Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06229 LG1 92389808 92392285 PREDICTED: plant intracellular Ras-group-related LRR protein 5-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   developmental growth
Cellular Component   located in   nucleus, plasma membrane, nucleus, plasma membrane
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 92389842 3_prime_UTR_variant
T/G 92389903 3_prime_UTR_variant
T/G 92389913 3_prime_UTR_variant
A/C 92389921 3_prime_UTR_variant
G/A 92389932 3_prime_UTR_variant
A/T 92389937 3_prime_UTR_variant
A/G 92389994 3_prime_UTR_variant
T/G 92389997 3_prime_UTR_variant
C/T 92390007 3_prime_UTR_variant
C/A 92390032 synonymous_variant p.Ser513Ser
C/G 92390293 missense_variant p.Lys452Asn
A/G 92390728 synonymous_variant p.Ile307Ile
G/A 92391481 upstream_gene_variant
G/T 92391601 synonymous_variant p.Ser167Ser
G/T 92391674 missense_variant p.Thr143Asn
C/G 92391681 missense_variant p.Val141Leu
G/T 92391703 synonymous_variant p.Pro133Pro
G/T 92391877 missense_variant p.Asp75Glu
G/A 92392270 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06229.1
MAPMLESEKDPPKRPSRAFLDTVEEITAIYRSLPPRPSIEEVEAATSTVDTLNNEEQTKLHQISMQKPPRDVPEDLFSVLQQLKKTMLLFHTQQHRREALQLLELENMFQTFGHLIQRASELVSGDIHKQSLPSIPEELVVITDQTETLVKEDEESQKNDFQMIQLSFSTGNGSTEKLSLMKVATLIESCAGSGATTLELRGKLEDQMEWLPVSIGKLSDVTEMDLSENRIMALPTTIVGLKALTKLDLHSNQLINLPHSFGELINLVDLDLHANRLKSLPATFGNLTNLIDLDLSSNGFTNLPETIGNLSSLKILNAETNELEELPHTIGNCSSLSELKLDFNQLKALPEAIGKLEGLEILTLHYNRVKRLPSTVGNLCNLNELDVSFNELEFVPENLCFATNLKKLNLGKNFADLRALPTSIGNLEMLEELDISDDQIKSLPESFRFLSKLRVFRADETPLEVPPRELVKLGAQEVVHYMADFVTKRDAKIVPLKKKKKGFWSWFCSIFCSKLE*


CDS Sequence:
>Vu_06229.1
ATGGCTCCGATGCTTGAGAGTGAAAAAGACCCTCCAAAACGACCTTCACGTGCCTTTCTGGACACAGTTGAAGAAATCACCGCAATTTATAGGTCACTGCCACCTCGACCTTCCATTGAAGAGGTGGAAGCTGCCACGTCCACTGTGGATACCCTCAACAACGAGGAACAAACCAAACTCCACCAAATCTCAATGCAAAAGCCTCCTCGCGATGTCCCCGAGGACCTCTTCTCTGTCCTGCAGCAACTCAAGAAGACCATGCTCCTTTTCCATACCCAACAACACAGGAGAGAGGCTCTTCAACTTCTTGAGCTCGAAAACATGTTTCAAACATTCGGTCATCTCATTCAGAGGGCTTCTGAATTGGTCTCTGGAGATATCCACAAGCAAAGTCTTCCCTCTATACCTGAAGAACTCGTAGTGATCACTGACCAAACTGAAACTTTGGTGAAGGAAGACGAAGAATCACAGAAGAATGATTTCCAAATGATACAGCTGTCCTTCTCTACAGGGAATGGAAGCACTGAGAAATTAAGTCTAATGAAAGTTGCTACTCTTATTGAAAGTTGTGCCGGTAGTGGAGCTACAACCCTTGAACTTAGAGGGAAGTTGGAGGATCAGATGGAGTGGTTGCCGGTGTCAATTGGGAAATTATCTGATGTCACTGAAATGGACCTATCAGAAAACAGAATCATGGCTCTTCCTACAACCATTGTGGGACTCAAGGCTTTAACAAAGCTTGATCTTCACTCAAACCAACTTATAAACCTTCCCCATTCATTTGGGGAATTGATAAACCTTGTTGATCTTGACCTCCACGCCAACAGATTGAAATCACTTCCTGCTACTTTTGGAAACTTGACAAACCTCATTGATCTAGACTTGAGCTCAAATGGGTTCACAAATTTACCAGAGACAATTGGGAATTTGAGCAGCTTGAAGATATTGAATGCTGAGACCAACGAGCTTGAGGAACTGCCTCACACAATTGGAAATTGCTCATCACTATCTGAGCTCAAGTTGGATTTCAATCAGCTAAAGGCCTTACCTGAGGCAATTGGGAAGCTTGAAGGGTTGGAGATTCTCACTTTGCACTATAATAGAGTTAAGAGGTTGCCTTCCACAGTGGGCAATCTATGCAATTTGAATGAACTTGATGTTAGCTTTAATGAGCTCGAATTTGTACCAGAGAATCTGTGTTTTGCAACTAATTTGAAGAAATTAAACTTGGGGAAGAACTTTGCGGACTTAAGAGCCTTGCCAACATCAATTGGAAATCTTGAAATGCTTGAGGAGTTGGATATAAGTGATGATCAAATAAAATCTTTACCAGAGTCTTTCAGGTTCTTGTCCAAGTTGAGAGTTTTTCGAGCTGATGAGACCCCCCTTGAGGTGCCACCCAGAGAATTGGTCAAGTTGGGTGCTCAGGAAGTTGTGCACTATATGGCTGATTTTGTCACCAAAAGGGACGCAAAAATCGTGCCATTAAAGAAGAAAAAGAAGGGGTTCTGGTCCTGGTTTTGCTCCATATTTTGTTCGAAGCTTGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_06229::LG1:92392285-92394285(-)
TTTAAAAAATAGGGTTAAAAAAATTTGACAATTACATTTGGGGTAAATCTGCATGCGATTTAGGGTTCCAGAATCTCGTTTCGAAGAGTGCAACTGTGAATGATTTATGATTCGTTTGTGAATGATTGAATACGAATGGGTAATAATTTTCTTACCAGTGGCAAAAGAGACTGCAAGCTCGTCTACGGAACCAGAGAACAATGATGAACTGGAACATATCACAATAGCGCGGGCTTTACTGAATTACCGTTTGAAGGAGAAGATGACAATGTCTAATCCAAACACTCTCATTCCATTTCATAAAAGGTTTCAGATTCAAAATCCCAGACCAATCAGTTCTCAACCACCGCCAGCCACTTCGTCAAAAATCCTTCCCCTAATTTGCCAAAGGACCGCACCTCGAAGCAAGCCATCAATGGCAACAGCAAATGAAAGTTCTCGAAACAGGCATCCACAGGCTGCAGTGACCGGCGACAATTCCACCCTACCACCACAGTCTTGTGCTCTAGAAAGCCGAGGGATCCGTCCCCTTAAGTTCCCTGCAGTAGGAGCAGCACCTTATGTTCCTATTCGACAAATTTGACAATTACATTTGACAATTAACCCTATCTTTTAAATTAATTTAAATTAATTAATTTAACACATATCACAGTGCCACGTCAACAAAAAATGTACACCTCATCAGTTTTCTTCCACCTAGGCAGCTGTGCCGTTAGTTTTTTAACGCCGTAACAAAAAAGGACTAACTTGCACCGTTTTTGCGAAAAGTGGGATCTTAGTGAACTTTTGAAAAAACGTAGGACCAATTTGAACAGACCCTATGAAAAGTGGGACCAAAATACGAATTAAACCTAAAAAAAATTAGTTAATACTAACTTGGAAATAGTCGTACCGTATTGATTGAGAAATTATGAATAATATCAACAGAAAAATAATTCCCACAATCTCAATCGAAATATAAATTTTATCAAAAGTTCACTGCAAAATCCTTACTTACATCACTAAAAAATATTGATATTTTGTTTTAAATTTTCATCGGGCCAAGCATAATCTCAACTCAATTATAGACATTGACCAAAATATACCACTAATGATGACTAATAAAACTTTGGTTGATAATATCGAAAAATAACATGAAATTTTATTAAGAAAAAATAGCATGGTAAATATAATAAAAAAATAATTACAACTATTTTAGTTTCAAAGAAACATTAATATCATTAACTAAAAAAATATATTAAATAAATATTAAATTAAATTTTAAATCTTTTCATCAATTTGAATATTTTTAATTAAGTTGTTATTAATTTTTTTTCTGTCTATTAATATTCAAAACTTGTTTTTATGTATTTTAGTTGAATCCATGCTATTTTATTTTGTTCGATAATTAAATTACATTATTCTTATCTTAATTCATAATATTGTAATTGTGTTAAAAACGGAGAGATTTTATAATTAATAAAATTACATTATGATAAATTTAAAATAATAAATAATTTTTTTAATTTAATATTATGCTATATTAATCATAAAACCTAATCTTTTTTCTGACACACGAAATATAAAGAACAAAACTTTTAAGAAAAAAAAATACCACCCAATTCAAAAAATAGTTAAATAACAAATACTCAATTAAAAAATATAAATTTTTAAAATATTTAATAAAAAAGTTAATAATAAACATAATTAAAATTACAAAGGAGATTTTTGAGAAACTTAAAATTTAACAAAGTCTTCGCTAAATAACATGTGCAAATTTTAAGATGTCTTAATTAAATCTGAAGACAAAATAAAGCATTTAAATTGAGATCAAAATGAGAATACCTGATCAGAATTAAAAAATATAGTTTTAAATAATGAAATTCTATAATTAAACTGATTGAGTTATTATGATATATTTATATAATTTAAATTTTTATTAAATTTATTGTCCGAAAACGTATTTTAATGATTGAAGTTAAATTTTCTATAAGAATCAATTACTAATGGAGAGAGGTGAC


Gene Sequence:
>Vu_06229(-)
ATTCATTTTCAATTCCTTTAAGATTTTTCTGAAAGGAAAGTGTTTATTTTCTATTTTTCTCGGCAGCCTGTCTGAGCCTGCAAGGATAGTTTGTGTCTACGCTAGAATAAGATAAAAAGCCAAATCCTGAAAGCACAAAGGAACACATTGAAGCCTCTCTCCTTCTTCCATTATAGCAATAATCATGGCTCCGATGCTTGAGAGTGAAAAAGACCCTCCAAAACGACCTTCACGTGCCTTTCTGGACACAGTTGAAGAAATCACCGCAATTTATAGGTCACTGCCACCTCGACCTTCCATTGAAGAGGTGGAAGCTGCCACGTCCACTGTGGATACCCTCAACAACGAGGAACAAACCAAACTCCACCAAATCTCAATGCAAAAGCCTCCTCGCGATGTCCCCGAGGACCTCTTCTCTGTCCTGCAGCAACTCAAGAAGACCATGCTCCTTTTCCATACCCAACAACACAGGAGAGAGGCTCTTCAACTTCTTGAGCTCGAAAACATGTTTCAAACATTCGGTCATCTCATTCAGAGGGCTTCTGAATTGGTCTCTGGAGATATCCACAAGCAAAGTCTTCCCTCTATACCTGAAGAACTCGTAGTGATCACTGACCAAACTGAAACTTTGGTGAAGGAAGACGAAGAATCACAGAAGAATGATTTCCAAATGATACAGCTGTCCTTCTCTACAGGTTTGTATTATGGGAAATAACCAATTTCGTTTTTACTTGTTATTATTATTTTAGTGATTATGTTCTCTCATCTAATTATTGTTCATGGATTATGGTTAAGATTTCAACACCTTTTTGTTTTTCTCTCTTACGTGAAAGAAAAACAAATTTACTTAGCGTTTGTATGCTTTATGAAATGTACAAAAATGGTTTCATAGTTGCTTGATTACTTTGACAACTTATCAATTAGGTAGATCGCTGGGATACTTGTCTTGGTAGAAGTCTTAAATTTCGGTCACGGTCATGGTTCGTTGCGATACTTGATATAGCGAAAATTTATGGACAGGTATTTCTGATGTGTAGTGCAGTCACAGATACCCTAAAAACTTTTATGTTGAAACTGAGATTGTGGTCGTGGAATGTTTTTCGAAACCTTGATTTGCTATGATGTTCTTCCCTTTATTAATTTTGTAGGGAATGGAAGCACTGAGAAATTAAGTCTAATGAAAGTTGCTACTCTTATTGAAAGTTGTGCCGGTAGTGGAGCTACAACCCTTGAACTTAGAGGGAAGTTGGAGGATCAGATGGAGTGGTTGCCGGTGTCAATTGGGAAATTATCTGATGTCACTGAAATGGACCTATCAGAAAACAGAATCATGGCTCTTCCTACAACCATTGTGGGACTCAAGGCTTTAACAAAGCTTGATCTTCACTCAAACCAACTTATAAACCTTCCCCATTCATTTGGGGAATTGATAAACCTTGTTGATCTTGACCTCCACGCCAACAGATTGAAATCACTTCCTGCTACTTTTGGAAACTTGACAAACCTCATTGATCTAGACTTGAGCTCAAATGGGTTCACAAATTTACCAGAGACAATTGGGAATTTGAGCAGCTTGAAGATATTGAATGCTGAGACCAACGAGCTTGAGGAACTGCCTCACACAATTGGAAATTGCTCATCACTATCTGAGCTCAAGTTGGATTTCAATCAGCTAAAGGCCTTACCTGAGGCAATTGGGAAGCTTGAAGGGTTGGAGATTCTCACTTTGCACTATAATAGAGTTAAGAGGTTGCCTTCCACAGTGGGCAATCTATGCAATTTGAATGAACTTGATGTTAGCTTTAATGAGCTCGAATTTGTACCAGAGAATCTGTGTTTTGCAACTAATTTGAAGAAATTAAACTTGGGGAAGAACTTTGCGGACTTAAGAGCCTTGCCAACATCAATTGGAAATCTTGAAATGCTTGAGGAGTTGGATATAAGTGATGATCAAATAAAATCTTTACCAGAGTCTTTCAGGTTCTTGTCCAAGTTGAGAGTTTTTCGAGCTGATGAGACCCCCCTTGAGGTGCCACCCAGAGAATTGGTCAAGTTGGGTGCTCAGGTAAACCTTTAGATTCACTTGTTCCTACTTTGTCACCTTCTCTATTTACTTAACTCTTTGCTCCTTGTTCTTCACCAGGAAGTTGTGCACTATATGGCTGATTTTGTCACCAAAAGGGACGCAAAAATCGTGCCATTAAAGAAGAAAAAGAAGGGGTTCTGGTCCTGGTTTTGCTCCATATTTTGTTCGAAGCTTGAATGATAATCGAACAAAGTCTATGCTAATTTATGTTTCTTGTGCTTGTATTTTGTCTGTCTGCTGCATATGATTGAAACACCTTGTTTTTTCCTAATAGAAAGTAATCTGCAACCTTTTAAATTTGTTTATAACTTTGATTTTCTGCAAATATTGTGTATACAGTGAGTACTTTTGTAACTGAAATAAAAGATATGGCAATTCCTGGGTTTTTAACC