Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07779 LG1 108849122 108849975 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 108849178 3_prime_UTR_variant
A/G 108849192 3_prime_UTR_variant
C/G 108849201 3_prime_UTR_variant
C/A 108849316 3_prime_UTR_variant
G/T 108849391 3_prime_UTR_variant
G/A 108849738 stop_gained p.Gln68*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07779.1
MSFCLVGEFLHSDGMMAESDNESGGGKNESSICREQDRLLPIANVGRIMKKVLPGNAKISKESKETMQECVSEFISFVTGEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAMASLGFEDYAEPLKAYLHKYREMEGEKTAMIGKHHGATGFYANPL*


CDS Sequence:
>Vu_07779.1
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Promoter Sequence:
>Vu_07779::LG1:108849975-108851975(-)
AAAACTAGAAATAAAAATATTTATTATTTATAAAATTAAAAGAAATTTTTTTCATTATTTTTAAACCAACTCTAACCCTATTTTTTACATGTAGGAAAAATAAAAAATAAATATAATAATTATATTATAATAATACATTAGAGTTTATTTAAAAATAATAAAATGAAACATTTAATAAAAATTTGAATTTTAATAAAAAATAAATTTGGTCTCAATTCAGACAGAAACAAAATTGGAACTGAATTGAACAAAATTAACATAAATTGATACTAAATAGAACAAAATTAACGAAAATTGGGATTGAATTGGCACGTGACACTAGCACTGATACGTGTCACTAACATTGACTTGACATTGTCACATGAGACAATATTAACTTGTCACGCAGAAAACTTTTTTTAAATTAAGAAAAAAAAATACAAACATACATTGTTTATCATTTCTTAACAATTTAAACGATGTCATGACAAATGACTAAATTGAACATATTTTACTAAAGTAGAAGCCAGATTAAACATAAAAAAAGGTTTTATATTAAACAAAATGGACGAAAATAAAAATTAAAAGAGTATTTAAACCAACATCAAATAAACTAACAATATTTAGTATTTGAAAAAGAAAATATGATTATATTTGTACTTGTTGATGTTCTTGATTTAAAAAAAAAAAAGTTGAATATAGTCTATACTTATTTTTATGCGTGGTTAATTTATATATTCTATATCAATACAAATATTTTTCTATAAGTAAAAATTTATTTATTATCCAAATAGGTGATATCCACAAATTAGATTTCATGATACAAGTATTCACCTACATTGATTAATAAATCAATAATAAAATATTTTCAGCACTTATTTATAAAATATTTATGGTAGATCTTATCAGAAAAATACATGGTGCACTTATTTTTTATTGTCTCTTTTATACACGGTTACAGGACAGATAGGTGAAAACAAAGTTTAGAATTTGACTTTCCAAATACCAAATTCTAACATGTAGAACAAATCGGGCTATGCGGAAAATATAGTGTATAATGTGTTATCTGATAAATTAAAAAAAAATGTACTGGAAAAAATTTGGTAAACAACTTTTGTAGTAATAAAAGAAATTAGATAAATGGATATACTGTAATAAAGCAAATTTAGAAAGAATTTTTAACACAGCTTAAAGTATAATTCTCTCTCTGTTTTAAATTTACCCAAATATTTTAAATGAATCATATAATTTGTACTGTGAACATTCACCATATTTTTTATGATCTTGTCTCTATTTAATGAATACGTAAAAATATATTTATTGAAATAAACTAATTATATATTATATAGAAAATTAGTATGAGAAATTTTCATGTAAGTATATGATATATATTATTTAATTAATAATAATTTTGTATACTTAATTATTTGTAAGCTTTTAGTGTGCAAAGCTGCCGTACTATAAAAGAAATGCTACTGTATAATAATAATGAGTGTTAAATTGATTTAGTTAATCTTTTTATTAAATAGTCACGCAAACTAAATATAAAAAGATTTTATTATTATTATTATTAGGACCCAAAGCTGCAAAGGGTTGTTAAACTTACACGTGAAGAAGCTATTTCGTAGATCAACGGCCAATAACCGTTCACATGGCACAGGAATAATGGTCAACAAAATAAAAGCCCAAATAATATAAACATTAAGATAGTTTAAGTAAGCTTCCTTGTTAACTCAATGTTCTTATCCAACCTAAAAAAAATGACATTTTATATGTCTGCATTCAAATAATCCAACAACCTTATTAACTTTTCTCCCTTCTAAACACCTAACTTTCTCTTTAAACTAACCAATTAATTTACCTCACTATTCAGAATAGTACAGATACCCTACCACTTTTGGAGCCCCTGCTCAGTGTTAGTGTTGATATTTTATCATAACTAGCATGGATATAAATGCACAAATTGCAAGATTCTTCTAGTTGAAACCATCTTAAATAATATATAATTATGTTAAATACTC


Gene Sequence:
>Vu_07779(-)
ATAGAAAGAGAAATAACACGTATATATGTGTGTGTGATGAGTTTTTGTTTGGTGGGTGAGTTCTTGCACAGTGATGGTATGATGGCTGAATCTGATAACGAGTCAGGAGGAGGAAAGAATGAATCTTCAATCTGCAGAGAGCAAGACAGGCTCCTTCCCATAGCCAACGTGGGCAGGATCATGAAGAAGGTGTTGCCGGGCAACGCTAAGATTTCCAAAGAATCAAAAGAAACCATGCAAGAGTGTGTGTCTGAGTTCATCAGTTTTGTAACAGGAGAGGCTTCTGATAAGTGTCAGAAAGAGAAAAGAAAGACCATCAACGGAGATGATCTTCTGTGGGCCATGGCCTCGCTTGGCTTTGAAGATTATGCAGAGCCCCTCAAAGCTTATCTGCACAAGTACAGGGAGATGGAAGGAGAAAAAACTGCTATGATTGGGAAGCACCATGGTGCTACTGGCTTTTATGCAAATCCACTGTGATCATATTCATGACGGTCACATAAAAAAGGATACATGTGTGGATCTCTGCTAAAGTTTGTTGCTTGAATTTCTGCTGTTATTGTGAATATAGGTAATTATGTATGCTTATAGGGATTTAGGATCTTTATATTCCTTTTCATCTTAGTTTGCTGCAGGGATAGGAACTAAGAGTAGGAATTGTTAGCTTGTTTCAATTGCAATATACTATGTATACATTTCAATTTCTAAGTGGTTTGCATTTGAGGTCCAAATAAAGTAAGAGGGTCAAATATTTAAGCTACTTTGAAGCTGCCTGCTTTGGCCTGTGAGTTCTAACTAATCATTGCTGCAAATATTTCCAGAAGTTTTCTAGCAGCTTTTCTGTGACAGGCCTC