Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06030 LG1 89531798 89536208 PREDICTED: probable disease resistance protein At5g66900
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 89531810 5_prime_UTR_variant
G/T 89532076 upstream_gene_variant
G/T 89532181 5_prime_UTR_variant
T/A 89532915 upstream_gene_variant
G/T 89533025 upstream_gene_variant
G/A 89533640 missense_variant p.Arg325His
A/G 89534076 synonymous_variant p.Glu395Glu
G/C 89534515 intron_variant
C/A 89534567 intron_variant
T/C 89534572 intron_variant
T/A 89534913 intron_variant
A/G 89534987 intron_variant
A/G 89535003 intron_variant
A/C 89535834 missense_variant p.Ile834Leu
C/T 89535841 missense_variant p.Ser836Phe
T/C 89535927 3_prime_UTR_variant
C/A 89535951 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06030.1
MGETDQLVILTRFQDAMRMVMDIVEKGRKNKRSKRILRSTLKNMTLVVQEIKQYNEHLNPPREEIITLVKENDPGEDLVCNSCSRSLWWTKFLSWFSLYGEGLLHEKNDSLTSDDKQVKDIKNTLYKVREIIELLDIENFEQKLKGDGTPIKCPYGVPENPEFTVGFVPVLSKLKMEVLQEGVFTLLLSGMGGSGKTTLATMLCKDKEVKGKFKNNILFVNFSQTPKLKNIVERLFEHCGYHVPEFVSDEDAIKRLEILMRKIEGSPLLLVLDDVWPGSEALVDKFKFQMSDYKILVISRVAFPKFGTQIILKSLVHEDAMTLFRHHALLEENSSKCSLSIPNEEIVQKVVRYCKGLPLAIKVIGRSLSHQSTELWQKMVEELSKGHCILDSNTELLTSLQKILDVLEDNPIIKECFMDLGLFPEDQRIPLPALIDMWAELYKLDDDGIEAMEIIKKLDSMNLANLLVARRNTGDSDNHCYNNHFVVLHDLLRDLAIYQNNREPIEQRKRIITGINENQSQWWLGEKQQGMMSRLLSKYRGWCVKQTIQQVSALILSLSTDETCASYWSDIQPSQAEVLILNLQTKKYTFPEFMEKMIKLKVLIVTNYGFHHSELDNFQLLGSVSNLKRIRLERISVPHLSALKNLKKLSLYMCSNISQVFENGTILVSDSFPSLLDLNIDYCKDMVRLPNGICDISSLKKLSITNCHKLCSLPQEIGQLLNLELLNLSTCTDLEEIPDSIQNLSKLRLLNISNCISLSNLPEDIGNLCNLRNLNMTSCARCELPYSITNLENLKVVVCDEETAASWEAFEALLPNLKVEVPQVDVNLNWLHSISS*


CDS Sequence:
>Vu_06030.1
ATGGGAGAGACCGATCAACTTGTTATTTTGACAAGATTTCAAGATGCAATGAGAATGGTCATGGACATAGTCGAAAAGGGTAGGAAGAACAAAAGGAGCAAGCGAATACTTAGGTCAACCCTAAAAAATATGACTCTAGTGGTGCAGGAGATAAAGCAATACAATGAACACTTGAATCCACCCAGAGAAGAAATCATCACTCTTGTCAAAGAAAATGATCCAGGGGAAGATCTTGTGTGCAATTCATGCTCCCGGAGCTTGTGGTGGACCAAATTTCTATCTTGGTTTTCACTCTACGGGGAGGGACTTTTGCATGAGAAGAATGATTCGCTTACTTCGGATGACAAACAAGTTAAGGATATAAAAAATACACTGTACAAGGTGAGAGAGATTATTGAGCTTCTTGATATAGAGAATTTTGAGCAGAAACTTAAAGGAGATGGAACGCCAATTAAGTGTCCTTATGGTGTTCCTGAAAACCCAGAATTTACTGTTGGCTTCGTTCCGGTGTTGAGCAAGTTGAAGATGGAGGTTCTCCAGGAAGGTGTGTTCACCCTTTTGTTGTCTGGCATGGGTGGATCTGGTAAAACAACCTTGGCTACAATGCTCTGTAAGGATAAAGAAGTCAAGGGTAAATTCAAGAACAATATTTTGTTTGTCAATTTCTCCCAAACGCCTAAGTTGAAGAATATCGTAGAGAGATTATTTGAACATTGTGGCTACCACGTGCCTGAGTTTGTAAGTGATGAAGATGCAATTAAACGGTTGGAAATTTTGATGAGGAAAATTGAGGGAAGTCCACTGTTGTTGGTCTTGGATGATGTTTGGCCAGGCTCGGAAGCCCTTGTTGACAAGTTTAAATTCCAGATGTCTGATTATAAAATTTTGGTGATTTCAAGGGTTGCATTTCCTAAATTTGGCACCCAAATCATCTTGAAATCCCTTGTTCATGAAGATGCAATGACCCTTTTCCGTCATCACGCTCTCTTGGAAGAAAACAGTTCAAAATGCAGTTTAAGTATTCCTAACGAAGAAATTGTCCAAAAGGTTGTGAGATATTGCAAGGGTTTACCGCTTGCCATTAAAGTGATTGGTAGATCACTGAGTCATCAGTCTACTGAGTTGTGGCAAAAGATGGTGGAGGAGTTGTCAAAAGGTCATTGTATACTTGATTCCAACACTGAATTACTTACTTCCCTCCAAAAGATCTTGGATGTATTGGAAGATAATCCCATCATCAAAGAGTGCTTCATGGACCTTGGGTTATTTCCTGAAGATCAAAGAATTCCTCTTCCTGCTCTCATTGACATGTGGGCAGAATTGTACAAATTAGATGATGATGGCATAGAGGCTATGGAAATCATAAAAAAATTGGACTCCATGAATCTGGCTAATCTTTTAGTAGCAAGGAGAAATACAGGTGACTCAGATAATCACTGCTACAATAACCACTTTGTCGTCCTCCATGATCTTCTAAGAGATCTTGCAATTTATCAAAACAACCGGGAACCAATTGAACAGAGAAAGAGAATTATTACTGGCATAAATGAAAATCAAAGTCAATGGTGGCTTGGGGAAAAGCAACAAGGCATGATGTCCCGCTTGTTGTCAAAATATCGCGGATGGTGTGTTAAACAGACTATTCAACAGGTCTCAGCCCTCATATTGTCGCTGTCAACTGATGAAACTTGTGCTTCATATTGGTCCGACATACAACCATCCCAAGCAGAAGTTCTGATTTTAAATCTTCAAACTAAGAAGTACACCTTTCCGGAGTTCATGGAGAAAATGATTAAACTAAAAGTCCTTATCGTGACAAATTATGGTTTTCATCATTCTGAACTGGACAATTTCCAACTACTAGGTTCTGTATCGAACCTGAAAAGAATCAGACTAGAGCGGATTTCTGTTCCTCACTTGAGCGCATTGAAAAATCTGAAAAAGTTATCTCTCTACATGTGTAGTAACATAAGCCAGGTTTTTGAAAATGGCACCATCCTAGTTTCAGATTCATTTCCAAGTTTATTAGATTTAAACATTGACTATTGCAAGGATATGGTGAGATTGCCTAATGGTATCTGTGACATTTCCTCTCTAAAGAAGCTCAGCATTACTAACTGCCACAAACTTTGTTCTCTGCCCCAAGAAATTGGACAGTTGTTGAATTTGGAACTCCTAAACCTAAGTACCTGTACTGACTTGGAAGAGATACCAGATTCTATTCAAAACCTTTCTAAGCTAAGACTTCTTAACATCTCAAACTGCATAAGCCTTTCAAATTTACCAGAGGACATTGGTAATCTATGTAATCTCAGAAATCTCAATATGACAAGCTGTGCTAGATGTGAACTGCCATATTCAATAACCAATCTTGAGAATTTAAAAGTAGTGGTATGCGATGAGGAGACAGCGGCCTCATGGGAAGCATTCGAAGCTTTGCTTCCCAATCTGAAGGTGGAGGTTCCTCAAGTTGATGTTAACCTAAACTGGCTTCATTCAATAAGCTCCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_06030::LG1:89529798-89531798(+)
TTAAATTAAATTTTGATTATAAAAGACTAAAATGGCGAAACTGATCTAACTGGAAAAACTCACTAAATAAGAATTTAACAAATAGACCAAATTTTATTTGGGAGTTGTTCCCTCCATTACCCCAAGTGCTCCTTACACCTTCTTGTTATTTTTTTTTATTTCAAAAATACCCCATGTTAATTTAATTTTATTTACCTTTTCTAAAATTCTAATCCTCCATGCACCCTTCCCTTTTATCTTTATCTGATCGGAGACAAACTACTTTCTCTCTTCATCTGTTCTTAGCGCATACACAAAGAACTGTTCTTAGCGCATACACAGAGATCTGCACCCCTGTTCTCTCTTTGTGCTTAATTACCTCATTCTCCTATTTAACCAAATTAATTTGTTTTTAATTTTGCTCAAATTTTGTTCCCATCCCCTCTATCCGTCTCTTTATCTTTCTATCTATCTATCTTAAATGTCAGTGAGTGTACCCTGCAAAGATTGGCCTAGTCTCCATTACCCAGATCCAAAAATTATCACAATCCCAACCATGGCTGCAGAGCTTGGTACACGTATTCTAACCCCATAAACTCTCTCTGTTAATGGGTTGGAGTGGGTTCAACGGTGGTGGTCCATTCATGGTGAGCATGGTGGCTTCTCTGGTCGTCCTTAACACACACGTGTGTGTTGCCGCTAGCATCATGGTGTGAGTTCTACTTGACACTTTCTACTTTAGTAAGCCCATTGTGGGTTCCAAAACTCCTCCATTGTTGCTGCAAAGCATGATTCAGTGAGGGGTCTTAAGACTTTGAAATAGGTGAAACTGGACCAGTTTATGACCAGAGATGGAGGAATGAAATGGGAAAAAAGTTCTTTGACGACGTCAGATATCTGTGTAAGAAGGGCAAAAGAGGAATGACGGGGTATAGAGGGTAGCATGTGATGGTGGAGGGAGTAACTCTCATTTTACTTTTATTGTTTGAAAATTTAAGACTAAAATGCTTACCTTTTCTTCATGTTAAGAGATGAATTATTATTTAGTATCCGATTTTAAAATGAAGATATTAGATTTTTATATTATGAAAATTATATAAATAAAATCATGTATGTTAAGTTGACAACAATAACAGTAAAATACTTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTAAATAAGATATACGCAAAAGTAAAGCTGACAAATCACGTGTGGTGGTTGCTGCTGATAACGTTTCCACCACTTTTCGTGGAAAAAGTCTTTTATGTTGTTTTTCCTATGAAATTTCCGAAGAGTATCGTGACAAGACAACCATACGATTTCTGCAATAATTGTAGACACGATTCCGATTAGTTCAATAGTTGTTTGTGTTTTTTATTTCCATTGAATAATTTTTGTCCACCTTACACGCGCCCCATCTTTCGCGGCAGGAACGTACGTTTGAAACGCTCGAAAAGTGATTTATTGCGTTTTAAACATCTTGGACAGCTTCCTCGGTCTAAGGCTGTAATATCTATCAACTTGACTGAAATATAAAAAACAAAAAAATTCTAATATAACGAGAATAGGTGCACTATTTTATTTTGTTATAAAACAGATCAAATATAAGTCATCACATAGATATTATAAAAAAATTGTAAAAAATAAATTATTAAAAAACCATTTTTCAAAAAGTAATAAGAGCGAAACAAAAACCAGGAAATTGAACCTTTCCATTGTTGGTAGTAAAGCACGATGAAATATGAAATGTAAAAAATTAGCCACAGATATTTTAAATGAAAAATGGTAACATAACACCCTTTTATATTTATTTGACAAGAAAAATAAAATAGTCATAATAATATAAAATTTTGTATTTTTTCGAAAAAAAAAATAAAGATAATATCAAATAATAAAGGTAAAAAATTTAGATGTGTTAAATAATATTTTTTATTTTAAACAGTGGGACTAACGTAAATAAAACAAAAGTTTTTTTTTTTAATATCTTTTTTTACTAAACAACCTAAATATTATCTCATCATCTCTA


Gene Sequence:
>Vu_06030(+)
ACGCGTGTTGGCGAAAGTCACTGGAAACGAACGCGAAGAACTCAACGCAGATTCCAGATCCTGCTTTATATGACTGATAAATAGCGCCTTTCGCGCTCTCATTTTAATTTTTCAATTTCAATAGCTACCAACTTACCGTTGCTTCGCTCCAAATCGCAAATTAAATTATCCCAAAAAGAAGGACTCAAGACGCAAAAACACTACTTCATAGGAGGTTTGAGCAATTTTCTCAAAGGCACAAGTTTTTTCTTTTCGACTTTGATGTCTCAGAGTATATAGATAACTGTCTCATTTTTTCTAAAATTTCAGTTTTATGCAACATCACTGACTTTTGTCTTTCACAACTTGTTCCTTGTTTGATTGAGCAGAGTAAGGAAGCAAAAGATTGGCTATCATGGGAGAGACCGATCAACTTGTTATTTTGACAAGATTTCAAGATGCAATGAGAATGGTCATGGACATAGTCGAAAAGGGTAGGAAGAACAAAAGGAGCAAGCGAATACTTAGGTCAACCCTAAAAAATATGACTCTAGTGGTGCAGGAGATAAAGCAATACAATGAACACTTGAATCCACCCAGAGAAGAAATCATCACTCTTGTCAAAGAAAATGATCCAGGGGAAGATCTTGTGTGCAATTCATGCTCCCGGAGCTTGTGGTGGACCAAATTTCTATCTTGGTTTTCACTCTACGGGGAGGGACTTTTGCATGAGAAGAATGATTCGCTTACTTCGGATGACAAACAAGTTAAGGATATAAAAAATACACTGTACAAGGTGAGAGAGATTATTGAGCTTCTTGATATAGAGAATTTTGAGCAGAAACTTAAAGGAGATGGAACGCCAATTAAGTGTCCTTATGGTGTTCCTGAAAACCCAGAATTTACTGTTGGCTTCGTTCCGGTGTTGAGCAAGTTGAAGATGGAGGTTCTCCAGGAAGGTGTGTTCACCCTTTTGTTGTCTGGCATGGGTGGATCTGGTAAAACAACCTTGGCTACAATGCTCTGTAAGGATAAAGAAGTCAAGGGTAAGAGGTCATTCTTCTTTTGTCCTCTCATGGCTGATAAATTGGCTGACTAATTCTTTATAACTTCATTTGTGGATCCCCTAACCAATTCTTCATAAGTCATCTACACTCATAAAGAACTTTGTTTAGAGTGATTGTTATCCCCTAACCAATTCTTCATAACTTCATTTATAGGTCCTCTATCTCACATTAAAAGACAGACGAGAAAAAGTTGTCTGAAAATTTGTTTGTAGTGGTAGATATGCTCTCATCAATGCTTTCATAAATTCACTTATATATCCTTTATCTCATACATACAATTCTCTGTCATAAACTACTAAACTTTCACTAAAGATAGTAGAAGAAGGATGAAAAATGTTCGTTTGAGAATTGCAAACATGTATGAAAGTTTATATGTATCTGATAAAAATTGTGGCAAGCCAAATGTTTTGAATCCCAATTTCTGTGGACTGACGGATCTCTTTGCTTTCACCAGGTAAATTCAAGAACAATATTTTGTTTGTCAATTTCTCCCAAACGCCTAAGTTGAAGAATATCGTAGAGAGATTATTTGAACATTGTGGCTACCACGTGCCTGAGTTTGTAAGTGATGAAGATGCAATTAAACGGTTGGAAATTTTGATGAGGAAAATTGAGGGAAGTCCACTGTTGTTGGTCTTGGATGATGTTTGGCCAGGCTCGGAAGCCCTTGTTGACAAGTTTAAATTCCAGATGTCTGATTATAAAATTTTGGTGATTTCAAGGGTTGCATTTCCTAAATTTGGCACCCAAATCATCTTGAAATCCCTTGTTCATGAAGATGCAATGACCCTTTTCCGTCATCACGCTCTCTTGGAAGAAAACAGTTCAAAATGCAGTTTAAGTATTCCTAACGAAGAAATTGTCCAAAAGGTGCTTATTCTTTACTTTCTGAGACATGAGTGTGTATAACTGCCCTTCTTGTCTGAAGTCATTCACTTGAAGTAGACATCTCAAGATAGGAAGGACATAACCTCTTGCAATTAAAATAAAACTTATCGATGAGTTAGAGAGTAGAAACCCCCAAAGCAATATCATGGTAGATAACCTAGGTACGACCTTTTGTTTACTAACCTTATTTACTTCACTGAAATGCAGGTTGTGAGATATTGCAAGGGTTTACCGCTTGCCATTAAAGTGATTGGTAGATCACTGAGTCATCAGTCTACTGAGTTGTGGCAAAAGATGGTGGAGGAGTTGTCAAAAGGTCATTGTATACTTGATTCCAACACTGAATTACTTACTTCCCTCCAAAAGATCTTGGATGTATTGGAAGATAATCCCATCATCAAAGAGTGCTTCATGGACCTTGGGTTATTTCCTGAAGATCAAAGAATTCCTCTTCCTGCTCTCATTGACATGTGGGCAGAATTGTACAAATTAGATGATGATGGCATAGAGGCTATGGAAATCATAAAAAAATTGGACTCCATGAATCTGGCTAATCTTTTAGTAGCAAGGTGAGATGACTAGTTGTTTTGCCTTCCCAGCTTCTTTATATACATATAAGGTGAATTTTACTCTAAAATAAACAATTCAATAGCATGTGTAGTTCATGCGATAATCAATTAGTAACTTGTAAATAGATCAAAATGACCATTTCTCTTGGAGTGAATGTAATCTTCGCACATCATGCAACTCTACATTTTTTTTCTTTAACTCATTCTGAGGTCAGAAGTTGAAATTCGTAATTTTTCTATCTAATAGAGAGCGTGTATTATATAATCTTGTTGGATAATTTCTCCTTTTACTAAAGATTTATTTTTTTCTGCTCGTTTACCAGGAGAAATACAGGTGACTCAGATAATCACTGCTACAATAACCACTTTGTCGTCCTCCATGATCTTCTAAGAGATCTTGCAATTTATCAAAACAACCGGGAACCAATTGAACAGAGAAAGAGAATTATTACTGGCATAAATGAAAATCAAAGTCAATGGTGGCTTGGGGAAAAGCAACAAGGCATGATGTCCCGCTTGTTGTCAAAATATCGCGGATGGTGTGTTAAACAGACTATTCAACAGGTCTCAGCCCTCATATTGTCGCTGTCAACTGGTTAGTTATACCGTTTTTAAATTTTATACTTTTAAATGTTAAAACTGCTAATAAGAAAGTATAATTGATTTGCCGTTGATTACTTTTGCCCAACTGACATCATATGGATTGGTTTTGCAGATGAAACTTGTGCTTCATATTGGTCCGACATACAACCATCCCAAGCAGAAGTTCTGATTTTAAATCTTCAAACTAAGAAGTACACCTTTCCGGAGTTCATGGAGAAAATGATTAAACTAAAAGTCCTTATCGTGACAAATTATGGTTTTCATCATTCTGAACTGGACAATTTCCAACTACTAGGTTCTGTATCGAACCTGAAAAGAATCAGACTAGAGCGGATTTCTGTTCCTCACTTGAGCGCATTGAAAAATCTGAAAAAGTTATCTCTCTACATGTGTAGTAACATAAGCCAGGTTTTTGAAAATGGCACCATCCTAGTTTCAGATTCATTTCCAAGTTTATTAGATTTAAACATTGACTATTGCAAGGATATGGTGAGATTGCCTAATGGTATCTGTGACATTTCCTCTCTAAAGAAGCTCAGCATTACTAACTGCCACAAACTTTGTTCTCTGCCCCAAGAAATTGGACAGTTGTTGAATTTGGAACTCCTAAACCTAAGTACCTGTACTGACTTGGAAGAGATACCAGATTCTATTCAAAACCTTTCTAAGCTAAGACTTCTTAACATCTCAAACTGCATAAGCCTTTCAAATTTACCAGAGGACATTGGTAATCTATGTAATCTCAGAAATCTCAATATGACAAGCTGTGCTAGATGTGAACTGCCATATTCAATAACCAATCTTGAGAATTTAAAAGTAGTGGTATGCGATGAGGAGACAGCGGCCTCATGGGAAGCATTCGAAGCTTTGCTTCCCAATCTGAAGGTGGAGGTTCCTCAAGTTGATGTTAACCTAAACTGGCTTCATTCAATAAGCTCCTAACTCCTAGGACCTTGTCTGCTTCATGGAAGGAAACATTTGAAGCTATGCTTCCCAATCATAAAGTCAGAGAGGTACCTCAAGTTGATGTTAACCTAAATGGCTTACCAATAGCCGCAAGTATTTTATGTATCTTGTATAAAAGTTTCTACACTAGCCCTACTTTTGTCACCAAGTGTGATGTATTTGCATGTTTCTTGCAAGTTGCAAACAGCAGATGATAATTGAAAAAGGTAGGAGATTGCGTGTAATGTGTGTGGTGTCATGAATTGACATACTTAGTACTAATACGTGTTGTAAGTTTTCTCACTTCTGAACTTTCATAAAGTATGCATTTTTATCTTAGATTTAAACTTTTATCCCTCG