Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06301 LG1 93431035 93431648 probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 93431060 missense_variant p.Cys157Arg
C/G 93431211 synonymous_variant p.Arg106Arg
G/A 93431446 missense_variant p.Ala68Val
G/T 93431527 missense_variant p.Ser41Tyr
G/T 93431576 missense_variant p.Arg25Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06301.1
MDPLTPNRVAFPGLAGLARSVERRRIERPALQPHLHIWSLSLGGARRVCRRHHRPHPLPYLRLGGLQALQSQPRFHPRQNPVRDWEEPPNLLPRTCLASLIFNDPAGVEPRLLDQVSTVISKVSHLGWGHWYTLRELEDSTNTFAPENVIGEGGYGIVHHRKIVP


CDS Sequence:
>Vu_06301.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06301::LG1:93431648-93433648(-)
CACAGTTCGCTAATCTTGTCACGGTTATAATTTAGTTATTCGTTTCGTCGTGCATTATCACACCGTTACACTCGTTCGATCATAGTGCCTCATAAACCCAATCACATCGCCAAGGAGTCTTGGGTCTCAGTCGCACTGCACATTGCTCTAAGGAGTAGATTTTTCAAATATCTTTCATCTTGTTGACATTGCTTGTCTATTCACCCTCATTTGTTGTTGTCGTCGTCCCCTGGGTTGTTGGAAGCTCCACTAAGGGTTGCTCTACCTACATTGGTGGTTTTGAAAGTGGTTTCGCAAAAACTCTTCATCCCATCATCTTGTTGTCACCACTTGTTCCTCTATCCCTTTGTTGTTGTTGTCCTCCCTTAGGTTGTTGGGGGCTCCATTAAGGGTTTCTCTACTTGCACTAATGGTTTTCAAGGTGTAACCACAATAGCGAAGGTTTCCCATCTCTTAACTATAAGTTTTTAAAATAGTATTTAATTTGAATATTTTGGACTATTTATAATTAAATTTAACTTTCATTTGAATATCTAATTAAGATTATATTTTTTTATTGTGCATTCACTCTTATATGTTGAATGTGTTCGGTTGACTAAAGGGTGTTCAACCCTCTAGAAGTTATTATTTTAAATATCAATGTTATATTTGTATTATCTCTTAATTTCATGTTTAAGATTCAATTTAAAGACTCAATTCTACTTTTATTTTTAATTATTTTAAAATAAAATGTCTTAGATGGTAAATCCACTGTATTTTCATCCCATCTTGTTTCAATTTATCTTATGGTATGTAGTTTGCATTGAATTTATTATCAACTAAATTCTCTTAGTTCTTTATATATCAATTACATAAACTTTATATATTAGTGCAATAAGCAACATGTGGACCATAGCTCATGCTAACATTGTTGATTTATGACAAGATGTAAGTGTTTTTTTAACTATTTAACTTTCATATATGCTTTATTATAACATAATTAATATATATTCCATATTACAAGTTTTTTATGGAGTCAAACCATTGGGAACAAACAAACTTGAAGAAATTTGCATAAAATGGGCAAGATATTTTTGAGACATAAAAATTAGTTTTCATAACCATTAGGAATGTTTTATTTAGATGTTTAAGTATTTTATGGCCTTAACCTTTAGCATAATACTTTTTGATATGTTTTTAGTACTTTAGTATACCTTAAGACAAGTATTGATGTTTGCAACCTGGTATTTGATTTGTCTGTAATATGGAATGTATTGATTTTTCGCAGGTTGTGGTTTAGAAGCTAGAAACCAATGTTGTATTAAAAAAACAATACATATTACATCGGTTTTAACCATAACCAATATAATATATATTGTTATTTTTTTAAAATACAACAATCACTAGTAAAAAAACTAGATTTAAAATCGATTAATAGGCCTCGGTTTTAGTGAAACCGAAACCTATTAAAACACGGTGGCAGAATTGTAAATAAAGTGAATTTTTATGACTCGGTTCACAGCGAACCGATGTCTAACAATTTGAATTCTGCTCTACTACCTCGGTCAATTGGAGACCCGAAGCAATAGGTGTTGTCACTTCTGCTCTACTGCCTCGGTCAGCTTGGGACCCGAGGCGATAGGTGTTGTCCGTGATTTTTATGGCTCCGTTTTTGTATTAACCGAGGCATTAGATGTGCTTTATCTCCAGGTTAAACATTTTTACGCTACTGTTGTTCCTCTTTCTTCTCTCTGCGTAAAACTAGCCTTTCTTCTCCAGCCACCGCAACTGCTGCACTGCTGGACCGCGCCTCCACCATGCCAGCTACCACCGCCTTCATTCCTCACCCCTCTCCTTTCTTCTTCTTCTCCTTGTTCTGCTTCTTCTTATTGTACTCTTTTTCACTATCTAGTTTCGTCTTTGCTGGAGGAAGGAAGGAATGAACAACACATGGGCCATGGATCCTCTGACTCCCCGCTTTCAAAAATGATGAAGATGAAGTCCGCGGGGCTGCAGGTACT


Gene Sequence:
>Vu_06301(-)
ATGGATCCTCTGACTCCCAATCGGGTAGCCTTCCCAGGTCTCGCCGGTCTTGCCCGATCAGTCGAGCGGCGCCGCATTGAACGACCAGCTCTCCAACCCCACCTCCATATTTGGTCTCTGTCTCTAGGTGGTGCTCGGCGTGTGTGTCGGCGCCACCATCGTCCTCATCCTCTTCCTTATCTCCGTCTGGGTGGCCTTCAAGCGCTCCAAAGCCAACCCCGTTTCCATCCCCGACGTCTCCAAGGAGATCCAAGAAATTAGGGTCGACCACGCCCCCACCCCAACCCGACCCTTTTCCCGAACCTGACCCAGTTTCGCCCACCGAGGAAAAAACCAACCCTCTCAACTACCAGAGAATCCAGTTCGAGATTGGGAAGAACCACCGAATCTCCTACCCCGAACGTGCCTTGCTTCGCTCATCTTCAACGATCCCGCCGGTGTTGAGCCTCGCCTCCTCGATCAGGTTTCCACCGTCATTTCCAAAGTTTCACACTTGGGCTGGGGCCACTGGTACACTCTCCGAGAGCTTGAGGATTCCACCAACACCTTCGCCCCTGAGAATGTTATTGGCGAAGGAGGATATGGAATTGTTCACCACCGCAAGATCGTTCCAT