Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06282 LG1 93169704 93173156 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 93169774 missense_variant p.Asp24Gly
C/T 93169775 synonymous_variant p.Asp24Asp
G/T 93169816 missense_variant p.Arg38Met
A/G 93169831 splice_region_variant&intron_variant
T/G 93170175 downstream_gene_variant
T/C 93170238 downstream_gene_variant
C/G 93170272 downstream_gene_variant
A/G 93170288 downstream_gene_variant
G/T 93170414 downstream_gene_variant
C/A 93170738 downstream_gene_variant
T/A 93170788 downstream_gene_variant
T/C 93170859 downstream_gene_variant
T/C 93170942 downstream_gene_variant
A/T 93171470 downstream_gene_variant
C/A 93171574 downstream_gene_variant
A/T 93171767 synonymous_variant p.Pro102Pro
A/C 93171883 downstream_gene_variant
T/C 93172174 downstream_gene_variant
C/G 93172396 downstream_gene_variant
A/T 93172606 downstream_gene_variant
G/A 93172650 downstream_gene_variant
C/T 93172741 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06282.1
MEERYESLKELGSGNFGVARLAKDKKTGELVAVKYIERGKKIDENVQREIINHRSLRHPNIIRFKEARYFFQQLISGVSYCHSMEICHRDLKLENTLLDGKPSPRLKICDFGYSKSALLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLSRKEYDGKISDVWSCGVTLYVMLRIIGVQYSIPDYVRVSSECRNLLSSIFVADPAKRITIPEIKQNPWFLKNLPKEIIEAERKGFEETNKDQPSQKVEEIMKIIQEARVPGQGSKAGDGIGGQGATGSLDIEDVEEIDVSGDYEHV*


CDS Sequence:
>Vu_06282.1
ATGGAGGAGCGGTATGAGTCATTGAAGGAGCTTGGTTCTGGGAATTTTGGTGTGGCCAGGTTGGCAAAAGACAAGAAGACTGGAGAGCTTGTTGCCGTCAAATACATAGAGAGGGGTAAAAAGATTGATGAGAATGTTCAGAGGGAGATAATTAACCACCGATCTTTAAGGCATCCAAATATAATCAGGTTCAAAGAGGCTAGATATTTCTTCCAGCAGCTAATATCCGGTGTTAGCTACTGTCATTCAATGGAAATTTGTCATAGAGATCTGAAATTGGAAAACACTCTCCTGGACGGAAAACCATCTCCTCGACTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCCAAGTCTGCTCTACTGCACTCTCAACCTAAATCAACAGTTGGAACTCCTGCATACATTGCTCCAGAGGTTCTGTCACGAAAGGAGTATGATGGGAAGATTTCAGATGTTTGGTCCTGTGGTGTGACTCTTTATGTCATGCTGAGAATAATTGGTGTTCAGTACTCCATACCCGACTATGTTCGTGTTTCTTCTGAGTGTAGGAATCTTCTCTCTAGCATCTTTGTTGCTGATCCTGCCAAGAGGATCACCATTCCAGAGATAAAACAGAATCCTTGGTTTCTGAAGAATTTGCCTAAAGAGATCATCGAAGCTGAAAGAAAAGGATTTGAGGAAACAAATAAAGACCAACCAAGCCAAAAGGTGGAAGAAATCATGAAGATCATACAAGAAGCAAGGGTACCAGGACAAGGATCCAAAGCTGGTGATGGTATCGGTGGGCAAGGTGCTACTGGATCATTAGATATTGAGGATGTCGAGGAAATTGATGTTAGTGGTGACTATGAACATGTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_06282::LG1:93167704-93169704(+)
TAATGAGTTTTCATTTTATAATTTTTGTCGTATATAATTTTATCTAATCACAAGCATAATACATCCGAAGGAATTGGGAATTGGTCTGGAGGGTTTTTTTTAGAAATGATGATTCAACGTATGCAGATGATGAGATTTGAGAGGTTAGTGAATATAGTGAAATTGAAGAGATCTTGAATGAACCTTTGCCTGAAGGTGAATATGTCAAAGGCAAATTGTTTAACGACAAATGTTTCTGATTTTTTTCAATTGAAACTACAGTAGGGATGACAGAGAAAAATGTTGGAGGGATGAAGAGAAAGGGTTGAGATGAATGAGAGAGGTCAGTAAGGGTTTGAGAGTTTTTTTTTTAATTTTGATAATGAAAATTATTAAAATACCTTTAACCTTAAAACTTAGAATGCATAATATATAAGAATATTTTTGTCTACTAAAACACTTCAGATGCATACGCGTTACCAAACCCCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATGTAGTAAATCGAACTTCATTTATCTAATACCCTTTGATTTTTGTAATAAATTTCATTATGTTTGAACAAAGTTTCCTATAAAGATTTATAAATTATAAAGGTAAAATAAAATGAAATTGTTGATAAATTAAAACGAATTTACCTATTAATTTATACATAAATTACCTTTAACTTGAATAAATTCATTTTGATTTTTCTTCTCTTTAATACCATCACCACAATGCGAAAATCCAAAGGGGCATTTTATACATTTATCTAAACATACATTAAGTTACTAATCTTATCTGCATTATTTCATTAAAATATATAATTATAGTTCAAAATATTAATTTAAATAGTTTAGTACATTGTAATAAAATATTGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAATTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATCTCTATGTCTTCCTTTCATACAATCAAGTAAAGATATTCATTTTACCTTATCCAATTTAAGGCTTTTCATAGCTCCAGAGAAGTGACATATGAAAGGAAGACACAGATATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTATACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTAAAATATTTAACTGAATTACTGTAAAATGTAAGTGACGAAAATCCTGGAAGACACGCAAAGCAAAGGTGAATTGAATTGAAGAGGAAGACAATCCGAATTTTAATTCCGTTTAGAAAGCAGACACTCATCATTGTAATGAAAGAGAAGCCGCGTAAGATACTTTACTCACTAACAACCAACATCTTCTCACCCTTTCTTTTCTTTTCCTCTCTCTCTCTTCAGCGGCTCTTAAACACCGTTGTCACTTCACCCCTCTTTTAAAATTCTTCGTATTCTATTCTTCACTTTTCCACATATAAAAAAAGCCTACAACTTTTCACGGAGTAATTTGCTAGTAGTACAAAGGTGAGTGAGCAACTCAACTCTGCAGCTACAAGAACATCACTTTTTTTTTTCTTTATATTCGCTCATGATTGATTATGTTTGTTTCTTTGAATTTTTCCTTGCCTCCGTATGCCACTTTGTATTAAATTAAATTAAACTGACCCTTCTTAAATTTATTATTTTGTACATACATGCTAATATATATATATATACAATATTGTTGTCATGAATATAAGATTAAGGTGTGTTCACTTATTGGGGTCCTCTGTGTATAAGTCCTTGAGAGGTGGGTGTTGTAGCTTTTGGGAAGGTTGACA


Gene Sequence:
>Vu_06282(+)
ATGGAGGAGCGGTATGAGTCATTGAAGGAGCTTGGTTCTGGGAATTTTGGTGTGGCCAGGTTGGCAAAAGACAAGAAGACTGGAGAGCTTGTTGCCGTCAAATACATAGAGAGGGGTAAAAAGGTAAACCTCTTTTTGCCAAATTGTTTCACTTGCAGTGAAATTCCATTGACTACTACTGAGTACTCACTAATGCTGTTGCTGGCTCAGAGATTTTCTTTGCATTGATTGCTCTTTTTCCTCACGATCTGAATTTGGAAACTACCTGTTTTGTTTTGTGTTTTTTTCTGCTCGTATATGAATTTTATATGATATCTCTGGACCGTGTTTTTCTTTCAAAATCTTAAATTGAATGTTCAATGTTTCATCATATCATATGAATCAAGGTACAATAACAATGGTTGGATTTTTAAATCTGTTAACCAGAGGAGCTACTTTTCCTGGTTATGATATTTCCTTCCTCCTTGTGTTTCTCAACTAGTCAACTCTCGAATTTATACTGTATTGTACTGATTGGTAGTTTCCATGAAAGTCTTATTCAGCATCATCTCGAGGAAAATTGGAGAATCGATATGCTGCAAGGCATAGAGTCTACAAAGTTCACTATTTATTCCCTGCGAGCAATAATAACCCATTTGTTTGTTTCTTCTTTTGAATTTCAAGTACAAATAAAAAAAAATTGAATTCTGTAGTTCCTCTTAAATGTCTTTGCCATTCTTGTTGAAATTATGACCGTCCTTTGATGATTGGAGATGTACATGACATAGAATTATTTTTGTTGTTCTCTCTATGGAGCTTATGTAGCTTACTTCACCATTCTCAACGAGAAGCTATCATCAAAGCTTAAAGGGATAACTTCGTTTTTATATTTTTTGTGCAAAGTCTTTCTCATGTGTTTTTCTTCTGAATGAGCTAGTTTTTGGTACCAGATTGATGAGAATGTTCAGAGGGAGATAATTAACCACCGATCTTTAAGGCATCCAAATATAATCAGGTTCAAAGAGGTGAGACCTTACTTTTCTTCTGCAAACTACCCCTTCGTTAGATTTGAAGGGAAATTGGGCGTTTTTAGTTAAGCAAGTGGTTAATCTGCTCTATTTTTGGTGCTTGCAACTCTCATGTTGCACTCTGCTTGAAATTTTTTTTCGTAATGACTTTTGATTGTGTAGTTTGTAGTTCCCTTTATAACGAGTTGTAATTGTTGACATAATGTGCACAAAGTCATTTGGAATGTTGCATTATTACTAAAAGTAATTGGGTCATAATCATTTGCCGTCAGACAATTGGCGTTTACATAATTCAAATTGATGTGACGTACTGTACATAATATTTTCCCCATAACTCCTCCTTCAGTAAAACTTGCAATCCAAGATCATCGATATGAAAATATCTGCTGAAATCACTTGGACCAGTATCTTCAGAAGAAACTATCAATAAGTCAACAAGATAATCTTTAGCCATAAACTTGACTCGTACCAAATGAAAAGGAGAAAAAAAAATGCTTATTAATATCATTCCCTTCTTTTAATGCTGTAATTTGTTTATTTTCTTCATGGGCTCAAATTCTACTCCATTTTTTCTAGCATGATGTGATGCCTTTTCTATTCAGAGTTTTAAGAAGTCTCGCACAATGAAATGCTGAATCAGATATATTTTCTGTAGGTCTTGCTGACCCCGACACATTTAGCTATTGTCTTGGAGTATGCTTCAGGTGGTGAACTTTTTGAGAGGATATGTAGTGCTGGTCGATTTAGCGAAGATGAGGTAGTAGAATCTGTAGTGTAGTTGATTTATTGACTTTTCCTTTCATGTAATCCGTATTCAGAAATAAGGTATATATTCATATTGAAATTTACCAAGTGAATGAATTCCCCGCATTGCAGGCTAGATATTTCTTCCAGCAGCTAATATCCGGTGTTAGCTACTGTCATTCAATGGTATGCACTCTGAACCCATTCTGTTCTTCATTACAAGCTCATCTCTTATGTAATGCTATACTGCCTATTTCAGGAAATTTGTCATAGAGATCTGAAATTGGAAAACACTCTCCTGGACGGAAAACCATCTCCTCGACTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCCAAGGTTAAGTGTTAATAGCATTCACCTACAAGAGGCTTTTTGAATATATAACATGCCTTACATTATATTCTGTCCACACATATGTTTCTTATAATTTTTCTTGACTTTCCTATCTATTTCAACATGTAATTGTAGTCTGCTCTACTGCACTCTCAACCTAAATCAACAGTTGGAACTCCTGCATACATTGCTCCAGAGGTTCTGTCACGAAAGGAGTATGATGGGAAGGTATTAAGACTTTTTGTTATTTCCCTAGGAATTTGAATATCATGTCATGTCACAACCAATGGGAATAAAAGCCATGGTTCATGGTTTAACAATTTAAACCATTCTCACTTCCATTTCAAAGTTCCTAAAATGATTTTGAATGTCCAATTTCTTAAGCAAATTGGCCTTTTTGTTTTTGTAGATTTCAGATGTTTGGTCCTGTGGTGTGACTCTTTATGTCATGCTGGTTGGTGCATACCCATTTGAAGATCCAGAAGATCCCAGAAATTTCAGAAAGACTATCGGGGTGAGCAATTGTTAGTTGTTTAACTTAAAGTTCATTTATGGTTAATCTGATATAGTAGAAAACTTAAAATCTGAGTCTCTGGTTGGTAGAGAATAATTGGTGTTCAGTACTCCATACCCGACTATGTTCGTGTTTCTTCTGAGTGTAGGAATCTTCTCTCTAGCATCTTTGTTGCTGATCCTGCCAAGGTATGTATCTCTAATTCTCCTAAGAGCAATGATACATGAACATTAATTATTTTTAAACATCCATCAATGCCTATCATTTCTCTCTCTCTCTCTGCCTATCACATCATAACATTGTTAAATTTTATATTATTTCTTTCTTTCTTTGAGTGGCATTAAGTATTTTTTGATGCAGATAAATTATTTTTCTTCTCTAAAAGCATGTGTACTTGTCATACAACATGTAATAACAGAATTACAAAGACCTTAGATCAATCAATATTTAACATTAAATGGAATTAGTATGCATTTATCTAACTCATAGCAACTCACATTGATTTTGTTCTAGAATATTAGAGTCTTCACCTCTCTAAATCTTACTATTTATGATCTTTGTTAAAGAGGATCACCATTCCAGAGATAAAACAGAATCCTTGGTTTCTGAAGAATTTGCCTAAAGAGATCATCGAAGCTGAAAGAAAAGGATTTGAGGAAACAAATAAAGACCAACCAAGCCAAAAGGTGGAAGAAATCATGAAGATCATACAAGAAGCAAGGGTACCAGGACAAGGATCCAAAGCTGGTGATGGTATCGGTGGGCAAGGTGCTACTGGATCATTAGATATTGAGGATGTCGAGGAAATTGATGTTAGTGGTGACTATGAACATGTGTGA