Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06196 LG1 91867151 91870950 PREDICTED: AP2-like ethylene-responsive transcription factor ANT isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 91867231 5_prime_UTR_variant
A/G 91867310 5_prime_UTR_variant
C/A 91867511 missense_variant p.Pro35His
C/T 91867769 intron_variant
A/T 91867790 intron_variant
A/T 91867799 splice_region_variant&intron_variant
T/A 91867961 missense_variant p.Phe151Tyr
A/T 91868024 missense_variant p.His172Leu
T/A 91868136 synonymous_variant p.Val209Val
G/A 91868498 intron_variant
T/A 91868755 splice_donor_variant&intron_variant
A/G 91868761 splice_region_variant&intron_variant
A/G 91869250 intron_variant
G/A 91869587 intron_variant
C/A 91870639 missense_variant p.Pro606Thr
C/A 91870907 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06196.1
MKSMENDDSVDLNNQNNWLGFSLSPQMNVGVASHPQPSSAADVVPTSFYHTAPLNNYGFYYGLEAENVGLYSALPIMPLKSDGSLYGMEALSRSQTQAMATTSTPKLENFLGGEAMGTPHYECSVTETIPLSLDSVFYNQSSRRDPNNQTFQNHVQHITTQQQHQQDLQAQHLSYYSTLRNHDMMLEGSKQSQTSDSNLQLPNMGDDGVPAPGLKSWGVRNFQTSHAQDSKLIVPVEENGGESGSIGSMAYGDLQSLSLSMSPSSQSSCVTSSHRTSPAVIDSVAMDTKKRGPEKVDQKQIIHRKSIDTFGQRTSQYRGVTRHRWTGRYEAHLWDNSCKKEGQSRKGRQVYLGGYDMEEKAARAYDLAALKYWGPSTHINFPLENYQNELEEMKNMTRQEYVAHLRRKSSGFSRGASMYRGVTRHHQHGRWQARIGRVAGNKDLYLGTFSTQEEAAEAYDIAAIKFRGVNAVTNFDITRYDVEKIMASSNLLSSELARRNRETDSGTQYIDHNHKSSAYDDTQEAILMQKSCESQNEQWKMAPYQSSQQLDQNPPRTESDRTNQSFSVALDNMFHQEVEESRKVRTHVSNPSSLATSLNSSREGSPDRTSLPMLSGMPSTASKLLSTNPNNVNSWDPSPHLRPALSLPQMPVFAAWTDA*


CDS Sequence:
>Vu_06196.1
ATGAAGAGCATGGAAAATGATGACTCTGTTGACCTTAATAATCAAAATAACTGGTTGGGTTTCTCACTCTCTCCTCAAATGAACGTAGGTGTTGCTTCACACCCCCAACCTTCCTCTGCTGCTGATGTGGTTCCTACAAGTTTTTACCACACTGCACCACTTAATAACTACGGCTTCTACTATGGACTTGAAGCTGAAAATGTTGGATTGTATTCAGCTTTGCCTATCATGCCCCTCAAATCTGATGGCTCTCTCTATGGAATGGAAGCTCTGAGCAGGTCACAAACACAAGCAATGGCTACCACATCAACTCCAAAACTGGAGAATTTCTTAGGTGGGGAAGCGATGGGGACCCCTCACTATGAATGTAGTGTCACAGAAACAATTCCTCTGAGCCTAGACAGTGTGTTTTACAACCAATCCTCACGCCGTGACCCAAATAACCAAACTTTCCAAAACCATGTCCAACACATTACCACTCAACAACAACATCAGCAAGACCTTCAAGCCCAACACTTATCATATTACTCTACCTTGAGAAACCATGATATGATGTTAGAAGGGTCGAAGCAAAGTCAAACCTCAGACAGCAATCTTCAGCTTCCAAACATGGGTGATGATGGAGTTCCTGCTCCTGGTCTTAAGAGTTGGGGAGTAAGGAACTTCCAAACTAGCCATGCACAGGACTCAAAGTTGATTGTTCCTGTAGAGGAAAATGGAGGTGAATCAGGGTCCATTGGATCAATGGCTTATGGGGATTTGCAGTCTTTAAGCTTGTCCATGAGTCCTAGCTCACAATCCAGTTGTGTGACTAGTTCGCACCGCACGTCACCTGCTGTCATTGATTCTGTTGCCATGGATACAAAGAAAAGGGGACCTGAAAAGGTTGACCAGAAGCAAATAATTCATAGGAAGTCGATTGACACCTTTGGACAAAGAACCTCTCAATATAGAGGTGTGACAAGGCATAGGTGGACTGGTAGGTATGAAGCTCATCTATGGGACAACAGCTGCAAGAAAGAGGGCCAAAGCAGGAAAGGAAGACAAGTTTATCTAGGGGGTTATGATATGGAAGAAAAAGCTGCGAGAGCTTATGATCTGGCCGCACTCAAGTATTGGGGACCCTCCACTCACATAAACTTCCCTTTGGAAAATTATCAAAATGAACTTGAGGAAATGAAGAACATGACGAGACAGGAGTATGTTGCTCATTTAAGAAGAAAAAGCAGCGGATTCTCAAGAGGGGCTTCAATGTACAGAGGAGTAACAAGACACCACCAACATGGAAGGTGGCAAGCACGAATTGGTAGAGTTGCTGGAAACAAAGATCTATATCTTGGAACCTTCAGTACACAAGAGGAAGCAGCTGAAGCCTATGACATTGCTGCTATAAAATTCAGAGGAGTGAATGCTGTAACCAACTTTGACATAACAAGATATGACGTGGAGAAAATCATGGCAAGCAGCAACCTTCTTAGCAGTGAGCTAGCTAGGCGCAACCGAGAGACAGACAGTGGAACTCAGTATATTGATCATAATCATAAGTCTTCTGCGTATGATGATACTCAAGAAGCTATTCTAATGCAGAAGAGCTGTGAAAGTCAAAATGAACAGTGGAAGATGGCTCCCTATCAATCCTCTCAACAACTTGACCAGAATCCACCTAGAACTGAGAGTGACAGAACTAACCAATCCTTCTCAGTGGCTTTGGACAACATGTTTCATCAAGAAGTAGAGGAATCAAGAAAGGTGAGAACGCATGTGTCAAATCCTTCTTCACTGGCCACAAGTTTGAATAGCTCAAGAGAAGGTAGCCCTGATAGGACAAGCTTGCCAATGCTCTCTGGAATGCCTTCCACTGCGTCAAAATTATTGTCTACCAATCCAAACAACGTGAATTCTTGGGATCCTTCACCCCATTTGAGGCCTGCCCTTTCTTTGCCTCAGATGCCAGTTTTTGCTGCTTGGACAGATGCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_06196::LG1:91865151-91867151(+)
GCTATTATTTGCCTCACCAAAACGCATATTGCAATCAACGCACACTTTTACGTTAATGCTTCAGCTTTGCAATTCGATTTGCTCCACGGAAAATGCTCATTCTCTCTATAAAATTCACCCTCTGTATATTTCAACAGGAATGTGCAAAATATATGTGGAATGCTGTACTCTGAGTTTGAGAAAATAACAATGAAAGATCATGAAATGGAAGTTTTTTGTGGTTGTCATGATTACTGTGCTGTATATATATAATGTTAGTGATTTCAGCTCTCTCATTTTTGTCTTCATGCATGTATTCATTGACTACAATCAAGAAACTTACACCTCAATAATTTTAGATTATTATTATTCTATTTATTTATACCAAAAGTACTCTCTATTCTAGATGCTTGATGAGTGGCGTAGACAATCATGGAAAACCAAGTAGCATTGGGCCAAATTAGATCACATCGTGTATATATCACAATTTTCCTTTCTAGTGTTTTGTTCCGTATTCCTCCCCACGCTTTGACTTTATAAAGCACCGTTCGCCCTAATTAGTAGTGTGAACATTCCTGAAACTTACTCTAGCATGATCATAGTGAACCTTTTGTGTTCTTCATTGCCAACAATTATAGGTGGCCTAAAACTTCTCAGACCAAGTATTATCAATAACCCTCTATTAATTACTCCCACTTTTTTCCCATAATCGCTGTTTATAGAACTACAACCATTAATAACTAATAAAGTAGGATTTTAAATTGCGGTTAGATCACGGATCAGGTTTCATTCTGATATCTGTAACAGTTGTGCTATTCCGGTTCGGTTTAACTCCAATTAAACGTGGATCCACTTGAACTGAACGCGTAAACGTGTTGCAGCTTTCGGGTCCTTTAGTTGTTTGATGTAATTTGATCCATTATAGACATGGTGTCAGAGTCACAAAATGTTATGAAACGATTGTAGATAAATGTAATTGACGAAGTAACGATTAATTAGCATTTTAATGAGGTCAGAGAAATTTAAAAAATCTTGATATTACAAAGTGTTCGTTAAAATCTTACTGAAAAAAAAATTAACAGTATGTAATTCAGGAAATCGAGATGAAGAAAGAGCCAAATGGGCGAAGAAAGTCAGTGGCCGTGGTTGAAATTTGAAATATGAATGTAATTGGGTGCATTGCAGCAAGGGCAAGTGGTAAATGTGCGTTTGAAAATCATGGGCAAAAAGGAGAGACTAGGTAGCCCACAGCACAGCAGAGGTTATTTGCAGAGGAGGACAAGAAAATTGGACTTTAAAGAAACGACGTCGTAAGAGCCAACCCCTATAACTCTCGGGTGGCAGATACCTGTCCTGTAGTTGCAAAGTTGTGGTAGGGGTCCATAGCAGAGCAGGATCTGCAAACTGTTTTGAAGTGACTGGAAGGAGGGACACGTTGTCCATGGCCCGTGAAACCCTATTCAAGCTTCAGCAATTCACACCCCAAAACCAACCAACCAAGCCGAATAGCAACCCCCATCACATTAAATGAACCTTTATTTGTGTGTATACAACATAAAATATATATTAGTAATGTGCACCCTGTTAGTAGTTTCTGTGTGTGTGTGTTACTGTGTGAGCGTGACCAATAAATTTGAGATGGACTTGGTTTGAGTGTTTGAAGTTGCATTTGCATCCATTGTGCAAAAATGAGGCCTCTGCATTTGTGTTGTTGGATGCAGCACAAGGGTCTTTTTTAGATAACAATAACTAATTGGTATTATTACTTTAATACGAGAGTGACTAAGGTCTATGGACTAAGGAGTGTTACATAAAAGAGAAAAGGAAAGGAGGGAGCGTAGAATAAAGCAAAAGCGAAGGTCTTTCTCATACACGGATCCCCATGGAATGCGGGAAGGATGCCTAGCATTGCTTGCTGGAACACATTCTTTTTGTTTAGTTTAAAGGAACTTGCTTTGTTCCCTTTAGAAATGTGTCCACCGAGACACCCTTATATACACGCCAGTACACTCGCATAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_06196(+)
AAGGAGAGAGAAAGAGCTTATAGAGGATGCAGTTGCTCGCAGGATCTGCATAGATTTGTTTACATCGTTTGTTAGATTTAGCCCAGTCAGTTTTGTGACAAAATTATTTATTTACAAAAAAAACTGAAGGAAAAGAAACTGGTCCAAGAGGTGGGGTGGAGAGGCTAGAGAGTGGATATTGTTTCCCATTGAATATTTAGACAGATATATATTTCTCCTGTTTGGTGAATGAGCAAGTGAGTGTTGGTTGAGAGAAAATGAAGAGCATGGAAAATGATGACTCTGTTGACCTTAATAATCAAAATAACTGGTTGGGTTTCTCACTCTCTCCTCAAATGAACGTAGGTGTTGCTTCACACCCCCAACCTTCCTCTGCTGCTGATGTGGTTCCTACAAGTTTTTACCACACTGCACCACTTAATAACTACGGCTTCTACTATGGACTTGAAGCTGAAAATGTTGGATTGTATTCAGCTTTGCCTATCATGCCCCTCAAATCTGATGGCTCTCTCTATGGAATGGAAGCTCTGAGCAGGTCACAAACACAAGGTTTGTCCAAAACTTTTTCTACATTCACGGAGACTTTTTTTTAGTTTGCACTATACTAATTGTTGCCTCCCTTGACCGCTGTTTTTATCTATTTTTGTGAAGCAATGGCTACCACATCAACTCCAAAACTGGAGAATTTCTTAGGTGGGGAAGCGATGGGGACCCCTCACTATGAATGTAGTGTCACAGAAACAATTCCTCTGAGCCTAGACAGTGTGTTTTACAACCAATCCTCACGCCGTGACCCAAATAACCAAACTTTCCAAAACCATGTCCAACACATTACCACTCAACAACAACATCAGCAAGACCTTCAAGCCCAACACTTATCATATTACTCTACCTTGAGAAACCATGATATGATGTTAGAAGGGTCGAAGCAAAGTCAAACCTCAGACAGCAATCTTCAGCTTCCAAACATGGGTGATGATGGAGTTCCTGCTCCTGGTCTTAAGAGTTGGGGAGTAAGGAACTTCCAAACTAGCCATGCACAGGACTCAAAGTTGATTGTTCCTGTAGAGGAAAATGGAGGTGAATCAGGGTCCATTGGATCAATGGCTTATGGGGATTTGCAGTCTTTAAGCTTGTCCATGAGTCCTAGCTCACAATCCAGTTGTGTGACTAGTTCGCACCGCACGTCACCTGCTGTCATTGATTCTGTTGCCATGGATACAAAGAAAAGGGGACCTGAAAAGGTTGACCAGAAGCAAATAATTCATAGGAAGTCGATTGACACCTTTGGACAAAGAACCTCTCAATATAGAGGTGTGACAAGGTTTGTTTTCTTCTGCCTACATCGCACTAATATGTTTATGTATTTTGAATGAACAAAGCTATATTTCAGTTGTTTGTTCTCATTGTTTGTTTAATATCATGCGTGAGCATCCTCAACACATTTAACAGTTCCTGTCCCTTTTTGTGTTTTTTGTTTTATTGTTTCTCTTTATTTCTAAAGTGTGTATGTGTATCAGGCATAGGTGGACTGGTAGGTATGAAGCTCATCTATGGGACAACAGCTGCAAGAAAGAGGGCCAAAGCAGGAAAGGAAGACAAGGTAAGAAAGGGGTTATATTCCCCCATCACTTTATCTTTACTATTTTTCTTGTGCATTTTGTTGGGTCCAACATATCCATCTATTGAGTTCCACTGTTCTTTGAAGCAAATATCTGCAATTTTTTAGATATCACTCACTATTCTTTTTGGTTTCTATCTTTACTTCCCGGGGAATGCCACTCAAATATACGATGAATCTCAGTTTATCTAGGTAAGTCTTCTTGAAATTCCCAGAGCTTAGATTCGCGAGACAGTTAAAGATAGATATCATTTAATATTTTGCTTATGACCTTAACAAAAGAGGAAAATTTATGTTTATTCAAGTCATTCCAAACTTTTGATTTTAGGGGGTTATGATATGGAAGAAAAAGCTGCGAGAGCTTATGATCTGGCCGCACTCAAGTATTGGGGACCCTCCACTCACATAAACTTCCCTGTAATAAAAAATAATTTATTTCTCCCTTCTCTTTCATGTTTCCACTCAAGTTGTGTGGTCTAGTTCATAACAGAGGATAAAATAATAGTCTTACAACATCTTTTTTCTTTTGCATTCTCTTCTAACAGTTGGAAAATTATCAAAATGAACTTGAGGAAATGAAGAACATGACGAGACAGGAGTATGTTGCTCATTTAAGAAGGTAATATCTTGTGGCTATTTATCATCAGGAAACATCTATTTTATTTGTTCATAATTTCTATCAACTTTATCAATTCAGAAAAAGCAGCGGATTCTCAAGAGGGGCTTCAATGTACAGAGGAGTAACAAGGTCTCCTAGCTAACAATTACTTATAGTACATATAATTACAATTTAATTAGTAATATAAATTTTGTATGTCTTTAATTAAAATGTCTGAAGTTTTTCAAACTTGGTTCACTTGGTAGCAGACACCACCAACATGGAAGGTGGCAAGCACGAATTGGTAGAGTTGCTGGAAACAAAGATCTATATCTTGGAACCTTCAGTAAGTTCTTTCATAATAACTCTTTTCTTCCACTGAATTAATGTCCGTTTTTAACTCTAAACGTGTTCATGTACCAATTACCATGTTTCCCATGGTAGGATGCGACAGAGAGGGCGCTTTATGACCTTGAAAACCTATTCTTTCATGTTCTCTAAGGATACCCATCTTTTCAGCCATGATAAAGCTGATCATGAGTCACTTTAATAAATATTGTAGAAGACTGTTAGTCCCGGAGAGACAGCTTTTATTAATGCTACTGATAGACAATAACAACTTTAATCTGAATTGTTCACTTAAGTAAAATCTTATCCAATGTCTGTAGCATAGAGAACACTGAACTCAAGCTTTTTACCAAATAGCACTTTCCAAAGTGTTTGTACTAGACCGAACAGAAAAAAAAAATTCCAATGTTGGCACAAAAAGCTAATAATTAGTCTCATTGAAATCAAACTCTAGGTACACAAGAGGAAGCAGCTGAAGCCTATGACATTGCTGCTATAAAATTCAGAGGAGTGAATGCTGTAACCAACTTTGACATAACAAGATATGACGTGGAGAAAATCATGGCAAGCAGCAACCTTCTTAGCAGTGAGCTAGCTAGGCGCAACCGAGAGACAGACAGTGGAACTCAGTATATTGATCATAATCATAAGTCTTCTGCGTATGATGATACTCAAGAAGCTATTCTAATGCAGAAGAGCTGTGAAAGTCAAAATGAACAGTGGAAGATGGCTCCCTATCAATCCTCTCAACAACTTGACCAGAATCCACCTAGAACTGAGAGTGACAGAACTAACCAATCCTTCTCAGTGGCTTTGGACAACATGTTTCATCAAGAAGTAGAGGAATCAAGAAAGGTGAGAACGCATGTGTCAAATCCTTCTTCACTGGCCACAAGTTTGAATAGCTCAAGAGAAGGTAGCCCTGATAGGACAAGCTTGCCAATGCTCTCTGGAATGCCTTCCACTGCGTCAAAATTATTGTCTACCAATCCAAACAACGTGAATTCTTGGGATCCTTCACCCCATTTGAGGCCTGCCCTTTCTTTGCCTCAGATGCCAGTTTTTGCTGCTTGGACAGATGCATAGTTCATAGTTTCACAGTCCTTTTATTTTTGTTCTCTCAAGTAAAATTTCAATCCTTTTATTGTCATTTTGCATGCCTGGACAATACAATAGAAGGATTTGTAGCCAGTAAAATTGAGGGTTTAAATATTATCCGCAAGTTTAAACTTT