Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06736 LG1 98361162 98366409 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 98361195 missense_variant p.Thr364Ser
C/T 98361365 missense_variant p.Gly307Glu
G/T 98361671 downstream_gene_variant
T/C 98361677 downstream_gene_variant
G/T 98361872 downstream_gene_variant
T/A 98361998 downstream_gene_variant
C/A 98362026 downstream_gene_variant
T/G 98362029 downstream_gene_variant
T/A 98362216 downstream_gene_variant
T/C 98362324 downstream_gene_variant
A/T 98362332 downstream_gene_variant
A/T 98362408 downstream_gene_variant
A/G 98362632 downstream_gene_variant
A/C 98362802 downstream_gene_variant
T/C 98362813 downstream_gene_variant
A/C 98362816 downstream_gene_variant
A/T 98362821 downstream_gene_variant
A/C 98362984 downstream_gene_variant
C/A 98363051 downstream_gene_variant
A/G 98363224 downstream_gene_variant
A/T 98363304 downstream_gene_variant
T/C 98363308 downstream_gene_variant
T/C 98363670 downstream_gene_variant
A/G 98363671 downstream_gene_variant
G/C 98363674 downstream_gene_variant
C/G 98363688 downstream_gene_variant
T/C 98363720 downstream_gene_variant
A/G 98363748 downstream_gene_variant
A/C 98363775 downstream_gene_variant
T/C 98363812 downstream_gene_variant
A/T 98363824 downstream_gene_variant
A/G 98363931 synonymous_variant p.Ala256Ala
A/G 98363982 synonymous_variant p.Gly239Gly
G/C 98364134 downstream_gene_variant
G/A 98364826 missense_variant p.Ser125Leu
G/A 98364830 missense_variant p.Leu124Phe
C/A 98364888 synonymous_variant p.Arg104Arg
C/A 98364916 missense_variant p.Gly95Val
A/G 98364967 missense_variant p.Phe78Ser
G/A 98364977 missense_variant p.His75Tyr
T/C 98365046 missense_variant p.Lys52Glu
C/A 98365179 downstream_gene_variant
G/A 98365306 downstream_gene_variant
T/C 98365408 downstream_gene_variant
A/G 98365418 downstream_gene_variant
G/A 98365564 downstream_gene_variant
G/C 98365594 downstream_gene_variant
A/G 98365666 downstream_gene_variant
C/T 98365874 intron_variant
G/A 98365900 intron_variant
T/A 98366119 intron_variant
A/T 98366159 intron_variant
C/A 98366256 intron_variant
A/T 98366326 intron_variant
A/T 98366327 intron_variant
A/C 98366334 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06736.1
MGNFCARCKIDGNLNPHPCSEVPNRSTQLFVHSNPNGYGYIDGGKPEILPTPRSEGDILSSPHLKPFTLYDLKKATGNFQPYNLIGEGGFGNVYKGRINETKSHGGTISGSGRDVAVKKLKPEGFQGHKEWLSEVNHLGQLHHQNLVKLIGYCLEGDNRLLVYEYMPNGCLEDHIFRKGTQPLPWATRIKIATGAARGLSFLHDSKQQIIYRDFKASNILIDSEFNAKLSDFGLAKAGPTGDHSYVSTQVLGTHGYAAPEYIATGRLTSRCDVYSFGVVLLELLSGRHAIDNTKSGVERNLVEWARPYLGERRKLFRIMDTRLEGQYPQKAAYTVAIIALQCISDAKTRPQMSEVLSALEHLPATRRSASPTETHT*


CDS Sequence:
>Vu_06736.1
ATGGGAAATTTCTGTGCTCGGTGCAAGATTGATGGCAATTTGAATCCACACCCATGTTCTGAAGTTCCCAATAGAAGCACCCAGTTGTTTGTTCATTCAAATCCAAACGGGTATGGATACATTGATGGAGGGAAACCTGAGATTCTCCCTACTCCAAGATCTGAAGGGGACATACTTTCATCCCCACATTTAAAACCCTTCACATTATATGATCTTAAGAAGGCCACAGGAAATTTTCAGCCTTATAATCTTATTGGAGAAGGAGGATTCGGAAATGTTTATAAGGGGAGAATTAACGAAACTAAATCCCACGGGGGTACAATTTCTGGATCTGGAAGAGATGTAGCCGTTAAGAAGCTTAAGCCTGAAGGCTTTCAAGGGCACAAGGAGTGGCTGTCTGAAGTGAATCATCTTGGCCAACTTCACCACCAGAATCTCGTCAAACTTATTGGATACTGCCTGGAAGGAGATAACCGACTTCTAGTGTACGAGTACATGCCCAACGGATGCTTGGAAGATCATATATTTCGCAAGGGCACACAACCACTTCCCTGGGCTACAAGAATCAAGATTGCCACAGGTGCTGCTCGAGGTCTTTCCTTCCTACATGACTCTAAGCAACAAATTATCTACCGTGATTTCAAGGCTTCTAACATTTTGATAGATTCGGAATTTAATGCAAAACTGTCGGACTTTGGATTGGCCAAAGCAGGGCCCACTGGTGATCATTCTTATGTTTCCACCCAAGTTCTGGGCACTCACGGCTATGCTGCTCCTGAATATATTGCTACAGGTCGGTTGACATCAAGGTGTGATGTGTATAGCTTTGGGGTTGTGCTATTGGAACTACTATCAGGGCGCCATGCTATTGATAACACAAAATCTGGAGTGGAACGTAATCTGGTAGAATGGGCAAGACCCTATTTGGGTGAAAGGAGGAAGTTGTTCCGGATTATGGATACCAGGTTAGAAGGGCAATACCCGCAGAAGGCAGCTTATACAGTTGCAATAATTGCGTTACAGTGTATTTCTGATGCCAAGACTAGGCCACAAATGTCTGAGGTTTTGTCTGCCTTGGAACACTTACCAGCCACTAGACGTTCAGCTAGCCCCACAGAAACCCATACATAA


Promoter Sequence:
>Vu_06736::LG1:98366409-98368409(-)
TCATCAATCATAGTTCACCAAAATCAGTAGCATTCAACAAGTAATCATAACAATGTCTCACCATACCAACTACAAATTTCACACCATTTTAAACATATAACACCAATTAAAAACATCACAATAACTTTAAAATGTGGTAGTTAACTTCCTTTACCGTATAAAGGACCAAACTACTCTACAAGACCTAAGATGACTCCACCAACTCAAGGAATTTTATTTGCATCTACAACTCACAAAAACATGATCAAGATATATCGTTAGAACCGCTGATCAACAAAGAGTCTTATAGAGGTCTCAAATGATACATGCAAAAACACTACAACTGGCATGCAAAGGAAACTGGACAGATTAAAGAAAAAAGTAGAAGCTAACTTACTCTTTTGAAAAAATTGATCGAATAGATTTGAATATCTCACCGTTGTAATTAGACGGTCTCTGATCTTCAAATAGATTAACACAAAAGAACTTTTACAGAGAAGTCACACAACTCTGGAAAAATGATTTCTAGAAAGATTATGTGTTTTAAAATAATGAAACTCATTTATAACAAACTATTTATATTAAAATCATTTAGTATTAAAATAATTGAGTCTCACTATTTTTAAACTACTATCACTTCTAAAATATCATTTTCTAGATTTTTACATAAAGAAAAAAAAAATTAACCCATAACATTATATGTATTTTTAATTTGAAATTATAGTAAATTGTAACTATTTCTAATACTTACACTTTCAGGCTTTATGATTTTTAATAAAATCTCTATAAAATTATTATACTATATTTGTCCCCCAATTTGCGAAAGTAAACATTTTTAATCTATTGATAAAATATTTTTCAGATTCACACAAAATATTAGCATCTTCATAAATAATAAAAATGTTAGTTATTTATTTACGTAAAACCTTAACAATCTTATTAATTATAAGTTTCAATATTATTATCAAGTAGTTTCAATATTTTGTGTTAATATTTAAATAATATATTTATGTTAAACTAAAATTGTTTAATTTTGAACATTTTAAAAACTAAATGCTTTATTAAAATTTTATAACACCCCCAAAAGATAAAATTTGGTCTTCAATTTAAATAATAGATTAATATAAAAGATACATGCGACTTCTCATATAAAAAATAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACACACACACACACACACGTATATATATTACCTAAGTTTTTATTTATCTTCAGCTTACATACAGTAATAAAGAAAGCTAAACTTCTAAGTACATTTAATAAATCCAATTATCCATGCATGCTACATAAAGAAGGGTAGGTTCAATCCTGAACTCGTTGAAATGGAGAAAAACCATCTGAGACAAATGTATTCTTGGCTTTTAGCGTCCCAGAAAAGATTAGACCTTGAGAGAGACACTTATTTAAGGATTAAAAAAACTAATTAAAAAAGTAACGATATAAACATTTGATTACTATTTACTATACTTTTTTTTCTTCCCTCTTTGTCTTCACGTGTTTAATAGACTGATCAGTATTTTCCCAAAAAGGGTACCTAAACAGACAAAATAACTGTCCCTCTATTTATGTTCACATTCCACCCTTTGACCTTTGCAATGACTTCAAATTACCAGGAAAAGCCTTAGAGACTGTTAGTTACAAAATAACTTAGCGAGGGCATTTATAGAATAAACTAGTACGATTGTCGAGGATGTTTGTCCTGGTGGCAGCTTATGAAATAACATGTTTGTCCTTAGTTATCTGTCTCCAAACGTTTATATATATATACGTAAAAGTAAGACAACTCAACACTACAATCTGGTTCTCCCTTTTGTGTTCTTCTCTGGAAACACGGGAGAAGAACAAGATGCAAAAGAGAACCACGAGACACAAAGCATTCGGAGATTGGCATAGATAACACGTTGCATGTCGAGAATAAAGCCGGATTCAATCGTCCTTTTGTATTCTTTCTTGGGTTTTTAGAAAGGGTTAATTGTTTCCTCTG


Gene Sequence:
>Vu_06736(-)
ATGGGAAATTTCTGTGCTCGGTGCAAGATTGATGGCAATTTGAATCCACACCCATGTTCTGGTAGCATTTTTTCCTTATGCATTTGCATAAGGAAATCGATCATTTTCGCATTTTCCATAATTAATTATCCCTGTTTTAGGAGCGTATATGTAGGGGGGGTATGTTTTCTTTTGGTTCTCTCGTATAACTTCTTGATGGATTTTTGAAGAAAAACAAAATGGTTGTGGATTTGATAATTTGTTTTGTTAATTGTTCATCGTGATCATGCACGGATTTTTATTTTATTTTTAAAAAAAATGACGCTTCCCGTGAAATAGAACATAATGTAATTAGATTGCACACCCATCGGAATTGTTTTATTCATTGTACTTGACCAGCACCTCTTTATTGGATTTCTCATGCTTAAGAGATTTGGCTCAATTTATAGAGTCATAATGGATACCACTGACGAACTAATTAATTTGCATTGAATCCTCATCTTCTTTGTTTTTTTAGACAATACCGAATGCTAAAGGAAACCATCCAACAAGAACTGAGAATATTCTGTGACCAATCTAGGGTTCTTTATTAATCATACCACACAGCTGGTCATCCAAATCATATATAGTGGCATGAAATAATCCCAGTTTATTTATATACGACATATTAATGAAAAATATACCAGAAAGAATACATGGTTAAGGATTCAACCTCACTTTCTGCATTACTTTCTCAACTGTAGGGGGTCCTTATTGGAGTATGCTTATTGTAACCAACTCCTGCAAGTGTATTTTCTGTGTCTATATTGTTTACATAAAACAGACACAAGTACATACAGTTTGAATTAATTGTAAATGTTCTTTATCATAGGAAGTATGTAGGTTGGACTAACTAGTGATGGTAATCTTGGGAGAACAAGAGCACTTGCAATCCCCTTCTCCCCGTTTGTTTTATGCTTACAAACTTTCTTTTAGATTCTTGGAATATGTGAAGAGAACTTTATTTTATTTTTTTTATAAATACGCTTAAAAAAATAAAATAATTTTTTTTAAAAACTAAGCCAAATTTTGAAGAAGCTAATAGAAAATAACTTTCATAAACTAACCTACACATAAATTAAGTCCAGTTTATAAACCATGTGATTTTAAGTTTTTCCTAAGAAACCCTAATTATTTATGCATCTCAGTCATAAACTTTGTGCAGATGTTTGTTTTTCAAATACTGTTTTTTCTGCTACAAATAAATTGTTGGCTTTCACTGAGATGAAAATTATTTTTCAAATGTTACAGAAGTTCCCAATAGAAGCACCCAGTTGTTTGTTCATTCAAATCCAAACGGGTATGGATACATTGATGGAGGGAAACCTGAGATTCTCCCTACTCCAAGATCTGAAGGGGACATACTTTCATCCCCACATTTAAAACCCTTCACATTATATGATCTTAAGAAGGCCACAGGAAATTTTCAGCCTTATAATCTTATTGGAGAAGGAGGATTCGGAAATGTTTATAAGGGGAGAATTAACGAAACTAAATCCCACGGGGGTACAATTTCTGGATCTGGAAGAGATGTAGCCGTTAAGAAGCTTAAGCCTGAAGGCTTTCAAGGGCACAAGGAGTGGCTGGTAGGTTACTTCCACAGGCCTTTAACCCTACTGCTTTTGTTTTATATGGATCATAGTCCATTATAGTTCTCTTTGTTTGCAGTCTGAAGTGAATCATCTTGGCCAACTTCACCACCAGAATCTCGTCAAACTTATTGGATACTGCCTGGAAGGAGATAACCGACTTCTAGTGTACGAGTACATGCCCAACGGATGCTTGGAAGATCATATATTTCGCAGTATGTTTATGCCCTTAGTAACTTAAACTTTAAGTTTTAGAAAGTAAAACACTTCAAACTTGTTTGTGCTATGATTTAACAATTTTGTAAATCAAGAAATCCAAACCTTTCTTAAGAACTGTGCCACTGTGTTCCATTTGATCAATCATGGAACTGTAAATTGCAGAGGGCACACAACCACTTCCCTGGGCTACAAGAATCAAGATTGCCACAGGTGCTGCTCGAGGTCTTTCCTTCCTACATGACTCTAAGCAACAAATTATCTACCGTGATTTCAAGGCTTCTAACATTTTGATAGATTCGGTATGTTGGTTAAAAGCTTGCATTACTATGTTAATGTGCACATTTTAGGAGAGTGCTTGCAAATAATGTATCACCTTTAGCCATCTTTATTTCCTATCTATTATATTGTTTTCCTTCTCTATTTTTTCTGGGATTTTTAAATAGAACACACTCTTCCAATTTGAAATACTGATTCGAAGTACATTTTAACTTCAGTATCCTCGTGGTGGTAGCTCTTTTTAACTTAAAAACGTGTTCACACAAATTCAGGAATTTAATGCAAAACTGTCGGACTTTGGATTGGCCAAAGCAGGGCCCACTGGTGATCATTCTTATGTTTCCACCCAAGTTCTGGGCACTCACGGCTATGCTGCTCCTGAATATATTGCTACAGGTTTGTGTTTTTTCTTAAATATATTTTCAAGCTTTTTGGCTCATAAAAGAAAATGATGTTCTGTCACCTTTCTAATTTTTAAACCTTTTAGATTTTTTTATGTTGGATATTTCACATCATGTACAACTAAGTGAGATATGAATATTCAAGGTAATGTTAATGATAGACAAACCAACTTAATAAAATTCTGAACATCTAGAATCTACCATAAATTTCAACACTTGAATTAATGTGACTCGTTATTATGATAAACTTTATTTTCTATGTGGATAATGGATTATTTCCTAGGCCATTCTCCTTTTATATTCACAAGTTAGGTTGGTTTTGTTCAGAAAAAAAAAATTATATACAGTCCCTTCAACCTTAGAATATAAAAAAAAAAATACTTACAATACTTTAATCTTAATGTTTTAAATCTAAACAATAATGTAGTATATTTCTCTTATCTAACTAATATTTTAAAATTGGAACATAAGAAAAATTATTATAAGAAATAATTCAAATTTTACAAATATTTAGAAATATATTCTTAACACTACTCTTTTAAATTTTATTTCATCGTATATTTGAATTTCAAATTTAAAATCTGATTCTCCCCCTTCGATTATTGTTTTATTTTTTCTTATAATTCTTATCATTTTTATTTATTTTATAAAACCTTATACATTTATTCATTTTCACATCGAGTTTCTTTAAGATATATGCATCTTTATGCTATTCTTTTAATTTAATTTTTTTTATATCTTTTTAATTTGTAGTCACCTCCTTTTCCATCAATTTGAGAATAAATATTACTTTTGATTTGTATTTTGAACACTTTTGAGTTGTTTAAATTATTATCTTCATAAATTTTATGTTCAGAAAACACCTTATATATCTCATCAAACACTTTCTTAACCTGTAAATATATGAAACAATAAGAATTAATTTGAAGTTAAGTGATTTTCAATTTCAATATTTTTCAAAATGTTTTATTTCTCATTCTTACTTCACAATTATATACAAGTCAACCTTTTATAACTTTTATAAATTTTGTTGGGTGTAAAATATGATATTTTACAAAGAAAAAGTTGTTACAACCTCAACACCTTCTTGTTGATATTGAGATTTACATGTTTTTTCACATTCCCCAATCACAATTGTGATTTCCATCAACTCTTGATAGAAACTTGTATGTTATAACACCAACAAATTCATATAATTCATGTCATAATTACACTTGTGGCATTTTACATTTGTTTCCATCAAATATTTATAGAAGAATGATGTATTAACACTTTTAACAAGTTCAAATAAACCGTTGACACATTATTTTCTGCTCCCTCATTTCTTTTGTTTTTGGTTTTTTTTCTTATTACCATTATTCTTAAAATGAAGTTATCATTTTGTTGTTTAGATCATCAAAAGATTATGTTTTCCACTTGTTATATGGGAGATTATTTTTCTTGCCATATAGGAACAATGAAAAAAGACACACATATAATATTATATATTTTGATTAAATTTGTTATCCTTGTAGTTTTTTACTTGCAAACCTATCTCTACAAATATTTGTTAACCTTGTAAGCCTCATTTGCTCTTGTGCTTAATAAGATGCATTCAACAACTTTATTAGAGTAATGCATGATAAATTCCTAGACATAGACTTGTAGTTTCAAATTTTTGAGGTACTATCTATGATTTAAATTTTTGAACAATTTTGTAATCTCAAAGTTTAGTGTTTACATTGTTAAATAAGGTTGAGTTAAGTCTATATTTTCACTGACTAACATAACATGATATTATATTTATTCAAAATCTATTTTAGTTGAGATTTAAATCTATCAAATCCTCTAGATTTTCAAGCACATATTATAATTAAATTTAAACCTAATATATATAAAGGGGTATTGGATTCCATTTCAAATTCTCATATCAAATTCATTATTTGCATTTCTTTCAATTTTTCATTTCATTAGTACTCTTACTTCAAAATCTCTAAAACCTTTTGTGTATTAAATAGTTTTCTTAGTGTTATTATGTTATTTATTTCCCTTGTACGTATACAAAACATGCGAAAATGTATGCAATTTACATTGTATTAATACACATATATCATTCGATTATACTACAACTATTTTTTTTTTCATTTATTTTTGTTGTATATTTTTCTTGTGATAGTTGCAAACCTAACATTTACAATTATTCATGATGGATCTAGAGTCTCCCGATGCAGCATCACTATTGGGTCTTCCAAGCATCGGATAATTTTCAAACAACTTCTATAACTTTACTACTCTAGTCTGCATTATTCATGAGTTCTAACCCTATCCTGAGATATTGATCTACTAATTTACGCATTGGTTCGTACGGAAGGGTTTAGTTTCCTAATTGAGATATCTTAACAACAATGCGTTTTTTCTTTGATCTCAGGTCGGTTGACATCAAGGTGTGATGTGTATAGCTTTGGGGTTGTGCTATTGGAACTACTATCAGGGCGCCATGCTATTGATAACACAAAAT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