Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_08030 LG2 2236664 2237467 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 50
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SNP Position Effect Amino acid change
A/G 2236705 downstream_gene_variant
C/T 2236744 downstream_gene_variant
T/C 2236764 downstream_gene_variant
G/A 2236766 downstream_gene_variant
T/C 2236768 downstream_gene_variant
T/C 2236773 downstream_gene_variant
G/C 2236831 missense_variant p.Ser140Arg
C/A 2237147 missense_variant p.Trp76Cys
C/T 2237319 missense_variant p.Ser50Asn
C/T 2237402 synonymous_variant p.Ser22Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_08030.1
MSGDNTKPSDSPESDFTKQWPSELSEYLNLDDDQWSYDDLDSFVSGHVFSHKTEANEVGELGGSSTHHEEFSIRDDGNEHEKKEVRDRVAFKTKSEIEIMDDGFKWRKYGKKMVKNSPNPRNYYRCSVEGCSVKKVVERDKHDPSLRAN*


CDS Sequence:
>Vu_08030.1
ATGAGTGGTGATAATACAAAACCATCAGATTCACCTGAGAGTGATTTCACCAAGCAATGGCCTTCGGAGCTCTCCGAGTACCTGAATTTAGATGATGATCAATGGTCATACGATGATCTCGATTCATTTGTTTCAGGGCATGTTTTCAGCCATAAGACTGAAGCCAATGAAGTTGGTGAGCTTGGAGGAAGTAGCACCCACCATGAAGAGTTTTCTATCAGAGACGATGGTAATGAACATGAGAAGAAGGAAGTGAGAGATAGAGTTGCGTTCAAAACAAAGTCAGAGATAGAAATAATGGATGACGGGTTCAAGTGGAGGAAGTACGGAAAAAAGATGGTGAAAAACAGCCCAAATCCAAGGAACTACTACAGGTGTTCAGTGGAGGGATGTTCAGTGAAGAAGGTAGTTGAAAGGGACAAGCATGATCCGAGTTTAAGGGCTAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_08030::LG2:2237467-2239467(-)
AAAATCACATTGCATAAGAAATTAGTATGAAAAGTGTTTCTAACATTAGTTTAAGGTTGTGATACAAGCTCGACGTAATATCCACGACGCTTCCTAGAAACAATAGTCGATGAGATTGATGTGCCAAGATGAGAGGTTCAAACAGAGTCCTGTTTTGAAAATTGGTATTTTAAGTCAGAGCCAACTTTAACATAAACTTTTATTTAAAATCTCCACTTTTATTTAATTGCTAACCAAACACTTATAGTCTTCGAATTTGTTGATCTGCCCCGAAATGGAAGTCAGGAGAAGATACCTACGAACTTCCTCACCTTTTGCCAATTTTGGGGATTATGATGATGTCTTCAAAAATTATGAATCGTTTTCCTTCAATTATTTTGTTTCGTATATTGTAATTATAGTTTGAATAATTCCAATACTTAGAATTTTGAATTTTGAGTTAGGTATTTTGTATCCAAGTTACTTCCATTAAATACAATGCTGGAGTCTAGACTCTGAGTTTCTTGATTTGGCAAAAGAAATAATTAAAATAAAATGACGTTGACTTTATAGATATCATGACTCTTTTTTTTCACAATATTATTATTATATTTTATTTTATTAGAGATAAATTCAGGTGACGTAATACAAAAAGTGTATACGAGGGACTTTAAAATTTTATAAAAAGACAATTTTCTATAAGGGTTATATATATTAGGTTTATTGTCTTAAATTTTTTTTAAAATAAGTATCTTCTTCATACATAGAGTAAATTTTGATTTTATATATTTTTTATTTTAATAAAGTAATTTTAAGAGAATTATCGTACACTCCATTTATAATATATAACTTTGTGATTAAGGCAAATTTCAAATTGTTTTAGTAAGAAAGAATATATGTTATAAATTCACAAGTCATAAATATTGTTATAATTAATTAGTTATAATTAAACAGGAATGATGGAATGGATCAAGGGTCTTTCTATTTTAGAAAACGAAAGAATTACCAACACTTCAATACTTTGCATCGAGGATTATAATTAAGAAAGTAATTATATACATGACAATCTACAAAATAGGAGTATTGAAGTGGATATGACATTTGTAACATGTGTCAATAAAGCAATGAAAGTAAATACTTGAGTGTTTACGACCTTTTATTTATTTATTTATTTATTCTTTGTTTACAATAAAGAATGTATAGATATTTTAGATTATTTCAAAAGCAACTTTCTATTACAATATAAGAGAGCAATCAAACATATCTATTAAGATAACCAAAAACTAGTGGTTCGAAAAGGGACCTCAAAGCACCATCACTTTTGACTTAGTTCTATCTCTATGAAGGGATTGGTCTAACCACGACACTCAATAGTCAATTAAAACTTTAACAGGTTACATACTAATCTAATTAAAAAAAAAAAACTTAACACTATTGGAAATAATTAAAATATATATTTTTTCCGCTCAAATTACTTTAAATTACCACCTCTCTCTTTTTTCATTTGCTATATAGCAAAGCAATTAACTGCATATTATTAAAATTGGTGCAAGTTGTATTTTGATTACTTATAATTGATGAGGTATATATCCTTTAAAAAGTCATTTTTATTTTATATGCGTCATTTTTATATTTTAGTAATTAAACTCATACTTTAGAAAGTCTTCCTGAGTCATCTGAGGCATGCCCCACACTCAGTGTATGTTTTCTTACATTTTTAACTGACATTAATGGATACCTACCATTGTGTTTTTAGAGACATGTTAACTTATTACTTTTCCATAAACTGGTTCTCATGATCATATATTAAAGAGGAGTTATTTATGTGTCATTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCCGTATATAGCCGTAGAAGCTTCCTGATGTAGTTCGTAGGAAGGTCACAAAGAAGCTGCATCGTTTAAAAAAAGGCTATGGGGTTTATATTATGTGAGTCATAGTCCATTCTTTTCGTATCAATGGTGCCAAA


Gene Sequence:
>Vu_08030(-)
ATGAGTGGTGATAATACAAAACCATCAGATTCACCTGAGAGTGATTTCACCAAGCAATGGCCTTCGGAGCTCTCCGAGTACCTGAATTTAGATGATGATCAATGGTCATACGATGATCTCGATTCATTTGTTTCAGGGCATGTTTTCAGCCATAAGACTGAAGCCAATGAAGTTGGTGAGCTTGGAGGAAGTAGCACCCACCATGAAGAGTTTTCTATCAGTAAATGAAGTTCCTGAAATGAAGTTAATTATGCTTTATTTACACCTTGTATTTTTCTTAACTTGTATATGTGTCTGGTTGTGTCGTAAAGGAGACGATGGTAATGAACATGAGAAGAAGGAAGTGAGAGATAGAGTTGCGTTCAAAACAAAGTCAGAGATAGAAATAATGGATGACGGGTTCAAGTGGAGGAAGTACGGAAAAAAGATGGTGAAAAACAGCCCAAATCCAAGGTGTGGGAGTTTATTGCATGGTTCATCATGATTGTCATGAGAAGTGTTGTTTATGTTTTATTCAATCTTCCATATACATATATATTAAAAAACTTTGTTATATGATAAATATTGTTTTACAGGAACTACTACAGGTGTTCAGTGGAGGGATGTTCAGTGAAGAAGGTAGTTGAAAGGGACAAGCATGATCCGAGGTATGTAATAACAACCTACGTAGGCACCCATACTCATCCGAGTTACAATTAAATCGAAGAAGTTGAAGTTTCTGGGGACATAGCTAGTCTGCATGTGCTCTTCCCAAGTGTTATGTGGTAATTTTTCATGAACAATTGAAGTTTAAGGGCTAATTAA