Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06807 LG1 98997125 99000733 PREDICTED: DNAJ protein JJJ1 homolog
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   zinc ion binding, nucleic acid binding, protein binding, protein binding
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03009 Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 98997471 3_prime_UTR_variant
G/T 98997631 downstream_gene_variant
G/C 98997807 downstream_gene_variant
A/G 98997865 downstream_gene_variant
A/T 98997870 downstream_gene_variant
A/C 98997873 downstream_gene_variant
T/C 98997879 downstream_gene_variant
A/G 98997882 downstream_gene_variant
A/C 98998274 downstream_gene_variant
A/C,G 98998365 downstream_gene_variant
C/T 98998519 downstream_gene_variant
A/T 98998754 downstream_gene_variant
C/T 98998755 downstream_gene_variant
T/A 98998825 splice_region_variant&intron_variant
T/A 98998920 stop_gained p.Lys583*
A/T 98998921 missense_variant p.Asn582Lys
C/A 98998946 missense_variant p.Gly574Val
A/G 98998963 synonymous_variant p.Asn568Asn
G/A 98998999 synonymous_variant p.His556His
T/C 98999774 missense_variant p.Lys298Arg
T/A 98999825 missense_variant p.Glu281Val
A/T 99000236 missense_variant p.Val144Asp
G/C 99000243 missense_variant p.Leu142Val
G/T 99000577 synonymous_variant p.Ser30Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06807.1
MASSSSLAKRCHYEVLDLPQDCAPEEIRSSYRRLALQRHPDKLIKSGISQEEATAQFQELQHAYEVLSDPKERAWYDSHRSQILFSDPNSLSKSVVPDLFSFFSNTVYSGYSDTGKGFYKVYSDVFDKIHANEINFARKMGLGVEAVRQAPLMGNLDSPYAQVTAFYGYWLGFCTVMDFFWVDEYDVMAGPNRKSRRLMEEENNKARKKARREYNDTVRRLGDFVKKRDKRVIDMRVKKNMEMERKKEEERETKKRLEKERKERAMAYEEADWAKVDNEEEVEEWVEEGEEEKKKNDKEFYCVLCGKKFKSEKQWKNHEQSKKHKERVAEFRDSIGDEQDLEEGKEGLGSEEDGVGVDGDGGYGVGDLEARIRDDLNVEDGVIRNGVEPDDDDDCGGDEFSDASHAKEGEDSNGLVNLDDSGNQDGDNDDNGVVDEFSDASLAKEGEDSNGSVNLDDGGNQDGDNDENGVLEAMVAGHKNRKPRASTHKSKASIVPSQIETEKDESGPMEYNNRKPTRKKRRAKKEKGRENWEESQGTASSCNDENINGNGNDNAHGEESSSQHFTENGDNIIGNEQVSRGNKISNQPADKKGAGKDTKITAKISSKGRKAKVTSKNIGNTCDACGEEFESRNKLHKHLGDSGHATIIRGR*


CDS Sequence:
>Vu_06807.1
ATGGCGTCTTCGTCGTCGCTGGCGAAGCGATGCCATTACGAAGTGCTCGATCTCCCCCAAGACTGTGCTCCCGAGGAGATTCGCTCCTCCTACCGCCGCCTTGCCCTTCAGCGCCACCCGGACAAGCTCATAAAATCGGGTATCTCCCAAGAGGAAGCCACCGCGCAGTTCCAGGAACTCCAACACGCATACGAAGTTCTCTCCGACCCCAAGGAACGCGCTTGGTACGATTCCCACCGTTCCCAAATCCTCTTCTCCGACCCTAATTCCCTCTCCAAATCGGTCGTCCCCGACCTCTTCTCCTTCTTCTCCAACACCGTCTATTCCGGCTACTCTGACACCGGAAAGGGCTTTTATAAAGTTTATTCTGATGTTTTCGATAAAATCCACGCCAACGAGATCAATTTCGCGCGGAAAATGGGGCTCGGAGTTGAGGCTGTTCGACAGGCTCCTCTAATGGGGAACTTGGATAGCCCCTACGCGCAGGTCACTGCGTTTTATGGATATTGGTTAGGGTTTTGTACTGTGATGGACTTTTTTTGGGTGGATGAGTATGATGTTATGGCAGGGCCGAACCGGAAGTCGCGGCGGCTTATGGAGGAGGAGAATAATAAGGCTAGGAAGAAGGCGAGAAGGGAGTATAATGATACTGTGAGGAGGTTGGGGGATTTTGTGAAGAAGAGGGATAAGAGGGTGATTGATATGAGGGTGAAGAAGAATATGGAGATGGAGAGGAAGAAGGAAGAAGAGAGGGAGACAAAGAAGAGGTTGGAGAAGGAGAGGAAGGAGAGGGCCATGGCGTATGAGGAGGCTGATTGGGCTAAGGTTGATAATGAGGAGGAGGTAGAGGAATGGGTCGAGGAGGGGGAGGAGGAGAAGAAGAAGAATGATAAGGAGTTTTATTGTGTGTTGTGTGGGAAGAAGTTTAAGAGTGAGAAGCAGTGGAAAAATCATGAGCAGTCCAAGAAGCATAAGGAGAGGGTTGCGGAGTTCAGGGATTCCATTGGTGATGAGCAGGATTTGGAAGAAGGAAAGGAGGGACTGGGAAGTGAGGAAGATGGGGTTGGGGTGGATGGTGATGGTGGTTATGGGGTTGGTGATTTGGAAGCGAGGATTCGGGATGATCTTAATGTTGAAGACGGGGTAATTAGAAACGGGGTTGAACCGGATGATGATGATGATTGCGGTGGTGATGAGTTTTCCGATGCTTCGCATGCGAAGGAGGGGGAAGATTCCAATGGGTTGGTTAATCTTGATGATAGTGGCAATCAAGACGGTGATAACGATGACAATGGTGTTGTTGATGAGTTTTCCGATGCTTCGCTTGCGAAGGAGGGGGAAGATTCCAATGGGTCGGTTAATCTTGATGATGGTGGCAATCAAGACGGTGATAACGATGAAAATGGTGTTCTTGAAGCAATGGTGGCTGGCCACAAGAACAGAAAGCCACGAGCTTCAACCCACAAATCCAAGGCTTCAATAGTTCCATCTCAAATTGAAACTGAGAAGGATGAATCTGGCCCTATGGAGTACAACAACCGGAAGCCCACAAGAAAGAAACGTAGAGCTAAGAAAGAGAAGGGTAGGGAAAATTGGGAAGAATCTCAGGGGACTGCTTCCAGTTGCAATGATGAGAACATAAACGGTAATGGAAATGACAATGCTCACGGAGAGGAGTCTTCTTCCCAACATTTTACGGAAAATGGGGATAACATTATTGGGAATGAGCAGGTTAGTAGAGGTAATAAGATTTCAAACCAACCCGCTGATAAAAAGGGAGCTGGCAAGGACACAAAAATCACAGCCAAAATTTCATCCAAAGGAAGAAAAGCAAAGGTGACATCGAAAAACATTGGTAATACTTGTGATGCGTGTGGAGAGGAGTTTGAGTCAAGAAATAAATTACATAAACATCTTGGCGATTCTGGGCATGCGACAATAATAAGAGGTCGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_06807::LG1:99000733-99002733(-)
AGTTGTTATCTCCTTACTCATTCATACATCACATCGATACGAGATTACATTACACATAGTGGCATCGATACATAATAAACCATGTATTATTTATAATATAATAATGATTTTAATCCTAAATATCAGGGTAATTTTTAGAGCTGTCAAAACGGGTCATCCGGCCCGACTTGGCCCGGCCCACCACGGGTTGGTCACTTAGTGAGCCAACCCAACCCGCTCATTTATTAGCGAGCCAGAAAAATTCGAACCCGGCCCGACTCATCACGGGTTGGTGGGTAAACGGGTTGACTCACTGGCTCACTTAATTACAATGTTTTTAAATAAATAAAAAATTACAAACTTTCTATAATTCAAATCTAAACAAATTTCACTCCGAGTGTTTAATTAATTTTGAAAATAAGGAACTTAAATAATTTTTTCAAGCAAAAATAAAATAATAAATATTTTTTTATAAAACTAAAATTAAATTTTAATAAAATAAAATTAGGTAGGTGGGTTGGTGGGTCAACCCGGTCCACCAGGGGTTCAACCCGCATGAGCTGGATTTAAATGAGCCGGGTTGAAATCTGACCCGCATAAAAACAATACAATTTTTTCAAACTCAACTCGACTCAAACTGTTGTGACCCATTTTGACAGCTCTAATAATTTTTTAGGTTTTGATTTCCAAATTAAAAAATATATTTTATTGTCAAAAGTGAAAAAAGTAACTTTAGCCTACAATAAAATGTTTTTTTCTTAACAAAGACAACAACTTTTTTACCTGTTATCGAATTATAACTCCTTTTAATAATAACATATAAATTCAATTATTCAATTATAATAAAATATTGTATATTAGCCGTACAAAATTGTACTCTTGTCAACCTATCATCATTAACTTTTTTTTTAATTATATGCCAAAAAAATTAATTTATTATCTAATATATTGTTCTCACTTACCCTCCTTTGTCAAAAAGGTTCTTAAAACAATGATGTAAGTTAAAAGGCATTAACGAAAACAAACTTAATTGCGTTGTCAAAAGACATAACAACTTGAGTATCATAGAAAAATATGATATAAAAACACAAACACAGAAATAAGATGTATGTAAAAATAAAATATTACGAAGATAAAAAATACTCAAATGTACCTTGATACATAAAATCTATGCTTATATAAAGGTATTTTTTTGTTTTTTACATTTATTTTCAATTTTACTTTTAAATTATCTTTTATTATTCTTTAAGTAATTATCTTTTAAAATTTAATATTTTTTTCGATTTCGAATTATTTTAAAGTTAACCATTTACAAAATAAAATAAATTTATTTATAATAAAATTTTAAAATTTATTTATATTTAATTTTAGAATTAAAATAATAATAATTTTTTTATTTTTTATTATCATCAATGAAAGTGAATACACAGCGTGTTTTTACTAGTATTAAATTAGTTAGATAAAAAATGTAATAAATAAAATATTATATTAGTTTTAGATTATTATTTTAAATGGTTTGATAATTTTTATAATATTCAATTTAATAATGGAATAGGATGCATTGGAAATATTAGATATTTTAAAAAAGTAGTATATCATATTCAATATTCTTACAACAGATAGATCACATTTACTAATTTAGATAAAAAGTGTAAATTAAAATAAAGAAAAAGTTATATAAAGATTAGAATACTTCTATTAATAAGAATATTTTTAGGTGTTATTCTTCCATAAAGATAGATATACATGATATCATAATTTAAATACAATTTTATATTTAAGAAAATGTTCACTACAAATTACAATCATAATATAACTTGTATATTTAAAAAAGATTTATTTGTTATACATTTTAATGATACAAAACAAAGCAAAAAAATAAATAATATAGTTACACGTAAAAGAAAATAGTATGATAAGATAAGAGATAAATCATCGTATCTTTAAAAATTTAAACTAAAATGATACAGAAATGAAGTGCGTAACCATGTATATATAATAGATGCACTTTTTCCTGTTCT


Gene Sequence:
>Vu_06807(-)
ATAGAAGACTTGGTGTGTTTTATTGGTTTTAGCTGAAGACACAAAACCGGAACCCTAACAAGCATCAATGGCGTCTTCGTCGTCGCTGGCGAAGCGATGCCATTACGAAGTGCTCGATCTCCCCCAAGACTGTGCTCCCGAGGAGATTCGCTCCTCCTACCGCCGCCTTGCCCTTCAGCGCCACCCGGACAAGCTCATAAAATCGGGTATCTCCCAAGAGGAAGCCACCGCGCAGTTCCAGGAACTCCAACACGCATACGAAGTTCTCTCCGACCCCAAGGAACGCGCTTGGTACGATTCCCACCGTTCCCAAATCCTCTTCTCCGACCCTAATTCCCTCTCCAAATCGGTCGTCCCCGACCTCTTCTCCTTCTTCTCCAACACCGTCTATTCCGGCTACTCTGACACCGGAAAGGGCTTTTATAAAGTTTATTCTGATGTTTTCGATAAAATCCACGCCAACGAGATCAATTTCGCGCGGAAAATGGGGCTCGGAGTTGAGGCTGTTCGACAGGCTCCTCTAATGGGGAACTTGGATAGCCCCTACGCGCAGGTCACTGCGTTTTATGGATATTGGTTAGGGTTTTGTACTGTGATGGACTTTTTTTGGGTGGATGAGTATGATGTTATGGCAGGGCCGAACCGGAAGTCGCGGCGGCTTATGGAGGAGGAGAATAATAAGGCTAGGAAGAAGGCGAGAAGGGAGTATAATGATACTGTGAGGAGGTTGGGGGATTTTGTGAAGAAGAGGGATAAGAGGGTGATTGATATGAGGGTGAAGAAGAATATGGAGATGGAGAGGAAGAAGGAAGAAGAGAGGGAGACAAAGAAGAGGTTGGAGAAGGAGAGGAAGGAGAGGGCCATGGCGTATGAGGAGGCTGATTGGGCTAAGGTTGATAATGAGGAGGAGGTAGAGGAATGGGTCGAGGAGGGGGAGGAGGAGAAGAAGAAGAATGATAAGGAGTTTTATTGTGTGTTGTGTGGGAAGAAGTTTAAGAGTGAGAAGCAGTGGAAAAATCATGAGCAGTCCAAGAAGCATAAGGAGAGGGTTGCGGAGTTCAGGGATTCCATTGGTGATGAGCAGGATTTGGAAGAAGGAAAGGAGGGACTGGGAAGTGAGGAAGATGGGGTTGGGGTGGATGGTGATGGTGGTTATGGGGTTGGTGATTTGGAAGCGAGGATTCGGGATGATCTTAATGTTGAAGACGGGGTAATTAGAAACGGGGTTGAACCGGATGATGATGATGATTGCGGTGGTGATGAGTTTTCCGATGCTTCGCATGCGAAGGAGGGGGAAGATTCCAATGGGTTGGTTAATCTTGATGATAGTGGCAATCAAGACGGTGATAACGATGACAATGGTGTTGTTGATGAGTTTTCCGATGCTTCGCTTGCGAAGGAGGGGGAAGATTCCAATGGGTCGGTTAATCTTGATGATGGTGGCAATCAAGACGGTGATAACGATGAAAATGGTGTTCTTGAAGCAATGGTGGCTGGCCACAAGAACAGAAAGCCACGAGCTTCAACCCACAAATCCAAGGCTTCAATAGTTCCATCTCAAATTGAAACTGAGAAGGATGAATCTGGCCCTATGGAGTACAACAACCGGAAGCCCACAAGAAAGAAACGTAGAGCTAAGAAAGAGAAGGGTAGGGAAAATTGGGAAGAATCTCAGGGGACTGCTTCCAGTTGCAATGATGAGAACATAAACGGTAATGGAAATGACAATGCTCACGGAGAGGAGTCTTCTTCCCAACATTTTACGGAAAATGGGGATAACATTATTGGGAATGAGCAGGTTAGTAGAGGTAATAAGATTTCAAACCAACCCGCTGATAAAAAGGGAGCTGGCAAGGACACAAAAATCACAGCCAAAATTTCATCCAAAGGAAGAAAAGCAAAGGTAAGAACTTCGGAATATACCTGCTCTGTTCTCCATGCCTCATAAGTTGTGAAGTTCGGACTCCTCTCTCAAATGGTGTGTTGTGGTGTCCAATTCAAAAGACATTTTTTTTGTCTTTGATATAATTTTGACACCCTTCAACATAACATTGATAATGACAAATATAATGTCTTAAATGAATTATATTCTCTTTTCAGTTTTTTTAAGGTTGGATAAATGGAGTATATTCTTTATCATGTGACAATATGTTTAAATTATTATATTGTTTATAAATGATTTTGAATATCTTAATATTGATTGTTAATTTATATGATTTAAAATTCATGAGAATCTAATATATAGATACTGGTTCCCATATCCTACATTTTAAAGATTACTTGGGTAAGAAGTGTCTGAGTATCTGTAGTATTTGTGCTACATAGGTCATAAGACTTGTTGCTGCAACTGCTGTCACTCTAACTTTTGTTTTAGTAATTTCCTGAACTCCAAACCTGTATTCGTCTTCCGATAGTTTTTACGTTTTAAAGGTAGATTTTCTAGGTAGGTTAAATTGGTCTTCAGTTACCGTAATACAGTAGAATGCTGCGAAATGGAGTGGGGTGGGGGGGCGGGGGTCAAATTCCCTCCTCGCCCAGGTTTGGCTTCCCCCAAAATCGAGGAGAGTTGAATGAGAGTGGGTTTTACATTAATTATCTTAAATTCAATAGTTTTATTTGACTGTTCTAAGCTCTAACTATATAATAAAGAATTTGCTTATCTCTGCTTCACTTCATTCACCTCCACCACTACATAGTGCTCCCTGTCCCTTCTTATGTTTCAACCCAACAGAACTTTTAGAAGGACCACACACACTTAGCCATGTTGTTCTGATCGATTAGCGAGCAATACCTGGTCGTAGTTTGTTGATATGACAAATCTCGGTTGTTCACTTTTCCAATTTTTTTCATGTTTATTCTGTGTTATAGTTTTTATGTAGAGGCACTTTCTATTGTTTTGTAATGTTTTCTGGCCTTGCCTTACTATCAAGTTGCTTTTTGTGCTTCATAAACCTGATTGTGATTTTGTTTCTTGAATAAGGTGACATCGAAAAACATTGGTAATACTTGTGATGCGTGTGGAGAGGAGTTTGAGTCAAGGTAATCTTATGCCTCTCTTCTTTATCAAAATAAAATTTCATATTGTTCTAATAATAAATCTTGCCTCATACTAAACTGTTGCATAACTTCGTTTGATTTGCTACGCAGAAATAAATTACATAAACATCTTGGCGATTCTGGGCATGCGACAATAATAAGAGGTCGATAAAGGAAACTGCAGTTGGAAGTATTCAATTCAAGCGCGTCCCCGAGTATAATTCCATTTGGAGAAGCAAAAGATATTGGTCCATTCTTTAATTCTTAATAGTGTTTAAGAATTTTTGTGTAATCCTTCGGCAGAATGCATTCTGTTATTTATGTCATAGTTGAGAGATCCATGGATCTCTTAGTATGTCAATTTTTTTAGTTTTATGTCTCGAGCAGAGAAGTGTTTAAACGAATTAGTGTGATGATTATAGTAAAAGAAAATCTTGATTTATTGTAGATGATCATTTTAATCTTTTAAGGTATTCACCCAAAGTTTAGAAGTCTCAACGGATCTTGAATTCAGCTAACAATCTCTTGTAAACACTTTATTATGAGGTTGATCTAATTATGCATTTTAGAGAT