Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06036 LG1 89598135 89603452 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 89598284 5_prime_UTR_variant
G/T 89598286 5_prime_UTR_variant
T/C 89598497 missense_variant p.Ser35Pro
T/C 89598517 synonymous_variant p.Cys41Cys
C/A 89598574 synonymous_variant p.Pro60Pro
T/C 89598640 synonymous_variant p.Gly82Gly
T/A 89598714 splice_region_variant&intron_variant
C/T 89598722 downstream_gene_variant
G/A 89598825 downstream_gene_variant
G/A 89598877 downstream_gene_variant
C/T 89598878 downstream_gene_variant
G/C 89598928 downstream_gene_variant
G/A 89599109 downstream_gene_variant
T/A 89599123 downstream_gene_variant
A/T 89599124 downstream_gene_variant
G/A 89599200 downstream_gene_variant
G/C 89599264 synonymous_variant p.Thr112Thr
A/T 89599269 missense_variant p.Lys114Met
C/T 89599359 missense_variant p.Thr144Ile
T/C 89599366 synonymous_variant p.Asn146Asn
C/G 89599527 missense_variant p.Thr200Ser
A/G 89600062 synonymous_variant p.Leu352Leu
A/G 89600173 downstream_gene_variant
G/A 89600348 intron_variant
G/T 89600503 intron_variant
G/C 89600603 intron_variant
G/T 89600645 intron_variant
C/T 89600673 intron_variant
G/T 89600728 missense_variant p.Gln361His
C/T 89600929 synonymous_variant p.Tyr395Tyr
G/T 89601165 intron_variant
T/G 89601310 intron_variant
A/C 89601392 intron_variant
T/A 89601441 intron_variant
A/T 89602037 intron_variant
C/G 89602118 intron_variant
G/T 89602142 intron_variant
A/C 89602143 intron_variant
G/T 89602149 intron_variant
G/A 89602271 intron_variant
T/G 89602276 intron_variant
C/T 89602319 splice_region_variant&intron_variant
C/G 89602700 missense_variant p.Asp618Glu
G/A 89602868 3_prime_UTR_variant
T/A 89603371 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06036.1
MRWLPTLSFTPSASSSSSSAASADHRRKVWLFGSSSKKRACHGENDARWHDDDSPPFPSPGTPQPLPLPELAASSAVLRRDGECRLPSPKDAATVTTSTGCRMRSVFAGQDTRKNMEQAETRSSRMVHQDSCGCCECARENSNTNNSNFASIPRRSSFSSIPFASPSIMSPQKTKNGESVPYYYASPKGNQFWSAPEMSTCETGLLPPAFFDLSVLGTETSPSPTSHQSPQRRSPGQHTRTLSGPLSPLHSKLSLEISMVRRESTAPPVSVHPLPLPPGAPLPSPSSASTFSNARSESLPMKNQWQKGKLIGRGTFGSVYVATNRETGALCAMKEVEMFPDDPKSAESIKQLEQEIKVLSQLKHSNIVQYFGSEIVEGRFYIYLEYVHPGSINKYVREHCGAITESVIRNFTRHILSGLAYLHSKKTIHRDIKGANLLVDSAGVVKLADFGMAKHLTGFEANLSLRGSPYWMAPELLQAVMQKDNSPDLAFAIDIWSLGCTIIEMFTGKPPWSEYEGAAALFKVMKETPPIPETLSPEGKDFLRCCFIRNPAERPAAAVLLEHRFLKNSQQPDVSSPTQLYNGTGFMDKPRSPIKQFEYKHDQLSISCAKIAKVKAADRRGFLISSLEILPASLNQ*


CDS Sequence:
>Vu_06036.1
ATGCGCTGGTTACCCACGCTTTCCTTCACGCCTTCCGCTTCCTCCTCGTCTTCCTCAGCCGCCTCCGCCGACCACCGCCGGAAGGTGTGGCTGTTCGGTAGTTCATCCAAGAAACGCGCCTGTCATGGCGAGAACGACGCCAGGTGGCACGATGACGATTCACCACCCTTCCCTTCCCCCGGCACACCTCAGCCCTTGCCCCTGCCGGAGCTCGCCGCTTCCTCAGCCGTTCTCCGCAGAGACGGTGAATGTCGTCTTCCCTCGCCCAAGGATGCTGCTACAGTCACCACCTCCACCGGCTGTCGGATGCGGAGTGTTTTTGCTGGCCAAGACACGAGAAAGAATATGGAACAGGCTGAAACTAGGTCATCGAGAATGGTGCATCAAGATTCGTGTGGTTGTTGTGAATGTGCTCGAGAGAATAGTAATACTAATAATAGTAACTTCGCGAGCATCCCTCGTAGGAGCAGTTTTTCAAGTATTCCCTTTGCAAGTCCTTCAATAATGAGTCCACAGAAAACAAAAAATGGTGAATCAGTGCCATATTATTATGCGAGTCCCAAAGGAAATCAGTTCTGGTCTGCACCAGAAATGTCTACCTGTGAAACAGGGTTGCTACCTCCTGCCTTCTTTGATTTATCCGTGTTGGGCACAGAAACTTCTCCCTCTCCCACCTCCCATCAAAGTCCACAGAGGAGAAGTCCCGGGCAACACACCAGAACCTTGAGTGGACCTCTATCTCCTTTACATTCCAAGTTATCACTCGAAATCTCAATGGTGCGCCGTGAAAGTACTGCCCCTCCTGTCAGTGTTCACCCCTTGCCCCTGCCTCCTGGGGCTCCCCTGCCCTCTCCATCGTCAGCTAGTACATTTTCCAATGCTAGATCAGAATCATTGCCAATGAAAAACCAATGGCAGAAAGGGAAACTTATTGGGCGTGGGACATTTGGAAGTGTTTATGTTGCAACCAATAGGGAAACCGGTGCATTATGTGCAATGAAGGAAGTGGAAATGTTTCCTGATGATCCAAAATCTGCTGAGTCTATAAAACAGTTAGAGCAGGAAATTAAAGTTCTTAGCCAGCTAAAGCATTCGAACATCGTGCAGTATTTTGGCAGTGAAATAGTTGAGGGCCGGTTTTATATTTATCTGGAATATGTTCATCCTGGTTCAATTAATAAATACGTCCGTGAACATTGTGGTGCCATAACAGAATCTGTCATTCGGAATTTCACTCGACATATTCTATCTGGATTGGCTTATTTACATAGCAAAAAAACAATTCATAGGGACATCAAAGGGGCTAACTTGCTTGTTGACTCCGCTGGAGTTGTTAAACTTGCTGATTTTGGGATGGCTAAGCATCTAACTGGGTTCGAAGCTAATCTATCTTTGAGGGGAAGTCCGTACTGGATGGCTCCAGAGCTTTTGCAGGCTGTGATGCAAAAGGATAACAGCCCTGATCTTGCTTTTGCTATTGATATTTGGAGTCTGGGTTGTACCATCATTGAAATGTTCACAGGGAAGCCTCCTTGGAGTGAATATGAAGGAGCTGCAGCTCTGTTTAAGGTTATGAAGGAAACCCCTCCTATTCCTGAAACATTGTCGCCAGAGGGTAAAGATTTCTTGAGGTGCTGCTTTATAAGGAATCCAGCAGAGCGGCCAGCAGCTGCAGTTTTACTAGAACATCGATTTTTGAAAAACTCTCAACAGCCTGATGTTTCATCTCCCACTCAGTTGTATAATGGAACAGGCTTCATGGACAAACCACGTAGTCCCATCAAACAATTTGAATATAAACATGATCAGTTGTCAATCTCCTGTGCCAAAATTGCCAAGGTTAAAGCAGCTGACAGGCGTGGATTTCTCATTTCTTCGTTGGAAATTCTTCCTGCATCCTTGAACCAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_06036::LG1:89596135-89598135(+)
CAGACATTGTTTACCGATACGGATAGAATGCAATTTTGTGGACTCAGTTCTAATCTGCTCTTCCCTTTTTAATTCATATATACCAAACGTGGAAAATGCTCTTTTCCCTTTTTCATCTGTCTGATCCTGTTCCTTTTACAATATTCTTTATAAAATGGAATTTTTTTTCAATATATCTTGATTGTGATCTATGATAAAGATTAGTATCTATTACTATTAAAACCATATTTTTTTAGCAGTGTCCTTTTCAATTTATGTTTCTCTGTTTGATTATTTTCCCTGAATGAATCGAAATACCGAAAGGCAGAAGCATGAAAAGGTGGAGATAAGGTTCGTGAAATTGAGGATAGAAGAAGGGTATTGGTCAAGTTGGGTGACCTTTGACCAATTCAGATCACTACTTCAACCAATCCTCTACTTTCTACTGCTTCAATTATCAAAATCTTTCAATAACTTTTGTGGAATGTTGTTCTTGTAGCAATCATGTTGTTTTGACCATTTTGGCTTACGTGGTGCCCCAATAATGCTTAAAAGCAATGCATTATAACTTTTAGTCAACAATGAAAGCATAGATAAATTTATTAAAAAAACACCTTCGATAAACTTGGGAAAAAAATACTTGAACTTATAATCAAATAATCACTTAAAATTAAGTATAATACTTAACGAACAACATATAAACTCTTTTTAATCATTCAAAAGGTTCTATTTTTTTTTCCTTTTCAATTACTATATCTACTTTGACGTATTTTGTTTAATGTTTCTTAACTTAAAAAAATTATAAAGGTTCTTATACATAACAATTATTATCATCCTCTATATTGGTATATCATTTTTACCATTCTAACTATCATCATTATGGCCATATCATCATCACCACCATTTTTATTATGATTAATTATATTACAATATATTATTATCTAATTTTTAGACATTGAATATCAATAGCTATTTTTATAACATATTTATGTTATCGTATTTTAACCACAAAATAAGTTCTTAAAGTATTTGAAGAAAAGAGAGTCATGTTTATTTAATTTAATGTTATGAATCGTGTATTAATATTGTCAAACACCGAAAAAAATGTAGATTATGCCCACTTTCCATCTTAATTATGGTCATGGAGTTGTGGTTAGAGGCTTTTTTTAATTTTTTTAATCACAATTAAAAGTTGTCAATACGACCAGTGAAAATATATCACAACAACATGTAATAATTAAACCTAAATAAAATAATTATTTTCCAAAGGATGGATCTGAACAAATCTAACATAGAACAGTGGAAACAGTTGGATAACAGATGCAATTAATGTGTGTATTAAATTAGAGTTTATGATTTGATTTATTAAACATTGTATGTTGAGTCAATTACTCAAAGCGAGTACAGAGAATATAAGAATTAATTATTAAATCAACTCTATATAATGTCAATCTATCTAGAAGCGAATTACTATAGAATCGAGAAACGCGCAATCATCGATCAAATAACCTCTCGAAATCAACGTCACTCCTTCTCTTACAATCCGATCCAACAATAATGGAATCAAAATACGGTTTTACTTTTTCATTTTATAAACAAAATATGGTTTTACTTGGCAATAGTCTTCTCAATTCTCACCAACGTCAAACTCCATAAATTCACGTAATTCCTCCTTCAAACATCCTCAAGTCAAGACCCAACCACATTAAAATAATAATAATATTGAAAATTAGTATAATAAAAAATTCAGTAAGTTTGGTGAAAGTTGTTAAGGTTATTTCTATTTAGAGAGTGATGAGAAAATAAGTATACACTAATAATGCAGAATGATTTGGTGAAAATGAAGATAGAAATGGAAGTGAAAAGATAGTTATGTTAATTAAGGGAGACGTTGAGTTGTGTTACCTGGCGCGAACATAACTACCGTATCTAAAATAGAACAGTCTTTCTGTTGGTAAAAAAATAAAAGTGTTTTTTGGGAAAAGAATTATTTATATTGTGTCGTGTTCTCTGTTGTGTTG


Gene Sequence:
>Vu_06036(+)
GTGGCAACAGAGAGAGAGAAAGAGATTGGAGAGAGACCTTGACTTAGTTAGAGGGAAGGAAGAAAGAAAAAAAGAAAAGGTGGAACGTATTGACTTTGTGTGGAAGGCCTATGGTTGTCGTTTCTTTCTGGAACCGCTATGGTGCTAAAGCGAACGATGACTGTTGTTAAAGCTTTACATTGCGCTTCCAATAGGATCTCCTCTCTTCGATCCGCATTGTGAGGTCATAGGTTTCTTTGATTCTGTAGATTCACGCAGCCATGCGCTGGTTACCCACGCTTTCCTTCACGCCTTCCGCTTCCTCCTCGTCTTCCTCAGCCGCCTCCGCCGACCACCGCCGGAAGGTGTGGCTGTTCGGTAGTTCATCCAAGAAACGCGCCTGTCATGGCGAGAACGACGCCAGGTGGCACGATGACGATTCACCACCCTTCCCTTCCCCCGGCACACCTCAGCCCTTGCCCCTGCCGGAGCTCGCCGCTTCCTCAGCCGTTCTCCGCAGAGACGGTGAATGTCGTCTTCCCTCGCCCAAGGATGCTGCTACAGTCACCACCTCCACCGGCTGTCGGATGCGGAGGTCGATTTTTTAACTTGTCCTTTCTTTCCTTCAACTAGTTTTATCAGTGGCTTTTCAATTTTTGTTAGGTAATTAATTGCTTAATGAATTCGATTATTACTGCTTGAGATCGTTCCGTGATTTTTTATGTTGCACGTTTGTTGTTGTTTCGGACTGAATCTATGAGATGCGTATATTTTGTACTTGTGAAATGAAACTTTATGACACTGCCTGTGTAAGGTTCTCCTTAAACGCTTACGAGAAAAAAAATTAAATGAATCTGAGTTTATTTGACAAGTTAAAATCTATTTATGCACCTCGATTTTAAAGCAGTTGGATCAGGTACGTTCTGTAAAAGTTAAGTGCATAACTTGATTTAAATTTATGAAAATGATCAATTCATTTTACATTTGTTATTTTTGTTTTTGGAGAAATTATTCAAGCTGAATTGATTATGCATTTGCAGTTTTGTACTGCAACTTCTCCATGCGTTTGTGGAAGAGTTCTCAGTGGTGAGTTTGCTGACCTATTTGACCGAATTTTGTATTGTAACAGTGTTTTTGCTGGCCAAGACACGAGAAAGAATATGGAACAGGCTGAAACTAGGTCATCGAGAATGGTGCATCAAGATTCGTGTGGTTGTTGTGAATGTGCTCGAGAGAATAGTAATACTAATAATAGTAACTTCGCGAGCATCCCTCGTAGGAGCAGTTTTTCAAGTATTCCCTTTGCAAGTCCTTCAATAATGAGTCCACAGAAAACAAAAAATGGTGAATCAGTGCCATATTATTATGCGAGTCCCAAAGGAAATCAGTTCTGGTCTGCACCAGAAATGTCTACCTGTGAAACAGGGTTGCTACCTCCTGCCTTCTTTGATTTATCCGTGTTGGGCACAGAAACTTCTCCCTCTCCCACCTCCCATCAAAGTCCACAGAGGAGAAGTCCCGGGCAACACACCAGAACCTTGAGTGGACCTCTATCTCCTTTACATTCCAAGTTATCACTCGAAATCTCAATGGTGCGCCGTGAAAGTACTGCCCCTCCTGTCAGTGTTCACCCCTTGCCCCTGCCTCCTGGGGCTCCCCTGCCCTCTCCATCGTCAGCTAGTACATTTTCCAATGCTAGATCAGAATCATTGCCAATGAAAAACCAATGGCAGAAAGGGAAACTTATTGGGCGTGGGACATTTGGAAGTGTTTATGTTGCAACCAATAGGTATATAATGTTTCATGTGCATTTTAAGATCTTTTATCTATTTTCTGAATCTCTTAAAGAGATGTTGTTTCTTGACAGGGAAACCGGTGCATTATGTGCAATGAAGGAAGTGGAAATGTTTCCTGATGATCCAAAATCTGCTGAGTCTATAAAACAGTTAGAGCAGGTTGGTTGTCGTTACTTGTTTGTTACCACTGCCTATTTGTGATCTGTGTAAAATGTACAAACCGCATAGAGTGATGTTTTGTCTCCTTTATTGTGTTATGGTTCATATCTCTTATTAGAACTTTGGAATTTTAGTAAAGAAGTCAGTGCGGTAAATGTCAGTCAGTTTCTTGGGAATAGTAGTTCTCTTTCCAATCCTGAATAAGAACACATTTTAGTCACTTTGGATCTCTTATTACACGAGTACTGGGAACTGTGGCTGCATTATTAATAACATCTTGCAATTCTGCTTTAGCAAATTTACTTCTGAAATGTATTATCTTGAAACTTTTAATAACTAAGGCAACTACTTTGTAATGGTAATTGAAATTAATTTTTTCTCATTGAACAGTACAGATGTCCAGCTCAGATTAACTGGTCTATTATTTTACCTGTGTTTTCTCCTAGCCTTGGCCAATATACATTTTGCAGTGACGACTCCTAAATTTCGTTGTAGTGTCCATTATGCTTAATTACTTTGTGAGGTTGCTTTGTTGTTTTTATGGTTTGGCTATACATTTTACCCTCCCCTCATTAAGTATGAAGATATTTTATTCTCTATCCTCCCTATTCTTCTAACTAGTTTATTCTCTTTCTCCAGGAAATTAAAGTTCTTAGCCAGCTAAAGCATTCGAACATCGTGCAGTATTTTGGCAGTGAAATAGTAAACAATCTCTTACTTCATAATTAGCCGCTCAAGATTATTCATTTTTTTTGTTACAGCCTTAAAACCTTATAACATCTTTGGAGTATGCGTTTGCAGGTTGAGGGCCGGTTTTATATTTATCTGGAATATGTTCATCCTGGTTCAATTAATAAATACGTCCGTGAACATTGTGGTGCCATAACAGAATCTGTCATTCGGAATTTCACTCGACATATTCTATCTGGATTGGCTTATTTACATAGCAAAAAAACAATTCATAGGTACATTCACAACTCATACCAACTTGAATTCAAAACCTTTATTGATCCACATGCAATTGCTTTGTTCTAGTTGGAAAACGACTTTTCCTTGAATTTTTAATTTATCTTATATTTGAACCTTTGTCACTTTTGTATTTGCTTATATTTTTCTTGTATGCATATAGGGACATCAAAGGGGCTAACTTGCTTGTTGACTCCGCTGGAGTTGTTAAACTTGCTGATTTTGGGATGGCTAAGCATGTGAGTTAGAAGCCTTCCCCTTTAATTCACATTTTCTAGTTTCAGTTCTTTTTCATATGCTGAGAGTGGTTCGGTAATTCTGTAGAATCTTTGTATTTCTTCTATTTAATAAGATTATATGTTTATTGTTGAAAAATCCCAAGAGATTGGCATCAGAAACACAGGCCTTATGTTAAAAAGTTCAAAGTTATTGCTTTTAAAATTCCTTTCTCTCGCTTGAGATGAGCAATCTTGTCTCCCCTTAAAGCAGATTCAGATTTTTCTGAATTTGATTGTATAATAATCAGGTGCTTCATGTATTGTTTTTCAATTTCATTGGTTGAATATGTATCTTCAGGCGCTCTGGTGCTTATTTTGTGCTGTTGAATCTGTTCATGGGGTGTTTCATTAAGTTTATAACTCGGGATCCCTTTATGTCACAGCTAACTGGGTTCGAAGCTAATCTATCTTTGAGGGGAAGTCCGTACTGGATGGCTCCAGAGGTATATTATATATTATTACACTGCACTATCCTGTAATGTCTCGTGCAATTCTTATTAACACTTTTCTCATTCAGCTTTTGCAGGCTGTGATGCAAAAGGATAACAGCCCTGATCTTGCTTTTGCTATTGATATTTGGAGTCTGGGTTGTACCATCATTGAAATGTTCACAGGGAAGCCTCCTTGGAGTGAATATGAAGGAGTAAGCACCTGAAGAAAATTTTACTTTGCCTCTTTCCAACTTTGTGATTCTCAGGCTACTTCAATTCCATACTGATATAGTATTAGTATAAGATTTCTCATTGGTAACAGAATCCCAATGGTTTCCAAAACTACTTATTCAAAGATGGATGGTTTTATATCGCTTTATATGAGAATATGGGATTCTGAAGTTTGGTAACGGATGATATGCACCAACTTTTTACTTATTTTGGCAAACCTCAATATGAGCTAAGGCATGAGCCAACTTTTTTCTGTTTTCAGCTTGTGGATTTGGCAGAGATGATGTATGTATACGGGTACTTTATTTTTTAGCTTGTTAAATAATTTTTTTTTTCTAATTATACAGGCTGCAGCTCTGTTTAAGGTTATGAAGGAAACCCCTCCTATTCCTGAAACATTGTCGCCAGAGGGTAAAGATTTCTTGAGGTGCTGCTTTATAAGGAATCCAGCAGAGCGGCCAGCAGCTGCAGTTTTACTAGAACATCGATTTTTGAAAAACTCTCAACAGCCTGATGTTTCATCTCCCACTCAGTTGTATAATGGAACAGGCTTCATGGTGAATACAGTTGTGCCATTTTATATTTGCCGAGTCATTTTATTTGTTTGTTATTAAAATTTTCTTTTGTTGGCAGGACAAACCACGTAGTCCCATCAAACAATTTGAATATAAACATGATCAGTTGTCAATCTCCTGTGCCAAAATTGCCAAGGTTAAAGCAGCTGACAGGCGTGGATTTCTCATTTCTTCGTTGGAAATTCTTCCTGCATCCTTGAACCAATAACGTAATCCTGTTTTTAACACGCGATGACCATTGCCCAATTTCTCTGCGCCATGCTTTTTCTTTGCTGAAGTGGGAATCATCTCACAATAACCACATAGCAGTGGTACCACGGAACTTTTTTCTTCCCTCCACAGCACACCTGGTCGACTTCAAAAGGAAAAAAATGGTCTTTTCAATTGGCTGAGCTGGAGGAAGTTTTGATTATTTATGCCAATGACAGGGGCCCACATTGTAGTACTATAGTTTAAGAGACGCTCATGCAGTGACTTGCAGCGGTTGCCGTCATAGGTTCTCTTTTGCTTAGTTTATCAATGCTAAAAGTCAAGAGCTTCTTCTGTCTGTAAATTATGCCGCTCGAGAATACGGTAGCAGTTTTAGAAAATAATAATATCATTATACTAACTTAGAGTGACGAAGCAATTAACCTCAAAGGTTCATATTTCTTCCTCTCTCTATATTAGGATGAAGTCAAATTTATGTAGACTTAGTGTTCATCCCTCTCTGTTTCATGAGGATTCTAATTTGGTTGCTTATCGTAGATATGTCAATCCACTCCAGAAATGTTGTAATTACGATAAAGACTCTCAAAATCTTCAGTTTGGGATTGTAAAAATTGTACTTTCACAGGAGCTGCTACATGTTAATGTCCATAGGACTTAAGAATAAATATTGTTGACCTTCTAGAGTTGTATCTG