Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06057 LG1 89898261 89902104 PREDICTED: B3 domain-containing protein Os01g0234100-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   meristem development
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 89898264 missense_variant p.Val2Met
T/G 89898424 splice_region_variant&intron_variant
T/A 89898460 intron_variant
G/A 89898617 intron_variant
G/A 89899224 intron_variant
G/T 89899315 intron_variant
A/C 89899402 intron_variant
C/A 89899616 missense_variant p.Ser111Tyr
G/C 89899658 missense_variant p.Arg125Pro
C/T 89899968 synonymous_variant p.Phe196Phe
G/T 89900212 intron_variant
T/G 89900232 intron_variant
C/A 89900384 downstream_gene_variant
T/A 89900396 downstream_gene_variant
A/G 89900493 downstream_gene_variant
A/G 89900561 downstream_gene_variant
T/G 89900563 downstream_gene_variant
G/A 89900767 downstream_gene_variant
G/A 89901379 stop_retained_variant p.Ter241Ter
T/A 89901410 synonymous_variant p.Thr251Thr
G/A 89901446 synonymous_variant p.Lys263Lys
C/T 89901458 synonymous_variant p.Leu267Leu
G/T 89901493 missense_variant p.Arg279Ile
A/G 89901497 synonymous_variant p.Thr280Thr
T/A 89901573 missense_variant p.Trp306Arg
A/G 89901952 missense_variant p.Gln432Arg
G/T 89902006 missense_variant p.Arg450Met
G/T 89902084 missense_variant p.Arg476Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06057.1
MVVTDERNRDRANRRDVVELTQYDQAVTVAYYGEELHGGVPLSHFSRISPLNMDKQNKVVEKKYKILNNSPTKQATCAEAQKFSSSMKAAVEGTSSRGEVMSSAVLQAEEVQSNLRPEFPSFVKSLVRSHVASCFWMGLPVSFCKRHLPDKDTTIILEDESGKEYNTKFIACKTGLSAGWRQFSAVHKLQEGDAVVFQLVEPTKFKVYIIRANNTRELDGAFLNFDSCTKQQKMGGKDNMDTDLTCNSSKRKLGKSVPLDIQKKRKANSSRLRPKVMPSVEQPEDGSEEALSEVMEEFRMLEFEDVSGFENFSIIVDGVSIDAEFPDDVRNKYYRLCCSQHAFLHENLIKGMNYKLVAGIISETVNIADAIKVSMLCTPRFEFVNWDKTLLAFEHLGMNVEFLRIRLRRLVSIAYEENDVSEVKKYLASRNEYSRADDEIRNIEEKLEELKGACNGFGAYIGSLKGKAENYHNKFRREVHAPW*


CDS Sequence:
>Vu_06057.1
ATGGTGGTTACTGATGAAAGGAACCGCGATCGTGCGAACAGGAGGGATGTGGTGGAGCTAACACAATATGATCAAGCTGTAACTGTAGCATATTATGGGGAGGAGTTGCATGGTGGCGTACCTCTATCTCACTTCTCCAGAATCTCTCCTTTAAACATGGATAAACAAAACAAGGTGGTGGAGAAGAAATACAAAATATTGAATAATAGTCCGACCAAGCAAGCTACGTGTGCTGAGGCTCAGAAGTTTTCAAGTTCCATGAAGGCTGCAGTAGAAGGAACATCCTCTCGTGGTGAGGTTATGTCATCTGCAGTTCTTCAAGCAGAGGAGGTCCAATCAAATTTGAGACCAGAATTTCCTAGTTTTGTGAAGTCGTTAGTTAGATCACATGTTGCTAGTTGTTTTTGGATGGGCCTTCCTGTGTCCTTCTGCAAAAGACACTTACCGGATAAGGATACAACAATCATTTTGGAAGATGAATCTGGTAAAGAATACAATACAAAATTCATTGCCTGTAAGACGGGATTGAGCGCCGGATGGAGACAGTTTTCTGCTGTGCACAAATTGCAGGAGGGTGATGCGGTGGTCTTCCAATTAGTTGAACCAACCAAATTTAAGGTTTATATAATAAGAGCTAATAATACGAGGGAACTAGATGGGGCCTTTCTGAATTTTGATAGCTGCACAAAACAACAAAAAATGGGAGGCAAAGATAACATGGATACTGATCTTACATGCAATAGCTCAAAGAGAAAACTTGGAAAATCTGTCCCACTTGATATCCAAAAGAAAAGAAAGGCAAACTCGTCGAGATTGAGACCTAAGGTTATGCCATCAGTAGAACAACCTGAAGATGGTAGTGAGGAAGCTCTCTCAGAAGTTATGGAGGAGTTTAGAATGCTTGAGTTTGAAGATGTCAGTGGCTTTGAAAATTTTAGCATCATCGTTGATGGAGTGTCAATAGATGCTGAGTTCCCTGACGATGTTAGAAACAAGTACTACAGGCTATGTTGTAGTCAGCATGCATTTCTTCATGAGAATCTGATCAAGGGCATGAACTATAAGCTGGTTGCTGGAATTATATCTGAAACTGTCAACATTGCCGATGCCATAAAGGTTAGTATGCTATGCACCCCACGTTTTGAATTTGTCAACTGGGACAAAACATTGCTAGCCTTCGAGCATCTGGGTATGAATGTTGAGTTTCTAAGGATCCGATTACGCCGGCTTGTAAGCATTGCTTATGAGGAAAATGATGTCTCAGAGGTCAAAAAGTACTTAGCCTCTAGAAACGAGTACAGTCGGGCGGATGATGAAATAAGGAACATAGAAGAGAAGCTCGAAGAATTGAAAGGAGCATGTAATGGTTTTGGTGCTTATATTGGGAGTTTGAAGGGCAAAGCTGAAAATTATCATAATAAATTTCGAAGAGAGGTCCATGCACCTTGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_06057::LG1:89896261-89898261(+)
GGAATTAAAACTCCCACAAACATTGTTAGTTAAATAATTTAAATTAAACATCTTAAGTTGTGTTAATTTGAGGGGGTTTTTTATACCCTCTCCAAAATAACCCCCTCTAAATAAGATTTTTTTTGTAGTGATAACTATATTTGAACTCTTTTTGAATCCAATTTAAATTGGATTAGATAAAGATTAAGTATACTTTGTCAATTAGATTAAATCTCATGAAATCGATCTAATAAACTTGATTAGTAAGTTTATTAGACATGGGTCAGGGTGACTCAACTCGACCTGTTAACTTGAGTATAGTCTCATCTCAGCATTAGTCACAATTGACTTGAGTCAATTTTGACCTAATCGACTTGTCTTAACTGGAGTTTGTGTCATCTCATCTTTACCTTTGACATGGACCTACTCATCTTAACTTTTGGTTGAGTCCAACGCGTCTTAATCTTTGGCTCAGGTTGAGTCTTGTTGACCTTCAGTTTGAATCGACTCAACTTAACCTTTAATCTGAGTCAATTCCACTTGATTTTTCGGACTAGACCAACTCAGCATGACCTTTGAACATGGTGAGTCTTTTCGACATTTAACCTAAATTAACTCAATTTAACTTTTGATTTAGACAGATTCAATTTGGACCAACTTAGCTTGATCTTAAATTTAAACTAAATTAATTCAACTTTGTTCTCAATCACCTTGCTAAACTTAAACCTATCTTAATTTTGAAATAAAAAAAATCAATCTAAATTTGATTCCTAATTGATTTAAAATGAAAAAAAATTAAATAAAAAGTTATTTAAATAGTCTTAAACTAATATGATTTTTAATTATTATAAATTGAAATTCACAATGTTTCAATTTTCCAAAGGAATAAAATAAAAAGAAGGAACAAATGGAAGTAAATATACTTATAAAATGAGGAGGAACTTTAACATACTAGGTTTTTTTTTTTATATTTAGACCTTCCTAGCTTGTAATTATACCTCCCTTACTATTTTATATTGTTATCTCTAAAAAGGTCATTTTTATTTAAAAGTAATATGAGTTTTATCTTTTAAACCATTATTACATCCTATATCTTCACCATTCATTATGTCATATTTTTGCAACATTCCTTCATATCTTTTAAACTATCTTTTTTATTAATATTCCATTCAGACAACTCTAGCCCCTTTATTTTGTGATGGGTGCACATGTCATGAAATTGTGTTTTTAATTAGCCAGAAAGTATTTCGGGAATCATGTTACTTTTCTAAATATAATTCTAGAAAGTACTTTTAGTAATATTTAAAATATCCATATTTTAAAATATTATAACAACGCTCTATTTTGTATTTTTTTTTATGTTTATTTTATATTTTAATATTATCATTTTACTATTTGGATTTCAAGCTATTTTTTTACTTTAAAATTATTTTAGATTTTTATATCAATTTGCATTCACTTTCTTTTATATATTTTATACTGGTAATATTTATATTTTTTATGTGTGTTAGCTGTTTTATATCTGTTAGAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATAATATTAGATGAATGAACTAATACAATCCCTAAATATTTTGAGCATGGAATGCTAAGGAGGTAGTTAGACAGGTGTTAATTATGTCTCTGATCTCATATTTCATATTTTGAGGTGGTTTTAAAATCTAATATTTCCAATGTTCCTACATTGTATTCCATTCCATTGCAAAATCTGAAGTCTGGTTGTCAATTACCAAACAATTTTTACAACAACACCAACCCAAAGACACAACATCTAAGGCGGTGGATATCAAACGGTAGTGGCTCATTTTGTTTTTTCTCGCTGGTCAACCGATCCATCCATGATGCAAACTTTTTTCTCTTTTTTTTCTTTTGTTTAAAGGTGGTGGTGTTTAAATCGTTCATTCACATTTGAAACTGAAAGGGGGCTATCTGATAAGGCTGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_06057(+)
ATGGTGGTTACTGATGAAAGGAACCGCGATCGTGCGAACAGGAGGGATGTGGTGGAGCTAACACAATATGATCAAGCTGTAACTGTAGCATATTATGGGGAGGAGTTGCATGGTGGCGTACCTCTATCTCACTTCTCCAGAATCTCTCCTTTAAACATGGTTTTTATTCTATCTTCTGTCTACATGGTTTTACTTTTTTTTTTTTTAATTTAGTGTCTGTTTTGCACGTTGGGGAACAAAGGCTTGGGTGGACATCTTCATTTATCTTCTTTCCCTTACATAGTTTCAATTTTTCATTTTGATATAAAGTAGTTCTTTTTAATTTCATTTATAATATCAGTATATGGCCAAACTAGGTGAGATTCTTTTTGCTGTAGGCTTCTCTCTGTGCTTCCTTTTCTGAATTGATAGTGATGAGTTGAAGTCTTGTTGCACTGTTTGCAGGATAAACAAAACAAGGTGGTGGAGAAGAAATACAAAATATTGAATAATAGTCCGACCAAGCAAGTAAGATTTTTTTTTTATTTTTTATTTGTTTTATGTTTCGTGATGGCTTTTATGGTGGACTTGTAAGATTTCTGCCTTTGGTGAACTCGTGTAATTGTTTCTTTCCTTCATAGTGTTTTTATAGCAAGAGGTAATATATGTTTGACAAGCAAATTATTTTTGTCGCCTACAATGGAGTATTTGAGTGTTTGATTTGGTATCAATCAATATGCCCCCATTTTAGTTTAGACTTCATTGAGGAATTTGAAAAGACTTTTTTCGTTGAAAATGTGTATCCAAACACATTATATGTTTGCATTAGAGAAGATGTATGATGCAAGGGATAATACTATACAAGTATTATGTCTGTCTAATGGAAATTGTGATGGAAAAAACAACTTGAAATACTTGCAGAAAAACAATGCTTTTAATTGGTTATAACATAGGCAACTTAAACTTTACTGATAATAATATCCAGATAACGTTCGAATGTAAGTATTACATTTCCTTTTTAGATCCAAGTTTAGACATTATTATGCAAGTGTATTGTAAATTCTAAATCAACCACGCTTCATAATGTACAACTTCTGTATGAGTTAAATGGATTGCAGCACAGTTAACTGAAAATTAAAGTCTAATTGGATTATTTCTATCAAATGCTTCTACAGGCTACGTGTGCTGAGGCTCAGAAGTTTTCAAGGTAAGCAAATCAGCATACTGCTGTTTAGATAATAGATTTCTCCTTTACTTGACTTCATTACGGTAAAATTTATCGTGGTATTTGCTTCCAGTTCCATGAAGGCTGCAGTAGAAGGAACATCCTCTCGTGGTGAGGTTATGTCATCTGCAGTTCTTCAAGCAGAGGAGGTCCAATCAAATTTGAGACCAGAATTTCCTAGTTTTGTGAAGTCGTTAGTTAGATCACATGTTGCTAGTTGTTTTTGGATGGTGAGTATCTTGATACACTGAAACAAAAAATACTTCTATTTTAGAAACCTTATTTCATTACGTTTCACTCGTGTATTCTGATTTCCTTTTGCAGGGCCTTCCTGTGTCCTTCTGCAAAAGACACTTACCGGATAAGGATACAACAATCATTTTGGAAGATGAATCTGGTAAAGAATACAATACAAAATTCATTGCCTGTAAGACGGGATTGAGCGCCGGATGGAGACAGTTTTCTGCTGTGCACAAATTGCAGGAGGGTGATGCGGTGGTCTTCCAATTAGTTGAACCAACCAAATTTAAGGTGATGCTTTTGATTTTTTTTGCTTAAATTTTTCTAGTGGTATTCACATTTCGATCAGAGCATGCATACTATGTTGCAATGAAAAAAGGTAACAATGGCTTGTATATCACTTGCCACTTTATCTTTGTGTTAGTTAGGCGCATGTCAATGTAATGGATACAATCATAACAAATCCAAATTTTCTAACAATTGATAAATATAATTTTGGGGTCACCTGGTTATTGGGTACTAATCCCTTGTGGAGGTCAATGCTTTTGAAAAGATAGTTTCCATGGGTCCTAAACATTATATCCAGATGATAAAAGACCATGATGTATTGCATTAGCAATATGCTTTGACAGTTACATTGTTTATCAATCATAAGTCCCTAACTGATTTGGAGGTTTAACCACTCTCTCCCTTACCCTTTGTTAGAGTTCAGGGGTAAATCCCGCATTGTACAATAAAAATGATTAAAGACTTATGCCATATTGATGTTATCATTTATCAACAAACAGAACTATTTTCTTATAAAAATAGGAAAAAAGAAACATATATGCTATCTCTGAAGATTTGGACAATGACAAATAACTTATTTTCTTGAGACTGGTGTGTTGTACGTGTTGTTTTAGTGAGGGAACACTTGCAACTAAAGAAAAATTTAGGAGGCCATAAGGCAACAGTTGTGGGGCTTAGTTGGATCAGGCAAACTTGGTACTGCTAAAATGATGGTCATACCCTGATTGCTATGGTTATCTTCGTAATATCATTTGGAGTTGTATAGAAGGTCATGTGGTGGCAATGATGCAGCTTCATGGTGAAATAGGGCACTGTTACAATGACAACTGCTCCCTGATTATTAAGACAATTATCCTCTGAATCTCTGCTAAAGAGTGTTCAAGTCCATGATTATGCCCAAGAATCATTCTGAGCATTGGGGGGAGTGGGTCACTATACCATCTTTTCTCTCTTTAAAGGCAAAACACTTATTGTATGTTTTTGGACAATAGCTGGAGTTAGTAAAAAGCTTCTTTTTTAACTTTCATAGATACCATTTTTCCTTTACTTTGTAAAAGCTGAATTTGTTGTTGTCCAAATGAAACTGGTCTCTATGTTGATTTTCAGCAAACTTAAACAAAACTTATTTTTAAGCTTTTCTTTAGGTCATGCCACCACTTATTGTTGTACTTGATTTTCAGGTTTATATAATAAGAGCTAATAATACGAGGGAACTAGATGGGGCCTTTCTGAATTTTGATAGCTGCACAAAACAACAAAAAATGGGAGGCAAGACTTGTTTCTCTATGCTTTTACTTTCTTTTATTATATCAAATCATGAATGATTGTGGATTTATGCATTCTTTGTTTTGCTCATTGCTCTCAGGCAAAGATAACATGGATACTGATCTTACATGCAATAGCTCAAAGAGAAAACTTGGAAAATCTGTCCCACTTGATATCCAAAAGAAAAGAAAGGCAAACTCGTCGAGATTGAGACCTAAGGTTATGCCATCAGTAGAACAACCTGAAGATGGTAGTGAGGAAGCTCTCTCAGAAGTTATGGAGGAGTTTAGAATGCTTGAGTTTGAAGATGTCAGTGGCTTTGAAAATTTTAGCATCATCGTTGATGGAGTGTCAATAGATGCTGAGTTCCCTGACGATGTTAGAAACAAGTACTACAGGCTATGTTGTAGTCAGCATGCATTTCTTCATGAGAATCTGATCAAGGGCATGAACTATAAGCTGGTTGCTGGAATTATATCTGAAACTGTCAACATTGCCGATGCCATAAAGGTTAGTATGCTATGCACCCCACGTTTTGAATTTGTCAACTGGGACAAAACATTGCTAGCCTTCGAGCATCTGGGTATGAATGTTGAGTTTCTAAGGATCCGATTACGCCGGCTTGTAAGCATTGCTTATGAGGAAAATGATGTCTCAGAGGTCAAAAAGTACTTAGCCTCTAGAAACGAGTACAGTCGGGCGGATGATGAAATAAGGAACATAGAAGAGAAGCTCGAAGAATTGAAAGGAGCATGTAATGGTTTTGGTGCTTATATTGGGAGTTTGAAGGGCAAAGCTGAAAATTATCATAATAAATTTCGAAGAGAGGTCCATGCACCTTGGTGA