTGAGGGATGCTTGCTCGGGGGATTCCAGTTAAGTGGGAAAGTTGAGGCTAATGCAACAGAGGAACACTGACGTAATTTTCAGACCAGGGAATTCTTGCACAGCTACAGTGGAGGAGGGTGTTAACTTAATCCTGCACTGGAAGTTCAATGTTCATTCTTTGCAGTAGGGTTAAGTCTGTGATGATTGGTGGCATGGTTAGTAACTGGGTTTGGATAGAAACTCAGAAAAATTGGATTACTGATCGAGTGATTCAACTGGATAGGCCAATGATCAAAATTTTTAAGACTACTTGACTATATATTATATTTTTAAAAAATTATTATGTGATACTAAGTTTTCCAAACCAACACACAACAAATTTCTTTTAATAATAAAATATTATATTTAAATAAGATAGCTATCAATAAAAAAATTATTTAAAATTTAAATTAGAAGTATTGGTAGAGCTACTTTTAATCCAAGTTGACTCTATTTATCATGGGTTTGTGCTTATTAGTGAATAAAAAAAATTAAACTCGCCTTGACAGTTAAATGGATTGGTTTACTTAATTATAATTTTTTTTTTCAATTTCAAAAAAGTAATAATTCTTTTTAAATAAAGTTCAATCTAAATATAATTCAAAATTATATTAAATATCATATATAATCCAAAATAAAAAAAATATAGCTCAAATACAATCCAAAATTATGTTAAGTTCCAAATACAATCTAAAATTAAAAAAATACAAAACAAATTATTATCTAATATCAAACCACAGTTAGCACTTATTTATTTATACCATTATAATCTTGAATGGATAAATTCATAGCATAGGAGGGTTTAAGTTTTGAATTTTTATTTTTTTAATATAATTTAAAGTTTATGGGTGGATTGGTGAACCAACCTAACTCTCTATGAGTTTAACTTAGATAAATCGATTTTTAGTGAGTCAAGTTTAGTTTTGATTCGTGACGAAATTTACAAATTCTTTAAAATCCAATCTTACTCGAACATGTAATAGGTGGAATTGGTTCGGGAGTTTTAATCTATTTGACAACTCTACTTGGAATGAGATAAAACAGATGTTACAATATTAAATTCTACATTTTTTTTAAGTAACACATATCTTATATTTACTTTTATAAATTAGTATACAAGATACCCAAGCTTTCCATCTTTTCACACATACAACCCACATATCTATTCTTATTTTCTTTAAGCAAGTGATTTGGAAATAATAAAAAAATTGATACATTAAAAAAATATATATATAAAGAAATAAAGAAAGAAACTCAATTTAATAATATCCAGATGTGTATTAAAGATTTCAATTAAATACAAATAAATATGTATCTTACAAAATGTCGACTCTATACATTAGGTAATAAAGAAAATTTCATCTAGAATTAACAGATACCTAAATGTTAATATTTTTAATTTTGTACATTTTCTTAAAAAAATTCTCTTTATATCTCTCTAATCAAGCAAATAGCAATAATATAACAGTTTTTTTCATCCCTCTTTTCGTTCTTTTTCACCCCATTTCTATCCTAAGAATGGAAAGGTTATCACAACTGAGATTAAAATTCACATAAGGCATGGTCGAACGAATTGATGAGGAAGGGAAACGGCATCATAGAGGAAAGTCTCTTCGTACCTAATAATAGATTTTCAAAACAATACTCAACTTCAAATTTCCAACGATCCATAACTGCCACTCACAACTCTTAGTCCCTGTATGGTTCCCATGCATTCCACCAACATACTTCTTTAACACTTTTTATCGTTGTCTCAGTCACCAACGAATCGTGTCGGTGGCGGCGCTGTCTTTGGCGTCGCCGCTGCACACATTTCCATTTTCCTCACCGTGATTAAGTGTTTTTCTGCCTCCAATGCATCCATGGATAACAATTGGGATAACTCCTCCCACTCATTTCACAATCCACTCGTCTGTAACTATATCGAACCAGATCCCGCACTCGTCTATACAGTCAATGACCACCCCGACTTCGAGCCCCAACAACCAAATGTTCCTGTTCTTGTTGAACATGGCAATCATCTTACCGTAGGAGGAGGAGTACCTAACTTGGAAAAGGGGGATTGGTCGACGAGGAAGCCTAAAATTCCTTTCATGGATCCAATGATTGAATATCATACCGTGCATGGCGATAATACGTTTCCCAACGGAGAAAATACGAGTGCAGATGTAAATTTAAACGACCTTCGATTTTGTCGTCCTGTACCAAAGCCAATGTTCTGCACTTGCTGTCAAGTTCTTAGACAATTGATTTACACCAACGGTAATTAATTAAGTTCTGATTCATCTTACATTCCGGGTTTAATTCTTTCCCTTAACCATGTTCTTTAAATTTAAAATATATATCGCAGGTTCTGATTGTGATGAAACATTTGAGATTCATGGAGAGATCGGGGTGATTAGCCACGCAATAGTCCACTGTCAGAATTTCACACCGGATGGCCTTTCAGGCGACTCTTATCGCAGGATTGAGTACGTTCTAAAACTTTTGCATGGAGATGTTACATTAAACAAAGCTTCATCGTCATTTTATGTTTTAGTGTATATTCAACCCTTGTCTGCATTTGGGTGTATCAGTTTCTCCCACAATAGCACAGCAGAAATTAAGAGTTACCTGGTAGAATACTGCACACAGAAGAATAAATTAGGATACATTGCTCTAGAAGATCCGTTGTCTACTTATTATGAAGCCCTCTGCACTGGTCTGGAAACGGTTGGCGGTTTCATTGGCGAAGAAGAAAATACAATCCCACGTTGGTCATTATCCCTTTTGGTTGTCACTTTTTCTCTTCCATGAATCATGTCATTCCACAAATATGATTATTGAGTCGTTACTTTTGTACAGAGCCTGAGTTGGAGGCCGAGAGTAAAAGGGCTTCTTCAGCTGTTAAACCCAACCGCCAATTTCAGGTTATACATATTTTTTTGTTTGTCTGAAAGTGTTGCACTTGCATGACTCTAATGAAGGTTTGGGGCACAGATAAAGAGAATAAAAAAGATGACATTGAATGATCTGAGAGGTGTGTTCCATTTAACGATTAAGGATGCTGCTGCAGAAATAGGCGTATCAGTATCTGTGATAAAGGGAATTTGCCGCAGGGAAAGAATATCTTACTGGCCACAAAGGAAGGTACAATGCATGCATGGAATGCAATTTGATTTTATGCAAATCATTATTGATGAACATCATTTGAAAACATATACAGGTGACAAGCTTGGCTAAGAGAGTGGAAGTGCTGAAGAAAAGTTTGGATTCAGCGGATCCAGTGGTAAGGAAAACAAGTCGAGAGGATATTCAAACTTTTCAACGATTAATAATCGAGTGCTGTGGTGGAGTCACCCCAACAGGAATACAGCTGCTTCAATTCCAAGAAC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