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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06214 LG1 92100676 92104276 serine/threonine kinase
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 92100702 missense_variant p.Ser811Phe
G/A 92100710 synonymous_variant p.Ser808Ser
G/A 92100715 missense_variant p.Pro807Ser
T/A 92100727 stop_gained p.Arg803*
T/G 92101166 intron_variant
G/A 92101220 intron_variant
G/T 92101261 intron_variant
T/A 92101269 intron_variant
A/G 92101315 intron_variant
A/T 92101348 intron_variant
C/T 92101361 intron_variant
G/T 92101371 intron_variant
T/G 92101379 intron_variant
G/A,* 92101623 intron_variant
G/T 92101766 intron_variant
G/A 92101768 intron_variant
G/A 92101814 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06214.1
MRLFLCSLFFFLFHSHTLHAARISEYRALISFKASSITDDPTNALSSWNTTTPYCSWFGVTCDSRRHVTILNLTSLSLSGTLYDDLSHLPFLSYLSLADNQFSGPIPSSFSALSALRHLNLSNNAFNATFPSNLARLANLQVLDLYNNNMTGPLPLAVAAMPLLRHLHLGGNFFAGQIPPEYGTWQHLQYLAVSGNELTGNIPPELGNLTALRELYIGYYNAYSGGIPPEIGNLSQLVRFDAAYCGLSGDIPADLGRLQNMDTLFLQVNALSGSLTPELGNLKSLKSMDLSNNVLSGEVPASFAELKNLTLLNLFRNKLHGAIPEFVGELPALEVLQLWENNFTGSIPQSLGRNGKLTLVDLSSNKLTGMLPPDMCYGNRLQTLITLGNYLLGPIPDSLGKCESLNRIRMGENFLNGSIPVGLFGLPKLTQVELQNNLLTGQFPEGGSVAVNLGQISLSNNKLSGPLPPTIGNFTSMQKLLLDGNKFSGQIPSQIGRLQQLSKIDFSHNQFSGPIAPELSRCKLLTFIDLSRNELSGEIPNQITAMRILNYLNLSRNHLVGSIPGSIASMQSLTSVDFSYNNLSGLVPGTGQFGYFNYTSFLGNTELCGPYLGPCKDGVANGPRQPHVKGPLSSSLKLLLVIGLLVCSIAFAVAAIIKARALKKASEAQYAYTLKVDEKSDVYSFGVVLLELVTGRKPVGEFGDGVDIVQWVRKMTDSNKEGVLKVLDPRLPSVPLHEVMHVFYVAMLCVEEQAVERPTMREVVQILTELPKPPSSKQGDLTESSLSSSNSLESPTTASKESKDNQRPPQSPPPDLLSI*


CDS Sequence:
>Vu_06214.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06214::LG1:92104276-92106276(-)
ATGTTATTGATTTAAATGATTTGAATAAAAAATGACTTGATTGATGCATATTAAACCCTCTGGGGACGAAATTGAAGTTTTTTTTAAAAAATGGGTATAAAGTAAACACATTGCCCTGAAAAGTGGATACCAAAGGACCAATTAAACCATTTTTTTACTACAATCATTGATGACCTACAAATTTGTATTGAATTTAACTTATTTATTATTTTCTTAAATTAATAATTTAATTCTATTAATTAATTTTTTAATTTATTTTACTCATTTATTTTTTATCTATATATATTATGTGGAAATAATATATTGTATTGAATTTTTTTTTTTTATAAATTTTGAGATGTTACAAGCTCAGTGACATAGTATCTCTTAAGTAAACTATTCATTGTTTGAAATGAACACTTGAATGAGTTATAACTTATGGTGGAGCTAAATAGTCTATGACAGATGCTCTTATGAAAGAATTTGTTGACTCTTTATTGGGTGTTTGGACATCACAAGGTCTCTCTCATCGGTTATATGCTCAATGCATATGGTACCAGTCTAACAAGAAAGTCGACGTACCGAAGATAATAAAGTAATCAAACATAATACATTGTCATGAAGTTGTGAAGAAAGTCTTTTGAATGAGGAGTATAACCATGAAGCTAAAGATACAAGACCAAATTACCAGTGTCTAAATGTAATAATAATAATACCACACAATTGTCCAATAATCAAATATTCTATGAAAAAACTAATGCTCTCAAAAATGAGTTGTAAATTGAGTCGGATTAGATTTTAAAAAAATATAATTCTTTTATACGAACTAGTTTTCAACTTGGTTCACTTAGAACTCGACTCATCGTGACCAACCTATCTAATTTAATTTAATTATTTATTATTTTGTGTTTCAATATTATTAATTAACATTTTTTTTATTATATTGTAGAAGGTGATACAGAATAAGATGTTTTAAGAGAGAAAAATATTATAGATTTATTTATTCAAGACTCTAATATTATAAATGCACCAGTGGTACAAAAATTATCAATATTGAAAACGTATTTGTTCGTCTTTTGTACATGTTTTTGGATTGTACTCGGATTATATGATACTTTTTTTATTTATTTTGGATTGTCTTTGGAGTTTAACATCATTTTAGTGTGGCGTTTATTTAGAATTGAATTAAAAAAAATTGTAATTTTTTTATTTTAAAAATAACTTATAATTAAATGAGTCAGTGAACCAATCCATTTAACGCACCAAGCCTTCGTGAATGAGGCTGGGTTTAAATTTTTTCAACTCAATAAATTAATCGAATTGAATTGACTCACTAAATAATTAACTTATAGTGAATTAGACAAGATCAAGTCGAATTACCCATTTTGACAGCTCTAGAAAAAATAAAGGACATGCATGAGAACATTACTCACGTATATAAGAAGGAGTTCTTTTACCATTTGAAATTTGATCCAGTAGCATTCATGATTAGGTCTATAATAGACTCAATGACAAGTAGTAATTCTTGTTTAAGAAATCTGAGTTGAATTAGGTCTATAATAGACTCAATGACAAGTAGTAATTCTTGTTTAAGAAATCTGAGTTGAATCAAGGGAGAAAATTGTGAAGACTATCTCATTGTGGACAATTGAAGTAAATTATCTAATCTCTTTTAATTTTAATCCATCTGCGCAAATTTATGTCAACAAGATCCTTAGCAACTAGTGATTTGCAAGGGTGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGGGAAAGAGGAAGATGGTTAAGATTGTAAGTATGTGTGAGTGTTGGAAGGGGATAAAGATGTGGGAGGGTCTGCTGAACATGGCTGAACATTGGCTCAGTCCTCATCCACTCACTCTGCTAAGGGGTCAGTGATCAGTAGCAGTCACACAAACAAACACACAATACAACATGTACACTCACTCACTCACCCTTTAACTCACTTCCCTCTCATTTTCGTTTTCGTTTTCCTTTCCATTTCTCCATTTCTCCATACCAACACAAA


Gene Sequence:
>Vu_06214(-)
ATGCGACTCTTCCTTTGTTCTCTCTTCTTCTTCCTCTTCCATTCTCACACACTCCATGCTGCGCGCATCTCAGAATATCGCGCGCTTATCTCTTTTAAAGCGTCTTCCATAACCGACGACCCTACCAATGCTCTCTCCTCCTGGAACACCACCACTCCCTACTGTTCCTGGTTCGGTGTCACGTGCGACTCCCGCCGCCACGTCACCATCCTTAACCTCACCTCCTTGTCCCTCTCCGGCACACTCTACGATGACCTCTCCCACCTCCCTTTCCTCTCCTACCTCTCCCTCGCCGACAACCAGTTCTCCGGCCCAATCCCCTCCTCCTTCTCCGCACTCTCCGCCCTCCGCCATCTCAACCTCTCCAACAACGCCTTCAACGCCACCTTCCCCTCCAACCTCGCCCGCCTCGCCAATCTCCAAGTCCTTGACCTCTACAACAACAATATGACCGGTCCCCTCCCCCTCGCCGTCGCCGCCATGCCCCTCCTCCGCCACCTCCACCTCGGCGGCAACTTTTTCGCCGGCCAGATCCCTCCCGAGTATGGCACCTGGCAGCACCTCCAGTACCTCGCCGTCTCCGGCAACGAGCTCACGGGAAACATCCCTCCGGAGCTTGGAAACCTCACCGCGCTTCGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGGCGGCATCCCGCCGGAAATTGGAAACCTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGATGCCGCGTATTGCGGACTCTCCGGCGATATTCCGGCTGACCTCGGAAGGCTTCAGAATATGGACACGCTCTTTCTTCAGGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTGAGCTGGGGAACCTGAAGAGTCTCAAGTCGATGGATCTGTCCAACAACGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGGCCAGCTTTGCGGAGCTCAAGAATCTCACTTTGCTGAACCTCTTCCGGAACAAGCTCCACGGTGCGATTCCAGAATTTGTCGGAGAGCTACCGGCGCTGGAGGTTTTGCAGCTATGGGAAAACAACTTCACGGGAAGCATTCCTCAGAGTCTGGGAAGAAATGGAAAACTCACTCTCGTTGATCTTTCTTCGAACAAGTTGACGGGAATGCTTCCTCCTGATATGTGCTACGGGAATCGTCTTCAGACTCTGATAACTCTCGGGAATTATCTGCTCGGTCCCATTCCGGATTCGCTTGGGAAGTGCGAGTCTCTGAATAGGATTCGAATGGGTGAGAACTTTCTTAATGGTTCTATTCCTGTTGGTCTATTTGGGCTTCCCAAACTCACCCAAGTAGAGCTTCAGAACAATCTTCTCACTGGACAGTTTCCTGAGGGTGGTTCCGTTGCTGTTAATCTCGGTCAGATCAGTCTCTCTAATAACAAGCTCTCTGGGCCGTTGCCACCCACCATCGGAAACTTCACCAGCATGCAGAAGCTTCTTCTCGACGGTAACAAGTTTTCGGGTCAAATCCCTTCGCAGATAGGCAGGCTGCAGCAGCTCTCCAAGATTGATTTTAGCCATAATCAGTTTTCGGGCCCCATTGCTCCCGAGTTAAGCAGGTGCAAGCTTTTGACTTTCATTGACCTCAGCCGCAATGAGCTCTCTGGTGAGATTCCAAATCAGATAACTGCAATGCGGATATTGAATTATCTGAACCTTTCAAGAAACCATTTAGTTGGCTCAATTCCAGGCTCCATAGCTTCTATGCAAAGTTTAACATCTGTTGATTTTTCCTACAACAATCTCTCTGGTTTGGTTCCTGGAACCGGGCAGTTCGGCTACTTTAACTACACCTCTTTCCTAGGGAACACTGAACTCTGTGGTCCTTATTTGGGTCCTTGTAAAGACGGGGTTGCCAATGGCCCTCGTCAACCTCATGTTAAAGGTCCTCTCTCTTCTTCGTTGAAGCTTCTGTTAGTTATAGGGTTGCTTGTGTGCTCCATCGCATTTGCTGTTGCGGCAATAATCAAAGCTCGGGCTTTGAAAAAGGCTAGTGAAGCTCGTGCGTGGAAATTAACTGCGTTCCAGCGTTTGGACTTCACTGCTGATGATGTTCTGGACTGCTTGAAGGAGGACAACATAATAGGAAAAGGAGGTGCAGGCATTGTGTACAAAGGTGCAATGCCGAATGGGGATCAGGTTGCTGTGAAAAGGTTACCTGCCATGAGCAGGGGATCTTCGCATGATCATGGTTTCAATGCTGAGATTCAGACATTGGGGAGGATTCGACACAGACACATTGTTAGACTGTTGGGTTTCTGTTCAAACCACGAGACAAATCTCTTGGTGTATGAGTATATGCCTAATGGAAGTTTGGGTGAGGTTCTTCATGGCAAGAAAGGTGGTCATTTGCATTGGGACACAAGGTATAAGATTGCTGTGGAGGCCGCGAAGGGCCTGTGCTATCTACATCATGACTGTTCGCCACTCATTGTCCATCGAGATGTTAAATCCAACAACATCCTTCTTGATTCTAACTTTGAAGCTCATGTTGCGGACTTTGGGCTCGCTAAGTTCCTGCAAGATTCTGGAACATCTGAATGCATGTCTGCAATTGCCGGTTCGTATGGATACATAGCTCCAGGTAATATTCTGAAATTCAACATAATTGATGATTTATACGTTGAACTAGCGTGACTAACAGCCTTTACTTATATATGGAGTCATTAACGGTCGGAGCTTGTCTCATGTCCCTCAACATCATTGACTTAGGGGCAGAACCGAACTGTATCAACACTGTTGTTTGGTTTAGACGTTTTATGTGCCTAATTAATTAATAAACGCAATATGTTGCCATCCTTGACTCGTTTTCGTTTTCGTCGCACACTAACAACGACCGCTTTCATTTGTCATCTGTTTTATGTTGTATCAAAATACTGTTACTGTTTAAAGCAAACATTAGCCGAGTTGTCGTTTGAGTCTTCGTCGTAGCCCCCATCCTATAATTAGGAAGTCCTGTAGTCATAGATTAGAGATGTTCACAATTGAAAACAGATGGTGATTAACTGGCAACATGTACATCAAAGTAAATAGATAACAAATTCGCATGGTCTCAGGTTTCACTTTATGTTAATTGTTTTCAATTAATGTGGCTGCTTTTTTTGTTCATGGTCACTGATTTAGGTTTGTGATTTTGACTGCAGAGTATGCCTACACGTTAAAAGTTGATGAGAAAAGCGATGTGTACAGCTTTGGAGTTGTTCTTTTGGAGCTTGTAACAGGCAGGAAACCAGTTGGGGAGTTTGGTGATGGTGTGGACATTGTGCAATGGGTGAGGAAAATGACGGATTCAAACAAGGAAGGAGTTCTAAAGGTTCTTGATCCTAGACTTCCATCAGTTCCTCTCCATGAGGTGATGCATGTTTTCTATGTAGCCATGCTATGTGTTGAAGAACAGGCAGTGGAGCGACCTACTATGCGAGAAGTTGTTCAAATTCTCACCGAGCTTCCAAAGCCACCGAGCTCTAAACAGGGGGACTTGACGGAGTCCTCTCTGTCTTCATCAAACAGTTTAGAGTCTCCAACCACGGCATCTAAGGAATCTAAAGATAATCAACGCCCTCCTCAGTCTCCACCACCCGATCTTCTTAGCATTTGA

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