Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_07349 LG1 104914037 104917732 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 104914583 missense_variant p.Lys136Met
T/A 104914620 missense_variant p.Arg124Trp
G/T 104914776 intron_variant
T/A,* 104914957 missense_variant p.Gln58Leu
G/A 104914958 stop_gained p.Gln58*
G/T 104914959 synonymous_variant p.Pro57Pro
C/T 104915011 intron_variant
A/T 104915390 intron_variant
G/T 104915391 intron_variant
C/A 104915996 downstream_gene_variant
A/T 104916110 downstream_gene_variant
T/A 104916455 downstream_gene_variant
G/A 104916533 downstream_gene_variant
T/C 104916536 downstream_gene_variant
A/T 104916539 downstream_gene_variant
A/G 104916558 downstream_gene_variant
G/T 104916693 downstream_gene_variant
T/A 104916694 downstream_gene_variant
T/A 104916698 downstream_gene_variant
C/T 104916699 downstream_gene_variant
A/T 104916713 downstream_gene_variant
T/C 104916762 downstream_gene_variant
G/T 104916774 downstream_gene_variant
C/T 104916831 downstream_gene_variant
A/C 104916952 downstream_gene_variant
A/G 104917287 downstream_gene_variant
A/C 104917289 downstream_gene_variant
G/A 104917330 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_07349.1
MKPFFLSNHPDTTMYNCSQVDFSHSMAHTPYPCGDPYFASSIVAYGPQAINQPQIIPQMLGLASTRIALPVELAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALKRVRGSGGRFLSAKQLQESNAEHVDNNSHSGQKKDASEVESHNSRTAENASITFTAISGLTTMSSNSLNFRQPEHNFLGNSSNMGGSSQCSGGLTFGGGTRQCASVGR*


CDS Sequence:
>Vu_07349.1
ATGAAGCCATTCTTCTTGTCGAATCATCCTGATACTACTATGTACAATTGTTCACAAGTTGATTTCAGTCATTCAATGGCCCATACTCCTTACCCTTGTGGTGATCCTTATTTTGCCAGTTCAATAGTTGCTTATGGACCACAGGCTATTAATCAACCACAAATAATACCCCAGATGCTGGGATTAGCATCCACCAGAATTGCATTACCTGTTGAGCTTGCAGAAGATGGTCCCATTTATGTCAATGCTAAACAATATCATGGTATACTCAGAAGGCGACAGTCCCGAGCAAAGCTTGAGGCTCAAAACAAACTCATCAAAAGTCGTAAGCCATATCTCCATGAATCTCGGCACCGTCACGCATTGAAGAGGGTTAGGGGGTCTGGTGGACGCTTTCTCAGCGCCAAGCAGCTGCAGGAGTCTAATGCAGAACATGTTGATAATAATAGCCATTCAGGCCAAAAGAAAGATGCATCAGAGGTGGAAAGTCATAACTCAAGGACAGCAGAAAATGCATCTATCACATTTACAGCCATCTCTGGCTTAACAACCATGTCTAGTAACAGTCTGAATTTCAGGCAGCCCGAACACAACTTCTTGGGGAACTCCTCTAACATGGGTGGATCATCACAATGCAGTGGTGGACTCACGTTTGGTGGTGGAACTCGGCAATGTGCTTCTGTTGGCCGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_07349::LG1:104917732-104919732(-)
ATTTCTTTATTTTCTTCTATATCAACTTTTTTTTAGCAAATATTGATCAATTTGTTTGACATCAATACAAATATTGACAATTTTTATAGTATTCCATTGCTCCACAAATAAATTACTACCACTAATATATTTTATTTTGTCTTAATTAAGCTTTACGACTCATAAATCAAGAAAATACATCACATCATACTCCACACGAAAAAAAAACACAATTTTTCTAAAATCTATTCCTCCTTTTCGGTTAGCTGGCTTTCCCATCACAACAATGTCAATCTCTGTCCAGTTATGGCTAACCAAGAATCATTTCCCTCTGCCAGATCAGGTAAAAGTATGAATCACTTATCCTCCATATTTTACTTTTTTTATTACATCACTCTTTCTTTATACATGTGGCTTATATCTTTGGATTCTCTCGTATTTATCCTATATTTTGAAAAGAAAGTTAACTTTACTTTTTGCATTAATGTTTTTTTTTTCTCACATAAGAAACGAAACAAAACAAAAACGAAAATAATTCGCTACATTGCATGATATTTTGGTCGTACGTTGTTGTTGGTCTAAATTATCTAATTCCCTTCTACCGACATTCTAGCACTTAGTTTTCCTTGTTTCCAAAGAACAGAGAAACTTTAGAATAGATTCTGTTTTAGAGTGTGAAACCTTATCCACAACCAATTCATTTTTTTATTTATTTAGAAGATAACTCAATGAGAAGTGAGAGCGTGGAAAAGGTGGCGCCACCGAATGTTAACCTTTTGTTATTAAAATAATAAACATCCATTAGGATAGACTTCGTCTCCCTAATATAACATTTCTTTCTCCTTTTTAGGATAAGCTTAATCTACCATACCCATATATTAATTAATTATACTATGTCTTTCAAGTTTCAACAAAATTAATAATAAATTACCGTGTGGCATCCAATAATGACCCCTTTCATCATTAACCAAGCATTAAAAAAATTAAAAAATACCAAAAGTTATGTTTACCGGAATTAAAGAATCACGCACACAAAGGTGGCAAATTAGGGATTTATTATCATCATTTACAATAGTCAGATGAAAATGGTGGAACACTTTCAAGCTAAAATCGATAACTCTATCTATTTCCTATACAGAATAAAGCAAGTTTATTGCTGAAGTACCTTATATTTATTATGTATCGTACTAACTAAATTCTATAATAAATATAATCATTATATTTACAGGTGTACTACCTTTCATGTTACATAAATTCATATTTATTTTTCATGATAATCTATTTACATACTGTTGCAAAATATACTTATATATTTGTTGAATATGTTTACGTTTTTTTTAAAATAATTTAATAACAATTTCATGTATAAACGGCCGAATTAATTTATTAAGTGAATAATGAAAAATTATGCATTTTTTTTAAAAAAACTTATGCTAAAATATAGCCTAATTAAATATTTTATTAATCAACGATAGTTATTAAATGAATTTACCTTCTAAAGTTTTTCATATTTTATCATAAATTTTTTTAAAAATTTATTCGTTTTCCTATTATGTTTGTAATAGAAGCATGTGGCTCGAACAATATGCGATAAACTACATTGTATTTTAGGTATAATGGAAAGTATGACATTAAGTTCAATAAAGGTGAGAAATAAAGAAAATTCAATGTTTGATATTATTTGGTGCAATGAACGGATGTTAAATAGTGTAAGTTAAATTAGAGTGTTAAAGATGAGTAAGAAACTTGGGATATACTTTTGGGATTGAAAAGGAACGCGCGGAGTAGAGCGTGGACTTAGTTGTTCGTTGGAGTAGGACAGGTGGAGCGCGTGAGGGAGGAGGTGGAACATGTGCGCGTGAGGGAAAGTATGAGGAACAGTGAAGGGCGGCTGAGAGGTGAGTGCCGAAGAAGAAGGCCCAAGGCCCAAGGATTGAGGAAGGGTGTGGGTGGGCCAACTGAGAGAAGGAAACATAAGAGAGTGTGTATTTATGGAGGCTGTGTTCTGTATTCTTCTTCTT


Gene Sequence:
>Vu_07349(-)
CAACAAACAACAAACAACAAATCCAAGAAAGAAAAGAGGATTGGAGAGAAGGCCTCAACTGTGAAAGGGTTTCCACAGAGGAGACATGCCCGATTTCTACCGACAATTCTATTTCTCTTTGCTTCACCTTACCAGATCCCAAAGGTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTGTAACTGTTTCTTTCTCTTATTTATTCTGCCTTATCCTGTCTCCACCAGCCACCTTTTTCGTTGCTTCCTTCCTTCTAACCTTCTTCTTATGGAATTTCCTTTATTTTTTTTTGTGGGATCCTAGTGGGGATTTCAAGTTTGCTCTTTTACTTTTGCATGTGGAGTTTGAGGTCAGCTTTTGTTGTTAAGGTCACTGCTCAGTGCTCACAAGTTTCTTTGAACTAGATCCGGGCTACAGTTTATACTGTTTTTACTTCTTATGTGTTTGCTCTGAAAGAGTCAACTGACACAAAATTGTTGAGCTGTGATATGTTTCTTTTGTTTTTGTTTTTACTATTGCTTTCTCTGTTGTCTGGATTATAATGTGATCCAGCGATTTTGGACTCTCTTGTTATGTATGCTTCTTTGGGTTTGTTTGTCTCGGATTATAACAAAATGGTCTCTTTTTTTATAAATGCATTTGCATGATTTAGATTCTGATGTGGTATTTCAGAACAAAAATGCCCCATACCCAGAGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTATCTCTTTTCTGTAGGTAGGGTGTAAACGGGTCAGGTTGGGTCCAATTTCGCTAATTTCATTTTCCAAACTGATCAAATAGCGTCGGGATTGTTCGTTTTCTTTTTCTGTCAAATCCCACTGGAATCAACATGTGGACGATAGGTTGTGGGCAATCAGTCTATTATATATGTATATAAACACAAAACTTAAATTTTGTTTTGGATTAAAAATAATAAATGGATGTGAAGATATTTATATATAAATAATAATTAAGAAGTACATCAACTAGTTTGCTCAATTGCCATTGGGTTGACGGGTTAAAAATAAAAGCTCTTACCTTACCTGAACAAGAAAGGCATTGTGTTTGAATGGATCGGGTTGGATCCGACCCTTCGCAACTCTTTTACACCCAAATCAATTTGTTTGGACCGGGTCGAGTCGGTTTGGGTGCAGGTTACCCGGCCCTGTGAATACTCATACCCTTTTTAGTTTCAGAAGGATATATTTCATATAATGTACGTTGTGTGGGACTACTAAACTGTATCTGTTGAATTGTACTTCCTTTTTGTCCAAGATCAAGACTAAGAGGTGGAGACTGAAAGTTTTTGAAGTTGCGCATGCTATACTACGTAATAATACTTATATATCGGTGTCATTATGTGGCTCTTTGTATTCTATATGCCTCTGTAAATAAGGATGTTCTTTGAGATTTCTTAATTGTTTGCTTAACATGATTTTGTAGGATATGATTGAAGGTTTTGAGAACTAAGGCTGCAATACTGTATACATTCTACACAAGTAATGGTAAGTTATATTTCGTTCTATAAACTTTTTGTTTAGAATTATCCATTTTTTAATAGTCTGATATAAATTGTGAAATACCTACCATGGCTGTAACAGTATTATTAATAAATTTGATTTAAGAAAATGCAGGAATAAAGTAGTTATGACAATGGTGTAATGTAATAATTTATTAGGGAGGTGTCTTTAGTGGCAGTGGTGGTAATAAAGTGTGGGTATAATTGATATTTTGTTAGAGACTTAGGGATTTGGAGAACTATCTTGAAATGTGAATAGTCCATGGTAGAGATGGGAATCCCAACTCCCACTTGTCTTGGGAATCAATGTAGATTATTTTTCAAATAGACAAAATGGGCACCTTAGATTTATTAACATGATAAGTTGTAGAAAATACTTGGGCAAATAAAATATCTCCTAAAATTTTATAATAGTTTGTCTTACTTTGGTTAAAGTAGTGAGTTTTCCATTCAAATGAGTAGAAGTTCTACCTGATAATTGAGAATGGAAAGATCAAGTTCTATGGTATGCACTGTAAGGTTCATTTGTACTCTGATGATTCGGATTTATTACACATATGATAAGTTACTTTTCTCTTTTTGGGAAACTTGCCGATTTGAGATTAAAATATATTCTTTTTTTGTTCTTCTCAAGTGTTGCCTTGTTATCTTGCTTTAGAAGTGTAAATATGTTGTTTCCCATGCGTTTGTTCCTCTAATGTGTATCATGCATTATACATGCATTATACTTGCACGTTCTTTTGTAGAATTTGATATTCCTTGCCTTACCTTTAAACCACTCAAACTTGAAACCATTGCTCTTTCAGTTCAAGATCTGGGAATTTGCCATGTGGAAGGTTAAATGAAGCCATTCTTCTTGTCGAATCATCCTGATACTACTATGTACAATTGTTCACAAGTTGATTTCAGTCATTCAATGGTATGTGAAGCTACTGTTTATGGATTTTCTGCTTCAAGTTCCAGTTATCAACAAGCTATTTCTCTCTCTCTCTCTTTTCAGGCCCATACTCCTTACCCTTGTGGTGATCCTTATTTTGCCAGTTCAATAGTTGCTTATGGACCACAGGCTATTGTAAGTTTCCTCAAGTACACTTTATAATGCATGATCTTCATTCAGATGAGGTTTTAGTACATTTTTCTTTCGTAGCATAACAATTTAATATGATGTCTATTAGAATCAACCACAAATAATACCCCAGATGCTGGGATTAGCATCCACCAGAATTGCATTACCTGTTGAGCTTGCAGAAGATGGTCCCATTTATGTCAATGCTAAACAATATCATGGTATACTCAGAAGGCGACAGTCCCGAGCAAAGCTTGAGGCTCAAAACAAACTCATCAAAAGTCGTAAGGTATGCTGCAGAACTACTTCCACCTCTTCCTGTATATTACCATACATTATTTTGTGGTTTTTATGGAGAATGTCAAGTCATATGACAAAACTGTACCTCTTTTTTTGACTAAAAAAATGTTTGCCAATGGACTGCTGCAGCCATATCTCCATGAATCTCGGCACCGTCACGCATTGAAGAGGGTTAGGGGGTCTGGTGGACGCTTTCTCAGCGCCAAGCAGCTGCAGGAGTCTAATGCAGAACATGTTGATAATAATAGCCATTCAGGCCAAAAGAAAGATGCATCAGAGGTGGAAAGTCATAACTCAAGGACAGCAGAAAATGCATCTATCACATTTACAGCCATCTCTGGCTTAACAACCATGTCTAGTAACAGTCTGAATTTCAGGCAGCCCGAACACAACTTCTTGGGGAACTCCTCTAACATGGGTGGATCATCACAATGCAGTGGTGGACTCACGTTTGGTGGTGGAACTCGGCAATGTGCTTCTGTTGGCCGGTGAGAGAGGTGGAACTGAATAAAAGATCAAGTTCACTGGTCTGGCAAATCATCCTTGGCTTATTCACTTTACTTTCCGAGTTTCATGTACTACAGATATGTTGTCTTCTCTTCTGGAACGCTCTGCATTAGCATTCACACCTTTGCTACTGCTTTTGCCATGTATTTAAAGTTTCTACTGCTTCTGTTTGCTTCTGTTGTTGGACTAGGTCTCAAAGTTTGTGCTTGAAAATACAACTTTTTATCTTTCTCCATTCATTCCCC