Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06219 LG1 92196970 92199385 PREDICTED: transcription factor bHLH18-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 92196979 3_prime_UTR_variant
T/C 92197011 3_prime_UTR_variant
G/A 92197069 3_prime_UTR_variant
G/T 92197074 3_prime_UTR_variant
C/T 92197308 3_prime_UTR_variant
G/T 92197473 3_prime_UTR_variant
T/A 92197760 intron_variant
T/A 92198053 missense_variant p.Arg265Trp
A/T 92198266 intron_variant
G/T 92198305 intron_variant
A/C 92198342 intron_variant
A/G 92198390 intron_variant
C/T 92198397 intron_variant
G/C 92198430 intron_variant
T/C 92198450 synonymous_variant p.Leu231Leu
G/T 92198809 missense_variant p.Leu112Ile
G/A 92199214 missense_variant p.Ser13Leu
C/A 92199293 5_prime_UTR_variant
C/A 92199298 5_prime_UTR_variant
G/A 92199332 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06219.1
MTEESNKPMDDASAPNWLSDLDMDDYNLFPDECALNLNLFDDQEFLPQDIASALEEQTQSLQRSLSSECPSKTVSNSSTDETSFDFERPAKLLKTTSSSCCNSDSSTITNNLSPKLSPSTSFSSFQSHILSFDNPNSSPPTTTTTTTTHFYGFDLNPTQNEMVSVSMPQLTKSRFPDQTPKGSSKNHNFETKPSHGKRSPAHAQDHIMAERKRREKLSQSFIALAALVPGLKKMDKASVLGDAIKYVKDLKERLAVLEEQSKKTREESAVVLNKPELSGDDDSSSCDECIGADSVSDTLFEVESRVSGKEMLLRIHCLKQKGLLVKLLAEIQRNNLLVINSSILPFGDSILDITIVAQMGENYNLTMKELAKNLRVSANKVVS*


CDS Sequence:
>Vu_06219.1
ATGACGGAGGAATCAAACAAACCAATGGATGATGCATCAGCACCCAACTGGTTATCTGATTTGGACATGGATGATTACAATTTATTTCCAGATGAGTGTGCCCTGAACTTGAACTTGTTTGATGATCAAGAGTTTCTGCCACAAGACATTGCCAGTGCCCTTGAAGAACAGACACAGAGCCTGCAGCGATCTTTGTCTTCGGAGTGCCCTTCCAAAACTGTGAGCAACTCATCCACCGATGAAACCAGTTTTGACTTTGAGAGACCAGCCAAGTTACTGAAAACGACAAGCAGTAGTTGCTGTAACTCTGACTCATCCACCATCACCAACAACCTCTCGCCAAAACTTTCCCCATCCACATCCTTCTCCTCCTTTCAGTCTCATATTCTGTCTTTTGACAACCCCAACTCCTCCCCTCCCACCACCACCACCACCACCACCACCCACTTTTACGGCTTTGACTTAAACCCAACGCAGAACGAAATGGTGTCAGTGTCAATGCCCCAATTGACAAAATCACGCTTCCCTGATCAAACGCCAAAAGGGTCCTCAAAAAATCACAACTTTGAAACAAAACCCTCACATGGTAAGAGATCTCCTGCTCACGCTCAGGATCACATCATGGCCGAGAGGAAGCGAAGAGAGAAGCTCAGCCAGAGCTTCATTGCTCTTGCAGCTCTTGTTCCTGGCCTAAAGAAGATGGATAAGGCTTCTGTGTTAGGGGACGCTATCAAATATGTGAAAGATCTTAAAGAGCGTTTGGCAGTGCTTGAAGAGCAGAGCAAGAAAACAAGGGAAGAATCGGCGGTGGTCCTGAACAAGCCAGAGCTCTCTGGCGATGATGATTCTTCTTCATGTGATGAGTGCATTGGTGCTGATAGTGTCAGTGACACTCTGTTTGAGGTGGAATCAAGAGTGTCAGGGAAGGAGATGCTGCTTCGGATCCACTGCCTCAAGCAAAAGGGGCTTCTCGTCAAATTACTGGCCGAGATCCAAAGAAATAACCTACTCGTTATTAATAGCAGCATCTTACCATTCGGTGATTCTATCCTTGACATTACCATAGTTGCTCAGATGGGAGAAAATTACAATTTGACTATGAAGGAACTTGCCAAGAACCTACGCGTTTCGGCAAATAAGGTTGTCTCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_06219::LG1:92199385-92201385(-)
ATTGTGATTTAAGATATTATGATGGTGTAAATTGTATAAATACATTCATTTCTAAGAAGAAGTGTAATATTGTGAAGTCTAGTGTAGTATATACAATGGTGTAGAGAGTTTGGCGTGAAGTCATCCTAACTCTACCCAACTCACAGACTCATAGAGAATGAGATTTATATGGTAAGAGTTAAAGGAGGTTTCTCGTTACGGGATCAATATAAAATAATGTCATGACGTAGAGGATTGATCAGAACTATGTTTGTCATGGTAATTGACCCAAGTTGAGTCATAACTATTATTTTTAGTCGAATCCACTATAGAAAGATCATGAAAAGTGTAGGACTTTATATGAGCATTGATTCCTTATGTATATGTTCCTGGACTAGAGACTTATAGGTTTATTTGTGTTTCATATGGAATGATGACTTGAATTATGAATACCTGATAGAAACATGAAGTATAGGATCTTAAATGCATGATATAACTTTATAAAAATTAATAATCTTGCCCTTATATTTTATCTATGATTGGTGTTGATTATTCACCTATTATGTTTGTGTGATACACATGAGCATATAATAGTGCAAGAAGCAGTGAAGTCTAATAGTAAAAGTGATTATGAGCTAAATAATAAAAGTTATTACAATCAAGTTTGGTTGTATATGATATAAATATATGGGACCTCTTAATATGATTTCAGTATTCATAATGCATTTTTGTTTGCTTATGATGTGTTAAAAATTTTAAGGAATTTATATTCATATTTGCGTTTCTTGTTTTTACATTGCTTAATACCAAATATGTTAAATTTGATTAGTAAATTAATACATGTTAATTTAGGTTGTTACTAAGAAAACCTAAATTATCTTAATCTTAATCTTGATATAATTTCTATTGAGACAACAAATTATATTATTCTTATTTCTTGCTATTATAAATAAGATACAATACATAATAAAAGTGAATAAAAACAAAATCTTGATTTGTTTAAGTTTTTTTTTTCGAAATTTAAATAAATAAATATAAATATAAATAATTATTTTTTAAATAGTTTTTTTTTTTTCCTAAAAGAACTTAACAAACCAACCCAAGGAATTTGTCAAAGTCATGAAGTAAAATTTATTTCTCCTCTAAAAAGGTTTTCCTATTTAATGTTTATTCGTACCTTCAATAAAAAGAAGAAGACAAATTACCATGTTTAAAATTTATATTGTAAAATTTTAGATTAATAAATTTACAGTAAAACGACTTGTAATTTGAAAAACAAATGCGACGTTAATCTTAACATATTTTATAACACGTTAAATAATTTAAAATCAGTATAACTTTATGTATATAATATGCGGCAATATTTTTCAAAACAACAATGGACTTTAAGATATAAATATGTATTAATTTTATTTAATAGTTTAAGAAAACATTTACTCACTTGACTTGATAGTTATAGAAATACAAATTGATGAAATTTGAAAGGCAGAAAACATGATTAAACTAGGAAAGTTTTATATTTGAACGAGATCCGCCGTGCACATGTGTTTGTGTAATAAAACATAATTACAGAAAAACATAAAGTTAATTAAAAATAAGATAAAAATTAATCTGGGCTGGCTGACTACTTGGCTCAATTATTGAGATGAATAGGTTAATTAATATCACATGATTCATATTCCACGTTCACAGCTACAGGGTGGCACACTAGATTTTCTTGCATCTCCCCTATAATTAAATACTATAAATTTTGAAAGATATGATTAAAAATTGGCAGAGTTATCATCTAACAGCCTATAACAATTTGGAAAATAAAATTTATGCGATATAATTATACAATTTGTCTCATAATAAAAAGACAAATATGAGAAAGAAAAGTAAACAATAATTGATGTGATGAAAAAGATTAGAAAAATATTATTATTAAAAGCATTATATAGATATAAGCAATTTATAAGGCACGAGTAGATTGTCCGCACGTGCTTTATTTCTTTCCTTTGTTTAAAGCCAGTTGAAGAATT


Gene Sequence:
>Vu_06219(-)
GAAAAGGTGAAGACTAGTAGGCTATAAAGATTGAACAAAGTTAACACACATTTCGCATTCAGTAGAAGAGAAAAAGCTTTGAATAGAGAAAGGACAAATCAGTGTTCTGTACGTAAAGTGTTGGTGGCCTAATTATGACGGAGGAATCAAACAAACCAATGGATGATGCATCAGCACCCAACTGGTTATCTGATTTGGTAAGAAAATTGATTTTGATTTCCAATCATGAAAAATGCACAAATGGATGGTTACAAATCCTTTAACACACTTTGTGTTGCTTTTCTTTTTTTTTGTCTTTGATGACAGGACATGGATGATTACAATTTATTTCCAGATGAGTGTGCCCTGAACTTGAACTTGTTTGATGATCAAGAGTTTCTGCCACAAGACATTGCCAGTGCCCTTGAAGAACAGACACAGAGCCTGCAGCGATCTTTGTCTTCGGAGTGCCCTTCCAAAACTGTGAGCAACTCATCCACCGATGAAACCAGTTTTGACTTTGAGAGACCAGCCAAGTTACTGAAAACGACAAGCAGTAGTTGCTGTAACTCTGACTCATCCACCATCACCAACAACCTCTCGCCAAAACTTTCCCCATCCACATCCTTCTCCTCCTTTCAGTCTCATATTCTGTCTTTTGACAACCCCAACTCCTCCCCTCCCACCACCACCACCACCACCACCACCCACTTTTACGGCTTTGACTTAAACCCAACGCAGAACGAAATGGTGTCAGTGTCAATGCCCCAATTGACAAAATCACGCTTCCCTGATCAAACGCCAAAAGGGTCCTCAAAAAATCACAACTTTGAAACAAAACCCTCACATGGTAAGAGATCTCCTGCTCACGCTCAGGATCACATCATGGCCGAGAGGAAGCGAAGAGAGAAGCTCAGCCAGAGCTTCATTGCTCTTGCAGCTCTTGTTCCTGGCCTAAAGAAGGTAATTAACTACTCTTATGCTAGCGCAAGTCAATTATGATTCATTGGAAAATGTTTGCTAAGGAATCAGTTCAGTAGTGGAAAATCATAATTAGAAATTGTTATAATACACTTGATTATCTGTTTGATCATAGAATTGCTAATAAAATTTACATAGTTAAGTAATTGGATTAAAAAATTTATACTGATATTCAACTTTAACCTGACACACTTGCCTAAAAGATAAAGAAGTCATCAATGCCACTGGCTTGGTTACCCTGCTTGACTAAACGTGTGGAAAATGTGTTGATCCACGCAGATGGATAAGGCTTCTGTGTTAGGGGACGCTATCAAATATGTGAAAGATCTTAAAGAGCGTTTGGCAGTGCTTGAAGAGCAGAGCAAGAAAACAAGGGAAGAATCGGCGGTGGTCCTGAACAAGCCAGAGCTCTCTGGCGATGATGATTCTTCTTCATGTGATGAGTGCATTGGTGCTGATAGTGTCAGTGACACTCTGTTTGAGGTGGAATCAAGAGTGTCAGGGAAGGAGATGCTGCTTCGGATCCACTGCCTCAAGCAAAAGGGGCTTCTCGTCAAATTACTGGCCGAGATCCAAAGAAATAACCTACTCGTTATTAATAGCAGCATCTTACCATTCGGTGATTCTATCCTTGACATTACCATAGTTGCTCAGGTAGAAGGACAATCCTTACCTTAATAACAAAAATAATGATCATACTGTAATATTATTTTTATAAGCTCTTGTCATTTTTCTCGCACACTCACTACGTTTTTAATTGCTTGAATCTATACCAACTTGAAGTACAATTAGTTTAATTGTATTTGAATGCTGATGGTTTTGCAGATGGGAGAAAATTACAATTTGACTATGAAGGAACTTGCCAAGAACCTACGCGTTTCGGCAAATAAGGTTGTCTCATAACATAAACGCGGCTCGAGTATGGGATACCATGAAGATATATGGCAAGAATCAAAACTCTGAATCAGAATTGGTGCACCAACCATAGAGTAAATAATCCTAAAATGGAATGTTTTCTGTTAATGTGAGATCTACTCCAGCTAGCTTACAGTGTTCCTGTGTTCCCCGAAATGCAGATGATCGATCCAAAAGGGATATTGTCTTTTTCGTGTTGTGCGTGGTTTCTCAGGCCTTCGGTCTGTGCCTGCTTGACAAAACAAAGAGTATTTGAATAATTTTGTGGAGATATTAGGAATGGTTCCAATCTGACACGGCTTAGTTAACGCGAGCTTAATTAGAGATAATAAGTTAAATTAGTGATGACTTATGACACTGACAGCTTTTGAGTTTGATAATCTGCTCTCTTTAATCTTTGATCATGTTTGAAAGATGCAAATCTCTCTCTTTAGGCCTTTGCTTGTTTCAATAGAAAATGAGAAATTCATATTTAATATTGAGGCACCAACATTTATGTAAACCACTTGCTATACATCTAAGTTTATACTTTGACAATCAT