Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06642 LG1 97323319 97324120 PREDICTED: transcription factor WER-like
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 97323388 missense_variant p.Ile180Thr
T/C 97323464 missense_variant p.Met155Val
G/A 97323665 missense_variant p.Arg88Trp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06642.1
MEAYENESKKGFWNAEEDSVLTNYVKKHGTGKWNRIPKVTGLKRSGKSCRLRWMNYLTPDVKRGDFSEEEEDLVVRLHSLLGNRWSLIAGRIPGRTDNQVKNFWNTHLSKKLGVDKKRKRKACVTAKYIPGVEAEGASSMERSGEGEKLVHESWSDDLMELGNMHEGIMRDDFGCSFSFPNSVFDLCTSPYCTQSFHHSFFAL*


CDS Sequence:
>Vu_06642.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06642::LG1:97324120-97326120(-)
CTTCTATCACTGCACCATATTCACCGTCAAGATCAAAGTTTACCCAAACACACACCACACGACCTCAAGAACAAAATCACAATAGTCTAAAATAATCCTTATATTTTTCTTTTTCTCTTCTAAAGTACTTACCAAATTCAATCTTCAAGTAATAATTAAATTTGAATATTTTCTTCAATATACTTCAAAATTATAATCTCTCACATTCAACTAATATGGAAGGAAGAGAATAAAAAAGTTTAAGTAAGTTTTACCTCAGTGTAAATATAGATACTTTTAAATAAATTTGCTAAGTATTTAAAACATTTTTTTTGTATATAAGTGTTATTTTATTTATTTTGTTGTCAATAAAGTTATATGATTATTTTTTTTTCTAATTCATTGATGAATTTCCATTTTTTTAAAATTTTGTCCAACTTCTTAATCAACTCGTTCTTAAAAAAGAAAAATAACAAATTGATGAATGAGTTAAAAAATATTGTAAATGAAAGAAGGAAATAGATCAATGACTTAAAGACAACAAAGCAAGACTAACATTTATGTCATCTTACAATAAAATTAATTAAATACAAAATTAATTAAATGTAGAATACTTAGAGAAAATAAAAAAAATTGAGCAATCAATATAAATAAAATTCTTAGTAGAAACTTAATTCAAAATACTTAAATATATTCAAAATACAGTTAGTTATAAATACTTAGTTAAATTCTTATTTGCTCAGCACAGTTGCTTTTTGTTTAGCGAAAAATTTATTCTTTTCACTAGACAAGGATAACATTCGTTAGACAAACATAAATAGGGTCTTTCTTGTCGAAAATAAGAGAATTATTTATCGAACGGGAGGTTCCTAAAAAATCCTTAAAATTTCTTTAAACTTCCACTCCTCTACAAAAGTCTCAATATAATTAATGTATCCAAAAGAAAATATTTAAGTCTTAAACCCTAAAAAAAATTTGACATAAAAACAAATAAAAAGATTCAATAAGCATGATAAACAAGATATTATCACACTTATTAAGAAGCCTTTTACCTTTTATTTTTCACTTTATTAATTTCAAATAAAAATAATTTATTTATAATTAATTAAATATTAACCTCAAAAACATTTTAATCACTCGCAAAATTTCATAAAATCTTCTCATATTTTCCTTCATTTCTTACAATATTTCCTCCCATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTATCATCTCTCACATTTATTGCTTCTTCTATCTTCTCCCTCTATTTTTGTCATCTCACCTGCAGGATGTCATCGATATTTTGGTTACGCATACCAAAATTTTCTATTTCAAACACCTTCTTTCAGCAGTACCCAATACTACTGAACCCTACTGCGCTGCTTTATCTGCACTCATTAAATGGCCAAATGAATCAAAAGGGTGTGATTTTAAAACAATATTTAATTACGTAAATTTAAGAAAATTATATGTAGATAAATAAGACATTGCTTAAAAGTTTAAAATTGGATTTCTTGCATAATTTTGATTTAGTTTAATTTATCTTGGAGATTTCAAATTTGGATATTTCTAGTACAGAACTAAATAGTTACAGCATATTGTACCAGGAAGTTAACTTTAATTTTAACTAAATTGTATAAAATTTAAATATATTTATTTAGAATAACTTTACTTATCTTTCGTAAATAGAAAATTGTTTTTTTTTCATATTACTAAATCAAATCACCACTCCTTTTCTATTTTTTTAACATATCCTCCCTCTCTTGCATTTTCTCTGTTGCTAATTCTTCCTCAGAATATTTCATTTAGAGAAAAATTAAATGTGAACTGCTATATATATGTATATGAGGTATTGTAAGTATGTTATGCGGCAGGTTGTTTATATAAGCTTCGAAGCTTATATATTCGTACTATAAAAGAGTAAGACCATTGATCCCATTCAAGGCCTCTCGCGAATTTTCTAACTTAGTTCCTTTGCAATTACTTTCAGAACTGCAGCAAACAAGAGAAAGGCTTAAACTTTGCAACA


Gene Sequence:
>Vu_06642(-)
ATGGAAGCTTACGAGAACGAATCGAAGAAGGGGTTCTGGAATGCGGAGGAAGACTCGGTTCTAACTAATTACGTGAAAAAGCATGGAACTGGGAAGTGGAACCGGATTCCTAAAGTGACAGGTATGTGTGTGTATGTATAATGTCACTTTTCATAGTCATCTCATGGATGCGATCTCGTTTAATTTGTTCTGATTTTGATTGTAGGGTTGAAGAGAAGCGGCAAAAGTTGCAGACTGAGATGGATGAATTATCTGACTCCCGATGTTAAGCGTGGAGATTTCTCAGAAGAAGAAGAAGACCTTGTTGTTCGGCTTCACAGTCTCCTTGGAAATAGGTTATTTCTTATTATCAGATAAATTGTTAGAAGAATATAAAGTCTTGATTTGATGGTAGGTAGTTACGATCGATTAAACAAGGGTAGTGCCTTTTTTATTGTTAAGGTGGTCTTTGATTGCGGGGAGGATTCCGGGGAGAACAGACAACCAGGTGAAGAACTTTTGGAACACTCATTTAAGCAAGAAGCTTGGTGTTGATAAGAAGAGAAAGAGAAAAGCTTGTGTGACTGCAAAATATATCCCTGGAGTTGAAGCTGAGGGTGCATCATCAATGGAGAGGAGTGGCGAAGGTGAGAAGCTTGTCCATGAAAGTTGGAGTGATGATCTGATGGAGTTGGGAAACATGCATGAAGGGATTATGAGAGATGATTTTGGATGTAGCTTTTCTTTTCCTAATAGTGTGTTCGATCTGTGCACTTCTCCTTACTGCACTCAATCTTTTCACCACTCTTTCTTTGCCCTTTGA