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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06213 LG1 92091231 92094843 serine/threonine kinase
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 92091647 missense_variant p.Arg681His
C/T 92091927 intron_variant
C/T 92092126 intron_variant
A/G 92092161 intron_variant
G/T 92092175 intron_variant
G/T 92092277 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06213.1
MRLFLCSLFFFLFHSHTLHAARISEYRALISFKASSITDDPTNALSSWNTTTPYCSWFGVTCDSRRHVTILNLTSLSLSGTLYDDLSHLPFLSYLSLADNQFSGPIPSSFSALSALRHLNLSNNAFNATFPSNLARLANLQVLDLYNNNMTGPLPLAVAAMPLLRHLHLGGNFFAGQIPPEYGTWQHLQYLAVSGNELTGNIPPELGNLTALRELYIGYYNAYSGGIPPEIGNLSQLVRFDAAYCGLSGDIPADLGRLQNMDTLFLQVNALSGSLTPELGNLKSLKSMDLSNNVLSGEVPASFAELKNLTLLNLFRNKLHGAIPEFVGELPALEVLQLWENNFTGSIPQSLGRNGKLTLVDLSSNKLTGMLPPDMCYGNRLQTLITLGNYLLGPIPDSLGKCESLNRIRMGENFLNGSIPVGLFGLPKLTQVELQNNLLTGQFPEGGSVAVNLGQISLSNNKLSGPLPPTIGNFTSMQKLLLDGNKFSGQIPSQIGRLQQLSKIDFSHNQFSGPIAPELSRCKLLTFIDLSRNELSGEIPNQITAMRILNYLNLSRNHLVGSIPGSIASMQSLTSVDFSYNNLSGLVPGTGQFGYFNYTSFLGNTELCGPYLGPCKDGVANGPRQPHVKGPLSSSLKLLLVIGLLVCSIAFAVAAIIKARALKKASEAQYAYTLKVDEKSDVYSFGVVLLELVTGRKPVGEFGDGVDIVQWVRKMTDSNKEGVLKVLDPRLPSVPLHEVMHVFYVAMLCVEEQAVERPTMREVVQILTELPKPPSSKQGDLTESSLSSSNILESPTTESKEPKDNQRPPQSPPPDLLSI*


CDS Sequence:
>Vu_06213.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06213::LG1:92094843-92096843(-)
GGTGAAGATTCAACTATAAAAGACTTTCTCACACTTAAGTTAGTAAGAAAGTTGAGTTTTTTGAGTAAGAGATAATGAGTATATGAAAGAGAGTGTATTTTCTTTGAAATACCATGTGTATTTATAAGATTTCTAGACCCTATGGTTCATGTGGTAAAAATAGATAGTATAGAAGGAATATAAAATAGTATTAACAAATATAATAACTTATTCTAGAGCTGTCAAAAAGGGTCGCCCGACCCACTACTGGTTGGTCACTTAGTGAGCCAACCCAACCCAACTCATTTATTAGCGAGGCTGAAAAATTTGAACCCGTCCCGACCCACCACGGGTTGGCTCACTTGCTCACTTAATTACAATTTCTTTTAAATAAAAAAATTACAAACTTTCTATAATTCAAATTTAAACAAATTTCACTCTCAACGTGAGTGTTTAATTAATTTTGAAAATAAGAAACTTAAATAATTTTTTCAAGCAAAAAATAATAATAAATATTTTTTTATAAAATTCAAATTAAATTTTAATAAAATAAAATTAGGTAGGTAGGTTGGTAGGTCCCGCATGAAATGAGTTTAAATGAGCCGTGTTGAAATCTGACCCACATAAAAAAAATTACAATTTTTTTAAATTCAACCTGGCCTGAATCCGTGGTGGGCCAGATTTGACACATTTTGACACCTCTACGATAATTAGCAAAAAAAAAATAATAGTAATAATTTGATACCTTACTTGATATACAAAATATTTTGTAAGAATATGTCATCAAAGAATATCATGACATAATCAAACTACCTAGATTCAGTTACTTATACGATTAATACATGAATTTTTATACCAACAAATATATTTCAAAATATCTTCTAAATATTTTGTTAGTAAAAGTGAATAAACCTTTTTCAAATGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATATAAAAGATGCAGAATTTTTATGTATATATGATATTTTAAGCATCATATATGTTATTTTCATTTTAAAAATAAAACAGTTTTTTAAATATTTTTAATACAAAATTCTATTTATTCCTTAAAGAAGTAATTATTTTGAAAAATCTTTATTTTAAAAACACTTATTCTAAGTTTTAAGTTTCAAAACGAAACCAATATTTTAGAAATTGTATAGCACTAACATGACACCGCGTTACTCATTACCAATATGAAACTAATGTGCATTCGTCATTACCAAATTAGATTAGTTGTGTCATGCAAAAGAAACCATAGACGAAAGGTTGGGCACGAGAAGGGACCAAATTTGTTGAAAGAAACTTGAATGTTGTGACACTTCAGAAAATGCCGATAATATATTTTGTTTTCTTCACGTACTTCTGTCCACGATGAGATGATAAAAATTCTAGAAAAGAAGACTACACTAACCGTAATTAGTCAAATAAAATAATATAAAGATAAAGTGACAAATGTATAAATGCGTGAGCATTAAGGACAGTGATAGAATTAGAAAGGACAAACTAAAATTTGTGTAATGGTACAACAACAGAACAATTCATAAATGAGTTACCTAACACAAACCTCAAAACATGCAGTAGACATACTATAGGTATTCTACGGAGAGCTTTTCTGGAATTTTTTAGCTAATGATTTGTTGTTACAGTATACACTGTTTCAATCGTTGGAAATGTGAAGGTATGGTATGATTTGCAAGGGTGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGGGAAAGAGGAAGATGGTTAAGATTGTAAGTATGTGTGAGTGTTGGAAGGGGATAAAGATGTGGGAGGGTCTGCTGAACATGGCTGAACATTGGCTCAGTCCTCATCCACTCACTCTGCTAAGGGGTCAGTGATCAGTAGCAGTCACACAAACAAACACACAATACAACATGTACACTCACTCACTCACCCTTTAACTCACTTCCCTCTCATTTTCGTTTTCGTTTTCCTTTCCATTTCTCCATTTCTCCATACCAACACAAA


Gene Sequence:
>Vu_06213(-)
ATGCGACTCTTCCTTTGTTCTCTCTTCTTCTTCCTCTTCCATTCTCACACACTCCATGCTGCGCGCATCTCAGAATATCGCGCGCTTATCTCTTTTAAAGCGTCTTCCATAACCGACGACCCTACCAATGCTCTCTCCTCCTGGAACACCACCACTCCCTACTGTTCCTGGTTCGGTGTCACGTGCGACTCCCGCCGCCACGTCACCATCCTTAACCTCACCTCCTTGTCCCTCTCCGGCACACTCTACGATGACCTCTCCCACCTCCCTTTCCTCTCCTACCTCTCCCTCGCCGACAACCAGTTCTCCGGCCCAATCCCCTCCTCCTTCTCCGCACTCTCCGCCCTCCGCCATCTCAACCTCTCCAACAACGCCTTCAACGCCACCTTCCCCTCCAACCTCGCCCGCCTCGCCAATCTCCAAGTCCTTGACCTCTACAACAACAATATGACCGGTCCCCTCCCCCTCGCCGTCGCCGCCATGCCCCTCCTCCGCCACCTCCACCTCGGCGGCAACTTTTTCGCCGGCCAGATCCCTCCCGAGTATGGCACCTGGCAGCACCTCCAGTACCTCGCCGTCTCCGGCAACGAGCTCACGGGAAACATCCCTCCGGAGCTTGGAAACCTCACCGCGCTTCGCGAGCTCTACATTGGCTACTACAACGCTTACTCCGGCGGCATCCCGCCGGAAATTGGAAACCTGTCCCAGCTTGTCCGTTTCGATGCCGCGTATTGCGGACTCTCCGGCGATATTCCGGCTGACCTCGGAAGGCTTCAGAATATGGACACGCTCTTTCTTCAGGTGAATGCGCTCTCCGGCTCGCTCACTCCTGAGCTGGGGAACCTGAAGAGTCTCAAGTCGATGGATCTGTCCAACAACGTTCTCTCCGGCGAGGTTCCGGCCAGCTTTGCGGAGCTCAAGAATCTCACTTTGCTGAACCTCTTCCGGAACAAGCTCCACGGTGCGATTCCAGAATTTGTCGGAGAGCTACCGGCGCTGGAGGTTTTGCAGCTATGGGAAAACAACTTCACGGGAAGCATTCCTCAGAGTCTGGGAAGAAATGGAAAACTCACTCTCGTTGATCTTTCTTCGAACAAGTTGACGGGAATGCTTCCTCCTGATATGTGCTACGGGAATCGTCTTCAGACTCTGATAACTCTCGGGAATTATCTGCTCGGTCCCATTCCGGATTCGCTTGGGAAGTGCGAGTCTCTGAATAGGATTCGAATGGGTGAGAACTTTCTTAATGGTTCTATTCCTGTTGGTCTATTTGGGCTTCCCAAACTCACCCAAGTAGAGCTTCAGAACAATCTTCTCACTGGACAGTTTCCTGAGGGTGGTTCCGTTGCTGTTAATCTCGGTCAGATCAGTCTCTCTAATAACAAGCTCTCTGGGCCGTTGCCACCCACCATCGGAAACTTCACCAGCATGCAGAAGCTTCTTCTCGACGGTAACAAGTTTTCGGGTCAAATCCCTTCGCAGATAGGCAGGCTGCAGCAGCTCTCCAAGATTGATTTTAGCCATAATCAGTTTTCGGGCCCCATTGCTCCCGAGTTAAGCAGGTGCAAGCTTTTGACTTTCATTGACCTCAGCCGCAATGAGCTCTCTGGTGAGATTCCAAATCAGATAACTGCAATGCGGATATTGAATTATCTGAACCTTTCAAGAAACCATTTAGTTGGCTCAATTCCAGGCTCCATAGCTTCTATGCAAAGTTTAACATCTGTTGATTTTTCCTACAACAATCTCTCTGGTTTGGTTCCTGGAACCGGGCAGTTCGGCTACTTTAACTACACCTCTTTCCTAGGGAACACTGAACTCTGTGGTCCTTATTTGGGTCCTTGTAAAGACGGGGTTGCCAATGGCCCTCGTCAACCTCATGTTAAAGGTCCTCTCTCTTCTTCGTTGAAGCTTCTGTTAGTTATAGGGTTGCTTGTGTGCTCCATCGCATTTGCTGTTGCGGCAATAATCAAAGCTCGGGCTTTGAAAAAGGCTAGTGAAGCTCGTGCGTGGAAATTAACTGCGTTCCAGCGTTTGGACTTCACTGCTGATGATGTTCTGGACTGCTTGAAGGAGGACAACATAATAGGAAAAGGAGGTGCAGGCATTGTGTACAAAGGTGCAATGCCGAATGGGGATCAGGTTGCTGTGAAAAGGTTACCTGCCATGAGCAGGGGATCTTCGCATGATCATGGTTTCAATGCTGAGATTCAGACATTGGGGAGGATTCGACACAGACACATTGTTAGACTGTTGGGTTTCTGTTCAAACCACGAGACAAATCTCTTGGTGTATGAGTATATGCCTAATGGAAGTTTGGGTGAGGTTCTTCATGGCAAGAAAGGTGGTCATTTGCATTGGGACACAAGGTATAAGATTGCTGTGGAGGCCGCGAAGGGCCTGTGCTATCTACATCATGACTGTTCGCCACTCATTGTCCATCGAGATGTTAAATCCAACAACATCCTTCTTGATTCTAACTTTGAAGCTCATGTTGCGGACTTTGGGCTCGCTAAGTTCCTGCAAGATTCTGGAACATCTGAATGCATGTCTGCAATTGCCGGTTCGTATGGATACATAGCTCCAGGTAATATTCTGAAATTCAACATAATTGATGATTTATACGTTGAACTAGCGTGACTAACAGCCTTTTTTTCTATATGGAGTCCTTAACGGTCGGAGTTTGTCTCATGTCCCTCAACATCATTGGCTTAGGGGTAGAACCGAACTGTATCAACACTGCTGTTTGTTTTAGACGTTTTATGTGCCTAATTAATTAATAAACGCTATATGTTGCCTTCCTTGACTCGTTTTCGTTTTCGTCGCACACTAATAACGACCGCTTTCATTTGTCCTCTGATTTATGTTGCTTCAAAATATTGTTACTGTTTAAAGCAAACATTAGCCGAGTGTGTCGTTTGAGTCTTCATCGTAGCCCCCACCCTATAATTAGGAAGTCCTGCAGTCATAGATTAATCATAGATTAAAGATTTTCACAATTGAAAACGGATGGTGATTAACTGGCAACATGTACGTCAAACTAAATATATAACACATTCGCATGGCCTTAGCATTCATTTTTTGTTAATTGTTTTCAATTAATGTGGCTGCTTTTTTTGTTCGTGGTCATTGATTTAAGTTTGTGATTTTGACTGCAGAGTATGCCTACACGTTAAAAGTTGATGAGAAAAGCGACGTTTACAGCTTTGGAGTTGTTCTTTTGGAGCTTGTAACAGGCAGGAAACCAGTTGGGGAGTTTGGTGATGGTGTGGACATTGTGCAGTGGGTGAGGAAAATGACGGATTCAAACAAGGAAGGAGTTCTAAAGGTTCTTGATCCTAGACTTCCATCAGTTCCTCTCCATGAGGTGATGCATGTTTTCTATGTAGCCATGCTATGTGTTGAAGAACAGGCAGTGGAGCGACCTACTATGCGAGAAGTTGTTCAAATTCTCACCGAGCTTCCAAAGCCACCGAGCTCTAAACAGGGGGACTTGACGGAGTCCTCTCTGTCATCATCAAACATTTTAGAGTCTCCAACCACGGAATCCAAGGAACCTAAAGATAATCAACGCCCTCCTCAGTCTCCACCACCCGATCTTCTTAGCATTTGA

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