Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06695 LG1 97906817 97908841 PREDICTED: transcription factor MYB1R1
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category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   tissue development, cell differentiation, organic substance catabolic process, hormone-mediated signaling pathway, response to nitrogen compound, plant epidermis development, hormone-mediated signaling pathway, developmental growth, response to light intensity, regulation of transcription, DNA-templated, organic substance catabolic process, root morphogenesis, hormone-mediated signaling pathway, hormone-mediated signaling pathway, regulation of transcription, DNA-templated, root morphogenesis, anatomical structure maturation, oxoacid metabolic process, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, oxoacid metabolic process
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 97906833 5_prime_UTR_variant
G/A 97907426 synonymous_variant p.Gln124Gln
C/T 97907447 synonymous_variant p.Ser131Ser
A/G 97907716 intron_variant
C/T 97907808 intron_variant
A/G 97907822 intron_variant
A/T 97907862 intron_variant
G/A 97907894 intron_variant
C/T 97908063 missense_variant p.Pro177Ser
G/C 97908243 missense_variant p.Ala237Pro
C/A 97908247 missense_variant p.Ser238Tyr
G/C 97908254 synonymous_variant p.Val240Val
G/T 97908258 missense_variant p.Asp242Tyr
T/C 97908370 missense_variant p.Val279Ala
T/A 97908447 3_prime_UTR_variant
C/G 97908599 3_prime_UTR_variant
A/T 97908814 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06695.1
MSRACAATDSVASGEIMLFGVRVVVDSMRKSVSMNNLSQYEHRHDANNNNKDVLAVGYASADDAVPHNTGRHRERERKRGVPWTEEEHKLFLVGLQKVGKGDWRGISKNYVKTRTPTQVASHAQKYFLRRSNLNRRRRRSSLFDITTDTVSAIPMEEEQVQNQDTLFHPQAVCPAVPETSKSGIPMMPVYQFGIGSGAIAVQGGKPLEELTLGQGNIEHNVPINLVRAIPVVADPKASTVSDIITPSSSSALDPPTLSLGLAFSSDQRQTSSRHSALHVMPCFSNGDSTISVA*


CDS Sequence:
>Vu_06695.1
ATGTCTCGTGCCTGCGCTGCTACAGACTCGGTTGCCTCCGGCGAGATCATGCTGTTTGGGGTTCGAGTGGTAGTCGATTCCATGAGAAAAAGCGTCAGCATGAACAACCTTTCACAGTACGAGCATAGGCACGACGCTAACAACAACAATAAAGATGTTCTCGCAGTTGGTTATGCCTCAGCCGATGACGCCGTTCCTCATAACACTGGCCGCCACCGTGAGCGGGAGCGCAAGCGAGGAGTTCCGTGGACAGAGGAAGAGCACAAACTGTTTTTGGTTGGGTTGCAGAAGGTAGGGAAAGGTGATTGGAGAGGAATCTCCAAAAACTATGTGAAAACGCGAACTCCGACGCAGGTTGCGAGCCATGCTCAGAAGTACTTTCTCCGAAGAAGCAACCTGAATCGTCGTCGCCGTAGATCCAGCCTCTTCGACATCACCACCGACACGGTATCTGCAATTCCAATGGAGGAAGAACAGGTCCAGAATCAAGACACCCTGTTTCATCCGCAAGCAGTGTGCCCAGCAGTTCCTGAAACTAGCAAAAGTGGAATTCCAATGATGCCAGTGTATCAGTTTGGGATTGGTTCTGGGGCTATTGCAGTCCAAGGTGGGAAACCATTAGAAGAACTCACTCTGGGACAAGGAAACATAGAGCACAATGTGCCAATCAATCTGGTCCGTGCAATTCCTGTTGTTGCAGATCCTAAAGCATCCACAGTGTCGGATATCATCACCCCAAGTTCTAGTTCTGCTCTTGACCCACCCACACTGTCCTTGGGGCTAGCCTTCTCTTCTGACCAAAGGCAAACATCATCAAGACATTCTGCTTTACATGTCATGCCATGTTTCAGCAATGGAGATAGCACCATTAGTGTTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_06695::LG1:97904817-97906817(+)
AAATATGATTAAATATATATTTTTTCTTAGTTGTTAATTAGTAATTTCTCTTTGAATTTTTTATTAAATTTAAGTTTTAACTTTAAAAATGTGTAGACTTAATTATTTTAATTAATTTTTTTTAATTTTAGTTAACATCTAATATTTGAATTCTTTATATAATTTGGTACATTTTACTTCAATATAAATAAAAAATACATTAAATAAATTAGAAAATTTAATTAAAATTTAAAAAATAAAAAATTAAATTAGTATAAAATTTAAAAATGATAAGTTTTAATTTTTAATTATAAATAACCAAAATTATATTTAATAATAAAACATATTTATGATTAAAAATTAATTATTATCATAATTATTAAAATAAATAATATATAGTTACTAAAGTTTACGTTGAATTTATAAAAGAGTCTTCAAAAGTAATCATCGATATAGTTTTATTTATTAATTTCTATAATGTTATAATTACATAATATTACATACAATTATATTATCACATTATTACTAAAAATTATTTCTATTTATAAAGATAAAAACAGTAAAATAAGAACACACACATAAAGCAACTAATAAAAAAGGTCACATTATTAATTGTGTAAATAGTTTTAATTATGAATTATTTGTTATATGTAAATGAATCAATAAAATTAGTTAGATTTATAAAACTGAGAGATAGAAAAATATGTACATATATAAAACTTATAAAGAAAAGTTATCTTAATAAATTTTTTAATTCTTATATTTATATTAATGAATCAATACATATTTTTATTTAATATGGCTGTTATATTTTAAAAAAATATTTGATTAATAATGTTAACATTAGTTCTACTATTTTATTCTGAAATTGAAGAATAAACTAGTAAAAAATTAATAGTTATACTAATAGATGTTAACTCATCTTCTAAGCAACATTAATATTGATTTATGAAAAAATACCACTGCTAAATTTAAAAAAAAAACATTGAGTCAAATATAAATAAAATAACATTAAATTATTGTTACAATGTAAGCATCAAAATTCTATTAAACTTATTATTAATTGTTATAAATCACATTTGACGTACTTTAGTTTGTTGGCCATTATATTATTAGTTCATATAAATTAACAATCATTTTTTAATACATGTTTTTATTAACTCTTGTCATCACTTAATTTGTTATCTTTAAAATAATTAGAGCTAAATGTTTTTTTGCTACATACTTAAGACTTGGGTTAATGTGCTGTAAGTGTATTAAAATATTATAATTGTGCTTATGAAGCTAAAAGGAAATATGGTCAATTTTAAAATTTAAATATTATTTTGTTGTAGTTGTTTTCCAGAACGGTGGTTAGATCTTCATCCAGTTGTTATCTAACATCCTCAATTAGTCATCTTAATATTTTAACTCATTTACTAAAATAACAATAAATAATTAAATTTAAAGACTAGATAAAAATGAACATATCATGCACACTTGAATAAAAGTTTTTTTAATTATATAATTTAAAGTAACAAACAACTATTCCTTTGTAAGTTTTAATAGCTTATGAGACTTAAGTGATAATGAATTAACCTTTTTTGAGAATCAAAATGACTGTGAATCTTATTTTATTTGTATGTGTAATATTAAAAAATAATGTTCGGTATATTTAATTTGTAACTTTAACTTCTTTCAGTAATAATATATTAACTATTGATATTTTATTAAATAGATTTAATGAGTCAAGCTAACATGTTGTTGACCTGCAAAGTTGTTATAAAATATTTTATAATTTTACCTTAAATATATAAAAAATTACTTTCTAATGAATGGATAAATAATAGCTGAAAATTGAATTCAGAATTATTAAAGCAAAAAATAACAATGTAAAAAAAAAACTTGTCTATACGTTTCAGTTAAGTTTTTTAAAAGATTATTAAATTGAATTTTTAAAAATATATGCTCCACATGGTTGCCACCTCATTGCCGTCTGAAACTCTGTTGTATTAAACACCACGCACTCACCTTTGATCCTA


Gene Sequence:
>Vu_06695(+)
AACTTCTCTCTCCTTCATATACTTCGTCTTCTCTCTCCTTTCACCGATTCACAAAACTCCCTTGTGTGGTCTCTGATTCTATCTGAATCAAACGAACTAACCGAGATCACCGTCCGATCCGATCATGTCTCGTGCCTGCGCTGCTACAGACTCGGTTGCCTCCGGCGAGATCATGCTGTTTGGGGTTCGAGTGGTAGTCGATTCCATGAGAAAAAGCGTCAGCATGAACAACCTTTCACAGTACGAGCATAGGCACGACGCTAACAACAACAATAAAGATGTTCTCGCAGTTGGTTATGCCTCAGCCGATGACGCCGTTCCTCATAACACTGGCCGCCACCGTGAGCGGGAGCGCAAGCGAGGTTCCATCCATTTATTCCATCAAATTGTCATTTTTTAATTTTAATATAACTTCTCTCGTTTGATCGCATAACCGGTGATTCTGATGGATTAATTGAAATTGTGTTGTTGATTAGGAGTTCCGTGGACAGAGGAAGAGCACAAACTGTTTTTGGTTGGGTTGCAGAAGGTAGGGAAAGGTGATTGGAGAGGAATCTCCAAAAACTATGTGAAAACGCGAACTCCGACGCAGGTTGCGAGCCATGCTCAGAAGTACTTTCTCCGAAGAAGCAACCTGAATCGTCGTCGCCGTAGATCCAGCCTCTTCGACATCACCACCGACACGGTAATTTAATCACCGCATTTCTCTCGGTCTCATCCTCTGTTACCTGTTTGTCCTTTATTTTAAAAAGGATTGATTCAAATTAATTTCTTAATCAGTCTCCCTATAAAAAAAATTACTGAGATGCTTTTGGTGTTATTCCTGTTCAATTAGTTATACTCCTAATCGGTAGAGTATTATTGTCTTACAAAATGACATATTTTCTCAAGTATTTCTTAATGTTCTAGTCAATAGTCGTGTGTTGAATATTATTACTCCTTCCATTTTAGGGATTTGAGAAAGAAAGAAAGAAGCTGCCGTGTATCTTGTCATGAAATTCTATTAGTTATGGAAAGGAAATTTTGCGTGTGAGTGGTTATAAAAATGGATTTAGGGATTTTGTCTCCTGTGTAATAGTTGACCTGACTGGAGCAAAACCTTTTCAAACCTGGATTGGAATTTGGAGTGACAAAATATTAATGATTTTATCAATTTTTGTGCCAGGTATCTGCAATTCCAATGGAGGAAGAACAGGTCCAGAATCAAGACACCCTGTTTCATCCGCAAGCAGTGTGCCCAGCAGTTCCTGAAACTAGCAAAAGTGGAATTCCAATGATGCCAGTGTATCAGTTTGGGATTGGTTCTGGGGCTATTGCAGTCCAAGGTGGGAAACCATTAGAAGAACTCACTCTGGGACAAGGAAACATAGAGCACAATGTGCCAATCAATCTGGTCCGTGCAATTCCTGTTGTTGCAGATCCTAAAGCATCCACAGTGTCGGATATCATCACCCCAAGTTCTAGTTCTGCTCTTGACCCACCCACACTGTCCTTGGGGCTAGCCTTCTCTTCTGACCAAAGGCAAACATCATCAAGACATTCTGCTTTACATGTCATGCCATGTTTCAGCAATGGAGATAGCACCATTAGTGTTGCTTAAGGAAGATGACTCGTGATTGTGTCAAGGTCCTTGTCTAGAGTATCTTGGATTTACAGGTTAATATAATATGTTCATCTCTAGTCTCTTGTCCTTCTGGTAGGGGAAAAAGTGAGAGATGTTGAAGGAAAGGGTGATGGATTTAAGAAGGCAAGTTTTAAGTGACTGAATATGATCCTTCTGTTCCTTGTACAGACCCGGGAAAGGTCCTGTCCTGTTTCTTCTTGTTTGCTTATGTTAATTAATGTATGACTTTAGATTATGGTTTATTTGGTCATTTATGTCTGTAGTTGATGTAACTGAAAATAACAAAATCCTCTGTTTTTTTTCTGATAATGCATTAATAGTTGGATATGGACCGCACAGACGAGTGGTTTATGACTCTTTTGGGGATAATATTATCAAGTTGGGTCTGAACTTTGAAGGTT