Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06990 LG1 100967109 100970354 PREDICTED: probable receptor-like protein kinase At5g15080 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   pattern recognition receptor signaling pathway, lipopolysaccharide-mediated signaling pathway, lipopolysaccharide-mediated signaling pathway, protein phosphorylation, cell surface receptor signaling pathway, lipopolysaccharide-mediated signaling pathway, protein phosphorylation, lipopolysaccharide-mediated signaling pathway, protein phosphorylation, meristem maintenance, lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
Cellular Component   located in   nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06990.1
MKVVSMETEKKCGCWAVLKRGVRGACKPSASRDSANTIPRTSLVYDAASETRYLNASNRELCPPLEARLSSDNPDPPPQENKAACQLLQFSFQELKAATGNFRPDSILGEGGFGYVFKGWIEEDGTSPAKPGSGITVAVKSLKPDGLQGHREWVAEVDFLGQLHHSNLVKLIGYCIEDDQRLLVYEFMTRGSLENHLFRRTVPLPWPNRVKIALGAAKGLAFLHNGPEPVIYRDFKTSNILLDTEYNAKLSDFGLAKAGPQGDKTHVSTRVVGTYGYAAPEYVMTGHLTAKSDVYSFGVVLLEILTGRRSMDKKRPSGEQNLVSWARPYLADKRKLYQLVDPRLELNYSLKGVQKISQLAYSCLSRDPKSRPNMDEVVKALTPLQGLNDLAILSYHSRLSQQGRRKKKDGTPHITYTQSKSMRASPLNTSKQHR*


CDS Sequence:
>Vu_06990.1
ATGAAAGTTGTGAGCATGGAGACAGAGAAGAAGTGCGGTTGCTGGGCTGTCCTTAAACGCGGTGTTAGAGGTGCGTGCAAACCTTCAGCTTCCAGAGACTCTGCTAACACTATCCCTCGTACTAGTCTCGTTTATGATGCAGCAAGCGAAACAAGATACCTGAATGCTAGCAATCGAGAACTTTGTCCTCCCCTCGAAGCTCGATTATCTTCTGATAACCCTGATCCCCCACCCCAGGAGAACAAGGCTGCATGCCAGCTCCTTCAATTTTCATTTCAAGAACTTAAAGCTGCAACTGGAAATTTCAGACCTGATAGCATTCTTGGGGAAGGTGGCTTTGGTTATGTTTTCAAAGGATGGATTGAGGAAGATGGAACCTCGCCAGCTAAACCTGGGTCAGGGATTACAGTGGCTGTCAAAAGCTTGAAGCCAGATGGCCTTCAGGGCCATAGAGAATGGGTGGCTGAAGTTGACTTTCTTGGACAGCTTCACCATTCTAACCTTGTGAAACTTATCGGTTACTGCATTGAAGATGATCAGCGGCTTCTTGTTTACGAGTTTATGACCCGTGGAAGTCTAGAAAATCATCTATTCAGAAGAACCGTACCTCTCCCGTGGCCCAACAGGGTTAAGATTGCCCTTGGTGCAGCAAAAGGATTGGCCTTCCTCCACAATGGTCCAGAACCAGTCATTTATAGAGATTTTAAAACATCTAATATTTTGCTGGATACGGAGTATAATGCAAAGCTTTCAGATTTTGGTCTAGCAAAAGCAGGACCTCAAGGAGACAAAACACATGTTTCTACCAGAGTAGTTGGAACTTATGGTTATGCTGCTCCAGAATATGTCATGACAGGGCACTTGACTGCTAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTTGTGTTGCTTGAGATACTAACAGGAAGAAGATCAATGGACAAGAAGCGTCCGAGTGGGGAGCAAAATCTTGTTTCTTGGGCTAGGCCATACTTAGCTGACAAGCGAAAGCTGTACCAGCTTGTGGATCCTCGCCTGGAGCTAAATTATTCTCTAAAAGGAGTGCAGAAGATTTCCCAGTTAGCTTATAGCTGCCTCAGCAGAGACCCTAAATCTCGCCCCAACATGGATGAAGTTGTGAAAGCGCTGACTCCATTGCAGGGGCTTAATGACCTTGCAATTTTGTCTTATCACTCTCGCTTGTCCCAACAAGGGAGACGGAAGAAGAAAGATGGAACTCCACACATCACATACACACAATCCAAGAGCATGAGGGCCTCTCCTTTGAATACCAGCAAGCAGCATCGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_06990::LG1:100970354-100972354(-)
CTCTCTTATAATATTCCCTTTTTGAGACTTTAAAAAGACTAAGATGGTCTTTGAAATAATGAAAGAAAATACCATTATTAAAATTGTTTGTGTTATGAAATTAAGACATATTTCACACTAAATTAGGGAGAATACTTCAAAAAATATATATTTTTTATTTCTTATTTACATTTTAAATTTACTTCACTTGGAGATCACTGTGACTTGACATGTTAATTTGATGTCATATATGATACACCACCTCATGATAGCTACCGAAACTAACTAACAAACTAATTTAAACATTTATATTAACATTAATAATATAATATAGGTTTAAGTGTTAAGTATAAAGTTGAGTATGTTTATTTCAGTTTTTAATACTTTTTTATGATATATTGAATATTAAAAGATTTATATTTTTAATCAAATAGGTATCATCTAACTTTTTTAATTAAATAACATACTGTTAACATTTCATTAATTTATTAGATTATTTTATAATTCTATATTTTAATAATAATATCAAATAAAATTGATTGATATATGATGTACGTGTTTTGTTTTTTATTTTCAATAATTCACTTTCTTATTTCATGCTTGAAAATTATTATAATTGTATTCAGCATATGAACTAATAGATATAAGATTAGAAGTTGATATATATATTGAAGACTAACAATATATTTTCATACAAAATAAGTGTTTTTTATCTGACTATTTAAATATAATATTGAAGAATGCTCATTTTATACGTTATGTGTTTGTGAAAGAACAATGTTATCAATTTTTCTTACTGTAAATTAATTATCAAGATTAAAATATATAAATTATGTAATTTTGGAAACAACTGGCTTCATTTAAGTGATATTGTAATTTTAAATCGAACTATTAATGTATTATTCTACAACCAATAGTTATTTCTCTTATAAAAGATTATTCTCTTATTATATTACATTATATATAGAGAGATACTTTAATATTATTAGCAATTTTACATAAAATATAATTTTTTTTATTAAATTATAATTATGTAAAGAAGAGGTTTATCAAAATTGAATAATTATAGTTTTATAAGTGCGCATAATAATAAATATTAAATAATATAATAATAAACGAAACCTGTAGGAAGGGTGTTATAGTATCAACTATTCTTCCTTCAATGATACATAATTCAGGCATGTGACTTATATACTAAACCAGGAAAAAAATATTCTATAAATTTCTCTGTTTCAAATAAAATCACAACGGAAACAAAAACAGGCAAATTACAACATAATCATTGGAACAGTTGAGCAGCAAAATTTGTTGTCTACTGTGACACGTAACATCATATTCTTTGCGGGCACATTATTCAAATCTAATACGAACAACATTATCTTAAAAACTGATTGATTGACAATACAAAAAGTATTTATATTAATACGTACAAAAATTAAAACCCATTGTAAAACTTTGATAATTAGTGGACAAAAAACAAAATGATGAAGTAAATTAAGAAATTGTTGCAAAAGTTATAATTCAAAACAGACAGTAGAAGAAAAGGTGGAAATATAATGTTAAAGAAACATAAAGTAAAATACATGGTTCTGTGTAATGAATAAAGAAAAGTATGCGTATCAGCTGTTTGAAAATATGTGGTACTTGTTTTGTGGGTATAAAAGGTTGATGAATGAATGAATGGCGGTGAAAGGCACGAAGGAGGCACTCCAAAAAAATGCTAAAACTTTGTTGGACATGAGGTTTTATGTTGTGTTTTGGTAATTTCAAGCACAAAGGTAAAAACAGAGGGTGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGTGTCCCATTCCCATCCCCCACACAAAAGGTGGTGGGAAAAAAGTTCTTTTTGTACACACTGCGATGATGGCGATGATGATGCCTGCAATCTCCAACACAAACACAAACACCATCTCTTTCTCTTCTCTCTCTCTTATCACTCTCTTCTTTCTTTGAAGCCAACCATGGTTAACATCTTCTCCCTCAGTCCGTGATTAAT


Gene Sequence:
>Vu_06990(-)
ATGAAAGTTGTGAGCATGGAGACAGAGAAGAAGTGCGGTTGCTGGGCTGTCCTTAAACGCGGTGTTAGAGGTGCGTGCAAACCTTCAGCTTCCAGAGACTCTGCTAACACTATCCCTCGTACTAGTCTCGTTTATGATGCAGGTACATACACAACACAACATAAACAATTTTTTTCCACCTTGGAGAATTCTTCATCTTCATTGTGAATCTCAACCACTATATTGTTTAGTGTCACTCCTCTCTCTCTCTCTCTCACCACTGAATGAAGTTTCAAGTTTGGCCACACCCCATGAGTCTCTTCTCTGCTTTTGTTTACTTTCTTCTTTTCTGAAGCTTAAAGTTTCTTCTTCCTTCTAATTCGGAAATAAAAGTTTGTGGTTTTGCAGTACCTTATTTAGAATTTGGGCCTGACTTATCCCCGACAAACTTGATTTGTAAACGGAGAGATGCATAAGCTATATAAGCTCTTATTAGGCACAGTCTTTAGCCAATGTAGGACTTGATTTTTTCGAAATACCTGATTCTGGGTTTGCTTGAAATCATGGAGTTTTCTGGGATGGTTATTTTTTTATATAAAAAATGAACTTTCTGTGGCAGGCATTTTTATGGAGTTTAATTATGACGTGGGTAGTTAAAAAGATGGATCTTTTTCAGCTTTATCGATGTGCGTTCTCAGAACCCTTTTCTCCATCTTCTTGTTTCAGACACTGTAAGCATAGCTAACTGCATGATTCCTTCGAAGGAACGTGGGGTGGTGCGCAGAGCAAACTGAGCTATTCCCCCTTGTAAAATTCAAAAGGATTTATATTTTTCATTTCCGTAGAGAGTGAATGGATTTTCTGGAATTTGAAGCTTTATAAATTTTGTGCTTGAAAGTAGAAACTAAGGATTTATTTAATCCGTTGTGATATGATGGTTTCGATTGCATTGTCAGATCCAAAACCAAGCTAAATGCAATTATCAGAAATCTTATTCATGAGTATTGGGAATTTCAAGAAGGAAGCCTTCACATTCTTTATTTTTTACTGATGCAGCAAGCGAAACAAGATACCTGAATGCTAGCAATCGAGAACTTTGTCCTCCCCTCGAAGCTCGATTATCTTCTGATAACCCTGATCCCCCACCCCAGGAGAACAAGGCTGCATGCCAGCTCCTTCAATTTTCATTTCAAGAACTTAAAGCTGCAACTGGAAATTTCAGACCTGATAGCATTCTTGGGGAAGGTGGCTTTGGTTATGTTTTCAAAGGATGGATTGAGGAAGATGGAACCTCGCCAGCTAAACCTGGGTCAGGGATTACAGTGGCTGTCAAAAGCTTGAAGCCAGATGGCCTTCAGGGCCATAGAGAATGGGTGGTTAGTAAAATATCTGCTTTGGGTTAGTAGATTGGTGTTGTAATGTGATGTTTAGGATAGGTTGGAGATTGAATTGTAACATGACATTTTGTTGATGCAGGCTGAAGTTGACTTTCTTGGACAGCTTCACCATTCTAACCTTGTGAAACTTATCGGTTACTGCATTGAAGATGATCAGCGGCTTCTTGTTTACGAGTTTATGACCCGTGGAAGTCTAGAAAATCATCTATTCAGAAGTTAGTTTCTGCCTTGCCTTTCCTTTCTTTTCTACGTAGAAATTATGAGGACTGCTACATATCTGAGATTATGTGGTAACAGTTTCCAGGTTTCCTGCAAAATCGTTCGATTGCTATTGCTTGAATAATAAACCAAAACTAATGAAGTGATCTGCTTTTGTTAATCTGTGACTTGATGCAACATTGTAGAATTCTTTCTTCACCAGCATATATTTTGCATTTCTTTTTCCCCTTGTAGGAATTATTTACTGGAGCAATTAGTGTGACTTGTATCACAACTGATTATTGTCTTATTTATATAAAAATTAAAATTAGCTAGCAAAATGTTATGCCATTATCATGAAGTGTTCTTGAGTAGTAGCAAATGACTTTATATGTTAAAAGGATAAAATTATGCATTCTGTGGTTATTGAAAATACTCCATAGAATTAACCACATAAAAATATTACTCGAGGATATTAACAGGAAATTTCATGACTTCATACTCTTTCTGTAATCTTTTCTGTATCATCTAATAACTTTTTCTTTTCACTATTTATTTGCCTTCTCCCCTCATTGCTTCCATATTCTTGATGATGATGATGATAGATCTGGCATACCTTACAACTAGTTATTCTGTTCTGGTCCCTTTCCTCTTGATCACGGTATCTAACAATTAAAGTCCCGATTTTGCCACAATTTGAAGGAACCGTACCTCTCCCGTGGCCCAACAGGGTTAAGATTGCCCTTGGTGCAGCAAAAGGATTGGCCTTCCTCCACAATGGTCCAGAACCAGTCATTTATAGAGATTTTAAAACATCTAATATTTTGCTGGATACGGTACGTGGTTACTGAAATAATCCAATCAGTTTCAGAGAAGTTTGTTTTATTACTTATTAACATGTCGTATCTTACAGGAGTATAATGCAAAGCTTTCAGATTTTGGTCTAGCAAAAGCAGGACCTCAAGGAGACAAAACACATGTTTCTACCAGAGTAGTTGGAACTTATGGTTATGCTGCTCCAGAATATGTCATGACAGGTAAGAATGAAACTCTTTAAAGCTTTGGATATGCTGTGGTGAAAGTTGTATTATGGATTACAATTTCTGCTACAGCGCAGACATTAAGGCAGCGCATGTTCATCTATCCAGACACCTGTAGAAGTCTTTCTAAGACCTATGAGAACTAAACAACTGCATGATTTTCTGTTTGTTTTCTTTTACCAGGGCACTTGACTGCTAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGAGTTGTGTTGCTTGAGATACTAACAGGAAGAAGATCAATGGACAAGAAGCGTCCGAGTGGGGAGCAAAATCTTGTTTCTTGGGCTAGGCCATACTTAGCTGACAAGCGAAAGCTGTACCAGCTTGTGGATCCTCGCCTGGAGCTAAATTATTCTCTAAAAGGAGTGCAGAAGATTTCCCAGTTAGCTTATAGCTGCCTCAGCAGAGACCCTAAATCTCGCCCCAACATGGATGAAGTTGTGAAAGCGCTGACTCCATTGCAGGGGCTTAATGACCTTGCAATTTTGTCTTATCACTCTCGCTTGTCCCAACAAGGGAGACGGAAGAAGAAAGATGGAACTCCACACATCACATACACACAATCCAAGAGCATGAGGGCCTCTCCTTTGAATACCAGCAAGCAGCATCGGTGA