Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07646 LG1 107754200 107759185 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process, biological_process
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   mRNA binding, mRNA binding, mRNA binding, mRNA binding, mRNA binding, mRNA binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 107754365 5_prime_UTR_variant
G/T 107754721 synonymous_variant p.Thr58Thr
T/A 107754825 intron_variant
T/C 107754826 intron_variant
G/A 107755693 synonymous_variant p.Pro176Pro
T/A 107755918 intron_variant
C/G 107755971 missense_variant p.Pro246Ala
C/T 107756059 missense_variant p.Ala275Val
C/A 107756242 missense_variant p.Pro336His
G/A 107756993 intron_variant
T/A 107757002 intron_variant
T/G 107757207 intron_variant
A/G 107757229 intron_variant
T/A 107757836 intron_variant
T/A 107758041 intron_variant
T/G 107758049 intron_variant
T/A 107758054 intron_variant
T/A 107758062 intron_variant
C/A 107758065 intron_variant
G/C 107758068 intron_variant
A/C 107758084 intron_variant
C/A 107758473 missense_variant p.Ala472Asp
C/T 107759063 3_prime_UTR_variant
G/T 107759066 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07646.2
MLVVELQYYMRTGSCKFGASCKYHHPRQAAGNATPVPLNYYGYPLRVGEKECSYYVKTGQCKFGATCKFHHPQPAGVQVIAPSPVPAVSHLPVPVPSPVYPTVQPQSGPSQQQYGVLVARPPMLPGSVVQGPYGPMVVSPAMVPFSGWGPYQAPATTPVMPSSSASNVGSTQLYGITPLPSSAATFTGPYQPSGPSVGPSGAIQKEHPFPERPDQPECHYYMKTGECKFGPSCRYHHPPDKGAPKANVILSPVGLPLRPGAPPCTHYTQRGVCKFGSACKFDHPMGSLSYSPSASSLADMPVAPYPVGSSIGTLAPSSSSSELRPELGAGVSKESVSSRMSSMSTSTGSVGLTLSSVGPISHSSTQPSAQSSSSSATTSATTSSTVSHTSS*

>Vu_07646.1
MERYGRASEGSQSDPSPEWTVAGADAGIEESSWQHGLAAAESYPLRPDEADCIYYLRTGFCGYGTRCRFNHPRDRAAVIGAAARTGGEFPERVGQPVCQYYMRTGSCKFGASCKYHHPRQAAGNATPVPLNYYGYPLRVGEKECSYYVKTGQCKFGATCKFHHPQPAGVQVIAPSPVPAVSHLPVPVPSPVYPTVQPQSGPSQQQYGVLVARPPMLPGSVVQGPYGPMVVSPAMVPFSGWGPYQAPATTPVMPSSSASNVGSTQLYGITPLPSSAATFTGPYQPSGPSVGPSGAIQKEHPFPERPDQPECHYYMKTGECKFGPSCRYHHPPDKGAPKANVILSPVGLPLRPGAPPCTHYTQRGVCKFGSACKFDHPMGSLSYSPSASSLADMPVAPYPVGSSIGTLAPSSSSSELRPELGAGVSKESVSSRMSSMSTSTGSVGLTLSSVGPISHSSTQPSAQSSSSSATTSATTSSTVSHTSS*


CDS Sequence:
>Vu_07646.2
ATGCTCGTGGTTGAACTGCAGTACTATATGAGGACGGGATCATGCAAGTTTGGTGCATCCTGCAAGTACCACCATCCTAGGCAGGCGGCAGGCAATGCTACCCCTGTGCCACTAAATTATTATGGATATCCGTTGCGAGTGGGTGAGAAAGAGTGTTCCTATTATGTGAAAACTGGACAGTGCAAATTTGGTGCAACTTGTAAATTCCACCATCCCCAACCTGCAGGTGTCCAAGTTATTGCACCATCACCGGTTCCCGCAGTTTCACATCTGCCTGTTCCGGTACCTTCACCGGTATATCCAACTGTACAGCCCCAATCTGGTCCTTCGCAACAACAATATGGTGTACTTGTTGCAAGGCCTCCTATGCTGCCTGGCTCAGTAGTTCAGGGTCCGTATGGGCCTATGGTGGTGTCTCCTGCCATGGTCCCTTTTTCAGGCTGGGGTCCTTATCAGGCTCCTGCAACAACCCCTGTAATGCCATCTAGCTCTGCGTCTAATGTTGGTTCAACACAGCTTTATGGGATAACCCCACTACCTTCGTCGGCAGCTACTTTTACTGGACCTTATCAGCCTTCTGGTCCCTCAGTTGGTCCTTCAGGTGCTATTCAGAAGGAGCATCCATTTCCAGAAAGACCTGATCAACCAGAATGTCATTATTACATGAAAACAGGGGAGTGCAAATTTGGTCCATCTTGCAGATATCATCATCCACCAGACAAGGGAGCACCTAAAGCAAATGTAATCCTTAGTCCTGTGGGTCTTCCTTTGCGTCCGGGGGCACCGCCTTGCACTCATTATACACAGCGTGGAGTTTGCAAATTTGGTTCTGCATGCAAATTTGATCATCCTATGGGATCACTTAGCTACAGTCCATCTGCCTCTTCCCTGGCTGACATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGTTCCTCAATCGGTACTCTTGCTCCGTCATCTTCATCCTCAGAGTTGCGGCCTGAACTTGGTGCAGGAGTCAGTAAGGAGTCTGTTTCGTCCAGAATGTCTTCAATGAGCACATCAACCGGATCAGTTGGTTTGACCTTGTCAAGCGTTGGACCCATTTCTCATTCAAGCACTCAACCATCTGCTCAGAGTTCCAGTTCTTCAGCAACTACCAGTGCTACCACAAGTAGCACTGTCTCTCACACCTCAAGCTAA

>Vu_07646.1
ATGGAGCGGTACGGCCGGGCCAGCGAAGGGTCGCAGTCTGATCCGTCGCCGGAATGGACCGTGGCCGGCGCCGACGCCGGCATCGAAGAGTCCTCGTGGCAACACGGATTGGCAGCTGCCGAATCGTACCCTCTGCGACCCGATGAGGCTGATTGTATCTATTATCTGAGGACGGGATTTTGCGGTTACGGCACACGGTGTCGTTTCAACCATCCCCGTGACCGTGCTGCGGTCATTGGAGCTGCGGCGAGGACTGGAGGGGAGTTTCCGGAGCGCGTGGGGCAGCCTGTGTGCCAGTACTATATGAGGACGGGATCATGCAAGTTTGGTGCATCCTGCAAGTACCACCATCCTAGGCAGGCGGCAGGCAATGCTACCCCTGTGCCACTAAATTATTATGGATATCCGTTGCGAGTGGGTGAGAAAGAGTGTTCCTATTATGTGAAAACTGGACAGTGCAAATTTGGTGCAACTTGTAAATTCCACCATCCCCAACCTGCAGGTGTCCAAGTTATTGCACCATCACCGGTTCCCGCAGTTTCACATCTGCCTGTTCCGGTACCTTCACCGGTATATCCAACTGTACAGCCCCAATCTGGTCCTTCGCAACAACAATATGGTGTACTTGTTGCAAGGCCTCCTATGCTGCCTGGCTCAGTAGTTCAGGGTCCGTATGGGCCTATGGTGGTGTCTCCTGCCATGGTCCCTTTTTCAGGCTGGGGTCCTTATCAGGCTCCTGCAACAACCCCTGTAATGCCATCTAGCTCTGCGTCTAATGTTGGTTCAACACAGCTTTATGGGATAACCCCACTACCTTCGTCGGCAGCTACTTTTACTGGACCTTATCAGCCTTCTGGTCCCTCAGTTGGTCCTTCAGGTGCTATTCAGAAGGAGCATCCATTTCCAGAAAGACCTGATCAACCAGAATGTCATTATTACATGAAAACAGGGGAGTGCAAATTTGGTCCATCTTGCAGATATCATCATCCACCAGACAAGGGAGCACCTAAAGCAAATGTAATCCTTAGTCCTGTGGGTCTTCCTTTGCGTCCGGGGGCACCGCCTTGCACTCATTATACACAGCGTGGAGTTTGCAAATTTGGTTCTGCATGCAAATTTGATCATCCTATGGGATCACTTAGCTACAGTCCATCTGCCTCTTCCCTGGCTGACATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGTTCCTCAATCGGTACTCTTGCTCCGTCATCTTCATCCTCAGAGTTGCGGCCTGAACTTGGTGCAGGAGTCAGTAAGGAGTCTGTTTCGTCCAGAATGTCTTCAATGAGCACATCAACCGGATCAGTTGGTTTGACCTTGTCAAGCGTTGGACCCATTTCTCATTCAAGCACTCAACCATCTGCTCAGAGTTCCAGTTCTTCAGCAACTACCAGTGCTACCACAAGTAGCACTGTCTCTCACACCTCAAGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_07646::LG1:107752200-107754200(+)
CTATTTCTTAACATAGTATCAAAACTATGATTAGAGTCTATCATAACGATATTTGTTGTTTGTTGGACATGTTGTTCTATCCGCTATCGGATCACCTATTAATGTCTAGTGAGTGCAAACGTCACCTTACAAACCAATTCTTTTAAATAAAAATCATAATAAATAAAACATAATATTATTAAGTAATCAATATAAAAATTATATATATTTTTCTTTTAAAGCATCAAGATTGAAATTATAATCATGTAAATATATCAAATAATAATTAGATAATTGTCAAATAAATATAAAAAATGATTATGATAAGAACAATTATTTTATACATAAGAGATGACATATTTTATAATAAAAACAAGATATGAAAAAGAAAAGAATGAACCTTTAGTTAACAAAATGGATATAATCTTCTTTATAATAAAACAAGTTCGAAAAACTTAATTTCAAATAATTGAAACACATTTTAAAAAATATTCAAGATAGAAATCTTTATAAAAAATCTAGAAAACCTATAAAAAATCTAGAAAACCTGTAAAAAATTTGATATATGTAGAATATATAGTACTTGTTTTATAGTATTTTTAACATATTATTTAATTGAAAGGGGAAAATAAAGAAATTTATATTTAATTTTTTGTGCTTAAAATACATTCTGTTTTTTCATAAGAGTCCTCAAACATTTTTACAAACACGAAAGAGTCATATAACTAAATTCATTATAAAAGTCCATATTTAGAAATTAATTTATTTCAACTCAGTTTAAATTTAACTTGAGAGGCAAAATCAAATTTAAGAAAAAAACCAATAGTTAAGTTTAGGGTAAACTTTGCACAAACATGAGCATCCTAATGCACATTCTCTAAATTATTATTTTTATAACAATTGTATATCCCTGGAGACAGAAGTTTGAAGTTTAATTAAGAATAATGGTTTTAATTATGTACAAAGTTAAACGCCAGCAAGTTTATACAATACAAAGAATAAAAAAATTATATATGTTGTAAGAAAAAAAAAACATTGACATTAGGTTTTCTTTCAAAGTACGCTTTGAGGGAGTAAGAAGTAATTTTGAAGTGTTTCTGCGAGAGTGTAGGAATGCTGCAAAACCTACTCGGTGCTAACCAATCACCTTTGACGATAAAGCGAATTTTCATTACACAATTAAGCAGCGACAAGATCTAAGTGGAAGCGAATGAAAATGCATGAATAATTTGTTTTGGTTCGATTCGGCCAAAGTTGAAACGAACCAATCTTCACGCGAGTGTTGGAAGTTTTTGTTATCATACACTGTCCGACAAAACATTTTGAAATTCAATAACTCCGAGTCTGAAGAAAGTAAAGAAGAAACCAGTTAGTTGGAACTTCATAATATGTATGGGAATAGATCCCGAAATCCCACAGTAACATCATAGCATAGTGGTGTGTTCCTTTAACCTTTTTATTACCACTTTTAAGGAAGATCTAACATGTTTCGGCCACGTGGAGCCAATGACATCTACTCATGTTTCTTTTTTTCCTCAGCGACAACGCCTGCCCACAACCATGAACAAGATTAACTAATTAATTATCTCACTAAATTTATTTTTTATTTTTTCTGTTTAATATAAATAGGACAAATGCATAGTCTCCACCACACAATGTCTTCACTATCTTCTATCACTTTTCTTACCACCACTTATGCAATCTGCACTGACATAAGCACGTTTAAAAAATCCTTCATTTACCCTTGTTTAATCTAATATTGTATAATTTACAACATTGTTTAATAGATTTTGTATTAATTTATGATAATAATTTTGTTTATATTGTGGGTGCTGGGACTGTTTTCTATTTTCTCAAAGAATAATAATATTAGAATATTGGTTACTAAAAAAGTAATTTTCAAATGTTAATAGTTAATAATGTTACAGTTTTTATATTTGGGTAATTTTATGGCATGTTTGGCGGGTACACAGATAATAAGCCAACCCACCCTTTCTCTTACCAATGAGAAGAGTCTCCCA


Gene Sequence:
>Vu_07646(+)
AAAGGGAAAAAAATCAAAATAAATAAGAAAAGAAGCTTAGAAACTGAAAGAGAGAGAAAATAGAGAGAGAAAGAGAGCAACTAATACTGTGGAAGAAACATAGAGGCAGTGTATGAGTGAGTGACTGAGAGAGAAAGAGAGAGAAAATCCAAACCAGTTTCTCACTCTTTTGATCGGAACCTCTCATTCCTGCCTTCAGGTTGAGACCCTTTTTTCTTCTCTTTGGTCCGTACAATGGAGCGGTACGGCCGGGCCAGCGAAGGGTCGCAGTCTGATCCGTCGCCGGAATGGACCGTGGCCGGCGCCGACGCCGGCATCGAAGGTGACTCTATCTACATTATCTGTTATTCCTTTCACGATTCTCGATTTGCGCTGAATAATGCAGAGTGTGGTAATAATGGAAGTAGGTTTGATCTTGATTTCGCTAATAATGCAGAGTCCTCGTGGCAACACGGATTGGCAGCTGCCGAATCGTACCCTCTGCGACCCGATGAGGCTGATTGTATCTATTATCTGAGGACGGGATTTTGCGGTTACGGCACACGGTGTCGTTTCAACCATCCCCGTGACCGTGCTGCGGTAATAAATAAATCTGCTTCTTCTTTTTCTTTCTAGTTTCTCAGGGTTTCTGGTTCGTTGCTTACTCCTGTGTAAGTGTGTGTCTCCAATTTCGCCTTTGATCTTGGCTTTGTGCAGTTCGGTTTGTTGAATTTTACTTGTGTTGTGGGTTAATCGAACTCGGTTGGGCGAGATTTAGATGTCTGCATTGGACACTGTGATCGAATGATGTTTCCTAAGTTGAAAATACTTCTGCATGTTTTGTTGCTTAGGTCATTGGAGCTGCGGCGAGGACTGGAGGGGAGTTTCCGGAGCGCGTGGGGCAGCCTGTGTGCCAGGTTTTTTAATATGGCTTTCATTCATAGATTCTTTGCTGCACCTGTATTAAATGGTTACATTTGATTGGTGATACTGTAAATGCAATCACTTTATGTTTTACAAAATGACGTGTTCTGGTGTTTCTTATAATAAATGTCGAGGTTTGGGTGAAAATTGAGATTGACTTCTATTTTTGTTCTGGTTGTCTTCAATGCTGGTGGCCTTCCTTATGTGTTGGTTGTATTGCATATGCTCGTGGTTGAACTGCAGTACTATATGAGGACGGGATCATGCAAGTTTGGTGCATCCTGCAAGTACCACCATCCTAGGCAGGCGGCAGGCAATGCTACCCCTGTGCCACTAAATTATTATGGATATCCGTTGCGAGTGGTCTGTATCGGTCTATGTTTATTGCGTAATATTATGTGATCTTTGTGAATGTTGGGATCATATTTTCTTAATGAGGATGGAAGTTTGATTCAAACTATTTTTCATGATTAATAACAGGGTGAGAAAGAGTGTTCCTATTATGTGAAAACTGGACAGTGCAAATTTGGTGCAACTTGTAAATTCCACCATCCCCAACCTGCAGGTGTCCAAGTTATTGCACCATCACCGGTTCCCGCAGTTTCACATCTGCCTGTTCCGGTACCTTCACCGGTATATCCAACTGTACAGCCCCAATCTGGTCCTTCGCAACAACAATATGGTGTACTTGTTGCAAGGCCTCCTATGCTGCCTGGCTCAGTAGTTCAGGGTCCGTATGGGCCTATGGTGGTGTCTCCTGCCATGGTCCCTTTTTCAGGCTGGGGTCCTTATCAGGTAGGTCCACTATGCGCTGCTTACTCAAGTTATGTGCACATTTACTAAATCTCTTAAGCACTTGGTGCAGGCTCCTGCAACAACCCCTGTAATGCCATCTAGCTCTGCGTCTAATGTTGGTTCAACACAGCTTTATGGGATAACCCCACTACCTTCGTCGGCAGCTACTTTTACTGGACCTTATCAGCCTTCTGGTCCCTCAGTTGGTCCTTCAGGTGCTATTCAGAAGGAGCATCCATTTCCAGAAAGACCTGATCAACCAGAATGTCATTATTACATGAAAACAGGGGAGTGCAAATTTGGTCCATCTTGCAGATATCATCATCCACCAGACAAGGGAGCACCTAAAGCAAATGTAATCCTTAGTCCTGTGGGTCTTCCTTTGCGTCCGGTAATTTCAAGTTCTTTGTTCTTTGGTGCTTTATACTGGGTTGTCATAAAAATGGGATCACAGTAGGAACCGTTTTTTCGTTCTTATTTTATGCTAGCTCTTTTTTAGGACACCTTTCTATTTTAATGTATTATGCATATTATGCATTCATGTTGGACTACACATTCTGCTGATATTTAGAATCGCATTAATGTTGGACTACACATTATGCATTCATGTTGGACTACACATTATACATTCATGTTGGACTACTCTGTACAACATCCATTACAAGTGTGCTTCTGGATCCTTCTTTAGGTTTAGGTTTTGTTAAATTGTAGTGTATCGCCGTAATACACTTATATCTGTATGTTAACTCCTTTTTCAATTCTCGTTCTAGGGATATGATCTTTGACTGGCCAAGGAATATTTTCTTATACAAACTCTTGAATGATTGAAACTTTTGTTCTCATCTTTAAAATTGTATGTACTAAAACATAACACTTATAATTGAGATAATGTAATACTTCTCTGATTAGTCTCTCTTGATGAGTTACTTGTCCTTGAAGAATGGACGAACCAAAAGCCTACTGACACCTAGCGCTAAAATTTTATTTCATCAAAAGAGAGTGGGCAGGGAAGCAAGGATCAATAACCAGATAATCCCTAGTCTCATATTAATATATATGCCAAAATTATTTCTTATTAATAGGTTCGATTATTTTGTTTATAGTTTTATTGAATTTTAAATATAGTCCTTGTACTTAAAATTTCAGAATAGATTATTGGTTTTCCGCTAGTTGCCAGCATTTAGACTCTGTTTGTGGATCTTTTCGGTCATGTGCAAGCCATTTTGCCGTTACAACTTATACAGGTTTCAGGGACACCAAGTACAAAATTTTATAATTAGGAGGGATTCAATTAAAAACTAAAAAAGTTTTTGGAACTTATAATGTATTAGAACTCAATGAACATTATCATTTTACACCTTTTTTTTTTTACTTAGTTTAAATATAGAATCAAGTTCTTTTCAGTTACATGTTCGACATGGTGTTTCTAAATGCAGAATAATTTATTAAACCTTATACACCGCCATGACATCAATGTTTTCATTGTGTGATTTATATGTCACGTGCTATTTCTTACTTATTTTGATTCTTATTGGATGTTTATTATATACATTCTCTGAAGCTATTTTTCGGTCTATTGGAGTATTCCGTGTTATTTTCTTGGTTTGTATGCTTGAAATTTATCTATATTATGAAATGTGTTTCTAATATTAAGTTGTGATTCAAGAACCATAAGAGTATTGTGTGGGCTTTGGCTTTGTGTGGAATTGGTTGACGTTGTTTGTATTTTCCTTTAACCTTTGTCGATGCCACAAATTTCTGGTTATGTGCTCTGTTATCTGTGGTTCTCCTCCTTAGAGCTATGTTCTCATGCTAGCTTGAGGTGTTCCAACCTTATTTCTATTGGTAATTTCATATTTCATTCTTGTGATTTTGGATTAGGGGCGATCTCTATTTTCCATGCACAAAACAGATGTTGATGTTTGATGGCATGCTTCCTCGTGTTATTTTACGAGAACATATTCCGGTCTTCGTAGGCTAGACGTTAATGATCTTTTTGGCTATTATTTTTCAGTCCGAAGTGCTGTGGCATTTTATTTTGTTTTCTGGACCGGTTGAAGAATATACAAGTATTTGTTTGTACTCATTATGAATTTATTTGTTTAAAGGACTGTTGATGCAATGATAAATCTGCCTATTCTGTTTTAATTTTAAATTGTCTGACTTTCCTGAATTCTTAATTGTTAATTGTTCGACTTTGTGTTTGATAATCAGGGGGCACCGCCTTGCACTCATTATACACAGCGTGGAGTTTGCAAATTTGGTTCTGCATGCAAATTTGATCATCCTATGGGATCACTTAGCTACAGTCCATCTGCCTCTTCCCTGGCTGACATGCCAGTTGCACCCTATCCTGTGGGTTCCTCAATCGGTACTCTTGCTCCGTCATCTTCATCCTCAGAGTTGCGGCCTGAACTTGGTGCAGGAGTCAGTAAGGAGTCTGTTTCGTCCAGAATGTCTTCAATGAGCACATCAACCGGATCAGTTGGTTTGACCTTGTCAAGCGTTGGACCCATTTCTCATTCAAGCACTCAACCATCTGCTCAGAGTTCCAGTTCTTCAGCAACTACCAGTGCTACCACAAGTAGCACTGTCTCTCACACCTCAAGCTAAGCAATGTGAATGAATTCCTCATTATCACTCCTTTTTATCTCAATTTTTCAACCGGCCATCATCACTCAAGGAGGTTCTCAAAATAGGTTTTATTTTTCAATTAATCCAGTTCCACATTCAGGTCTAGCACACACTTTCCCACCAATTGTCTGTGTCCATATAATCTTTCTGTGGCCATCCTTTTTATCTTGAATAAACCATGGCCAACCTTGAGAGTTTTAGCAACCCATACACGCACCTTGCTTTTGGATAACTTCAAAAGTATCTGCAACTCCATCATGCACATGTCCATTCACATCTCCAATTTTAGTAGTTTCTGGTGCTTATTTATGCTTCAATCTTTTTTGATGAGAAAAATTCTGCTCGGAGTTTCATTGACCATGTGTAATCCCTCTTCACATGAACCCCTTTTGCATTTGGGAATATATCCAAATCCTTTCCTGGAAGGTCCTGTTTGCCACCGTTCCCAAGTTATCCAAGGTTTGACGTGAAGAGTAGTAATCAGGAGACTACAATGAGGCTTCACATTGCTATCTTTTATGAATTTAGATACACGGTGATGTTGTGACAAGTAAAATGCTTGACTTGGTACTTAAGTTTATTACAGAATACATATATGAAGAAAGACATTTAAATTAACACATTTCAAAGTCCAATAATCTTTTTTTCACTGTC