Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_06028 LG1 89520346 89523168 PREDICTED: pollen receptor-like kinase 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 89520358 missense_variant p.Arg5Gly
G/A 89520442 missense_variant p.Asp33Asn
G/A 89520549 missense_variant p.Met68Ile
T/A 89520564 missense_variant p.Phe73Leu
C/A 89520672 synonymous_variant p.Ser109Ser
G/T 89520743 missense_variant p.Arg133Leu
T/A 89520840 intron_variant
T/C 89520860 intron_variant
T/A 89521166 missense_variant p.Ser239Arg
G/A 89521173 missense_variant p.Gly242Arg
G/T 89521201 missense_variant p.Gly251Val
A/G 89521797 missense_variant p.Arg339Gly
T/C 89521836 missense_variant p.Trp352Arg
G/A 89521934 synonymous_variant p.Gly384Gly
G/A 89522330 synonymous_variant p.Ser516Ser
T/C 89522340 missense_variant p.Ser520Pro
T/C 89522374 intron_variant
T/C 89522402 intron_variant
G/A 89522769 missense_variant p.Val606Ile
G/A 89522959 missense_variant p.Arg669Gln
A/T 89522966 missense_variant p.Arg671Ser
G/T 89522993 missense_variant p.Arg680Ser
G/T 89523019 missense_variant p.Cys689Phe
T/C 89523087 stop_lost p.Ter712Argext*?
T/G 89523135 missense_variant p.Cys728Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_06028.1
MEGLRKLGSGSVVMFGQGRVMVRERKRGCKNRDEFEGCPGPSRVECKDNVVRPRKKKKRLGQHLSACMQPNLFLSPSPILGSSFSSLFLHILPMPSKLFHPPTLHSSSSSSSAPSSLPPNFSSVLGQPLFRARTPPLVPTIHYGTKCLENYGSSLDSWNSTTPPCTDGHANWRGILCYEGKVWGVKLENMGLQGLIDIDSLKALPYLRTLSFMNNSLEGPWPEIHNLVGLKSIYLSNNKFSGEIPYRAFEGLKWLKKVYLSNNQFSGYVPTSLTVLPRLIELRLDGNEFTGAIPRFHPLNRLRLFNVANNQLQGQIPSTINRMPASSFAGNERLCGAPLESCTSKPSTASVVGAVVVVCLAVLVIGIVVLMIHKKQNGACAAKLGNPPSSIGKGRLRDVGDESRRSAGSMSSTDTRKAEHLRLSFLRDDREMFDLQELLRASAEILGSGCFSSSYKAALVNGPTIVVKRFKQMNNVGKEEFQDHMRRLGRLSHPNLLPPVAYYYRREEKLVVTDYVRNGSLAVRLHGHQSLGEPSLEWPIRLKIVKGIAKGLEYLYRDMPSLIAPHGNLKSSNVLLSESFEPLLTDYGLVPMINQELAQDIMVIYKSPEYLQQGRITKKTDVWCLGILILEILTGKFPANFLQKGKGSEVSLASWVDSVVPEEWTNAVFDQEMGTTKNSEGEMEKLLKIALNCCEADVDKRWDLKEAVEKILEVKERDGDQEIFLTSYASDAELISST*


CDS Sequence:
>Vu_06028.1
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Promoter Sequence:
>Vu_06028::LG1:89518346-89520346(+)
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Gene Sequence:
>Vu_06028(+)
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