Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07858 LG1 109460974 109465704 PREDICTED: calcium-dependent protein kinase 2-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 109460995 3_prime_UTR_variant
G/A 109461299 3_prime_UTR_variant
A/T 109461309 stop_lost p.Ter551Argext*?
T/G 109461819 upstream_gene_variant
T/A 109461918 missense_variant p.Lys484Met
A/G 109462397 upstream_gene_variant
G/A 109463250 intron_variant
A/T 109463278 intron_variant
G/A 109463767 synonymous_variant p.Asn307Asn
G/A 109463881 downstream_gene_variant
A/T 109463910 splice_donor_variant&intron_variant
A/C 109464353 downstream_gene_variant
T/A 109464476 downstream_gene_variant
A/T 109464477 downstream_gene_variant
G/T 109464535 downstream_gene_variant
C/T 109464586 downstream_gene_variant
A/G 109464722 downstream_gene_variant
A/T 109464727 downstream_gene_variant
C/T 109465040 missense_variant p.Glu182Lys
G/A 109465047 synonymous_variant p.Ala179Ala
C/T 109465270 missense_variant p.Arg105Lys
G/A 109465658 5_prime_UTR_variant
T/G 109465662 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07858.1
MGCHGSKEKKSNAEFSSAYGSGTRSGSGSGSQNTVQPPPTTTVAQAQTSPPPKPQRPSEVVASAPKPNLSPTQNARAVQKPDTTILGKPFEDIKKYYTLGKELGRGQFGVTYLCTENATGITYACKSILKRKLVSKADREDMKREIHIMQHLSGQNNIVEFKGAYEDRMSVHLVMELCAGGELFDRIIAQGHYSERAAASLCRAIVNVVHICHFMGVLHRDLKPENFLLSSKDDDATLKATDFGLSVFIEEGKVYHDMVGSAYYVAPEVLRRSYGKEIDIWSAGVILYILLSGVPPFWAETEKGIFNAILEGELDFASEPWPSISDSAKDLVRKMLTQDPKKRITSAQVLEHPWMREGGEASDKPIDSAVLSRMKQFRAMNKLKKLALKVIAENLSEEEIKGLKAMFANMDTDNSGTITYEELKTGLARIGSTLSEAEVKQLMDAADVDGNGSIDYLEFISATMHRHRLERDEHLYKAFQYFDKDNSGYITRDELETAMTQHGMGDEATIKEIISEVDTDNDGRINYEEFCAMMRSGMPQQGGSANPLIG*


CDS Sequence:
>Vu_07858.1
ATGGGCTGTCACGGCAGCAAGGAGAAAAAATCAAACGCAGAATTCAGCTCTGCTTATGGATCAGGCACTCGCAGTGGCAGTGGCAGTGGTAGTCAAAACACTGTTCAACCACCACCTACCACCACTGTTGCTCAGGCTCAAACATCACCTCCTCCCAAACCACAAAGACCGTCGGAGGTGGTAGCGAGTGCACCAAAACCCAATCTTTCTCCGACCCAGAATGCGAGGGCGGTGCAGAAACCCGACACCACGATTCTGGGCAAACCCTTTGAGGATATAAAGAAGTACTACACTCTGGGGAAGGAACTGGGAAGAGGGCAATTCGGGGTAACGTATCTGTGCACGGAGAATGCCACCGGAATCACGTACGCGTGCAAGTCGATTCTGAAGAGGAAGCTGGTGTCGAAGGCGGACAGGGAGGATATGAAGAGGGAGATTCATATCATGCAGCATTTGTCTGGGCAGAACAACATTGTGGAGTTCAAGGGGGCGTACGAGGACAGGATGTCGGTCCACCTTGTAATGGAACTCTGCGCCGGCGGGGAGCTATTCGACCGGATCATCGCCCAGGGTCATTACTCTGAGAGAGCCGCCGCCTCACTCTGCCGCGCCATTGTCAACGTTGTTCACATTTGCCACTTCATGGGAGTCTTGCACCGCGATCTCAAGCCCGAAAATTTCCTGCTCTCTTCTAAGGATGACGATGCTACGCTCAAGGCTACTGATTTTGGACTCTCTGTCTTCATTGAAGAAGGGAAGGTATATCATGATATGGTTGGCAGTGCTTACTATGTTGCTCCCGAGGTATTGCGTCGTAGTTATGGAAAAGAAATAGATATTTGGAGTGCAGGCGTCATATTGTATATTCTTCTCAGTGGTGTACCACCTTTTTGGGCTGAAACTGAGAAGGGAATATTTAACGCCATATTGGAAGGTGAACTTGATTTTGCAAGTGAACCATGGCCATCCATATCAGACAGCGCCAAAGATCTAGTCAGGAAGATGCTGACACAAGATCCAAAGAAGCGGATTACTTCTGCACAAGTCCTTGAACACCCGTGGATGAGAGAAGGTGGAGAGGCATCTGATAAACCAATCGATAGTGCAGTTCTATCCAGAATGAAACAATTCAGGGCAATGAATAAGCTCAAGAAGCTTGCATTAAAGGTTATTGCCGAAAATCTATCAGAAGAGGAGATTAAAGGTCTGAAAGCAATGTTTGCAAATATGGACACTGACAATAGTGGCACAATTACCTATGAAGAATTGAAGACTGGCTTGGCTCGAATTGGATCAACATTGTCTGAGGCTGAAGTGAAGCAACTCATGGATGCTGCTGATGTTGATGGAAATGGCTCAATCGACTATCTTGAATTCATTTCGGCTACAATGCATAGGCACAGACTTGAACGAGATGAACATCTTTACAAAGCATTCCAGTATTTTGATAAGGATAACAGTGGGTACATTACTAGAGATGAATTGGAGACTGCTATGACCCAACATGGAATGGGTGATGAAGCAACAATAAAGGAAATAATCTCTGAGGTGGATACAGATAATGATGGGAGAATAAACTACGAGGAATTTTGTGCAATGATGAGAAGTGGAATGCCACAGCAGGGAGGGTCAGCTAATCCACTAATTGGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_07858::LG1:109465704-109467704(-)
TTTTATTTTCTTGATAATAATCTTGTTTTCTTAAAAAAAAAGTGAAATAGAAATGGAAGGAAGGTAGCAATAAAGAAAAAATGGAAATGACTATATTCGATTAGAATTTATTGTTTGAAAAATGGAGACGAATGAGAAGAAAATGGTAGGAAGGTTGTTTTGCATGAAAATGACGCAACTGATAGAAGTGAGGTGGCTTTATGACCACTGGTTTCGCACTCTTGCTGCCACCCAAATATCATATATAATTTCCCTCAAATAAAATATGTATTTTAATATTGGAAATAACAATAAAATTAGTAATCTCTAATTTATAATGCTTTTATGGAAGGAGGGCATGTTTTTAAAAGAGAAATATATGTGTGAATTAAAAAAGTCAACGTTAACATTTTAATACGAATGGTTAGAATGTACCGTGATTATTACAATCGTTTAGTGGAATGTTAATGTGTTGAAAAGAACTAAGAGACACTGAATCGGTTTATTTAACAAAAGTGGTGTCTTAAAAATTTCTCCCTATATAAACTGATTTTATGACTAAAATCAATTTTTTTAATAAATAATAATGATAAAGATAAAGAGTGTAGGAAAATAAAAAATTACACCAGTAGTTTTATACTGGTTTAAATTAAAAAATTTATGTTTTAATTGTTAATTTTTCTAAAAAATATTAACTAATCACTAAAAAGTAACCAAAATTTACAGTAACATATAATTGAATTAAGATTATAAATACTTATATTCTGAGACACAAAAAATGAACATAAAAAATGAACAACACTTCGTTTGACACGTAAATAATGAATAATTTTCATAGCAACTTTTAATCATTTAGAAAAATTCAGTTGAAAGTTCTCACTCTACTCCTGCACTAAGTTTTTCAAAACTTTTTTTTCAAAAACACTTAGAGTTTCTTTAGCATATAACTCTTTAGGTAAATATATATAAACATTTGTTTTAAAAATTAGGTTAAAAAATCGAAGAGTCTATTGATACCTACCAATGATAATCGATTATCACATATATTTTTATGAAAAATAAAACTTTCAAGTGTTTTGTTACATCAGGTGGTGTTTATTGATTTTGACCTACCAATTTAAATAAAATACACAAATTACAATACTTCAACAACAAAAATCTAAAGTTTTTAATATATTTCTTGAATTCAAACATTGTTTAAAATTTTAACCATTCTCCAAAAGTCATCCTCAACAAATTGAAGAGCAAAATATCCATATTTTTTCCTGCTTAAACCATTGAATGAGGAGATGCATTCCAAACATTGATAAAATATGATGGTAAATTCTATATAAACTTTTTGAGAAAAGTAAACTTTAAATTTCTTATATTACCAAGTACTAAAAACATATTTAAATTTTTTAAATTTTATAATCTTAAAATCAAGAGTACTCTCTAGATTATTCAATTCAAAACTTTGTTTTTAAATTTCAGATTATGTCATTCAGAGGATACTTTAAAACTATAAAGGTAGAGTAGGGATTTCATATTTATAAAGGTGCTGAAAGGAAAGTATAAGGATACAGAAAGGGTTCCTTAAGACCAACATGGGCATGTTGGTAGCCCAACAAAAGATAGCGACCCAGATCTAATGAAGTTGACATTGCTCTGAGTTTTGTTTTCTACACCCCCATTATTACTGCCTACAGCTCTATGTTTAAAACAAATTCTTCATAGACATATAAGAAACATTTTTTTTTCCTTAATAATAAACTTGAATATTGTACAGTAGGTGCTTGATAGAGTGGAAATGGTGTGAGATTTGCGCGAATGATCTGTAATCAACTAAAACTAAAATCCAAACCAAACCAAATTATTTGCACCAGTTTTTCCTTTACTTCCTCGGGTGTCATCATCAATCTATTTGATTCTTAATTTATTTATGATTGTATTTGTTTAGAAAATAAATAAAAATGGTCGGATTCGAAAATATTCAATGTTTTTCACAGCATGTGTTGACAGTGTCACTATCGGTTGGACTT


Gene Sequence:
>Vu_07858(-)
GGACAGTAGCTGCCTTTTATCCCTCTTTTCTACTTTCTGCCCACATCACTGTAAACTACCTCCTTCCATCTCATTCTCTCACTCTTTTCTCAATCTTCTCCCAAATCCTTCCCAGCAGAAAATGGGCTGTCACGGCAGCAAGGAGAAAAAATCAAACGCAGAATTCAGCTCTGCTTATGGATCAGGCACTCGCAGTGGCAGTGGCAGTGGTAGTCAAAACACTGTTCAACCACCACCTACCACCACTGTTGCTCAGGCTCAAACATCACCTCCTCCCAAACCACAAAGACCGTCGGAGGTGGTAGCGAGTGCACCAAAACCCAATCTTTCTCCGACCCAGAATGCGAGGGCGGTGCAGAAACCCGACACCACGATTCTGGGCAAACCCTTTGAGGATATAAAGAAGTACTACACTCTGGGGAAGGAACTGGGAAGAGGGCAATTCGGGGTAACGTATCTGTGCACGGAGAATGCCACCGGAATCACGTACGCGTGCAAGTCGATTCTGAAGAGGAAGCTGGTGTCGAAGGCGGACAGGGAGGATATGAAGAGGGAGATTCATATCATGCAGCATTTGTCTGGGCAGAACAACATTGTGGAGTTCAAGGGGGCGTACGAGGACAGGATGTCGGTCCACCTTGTAATGGAACTCTGCGCCGGCGGGGAGCTATTCGACCGGATCATCGCCCAGGGTCATTACTCTGAGAGAGCCGCCGCCTCACTCTGCCGCGCCATTGTCAACGTTGTTCACATTTGCCACTTCATGGGAGTCTTGCACCGCGATCTCAAGCCCGAAAATTTCCTGCTCTCTTCTAAGGATGACGATGCTACGCTCAAGGCTACTGATTTTGGACTCTCTGTCTTCATTGAAGAAGGTTACCATCACTTTCACTTTCACCCCCTCCCTGTTTTAGATATTCAGGAGGCAGTAAGCGCTGAACCATGATAGAAATTTTGTTCCTTTTTTCGCTTTGATGTTATTTATTTCTGATTTGTTTATTTTCTGTTTGCATTGTTGTGCTACTTCGGATGCTGATTTTCTTTTGTTCTATACTTTACTGGTGAACCATTTGGGCATCAATATTAAGTTGACTCATCAATTCATGAAAGCTATGATAGGATAAGTTTTCAGAGTTCTATTGCCAGGTCAAACTTACCTATAACGTGACCTGTGTCATTTGGGAACTTTAAAGGCCAACACACTCCGTTGACTGTGAGATGTTTGTTTAATATATATATATATATAGATATCACCTTGATAGCTGTTGGCTATCCTGTCAATGATTCTTGGATTTGGAACAGATGATTCTATACTAAGGACTTATAGGAGTGAGATTGATTCTTGATGTAGTTATCTGATCAGGACATCCATTGTAAAAATAATATTTGATTTTGTGATGTAGGTGACATTTTGTTAAGCAAATTTCAGATCCGATGCTACATTGCTTTTTAATTCCTTTTCAGCAGGTGACATTGAAGTGTATCCACAGAATTGAATAATTTTGTCATGTTCGTTACAGCTTATGTTGAATTCTGATTCCATTTGACTGCTATGGTCGTTCTAAAGGACCTACGTATTGTTACCTGATACGGCTATTACTTTCACAATTTGCATTTGATAATTCATAGTATTTTCTAAATTTTTTCAGGGAAGGTATATCATGATATGGTTGGCAGTGCTTACTATGTTGCTCCCGAGGTATTGCGTCGTAGTTATGGAAAAGAAATAGATATTTGGAGTGCAGGCGTCATATTGTATATTCTTCTCAGTGGTGTACCACCTTTTTGGGCTGGTAAGATCTAATTGTAGTTTGACAATGTCGCATATCTATTGTTTATGGTTGAGTTTCTTATTTAAAAATGAACTATTCAGCATATAATAGGTGTGAGAATATGTTTCTATTATCTTTTGCAGAAACTGAGAAGGGAATATTTAACGCCATATTGGAAGGTGAACTTGATTTTGCAAGTGAACCATGGCCATCCATATCAGACAGCGCCAAAGATCTAGTCAGGAAGATGCTGACACAAGATCCAAAGAAGCGGATTACTTCTGCACAAGTCCTTGGTATTAGACTACCATTTCTAATTTGACTCAAGTAACTGTCATAATGCCACTCATTTGTTTAAATTAAAAGTTTTATTATTTACATTATTATCAGTTTAGCAGTTTGCTTTTCCTCCTTTCCATTTTTGTTACAAATTTTGAGTGCTTCTACTTGCTGTGTCGACTTTCTCAAGTTCCGTATATAGAGACAGCGAGAATAGTTTATTGTGTGTTGAACTGTAAAAGTAAGAACCAGCCAGCAAAATCCTATCGCAAAATCCTATCCGGGGAATGTTAATAGCCTACCAACAATAAGTTACTATCAAAATATCATCAACTAAGTAAATTTTCTCATTACTCATTTGAGTTGGCACTGTTTTGTCTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTCTATTTGTTCAATCTAAACCTGATTAAGATTGATGATTTTGTTTGGTAAGAACACCCGTGGATGAGAGAAGGTGGAGAGGCATCTGATAAACCAATCGATAGTGCAGTTCTATCCAGAATGAAACAATTCAGGGCAATGAATAAGCTCAAGAAGCTTGCATTAAAGGTATGGCATCAAACTTGAATTAAGACATCTACTGTCAATGTCCATTTCTGATGGTCCTTGATAATTGTTGAGGGATGATGATTCTCTTTTGATTGCACTTGTTATATTGCGTACACAAACAAATTTAAACTTACCCATTATGGAATACGATTACAGCTACAATATTATTAAAGTACTTCTGTTTGTTCTGTATAGTATATAAGCCTCTGTTGCTTTCACCTGAAAGTAGTTAATAATGTCTTTTCAACTGGCCCTTTCAATTTCTTTTCACCATGTTTAATACAACAATGTCATGGAATCAAAGACTTGTGTCTAAAACTGACATATTGTATGTTATCGATATAAATTATTTTACAGCAAAACTGATGTCCTGAAGTTTTCAACTTTTCCACAAGGAAGTACAAATACTTAAGAATTACTCCTTATTCATATTATTTCTAAAAACTGCTGTACCTATAGTCTTATTCCAATAGTAGTTAGACAAATTAAAGCATCTACACCTATGATGGCTTGAGCTCATATTTACAAGTTCAATTCTCTCTCTTGATTGAAGATTTGTGTTTTATAAATATAATTTTATACTTTATACTATGTATTTGCGTTGTATGTGTGCTTCTAGGTTTCTAGATACTGCTTTTATTCTTGAAGTTATCCTCTCAATTCATTGTATGCCGTTGAGAAGCATTTTTTGAGTTACATAATCCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTATGTATTTCTCCATTACTGACATTGGTGGAAATTTCTCGAGGTTATTGCCGAAAATCTATCAGAAGAGGAGATTAAAGGTCTGAAAGCAATGTTTGCAAATATGGACACTGACAATAGTGGCACAATTACCTATGAAGAATTGAAGACTGGCTTGGCTCGAATTGGATCAACATTGTCTGAGGCTGAAGTGAAGCAACTCATGGATGCTGTAAGTAGTTAGTAGTCACATATCCTTATCATGAGCATAACTAGTTGAACATTTGTGCATTCACTATATCTTGTTCTTATGCATAATTTTTCTCAGGCTGATGTTGATGGAAATGGCTCAATCGACTATCTTGAATTCATTTCGGCTACAATGCATAGGCACAGACTTGAACGAGATGAACATCTTTACAAAGCATTCCAGTATTTTGATAAGGATAACAGTGGGTGAGTTTTACAAAACTGGTATTTTAAGTGTTGCAATTTCTTTCTAACCTTTTGTTTTCAGACAACTAGATAATGTTGTGTTTAAAATCACCCATCATCGAAGTTTTGAACTGTTTCATCCTCTGGTTTGATTCTAGTCGAGTTCTTCAACGTTGTTGACAAACTTATGAGAATTTGAATTTGTTTCTTTTAGTCTCCAGGTCCATATTAGATAGTACTTTTTATCAGTAACATTTCTCTGTTGAACTGCATTAATTCACTTTAAGACTATCAATAGCATGAGGCTTGAGGGTTACACAAGGTTGATGGATAAGAATGGTCTTTAAATTCATGTATAGGTACATTACTAGAGATGAATTGGAGACTGCTATGACCCAACATGGAATGGGTGATGAAGCAACAATAAAGGAAATAATCTCTGAGGTGGATACAGATAATGTAAGTTGGTTATAGTTTGTTTAATGACGGTAGACCATTGATGCTGTTACTAACAATTCTCCCACTAACAGGATGGGAGAATAAACTACGAGGAATTTTGTGCAATGATGAGAAGTGGAATGCCACAGCAGGGAGGGTCAGCTAATCCACTAATTGGTTGAGTAGTGACTTATTCCTGTTGCGAAAAAGCACTATCTCCGGGAATGTGACAATTCACTTCATGCATTGATGATATTTCTTTGCAATCCCAATTTATTACAAAGATCCTGTTGTGTCTTTCGGATTGCTTGTTCTGTAATTTTTATAAGTTCAGCTGTCACATTTTACAAGTGACTTGGAAAACTGAATTTTTATATTAGGATACTTCTGTACTATATGGAGTTATCATTTTTATGGTGGCCAAGTAACAAGTAATCAAGGGAGGGAACTATTTTCCTTGACCTTTATATTGAAGTGCAAACTTGAACTTTTTTGGCATGATGTTCTGACAATTT