Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07442 LG1 105875462 105879708 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 47 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 105875633 intron_variant
A/T 105875653 intron_variant
T/G 105875656 intron_variant
T/C 105875657 intron_variant
A/G 105875675 intron_variant
T/G 105875719 intron_variant
C/G 105875916 intron_variant
A/G 105876123 intron_variant
T/A 105876837 intron_variant
A/C 105876853 intron_variant
C/T 105876923 intron_variant
A/G 105877009 intron_variant
G/A 105877011 intron_variant
A/G 105877035 intron_variant
G/A 105877056 intron_variant
G/T 105877166 intron_variant
C/A 105877207 intron_variant
A/G 105877382 intron_variant
T/A 105877401 intron_variant
T/G 105877525 intron_variant
C/T 105877625 intron_variant
C/T 105877673 intron_variant
G/C 105878103 downstream_gene_variant
T/C 105878118 downstream_gene_variant
T/C 105878152 downstream_gene_variant
T/C 105878244 downstream_gene_variant
T/C 105878270 downstream_gene_variant
G/A 105878273 downstream_gene_variant
G/C 105878294 downstream_gene_variant
G/T 105878296 downstream_gene_variant
C/T 105878506 downstream_gene_variant
T/C 105878532 downstream_gene_variant
T/A 105878893 downstream_gene_variant
A/C 105878921 downstream_gene_variant
T/G 105879000 downstream_gene_variant
G/C 105879155 downstream_gene_variant
A/G 105879414 synonymous_variant p.Ser267Ser
C/A 105879452 missense_variant p.Thr280Asn
A/C 105879474 synonymous_variant p.Pro287Pro
C/T 105879531 synonymous_variant p.Tyr306Tyr
C/G 105879671 missense_variant p.Ala353Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07442.1
MEDKVAFKNLLQDQKKACVSSTDALNWTQEPSIRNTLGSTLLGLSLNNSELPQNLEQDPLNQLGLLQVELEEVKKENQNLRSMLHEISEHYAALQNQLLLVMQQKKLSSSPNHEDMQKDSRQDDVKKPWLFLHTAKMNNQVTPEEAKIIEDQAFEASCKKARVSVRAPSSESLGDGCQWRKYGQKISKGNPCPRAYYRCNMGTSCPVRKQVQRCASDESVVITTYEGTHNHSLPPPARSMASTTSAALTMFLSGSTTSSASTYYPSASSCPTVTLDLTQPTKNYLKFPTSNHSQTFPLSINAYPHKYEGLPSEKDLSLVDVLSAAITRDPSLRAALEAAVSSMIADSQNINNHAQLSRSHYDPSS*


CDS Sequence:
>Vu_07442.1
ATGGAGGACAAAGTTGCATTCAAAAATTTGCTGCAAGATCAGAAAAAGGCATGTGTTAGTAGCACAGATGCACTCAACTGGACTCAGGAACCATCCATTAGAAACACTCTAGGATCTACTCTTCTCGGTTTGAGTCTCAATAACTCGGAGCTTCCCCAAAATCTTGAGCAAGATCCTCTGAACCAACTGGGATTGTTGCAAGTTGAGCTGGAGGAGGTGAAGAAGGAGAATCAAAATTTAAGGTCGATGCTTCATGAGATCAGTGAACACTACGCTGCTCTTCAGAATCAGTTATTATTGGTGATGCAGCAAAAGAAACTCTCTTCGTCTCCGAATCATGAGGACATGCAGAAGGATAGCAGGCAAGATGACGTGAAGAAGCCATGGCTGTTCTTACACACTGCTAAAATGAATAACCAAGTAACACCAGAAGAAGCAAAAATCATAGAAGATCAGGCATTTGAGGCTTCTTGCAAGAAAGCTAGAGTATCTGTAAGAGCACCGTCATCAGAATCTTTGGGTGATGGGTGTCAATGGAGAAAATATGGACAAAAGATATCAAAGGGTAACCCTTGTCCACGGGCCTACTATCGTTGCAACATGGGAACATCATGTCCAGTTCGCAAACAGGTTCAAAGGTGTGCTTCCGATGAAAGTGTTGTGATCACAACCTACGAGGGGACTCATAATCATTCACTCCCTCCACCAGCCAGATCCATGGCTTCCACAACATCAGCAGCACTCACCATGTTCCTTTCTGGCTCGACCACCAGTTCAGCTTCTACCTACTATCCATCTGCATCATCTTGTCCCACTGTAACACTTGACTTAACCCAGCCCACTAAGAACTACCTCAAATTCCCAACTTCAAACCATTCTCAAACTTTCCCTCTTTCAATCAATGCCTACCCTCACAAGTACGAAGGATTACCTTCAGAGAAAGACCTTTCCTTGGTCGATGTTCTTAGTGCTGCCATCACTAGGGATCCTTCTCTTAGGGCAGCCTTAGAAGCAGCCGTTTCCTCTATGATTGCAGATTCTCAGAACATCAACAACCATGCCCAGCTTAGTAGGAGTCATTATGACCCTTCTTCTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_07442::LG1:105873462-105875462(+)
TTTATGTCTGTAGTTGAATTTTTTATAACATATATTCATACATTAAATAATTTTTGTTCACACAATCATTCAATCATTATAATATTAAAAATTTAAAAATTAACAATCAGTTTCATCATCATTTCTTCATTCAATATTTATCATTTTCCTTTTCAGGGTTATTAGATTTAACATTAGAAGAATTCCCCTCCTCTTCTCTTCCACATTCACCAACATCATCATCAAAATCACAAAATTCATGCTTCCAAGTGGAAGTACAAATTATTGCTTCAACATTCTTTGGAAATAAATGACTTTTATACTTATTCAAAATCCTTGAATCAATACTGAAAGCAGATTCAGATGTAATTGTTGGCCAGGTCGAGACTGAGTTTCTTACACTTAGGTATTTTTTTTAATGATGTTGAACTATCAAGCTGTCAGACTGGACTACCGAACTCGACAAATGAGTTCTTACATTTAACTCCTTTTAATAATGTCAGATTATCGGACTAGACGAGACGAGTTATGTCAGATGAAAGAGATTATTCTAATCTATTCTTTTTGGTCGGACGATTGACTTCACATGACTCCATCTTTATTTTTTTCTAATTTTTTTGCATTTGTAAATTATTCTTTTCACATACTTTTACTATAGCGTTAATTAAGTTTAAAGTGTATCATAAGATTGAATGTTCTTAATTAAATCTCTGCCGAGAATTTTTGTGCACAGTTGAACATTTAACTTTTTTACATTTTTTTTTTCGTTAGATTTGGTGACTATTCAAAGTAATGTGACTCATTTTCCATTCTATTGTCATTGTTTAACTGTCTTGATATGAAAAATCAAACAAAACAACTTAATTAAAGTCTAAGTCTTTCATAAATTTAAATGAAAGTATCTATTAAAACTTTTATTTTACTATGTTAAAATTAGTGACATATAAGTTAAGCTAGCCTAATTAATAGATAAATATAGTAATAATAATTCAATTGAAAAATATCAAATTTTCATATACTCAATAATAAAACCTTTTATTAGAAATTTAGTTTAAAATAAAATACACTTAAATTAATTAAGTATTTATTTTATACTAATTCATTGTATAACTAAAATTCTTACCTTTTTAAAATAATAATACGTTAACAGTATATATAACTGAAAAACTCTAATTTATCTTAAAATTTTGAATGAAAAGTAATTTTATTTTATATTAATTTAAGTTTTATTGATGAATATTTTCCTAACTCTTTGTTCGAATTACCACCATTCTTACTCAATGAAATAATAAAACCGCTTGCCTACTATAAATTACAAAAATAAAAATAAAAATAACACGTATTTGGGAAGAAAAAATATAGCAAGAAATCCATTGGCATGCCAATAATAGTCCCCTTGTCTAGTGGAGACAACTTTAATTTTTCAGAAAATAATCGATAATATCGTAAGCTATGGAAATCTTATATATATATATATATATATATATAGAAAAAGTATTAGCCAGAGAAATATTATCTGTATAACAACACAAAAAAGGTGCACAAGTAAATAATAAATAATTTTTCAAAAAATATTAATTTATTTAATGGTAATATGGTGACCGTATCTCACATTTTCACACCAAGTTTTTTCACGTTTGCTTTAAAAAATGATATTGTAAAACAATAAAATACCATCTTCGATATAACTTTTAAGATAGTTATTACAAAAGTTGATTTTAGAAATTAAATCAAAGAAAAGTGTCACTATCTTTTCTCCCCACCACTTAGACAAGGTCACTTGTATATTTTATGTGGAAAAATTCTCTGATATAATAAGCAGACTTTCATACTTAACAAAGACTATGGTGACCAGAAAGAGGGAGTCTTAGTTTATATATATATATATAGACACACACACACGGAGGTTGCATCGACTGTATATCAATCTTTGCTTCATAACTGAGATTCCAATACTGATATCTGCAACTGAAACCATAACAACCCAGAAACAGCAGCTATATATGCATATCTGATATAAA


Gene Sequence:
>Vu_07442(+)
ATGGAGGACAAAGTTGCATTCAAAAATTTGCTGCAAGATCAGAAAAAGGCATGTGTTAGTAGCACAGATGCACTCAACTGGACTCAGGAACCATCCATTAGAAACACTGTAAGTTAATTACCTATTTTTTTCTTGCACTTCACCTTTATCTCTACCTATTCTTTACATCTTTTTTTTTTCTGTTTTCATTTATATTCAAGATATAATTAATTTATATTAGCTGATAATTTGTTTTGAAAGCTAAATTATCATGATCTTAATTACACGAGTATATATATACCATGTTTGTGAATTGTGCAGCTAGGATCTACTCTTCTCGGTTTGAGTCTCAATAACTCGGAGCTTCCCCAAAATCTTGAGCAAGATCCTCTGAACCAAGTGGGTAATCTTTGACGAGTTAAATCGATCTGCAAAAACTGCATGAATTTTTTGACTGATGCTCCCTGTGTTGGGTCTTTTCCTTGACTGGTTTTTAGCTGGGATTGTTGCAAGTTGAGCTGGAGGAGGTGAAGAAGGAGAATCAAAATTTAAGGTCGATGCTTCATGAGATCAGTGAACACTACGCTGCTCTTCAGAATCAGTTATTATTGGTGATGCAGCAAAAGAAACTCTCTTCGTCTCCGAATCATGAGGACATGCAGGCAAGTTTGACTATGAATTTATTTAATATATGCTTATTTGACTGATACTTCGTTTTGTTATGAAAATTAATTACATAACTGTTTGCTCACTCAAAACCATAGGACTAATAAGACTAGCAGCAGCACAAAATATATTCATAGGTAACATAAATTAAGTTCTTCTTTCTAATTATTAACATCACATGTATTATTGATCGATTAATCTCCAAATACATATCAATAGTTAATTAAAATTTGTATACTCTTCTAGCTCATTTTAAAAGAAATTGATTAAAACCATAAACCATTTTTTCTATGTCTCTAGAAGGATAGCAGGCAAGATGACGTGAAGAAGCCATGGCTGTTCTTACACACTGGTAAGGTACCCTTCAGAAAGTATTAATTACTTGTGTTGAACAAAGGCAAAAACCTGAAATATATATATAATTACGATGTTGAAGCTAAAATGAATAACCAAGTAACACCAGAAGAAGCAAAAATCATAGAAGATCAGGCATTTGAGGCTTCTTGCAAGAAAGCTAGAGTATCTGTAAGAGCACCGTCATCAGAATCTTTGGTATGTATGCATTTCTATCTTATTTTTGTAGAATTTTATTTTATAAATTTGATTGCTAATTCTCATAAAATCTATCATTTTATGCATTGATTTCATCCGAATGTAACATGAAAAGATTGGGATAATTGATTAGAAGAGGTGTATTGAGAAACATAAATCAACATTTGTAAATCTTACATGACTATAATCAATTTAAAATATACAAATGAGTATAATCAATTTAAAATATATAAATGAATGCAAATTTTATCTTATAATACAATTCTGTGAAGTTAAATTTAAAATCTACTTTTTAACATGACATAATATTTATTCTCCTTTTTATATCTAAGTTAAAAAAAATAGTATTTATGAATATAATTACAAAATTATTAAAATGTATCTTTTATAAAGTACTGTATTAATAAGTTTTATTTTTTTTTAATAATTAATCTTATTCGGTTTACAAACTACTTTTATAATATTAGATTAGATTAAATTTAAAGTTTATCTTTTAACATGGTTTCAGATGAGTAATTGTTAGAGTCTAAATTTAACGAGAAAAAATCCTTTAAAAGGAAAGTAAAATTTCTTTTGTATTTAAAAATATTTATAAATATAAAATAAAAAATTATTAAATTAAATTAAAAAGTCTTTTTTTTTTAAATAATTGGTTTTCACTCACGAGAGAGAGAACATTCTTATAACATGTTCTCCTTCTTTTTATCTTTATTTTTAGAAAAAAGAATATGTATTAAAAAATTAAAATAATATTTTTATTTTGATTCAATAAAATCACCACCAATAATAAATTTGTTGATTTTTATTAGAATAATTAAATATTTTTTATCCTTTAACTTTAAGTGAAAATTAGAATTAGTCATTTTTTGAAACTTTAACCAAATTTAGTTTCTCAACTTTGTAATGTATAAATTTAGTCATTTTAACCAAATTTTATTAAGTTTATTTAATGTTTGAAATGTATTTCATAATAGCATTTGAGTTGTTTACATTGTTTGACAAATTTTTTTTCTTCAATATTAATTGAAAAATGCATTTGAAACCTAAAAAAAAATTAATAAAATTTACGTTCTTCTAAAAATGGGGATTAAATTAGTCTAAAATTTTAAAAATGGACTAATTTCAATTTTTACTGAAACTTAAAAAATTAAAAATATATTTAACTCTTATTATAATTATATTAAAATTTAATGTATTTTCTTCTTAATTCATACTCTTTTACTTTAGACAGGCTAAGTGTAATTCATTTATAATATATAAATTTAAAACATGGGATAATGTTACAACTTTTTTGAAGGCAAATATTAAAAATTATTGGAAAGAAAATTGCCGACAACCATGTTGCATTTTTGTTGATCATTCAACATAACACTTTTCATTTCAAATGCAATGATTAAATTCCTGTTTAGTTTAGTTAAATTCTATTGGAAATTCAAGTGTGAGTGGTTGGGAATGTATCTGTGGGAAAGTGTATCTATGTAGAAGGGACTCACTCTTGAAGGAGAGATTATTAGAATCCAATTGTGAGTCTAAGTCCTACATTGGATAAAAATGAGAAAGTAAAACAATATATAAAGGTGAAAGATCCATAGTGTCAATCCGTTATATGGTTGGGCGTGGAAGGGACTCACTCTTGAGGGAGAGATTGTTGAAAATCCAAATGTGAGTCTAAATCCCACATTAGATAGAAAAAAGAAAGTAGAACAATATATAAAAGTGAAAGACTCATTAATCCATAACATTGGATAAAAAGTTATCTCATTGGTGTTTATGTCTCCTCAATGAACTTCTCGTCAATAGACCTGACAAAACCTTCAATATTCTTCATTGTGATAAGATGTTTTCATCATTACTGTCTCTCAATAATATAAAATCAAGATAAAAGAAAAATATAGAAAATGAAGAGTTATTTTAATTTTTGTCTATAGATTTGTTTTATTGAAGCAAAATTAAGTGTGGGTTGTTTAAGAAAGATAATTAATTACATTCATATTTTATATTTTTTAAATGTGGAAAGCAACTCCATCCAAAATGTCCTAATTAACATATATATGACTTAATTTTCATGGGAGAAACTAAAAATTAACTTGATCAAAAGCTCAACAATCATGCTAGTTTTTCGGTTCTCAACAAGAAAAAAGAAAAGGTAAATAAAAAAAGGCATTGATCTATTGCTGATATTAATTTACTTTTAAAGCCATGAAGTGAGTAAGGGTGATTTCATTATCTCCAATTAACCCAAAGAGCTAAAATTTAATTTTTATTTTAAGTTTTATAAAAATTTGATGCAACCAATAAAAATAAAATATGACATTGAATAAAGCATATATAGATATATGTATATAACTATGCATTGACATGTTATTGTTAGAAGGGTGATGGGTGTCAATGGAGAAAATATGGACAAAAGATATCAAAGGGTAACCCTTGTCCACGGGCCTACTATCGTTGCAACATGGGAACATCATGTCCAGTTCGCAAACAGGTTTACATTCTGATTAAGATTTGAATATATTACCTTCTTATTTGCTACCAAATACATGCATTTTCATTGTCCAACGTTGTTATTTACTTGGAAACAGGTTCAAAGGTGTGCTTCCGATGAAAGTGTTGTGATCACAACCTACGAGGGGACTCATAATCATTCACTCCCTCCACCAGCCAGATCCATGGCTTCCACAACATCAGCAGCACTCACCATGTTCCTTTCTGGCTCGACCACCAGTTCAGCTTCTACCTACTATCCATCTGCATCATCTTGTCCCACTGTAACACTTGACTTAACCCAGCCCACTAAGAACTACCTCAAATTCCCAACTTCAAACCATTCTCAAACTTTCCCTCTTTCAATCAATGCCTACCCTCACAAGTACGAAGGATTACCTTCAGAGAAAGACCTTTCCTTGGTCGATGTTCTTAGTGCTGCCATCACTAGGGATCCTTCTCTTAGGGCAGCCTTAGAAGCAGCCGTTTCCTCTATGATTGCAGATTCTCAGAACATCAACAACCATGCCCAGCTTAGTAGGAGTCATTATGACCCTTCTTCTTAG