Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07936 LG2 463329 467178 PREDICTED: putative axial regulator YABBY 2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   cell fate commitment, abaxial cell fate specification, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, abaxial cell fate specification, regulation of transcription, DNA-templated, abaxial cell fate specification, cell fate commitment, abaxial cell fate specification
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 466947 intron_variant
T/C 466992 intron_variant
T/C 466994 intron_variant
T/C 466996 intron_variant
T/A 467164 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07936.1
MVSVPYNSLLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASLQPFPPQDPQSQKQHLSFEEPSSKELGSSSSKCNKIAPFEAVEHEQPRIPPIRPTEKRHRVPSAYNRFIKEEIQRIKASNPDISHREAFSSAAKNWAHFPHIHFGLKLDGNSQGKLEQGEGGEKTNGFY*


CDS Sequence:
>Vu_07936.1
ATGGTTAGTGTTCCATACAACAGTTTGCTAACCATAGTGACGGTTAGATGTGGACATTGTGCTAATTTGCTATCAGTTAACATGGGAGCATCCCTTCAACCATTTCCTCCTCAAGACCCTCAGTCACAGAAACAGCACCTAAGCTTTGAAGAACCCAGCAGCAAGGAACTGGGATCCTCATCTTCAAAATGTAACAAAATAGCGCCATTTGAGGCAGTAGAGCATGAACAACCAAGGATTCCTCCCATTCGTCCTACAGAGAAGAGACATCGTGTGCCTTCTGCTTATAATCGATTCATTAAGGAGGAAATCCAAAGGATTAAGGCTAGTAATCCAGATATCAGCCACAGGGAGGCTTTCAGCTCCGCAGCCAAAAACTGGGCACATTTCCCTCACATTCACTTTGGGTTAAAGCTGGATGGTAACAGTCAAGGAAAGTTGGAGCAGGGAGAAGGAGGTGAAAAGACCAATGGATTCTACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_07936::LG2:467178-469178(-)
CTGCCTATAAATCCACCAAGCACACACTCAAAGGACACAGTCACATATAGATTAAAAATGTCAATGGAAATGATGGCAACGGAACGTGTTTGTTATGTTCACTGCAACTTCTGCAACACCATTCTAGCGGTACAGAACTCTCTTTCTCTCTCTCTTCTATCTACCTATCTATGTCTCTCTTTCTCTCTTTCTTTCTTCTCTTTGGTTATTTCTTTCCATACTCTTCTGAGCTTTCTGTTGCGCCACGCCCTTCACCAGCTAATTTGGCAAGTCTGGTTTTTTCTAATTTCTTTAATCGATCGAGATCGTGAGATGATACAACAGCCAGGAATAAAGAAAAAGCGCTTCTGGGTACCCATCAAAAAGCGAAATTCAGTTCAGACCTAATCAGAATGCATGTCTGTGTGTGTGAATATATATATATCCACATATTTATATATATTACATAAATGGATGAAAACTTAACTGTTGGAAAGCATGCAACAGAAGTATCCCAATTTATACATAAGGGTAACTTAATTCCCGGGGAAACACTCCAATCTATCACTTAAAGTGAATTAATTCGGTAAATGGGTGGTTTTTGTACCAAGGATTCCACTGCTATGTAATATTTTATGAGAAAGTGTAACTGGGTTTTGCTCCCTAACCTCTACCTTGATATGAGTGGTGCTAGTTTGGTCAGCGGCAAGAGATATATATGTGTATATATTTATATTATATATGCAGCCAAAGTAATAGCAGAAAGTTATGAAATTAAATAATTGAAACCCCTACCCGTACCTAACAACACAATTGTGAGAAATAAAGGAATTTTGTGAGTCAGAAGTGGAAGAAATTTTGAGATGCTTAAAAAATGCTTACTAAGGCTCAGCCTTGAGATCTATATACTAGGGTTATTCACAGGTATTAGGGTTCCCCTCTTTTGTTCAACTTTGTAATAAATAATAATTTTTTTTGGCAGAAGAGTAAACAGCAACTAGTATATGAGTATATGATTTGGTTTGGTATATGGTATTTTTTATTCTTTGTTGGTCTGTGTACTTGTGTGCTAAATTAACACGGTTCAGAAAATTAAATCTGAACACAACAAATCCATGTGATGGTACGCAGTGCAGTTTCTCTCTCCTCAGTCTTTGATTTGATCCCTTAATTGCCTTTCTGTGGCGATGAGGGTGAAGCATCATATCGTCTTTTATGATATCGTATATTTCATCAAGTTTTTTCACGGTTTCAGCCTTGTTGCTTCCCTTAAGTACAGAGGCAGTGTCCTCTCTTTCTTTCTACAAGAACTTGTGGGGATTCTGATAAATTCATATTTCACCACCAGAACAAGCTATATCACATCATATCATATGCCCCCTCTCTCCTTTTCTTAAATCTTTCTTGTTACTTTCTTTTGTGTCTCTCCTTTCATCATAGCATGTTGAAATTATAATTACCCCTTTTGAGAAAGCATTCTCTTTTCTTCTCTCCTTCTCAAATGAGATCTTACCATACCTAAAGGGCTAATCTGCTTCATTATGATACATCATCTCTTCTGGTAGTGGTTAACGGTGGTGTAGCCCTTCAAGGCCTTGATGGTTTCCGTTCCAGTCAAGTCCTTTTCACCCTCTCTCTTTCCACCACACTGTGTGCAACAATTTCTATCTTTTATCATCTTGCCTTGTAGTGTCAGCAAAAAGTGATGCGCACCCACAACAAGGGGACATTGTGAGAGATTGAGAGTACTGAATTTTAAATCGCCCCATGTCAGGTTCAGAGCGTTTGCTGCTATTATATGGATGTATTGAATGTGCCACACCACACCACACTCTCCCTAGCTGGACACTGCACACTACACACCCTTAAAAGTATACCTCTCTCAGAATGAATGAGAAAAACTGAAAAAATTACTGCATTCGCTTCCCTCTCTAGCTTATTTATCATCTTCTTATAACCTCTTTCTTCTGGCAGCTATGCATTTTGTCTTTTTCTCTGTTCATTTTTCATTGCAGTGCTGC


Gene Sequence:
>Vu_07936(-)
ATGGTGTGCTTTGGAAGCACTTTTCTTGGGAATGTGAAAGCTTCACTTATCCTATACATGTATAAACGTTAACCTCTTTTGACAATGTGAACACCCGTATATGTATGTATGTATACATACACACATATCTATCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGCGTCCATTGGTGATCAAAATTGTGCAGCTTTAAGTTCTTGGTTTTCATTCGTGAATGCATGTTTTACTGTATGCATACAAGAAGAGGATGTTCTTATACTCACTTTTCTACTGTATATTGTGTTTATTATGTATTTGAAAATGGGGTGTTGCAGGTTAGTGTTCCATACAACAGTTTGCTAACCATAGTGACGGTTAGATGTGGACATTGTGCTAATTTGCTATCAGTTAACATGGGAGCATCCCTTCAACCATTTCCTCCTCAAGACCCTCAGGTGTGTGTTATATATATATATATATGCATATACATTTCAGACTGTATTGGTCAATTCCCTCTTTCTGACGCCATGGGCAACCATAAATGAGATAACATAATTTCTTTATACTCACAGAAAAAAAAAGAAGAAAAAGCCTGCAGCTCTTTGAATGAATAACTGTGTGATCCTTTATTAATTCTTCTGTGTAATCTGTTGCTAATGAAGTCACAGAAACAGCACCTAAGCTTTGAAGAACCCAGCAGCAAGGAACTGGGATCCTCATCTTCAAAATGTAACAAAATAGCGCCATTTGAGGCAGTAGAGCATGAACAACCAAGGATTCCTCCCATTCGTCGTGAGTATACATTCTCACATTTCATGATTAATTTTCCCTCCTTTTGGTATCTGCTTTTGGATCGTATCCTAATTCGCCTAAATCTGAATGAACAAAAAGGCAACATGTATAACTAGACCAGCTAACCTGATGAGGAACTTTTTAATATCAGTGACAAGTTTTAATTAAGGATGAAAAAGACTCAAACTACTCTCTCCATAGCAGCAGAAGCTAATTTAATACAAGCAGCAGCAGCAGCAGAACGACCTTATCATTGAGGGCCACTAGTCATAAAAACAAGTTTTTCCAGTTTTTTCAGAGAGTCGGCGTCCATCTGAGTAACCAGTTTTTATGTGCCCAATTGGGGCATCTTGTTTTCTCCATCAATTTTAATGGCCCCCTCTAAGATGGTGACCTTACGTAACAAAAAATTGACCCATCCTTAATTCATTGCTGTCATGCCATGCCCTAAAACAAGAACAAGGACTTGTGTATTTTATATCACACACATATACACATTTGAACGCAATTATCCACGTGTAATTCATTTTACAGTCACAGATTCCTTTCACCATTATATAATAACAGCTCATCATGGTAATTATATTGATACTTGCAAGAAAAAGGTAGTAAGAGGTAGCAGTACTTAAGTTATGTAGTGGTCGATCTTCTCTCGCTGTGAGTGAACTGTACAAAGCAATGACGACAAAAACTGTTTCAGAAATTAGAAAGAAAATCCAATGGACTCTTGGATAAACAACGGAAATTTCAATGCTATTTGAATGCTAGAGCATATAATTGAATGGTCCTCCACAACCCAGTTCCACAGCTTCAGTCTGTCCAGGGAATTTGGCCTTTCGTGTGAAAAATTCCATATCTCAACCAGTTTTTCTGTTGGGGAATCTCTGATGTAAATTTTTTTGGGTTACAGATCTAGTGCAAATTGATGATTCATTCTACTTAATTTTTCTCTTACATCGTTATTCAATATTCCTAATTAATTCATCTCATGATTGTTCAACAGCTACAGAGAAGAGACATCGTGTGCCTTCTGCTTATAATCGATTCATTAAGTAAGTAGTTTTCGCCCTTTGTTATTTTAAAATCAACCTCCTTGCTTCTCCCTAATTACTGTGATATATTATGTAGGATTTGATTAAGGACTGAAATTATCATCATCACCATTATTAGAGATAATTATACGCATTTCGTTAAAGTTATAATGTCAATTATATTTATACTTTCCTGACTTTTACTTTTTTTTTCAGATTATATAAAAATAAAAGTGATGACATGCATAATAATTTAAATTTTTTAAGAGTCAATAAAGTATTATATTGGATAATTTGTCATTGATTAATAACATTTATCATTACATTATTTATTCTAAAAAGTAGTATATATATAAAGATAATAGTAAAGGGTGTAATTACTAAAGAAAGAAACAAGCATTATTAATTCAAGCGAAATGATTAAAATTTTATTTCGTATTCAAAGAATAAAGATGATCCAACAATCCAAGTAAATAAGTTTCTTAATTCTAAAGTACAGTAGAGATGATTCCATTGAGTAAAAACAAATAGCAAGTCTTTTCAAGTGTCTGATTTTGCAGGGAGGAAATCCAAAGGATTAAGGCTAGTAATCCAGATATCAGCCACAGGGAGGCTTTCAGCTCCGCAGCCAAAAACGTGAGTTTAACCTTAATTACTACATTAATCAGTATATATCATTCTCTGATCCATACAACTGCGTGCTGCACTTTTCTACATTTTTCATGTTTTTTGGAGCCACTTCTGTCAATTTACAGACACTCTTGTCTCTTCTATAAACTTCTTGCTCAAGGTCACAATCCAATATTATTCCTACGGTTATTTCAAACATCCTTCCAAAGTAATCATCTAGCTTGAGGGTATATGTGGGAAATCACATTTTTTAATTGGTTTACAACCCAGGAACATGGTATTTTATGTTATAGCCGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAATATATATATTTATTGGTCATATACAACATGAGATGTTGATAGAAAAACAATACATACAACATGAGGTTATCCAATCTTGTAAAGACAAAGTTTACAAAAGCTGATGCATTAGAAAAGGGATGTGAATCAACATTTGTTGAGGAATATGTTTAAGCATTTGAGTGGGCAACTATGTTCATTATCATAAAACCGTATCAAATCTCCCTTTTAAAAAGCCTACAACCTGTCAAATTAGGTCAAGTTTGATAGGCCATAGCCACTTTCACTTTCACGTGATCACTTTGTTAACCCTAACACATGCTGTAACCAGTGTCACTTGTCTAATTCGTCTACATGTGATTCCATCACTCTCCTATGTACTACACTGTGCTGCTTTTGAACTCTCTTATTTTTCCTATGTACCATAGCATGTTTTTCACCGCATTTTATTTGGACGCCACACACAGTCCAAGTTGATTGAAAAACCAGACCTGATCGATCACCCTTCTTCAAAATGACCATACCTGTTCAAAATTATGCATGTTAATTTGTACAAGAAAAGCACAAGCATCACAGACATTAGAATTTCCAGAAAAAACTCTCACTTTATCCATCACAACTAATGCCATTGAAAGATATATATATACAGAAAAAAAACTAATAAAATGGATCTGAAAGTGTTGTAAAGTGAGTTACTATAATAACATGGTCATGCTATAGCCATTTTAAAGACTAATAAGTGAAAATCTGTTCAAAGTTTTGAAGTTAACTTTGGAGTTTATTAGTTATATTATCTGCCAGTTCCTGCAAGAATCTTGACTATATATGGCATAAACAGCAGTTCATTGTTATATATAAATATATATGTTTGTGAGTCCATGAAATTTGTCTTTATGAAGAGTGCTTGATGTTTATATGTGTATGCAGTGGGCACATTTCCCTCACATTCACTTTGGGTTAAAGCTGGATGGTAACAGTCAAGGAAAGTTGGAGCAGGGAGAAGGAGGTGAAAAGACCAATGGATTCTACTGA