Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07470 LG1 106129001 106133514 PREDICTED: pto-interacting protein 1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   molecular_function
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 106130030 upstream_gene_variant
A/C 106130031 upstream_gene_variant
G/T 106130068 upstream_gene_variant
T/G 106130448 missense_variant p.Gln170Pro
T/A 106131394 missense_variant&splice_region_variant p.Asn29Tyr
C/T 106131860 missense_variant p.Gly2Ser
C/T 106131867 5_prime_UTR_variant
G/T 106131928 upstream_gene_variant
T/C 106132411 upstream_gene_variant
G/A 106132491 upstream_gene_variant
T/A 106132492 upstream_gene_variant
G/A 106132677 upstream_gene_variant
G/T 106133242 intron_variant
G/A 106133327 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07470.1
MGCFGFCTGNDSVAIADRGPFMQNTPTGNASYHGRHNAVPPPRPINFQPIAVPSITVDELKSLTDSFGSKSFIGEGAYGKVYQATLKTGRAVVVKKLDSSNQPEQEFLSQVSIVSRLKHENVVELVNYCVDGPFRALSYEYAPKGSLHDILHGRKGVKGSQPGEVLSWAQRVKIAVGAARGLEYLHEKAEIHIIHRYIKSSNILLFDDDVAKIADFDLSNQAPDAAARLHSTRVLGTFGYHAPEYAMTGQLTSKSDVYSFGVILLELLTGRKPVDHTLPRGQQSLVTWATPKLSEDKVKQCVDVRLKGEFPSKSVAKMAAVAALCVQYEAEFRPNMSIIVKALQPLLNTRSTHAKESPNM*


CDS Sequence:
>Vu_07470.1
ATGGGTTGCTTTGGCTTCTGCACCGGAAATGATAGTGTTGCAATTGCTGACAGAGGACCTTTCATGCAAAACACTCCTACTGGGAACGCCAGTTATCATGGCAGACATAATGCAGTGCCTCCTCCTCGGCCGATAAATTTTCAACCTATTGCTGTCCCTTCCATTACAGTAGACGAATTGAAGTCTTTAACAGATAGTTTTGGCTCAAAATCTTTCATTGGTGAGGGTGCATATGGGAAAGTATATCAAGCTACATTGAAAACTGGGCGTGCAGTGGTAGTCAAGAAGTTAGATTCCAGTAATCAGCCAGAGCAAGAATTTCTTTCTCAGGTCTCCATCGTATCAAGGCTAAAGCATGAAAATGTTGTTGAGCTTGTTAACTATTGCGTTGATGGTCCTTTCCGTGCCCTTTCCTACGAGTATGCTCCTAAAGGATCCCTTCATGATATTCTTCATGGACGAAAAGGTGTCAAGGGTTCACAACCTGGTGAAGTGCTCTCATGGGCTCAGAGAGTTAAAATTGCTGTTGGAGCAGCCAGGGGACTTGAATATCTTCATGAAAAGGCAGAGATTCACATAATCCATCGTTACATTAAGTCTAGTAACATACTTCTTTTTGACGATGACGTTGCAAAGATTGCTGATTTTGATTTGTCAAATCAAGCCCCTGATGCAGCTGCACGTCTTCATTCTACCCGTGTTCTTGGGACTTTTGGTTATCATGCTCCTGAATATGCAATGACGGGACAACTCACTTCAAAAAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTTATACTGCTAGAACTCTTAACCGGGCGTAAACCAGTTGATCACACACTGCCCCGAGGACAGCAAAGCCTTGTCACCTGGGCAACACCGAAGCTCAGTGAAGATAAGGTGAAGCAGTGTGTTGATGTTAGACTAAAGGGAGAGTTCCCTTCAAAGTCAGTTGCAAAGATGGCTGCTGTTGCTGCACTGTGTGTACAGTATGAAGCTGAGTTTCGGCCAAACATGAGCATTATAGTGAAAGCTTTGCAGCCTCTACTGAATACTCGTTCTACTCACGCAAAGGAATCACCAAACATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_07470::LG1:106133514-106135514(-)
TTATTATTATCTGCTGATTCTTTTCCAAATTTTCTTAAATTTTTTTTTACAAAAAATACTTGTAATTTTTATTGTGAAACATTTTTCATAAAAATATCTATCCATTTTTTACAATTATTTTTTTAAAAGATATTCACAAAATATTATTTAAAAAGATATTGCTCAAAAAAAAATATTAATAATTTCATATTTTATAATATTAATAATAATACTTTTAATAAAAAATTAAATTACACCAATTATCTTTTGGAATGAAACAATGACTTTAATTCAAAATCTATTAACTTTAATTCAAAACCTATTATATTAAATTCGTTAAAGAGGTCACAAATTCAATTTAAAACCAATTAAGACTTAAATTATTAAAGTTTACAATAATTTATACTGAAGTTGTTATAAATAAACATGATTTCAAGTAAAATATAACATTTATTGAAGTTATTAGTAGTTTGCACGAGTTGTGCCTTAGACAAAAGTTTTATTTGAAATCGTCCATGTCTAGTATAATTTCTTCTAATTCATTAATATTTAACTTAATTACATTTTTAACTAAATTATATCGAATAGAATTGACTTGAATGTGAAAAAAAAAATCATCATCATGTATACAATTTTATTACGATTGTGAGAACTCTGGTGCATGATTCTTTAAAACTTCTTCCAAACAATATACATGCTACATATTACCACTTAACTCTTTCGTAATTCTTTTTAAACAACACCTATTAAAAATAAATTAATTCATTAGAAAAAACCGAAAAAGTAGATGGAATCTTGAACAAAGATGCCAACCACATGTAAATCTAGAAGACAGCCAAATCCAACATCACAAGTGCAATTCCAGCCAAAGTTTGGAAAACTTCTCACCATGCCACCTTTCTTTATCCTTTTTGCTGTAAACCATTACTTCGTGTTAACTGCTTTTCGAATAATCATCAACTTCACCCAAATTTAACAAACATTCAATTTCTATTATATTTTTATTTATTTTGTTGATATATAATATTTTAGTTAACTATTTATGATTATATTATTAAAAGATAATAATGCTTTCACAAAATTCTTTTAAGAATATTTTAATGAGTCATTTTGTGAGTAATTTAAAATTATTCTATAATCAATAATAATAATTATTATAAAATTAACATAAATCAATAACAAATAATACGTAAATAATATTAAAATATTATAAAAAGATATTTTCCCAGTATCATTCTCATTATTAAAATATCAGTAGCAGATTTAATCAATCCTTCCTGTATTCAGTAACAGCAGCAGATTCTGCATGTACGCCACGTGGCAGAATCATAAAGCTTTGCTTATTTCGGTACAGTGTACTGATTTAGAAGGATTATGGAAGAGTCTAATGCCAATTTTTCTTTTCAATTGAAAAAAAATCGTTGCACTATATTATAACTAAATTAAATTTTCTTTTTTCAAAAAAATATACGCAGTTTATTTTAATTTTGGCTAGTGCGAAGAAATAATTTTTTTTTTATTTTTATATTTTTAAATGAATTTTTTTCTCTTCTTTCGTTTTATTTTTCTTGTGTCTTATCTGACAGAGTTTAAGTTTAAGTAAGAGTAACCGTAACAATTATTTTTGAAGTATTGAACTTTGTTAAAATGTTTTTAAAATTTGTTTTAATTAGAACTTGTGTGTTAGAACTCGACACCGCACAATGTTAGTTTTTAAAAGAAAAAAAAGCAATGTACCAGTAAGTAAAATTATTTTCTTCAAGTAATTGATTTTATGAAAGGATATTCAAATAGTTTCTCATTTTAATTACTTTTATGATGATTCTTTGCTGTTTATGAATATCTGGAACACTTACCATAAAAAAACCTAAAAGAATCAGTAATTATTTAATGAAACAAATTTAAACAAAGGTGCTTTATTTAATTGACTTGACTAATTTTAACGGAGGACGGGAGTAAGGGAAAAAAATAATGGAAAAGTGGGCATAAAATAAAAGGAAAATATCCGCGGTTTTGGAAAC


Gene Sequence:
>Vu_07470(-)
GGGATTTTGAGTATTGACTTGGCAAACGCTATAGTACTAACAATAAATGTAAATAAATAACGTTTGGTGATGTTCATAAGACGTCTCTCGGTGAAGTCAAGGTTGCTCTTCGCACAAACAGAACATTTCTTCTGCGTTTCCTTCAAACCTCTCCTTCATCCATTTTTCGCTCCAAACAATACAAACGCGGCAACCACACAAACCGTCTTTGCTTTGAATTCCGAAAGGTGGATTCTTCTCTTTCATGGCGCCGATTCCTGTTTCTGGGTTTTCCTCTCTTTGACTACTTCATGCACTGTTTCTTTTTTCTTTTTTCTACACGTTTTGCCGGTTACCCTTTTCTTATCATGTTGATGCCCGAACATCAAGACTGGGAAGTTTTATTTTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTCAACTCTGTCTCTTCTTGAACGATGAGATTGCAGAGTCCCTATGTAAGAAGGAGGTGACTGTATGTGTATTAAACCCAGAATTCTCTTAATCGCTTTGATTTTTCGCATGGTTATCGCTTTGTGGGGTTAGTTGTCTTTAAAGTAGTTGTTGCGGTAGTTGTCGTTGTTAGTATTATTATTATTCTTAATTGTTTTTTTGAGGGTGGGGGAACATATTTAAGGTAGTTCTGCATGTTTGTTTTTTTGTCTGGCCAGTTATCTTTTTGGGGTTTATAATTACAGGTAATAATGTGTTGATAGTATAGAGATATAAATATAAATAGTAGAAATAAGAAATTTTGTTCTTTTTGCTTCCGCAAGTTCGAGGATAATGGGATGCAACTATAACAGTAATTTTTTGGTGAAATGTTTTCTTCTTCTTTCTTTCCGTTTTGTCAAAGTGAAATTTGTTTTCACCGCATCTATTCATCGGGTATGATATAATTTGCTGCTATTGGTTTTGATTTGAGTGGATGGCTAATGAATTTTCTGAATTTTGATTTGTTTGTCGGTGCTCCTGTTTGCATTTTGACTAATTAGATGTAATTTGTTGTTCTGTCATGCATCAACAGATTAAATAGGAACTTGTTTCCTTTATGGTGTGCATCTTTTAAATGTCAATGTGAAAAGAAATAACCTTTTAAAGTCGAGAGGGGCTAGTTTTCTTGTCATCCCTTTGTGGTTCTGGAAGAGACTGAGTATTTTTCTTCTATTTTATTTTATTTTATCTTGATGCTACTGATTTACTTTCAAATGGCTTATTGGTTCATGTCTAAATTCTATTTCCTTGTTTTGTCTGAAGTGTTTTAATGCTGCAATTTATGTTTGTGTTCCTAGCTAGAACAATGAATGTTTGGTCATTAAGTTTCTGTCCAAAAAGGAAATGATATTTGATAAAAAAAATTTAGTTTATCAGAATAGCCGAAAAGGCGATTCCACCATGAGAGAGCTTCAAAATTCTCCAAGAAGTATGCGCAATAAAAATGTCTGCTATCTAGTACCCTTAAGACATCATATATAATATAGTGCCTTGAACTACCTAACAACATTTGCGTAGGTGATTCTTTTCTTTTGTTTACGTCTGGTGTTGTTTATCCTTAGGGGGAGTTGGTGTTGATAATATGTGCGTAGTCTTATTGTTACTTCTTGCAGTAACTTAACTGTTCAATTTGAAACTTACCTCCAGAATAGAGGATCATGGGTTGCTTTGGCTTCTGCACCGGAAATGATAGTGTTGCAATTGCTGACAGAGGACCTTTCATGCAAAACACTCCTACTGGTAATCCGCTATTTCCAGTTTTCTTTCCTTCTTTAAAATTTCTGTTTACAGTTCTATGTCTCATTGAATTTCCTACAAGTCATGGATTCGTTGTCATGATTTGAAATCCAAGGGTTCATGCTTTGAGTATACTGTCTGTTCACACTCTCATACAACAGTTTGAACTTGCTTCTCATTGACATTTCAAGTGTTATATTTATTTTTGTGCCATTTTCTAAATTTGGATATTCCAAAAGTAGCCTGTCCTAACTTTACATTTATCCTTTATTCAGTGTAGTTTAAGTGATTGTATTAATGGTATATTTGTTCCTGTTTGCACTTTAGTAAACCTGCTTTTATTTTAGTACCCCTTTTGTTTGGCTTTAATTTGGTTAGTACAATGCAGGGAACGCCAGTTATCATGGCAGACATAATGCAGTGCCTCCTCCTCGGCCGATAAATTTTCAACCTATTGCTGTCCCTTCCATTACAGTAGACGAATTGAAGTCTTTAACAGATAGTTTTGGCTCAAAATCTTTCATTGGTGAGGGTGCATATGGGAAAGTATATCAAGCTACATTGAAAACTGGGCGTGCAGTGGTAGTCAAGAAGTTAGATTCCAGTAATCAGCCAGAGCAAGAATTTCTTTCTCAGGTTTGGATCAATTGCTGTCGTAAATTTTCTAATGATAAAATCAGATTGTAAGACATCATTGCATCACATTCTACATAGCTGCGACTACGTTTTTATTCAGTACTTTGGGCTCCCAAATTGTGTAGGTCTCCATCGTATCAAGGCTAAAGCATGAAAATGTTGTTGAGCTTGTTAACTATTGCGTTGATGGTCCTTTCCGTGCCCTTTCCTACGAGTATGCTCCTAAAGGATCCCTTCATGATATTCTTCATGGTAGGCTATATCTTGTACTGTATCATCCCTTATTTTCTGCATGTTATACAGATATATTCAAAGTATCAAACTTTGATTAATTTAGTTTTAAATTAATTCTGGCTGATTTTTATAAAACCCAGTAACTCGTAACTTGTTTAGGAACTGTAATTTTGAAAACAATGCCATCCTTCTGAATGAGACTTGATGAAAATAGAATTATACTGTCAAGCACACGTTTTTATCCTCATGTTTGCCTACTAATGTTGTAACTTTTACTGATTGGATGAAACAGCATGAAAAGCTGTTCAAGTTTTTTTTTTTTTTTGCCTTTGACATTGAAGCTGCTTTATATCCCCTCCCCCCACTATTAGTGTCTTCATTTTTGTTAACGATTAATGATAACTGGTGTGTATAGGACGAAAAGGTGTCAAGGGTTCACAACCTGGTGAAGTGCTCTCATGGGCTCAGAGAGTTAAAATTGCTGTTGGAGCAGCCAGGGGACTTGAATATCTTCATGAAAAGGCAGAGATTCACATAATCCATCGTTACATTAAGTCTAGTAACATACTTCTTTTTGACGATGACGTTGCAAAGATTGCTGATTTTGATTTGTCAAATCAAGCCCCTGATGCAGCTGCACGTCTTCATTCTACCCGTGTTCTTGGGACTTTTGGTTATCATGCTCCTGAGTAAGTTATTCCCGGAAGCCTAATCTACTTGTTTGAGTGCATGCTTTCTTCTTCACATACTGTTAAATAAAATAACTTCTGCTTTAGTTAGAAGATATAAAAGTAGATAAGAAGAACATGAAAATCATAATTAAGAAAACGTAAAACTGATCTGTGGCTTTCAAATTGTGGCTTTTTAGAACTTATTGGGCTTGTTCTTTTCTTATGGCAGATATGCAATGACGGGACAACTCACTTCAAAAAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTTATACTGCTAGAACTCTTAACCGGGCGTAAACCAGTTGATCACACACTGCCCCGAGGACAGCAAAGCCTTGTCACCTGGGTAACTTTTGTGTTCTGTTAATGTTACTGTGGTATTTTCTTCCCCTTTCAAATTTGGATTTTGCACATTTTGTGATTCTTGTTCGTTCTGTTTTATCAGGCAACACCGAAGCTCAGTGAAGATAAGGTGAAGCAGTGTGTTGATGTTAGACTAAAGGGAGAGTTCCCTTCAAAGTCAGTTGCAAAGGTAATTAGATTATATTCTCTGTTGTCTTCTGGTCAAACAGTGATATTCCAAAACACTTGCTTTTGCACATTTTGCTGCAAACCTTTTATTCTATTCTGAACAAGCTTGAAAGAAATATATGCCACTCTCAACTTTTTGTCCATATAAAAATATGTGAATGGATTTTCATTTCATCTAAAATGTTGCTTTGATATTTTGCAAAAGATGGCTGCTGTTGCTGCACTGTGTGTACAGTATGAAGCTGAGTTTCGGCCAAACATGAGCATTATAGTGAAAGCTTTGCAGCCTCTACTGAATACTCGTTCTACTCACGCAAAGGAATCACCAAACATGTAATTTCCAGAATCATTCATTCCTTCTTTCAGATGGCAGATTGCGTTGACCAGTTGTCCTTGTGACAGGTGTCAGTGATTACTCGTTTTGAGGCATACAGTAGTAATGTCCCACTTGTGTTATTATATTTGTGGCTCAACTAAACGATGATGCTATATAAATAGTGATGTAGGTGACAAGATCCTATCATAGATAGTTCCGTTTATGGCTTTTTGAAGGTTTTATTTTTGTTTGTTGTTCGGTTTCCTTTTCTACAAGCCATGTAAAAGTGAATATATATTACTTTTCATGGACAACGCATGATGTCTCCTTGAATTATAATTTTCATGGGAATCTAGAGCATCTTTATTTTTTCCTTTTCG