People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05999 LG1 89071479 89075966 PREDICTED: wall-associated receptor kinase-like 14
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 89073382 missense_variant p.Leu260Pro
A/T 89073386 missense_variant p.Trp259Arg
C/T 89073595 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05999.1
MFHRSTKFALLLTIFVFCSTIARTSSNCQPSCGQHSLKYPFGFCSDSKVKLNCSSDSTKVKIGEFEVQNITSDSIFVSLPVKCNRSLRIIDPLFGVNFAPTFNNSFLLQGCKSKQNGCDTTPSSFVGEHGPVEGCDWENKSENFICFKRLPRNNSSREDVLQSDLKGIGCSFLFSAIAYDKSKGKELSLQLQMLELGWWLKGPCNCSNNASCTVVKLATGDPGYRCRCHEGFVGDGFKDGDGCRSTFSAVPQCKPSTLWLCRCRKAIKIGVLVGGVIIVATLVVALSLLCYFTRRRSSWLRKQVTVKRLLREAAGDSIVPLYPYKEIERATSFFDEKHRLGTGAFGTVYAGHLHNDECVAIKKIKYRDTNSVDQVINEIKLLSSVSHPNLVRLLGCCIEGGEQILVYEYMPNGTLSEHLQRERGGILPWTTRLTIATETANAIAYLHSAINPPIYHRDIKSSNILLDYSFQSKVADFGLSRLGMSETSHISTAPQGTPGYVDPQYHQNFHLSDKSDVYSFGVVLVEIISAMKVVDFSRPTSEINLAALAVERIRRGCLDDIIDPFLEPHRDAWTLYSVHKVAELAFRCLAFHSDMRPTMIEVAEELEVIRRSEWEALEETICTASSVGSVCSSPRIGRENSLVGVSFERVAGQGSETLIVPPKSEMFLQSVKEVKDNSPVSVHDAWLSGTSSPSTNC*


CDS Sequence:
>Vu_05999.1
ATGTTCCACCGCAGCACAAAGTTCGCACTGCTTCTCACCATCTTCGTTTTCTGTTCAACCATCGCCCGAACCAGCAGCAACTGCCAGCCCAGTTGCGGACAACATTCCCTAAAATACCCTTTTGGGTTCTGTTCTGACAGCAAAGTCAAACTAAACTGCAGCAGCGACAGTACGAAAGTCAAAATCGGCGAGTTCGAGGTTCAGAATATAACCTCTGATAGCATATTCGTGAGTCTTCCGGTGAAGTGCAACCGCAGCTTGCGAATCATAGACCCTCTTTTCGGCGTCAACTTTGCTCCTACGTTCAACAATAGCTTTCTGTTGCAGGGTTGCAAGTCCAAACAGAATGGCTGCGATACTACCCCATCGAGTTTCGTTGGCGAGCACGGCCCAGTGGAGGGGTGTGATTGGGAAAACAAAAGTGAAAATTTTATTTGCTTCAAGCGGTTGCCGCGTAATAATAGTTCGCGTGAAGATGTGCTCCAGAGTGATTTGAAAGGAATTGGGTGTAGCTTCTTGTTTTCTGCCATTGCTTATGACAAGAGTAAAGGAAAAGAGCTTTCGCTACAATTACAGATGCTTGAGTTGGGGTGGTGGCTCAAAGGGCCCTGTAATTGCTCCAACAATGCATCCTGCACGGTGGTCAAGCTTGCCACAGGAGATCCAGGCTACCGGTGCCGGTGCCATGAAGGTTTCGTAGGCGACGGTTTCAAAGACGGCGATGGCTGCCGGAGTACCTTTTCAGCAGTTCCTCAATGCAAACCTTCAACACTATGGCTTTGCAGATGTAGAAAAGCAATCAAAATCGGTGTCCTTGTTGGAGGGGTGATAATTGTGGCTACCCTGGTGGTTGCTCTGTCTCTTCTATGTTACTTTACTAGGCGTCGTTCCTCTTGGCTGAGAAAACAAGTTACAGTAAAGCGCTTATTACGAGAAGCTGCGGGCGACTCTATTGTTCCTCTATATCCGTACAAAGAAATAGAAAGAGCCACAAGTTTTTTCGATGAAAAACATAGGCTGGGAACTGGGGCATTTGGCACAGTTTATGCTGGACACCTTCACAACGATGAGTGCGTTGCTATAAAAAAGATTAAGTATAGAGACACCAATAGTGTTGACCAAGTCATAAACGAGATCAAGCTCCTTTCTTCAGTGAGTCACCCAAACTTAGTACGCCTCCTAGGTTGCTGCATAGAAGGAGGAGAACAGATACTTGTGTATGAGTATATGCCCAATGGAACACTATCTGAACATTTGCAAAGGGAGAGGGGCGGAATACTTCCATGGACAACAAGACTCACCATTGCTACAGAAACTGCTAATGCTATAGCATATCTCCATTCTGCCATTAACCCTCCGATATATCACAGAGACATAAAATCCAGCAACATACTCTTGGACTACAGTTTTCAATCAAAAGTGGCAGATTTTGGGCTTTCTAGGCTTGGAATGTCAGAAACATCACATATCTCAACCGCCCCACAAGGGACCCCGGGCTATGTTGATCCCCAATACCACCAGAACTTTCACCTTTCTGATAAAAGTGATGTCTACAGTTTTGGAGTGGTTTTGGTAGAGATAATAAGTGCAATGAAAGTGGTTGATTTTTCGCGACCTACAAGTGAAATCAATTTGGCTGCACTTGCAGTTGAAAGGATTAGGAGGGGTTGTCTCGATGATATCATTGATCCCTTCCTTGAGCCACATAGGGATGCTTGGACACTCTATTCTGTTCACAAGGTGGCTGAGCTTGCATTTAGATGCCTTGCTTTTCATAGTGACATGAGGCCTACCATGATTGAAGTGGCTGAGGAGCTTGAAGTTATAAGACGCAGTGAGTGGGAAGCTTTGGAGGAAACCATATGCACAGCTTCATCGGTTGGGTCCGTTTGTTCATCGCCTCGAATAGGAAGAGAGAATTCATTGGTTGGTGTTAGTTTTGAGAGAGTTGCAGGGCAAGGGAGTGAGACATTGATTGTTCCACCCAAGAGTGAAATGTTTTTGCAATCAGTGAAGGAAGTGAAGGACAACTCTCCTGTATCTGTGCATGATGCTTGGCTCAGTGGAACTAGCTCACCTTCAACAAATTGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_05999::LG1:89075966-89077966(-)
ATATATATATATATATATATATATATAATTCATATTATAATTTAATAATATATATTAAAATAATAGTATGTAAAGTGATCATTATTAAATAATTATTAAACATGGTAATTATAATAAAATTGTAGAACATAGAAAGAAATTCGTATACAATTAGAGAATATAAGGTAGTTTTGGAATGGTTAAATATTTGTCCACAATATAACATGAATAAGACAAACGCATGTTTAAATAAATTAAGGGTGTTTTTAAATAAAGATAGTCAATTATCCAGGAGAAAAAATCAATTCTTGTCATTGACTCTTTCAAGATAATTAATTATATTTTAAATATTATTAATTATTTTATTTTGTTTAACTGAAAGATAGTTTAAAAAAATGTAAAACTTCTGAAAGACAATATAAATAATAAATTTATACAAATACTTAAGAAATATCTGTTTTGATATTACCTATTTTGCGATAACCTATGGTCAAAACACCTTCCCCATTTTAAACCATGTATAAGTAAATTTTAGTTTATAAAATAAATTTATTTATTCGGTTTTTCTTTTTATGTGTTTGCAAAAACTAATGGTCACTACTTATACGAATATTTTCTTTTTAAATTACATATAAATAAATTATAGTTTAAGAAAATATATTTATTTATTTATTATTTATTAGAAATGTTTTGCAAAATGGTTATGGAAGAGACTTAGAGTAATTCTTTTTTACCCAACTTTTGTTTTTTCCTTAAATGGGAAGTTGGCCAAACAATTATTTAGAAATATTCTTAAAATAAAAAATGTATGTATTTGGGAAAATATGTAAATTAAGGATTTTTTTATCAGCATAAATTAAGGAGCTTAAAAATAAATGTATTTATTACCTTCTACTCCTAACTCAAGACTGAAAAGATAAAATATGAAATTAGTCTTGGCAAGTCAACACTCTGGTCAATGGTTTATTCGTTTGACATATATATATATATATAAATAAACATCTAAAGATGTTGATTTATTAGTTATTGTTATTCATATATTAATTTTAAATTATTTCTTTAAATTTCCATAATATGAATTTATATTATTTCTATTTTTCTAAATATTTTTCATTCCTTTAAAATATTGATGAACAACAATATATACAACATAAATATTTTATCACTTGGAATTAAATATTGAAATTCTTTGATTGTGGTAATACATATATTATGTGCATATATTAAAATAAAGTTTCATTACTTAAAGAAATTTTATATTTCAAAAATTAAAGGTTTTAAATATCTTAATATAAATTAATACAACGTACGATTAATTATGTGAAAGATGTAAGGAAGTATGCACGAAATCGATTTTCAGATGCTATATAACGTTAATCTGACGTATGATGATGGATTATCTTCTGATGAAAAATCAATTATTTGGAAATTGATAACTTGTGTGAACAATTGGTTCTTTCATATTTCCATACTTTTATTACAAAATTAATACCAGATATATGATATTGACTTATTAATATATTTATGATTGATTTTTTTTTCTGTATATATATAATTATTAATATTATTATTAGTATCTGACATTCAAAACAATAATTTGTGATTGAGGTAAAATGGATTATTCTCAATTCACATAATGATCTTACGTGGCTAAGAATGTTTTTATGGCTGAATAAACAACTATTCTACTTAATAAAGTATATATGAGCTTGTTTATTAAGGTAATTTTTTCCGTAGTAAAAATAGAAAAATAAAAGGAAATCCCAATATATTTGTTTTCAATTTACTCTCACTTATCTAAACAAAAAAATGTCCTAATTATTTTGTATTTCTATGTTTGCTCTTTTTATGGACATTATTTCTTCCACACTTGCCAAAGAAGCATGTGTGTGCATAGGCAAATTGTGAGAAAGAGCAGGGGCTTTTGTGTGGAGAATAAAATAATCAAAGGGTAGATTGGTCATTGAGAAAAGACCCAAAAATGAAGACATGTAGTTTACGTTGGGGTCCCAGGACAAGTG


Gene Sequence:
>Vu_05999(-)
GTCTGAGACGCCACACAACAATTAGAAGAAGCTTCTCTGAAAACTCACTCAATCAAAACGATCTTTTGCCTGTGTTACGCAGTGCGCTGATCTTCTTTCATTCCTTGGTCTCTTTATGCTTCAGAAACGACAACGTTAACTCTTCTACTACTTCTTACATCACATCACACACACCATTAACTTTCAACCTCGATCTTCGAGTGGTTTGGTGAAGAACTCCTGCCTCTGCCACACTCATTAATTTCCCAATTGCCCAGCCCGGAAGCTAAAGGTATGCATATATATCATATCAACGTCACCCTTCATTTTTCTCTCTGTTTTCCATTCCAAACTTCATTCAAACCTTTATTTCCTGTGAGCATTTATTGAGATAGATGGCTGTCCAACCGCATCCTTCACAGGATTTAATTTCCGTTTCTCCAAAGTCAACCGTATATTTAAACGCTTTTCCAACTTCCTCAAAAGCCTAACTCTTTATTACAGCAGAAAGCTGATGATTACACCGTTCCCTCAAATCCAAGTTTCATTTCGCATCCAGAGATGTTCCACCGCAGCACAAAGTTCGCACTGCTTCTCACCATCTTCGTTTTCTGTTCAACCATCGCCCGAACCAGCAGCAACTGCCAGCCCAGTTGCGGACAACATTCCCTAAAATACCCTTTTGGGTTCTGTTCTGACAGCAAAGTCAAACTAAACTGCAGCAGCGACAGTACGAAAGTCAAAATCGGCGAGTTCGAGGTTCAGAATATAACCTCTGATAGCATATTCGTGAGTCTTCCGGTGAAGTGCAACCGCAGCTTGCGAATCATAGACCCTCTTTTCGGCGTCAACTTTGCTCCTACGTTCAACAATAGCTTTCTGTTGCAGGGTTGCAAGTCCAAACAGAATGGCTGCGATACTACCCCATCGAGTTTCGTTGGCGAGCACGGCCCAGTGGAGGGGTGTGATTGGGAAAACAAAAGTGAAAATTTTATTTGCTTCAAGCGGTTGCCGCGTAATAATAGTTCGCGTGAAGATGTGCTCCAGAGTGATTTGAAAGGAATTGGGTGTAGCTTCTTGTTTTCTGCCATTGCTTATGACAAGAGTAAAGGAAAAGAGCTTTCGCTACAATTACAGATGCTTGAGTTGGGGTGGTGGCTCAAAGGGCCCTGTAATTGCTCCAACAATGCATCCTGCACGGTGGTCAAGCTTGCCACAGGAGATCCAGGCTACCGGTGCCGGTGCCATGAAGGTTTCGTAGGCGACGGTTTCAAAGACGGCGATGGCTGCCGGAGTAGTGAGTCTTTTCTCATTCTTATTACAAGTTACTTTGTGGTTTTGTATTCATACCTGTTAAGTCTAGTTTAATTACACTTTCATTCTGGTTAATACATTAATAGTAGTAACAAGGTAAACGGTAAACAGTGTCTAAAGTGTTATTTAAGAAAAACGTTTAAATTGAGAGAGGAGGTATATGTATTGTTTGCTTTTCGTGAAGTAGTTATTGTAATGATGATGATAATGGATGGTGATTATGATTGTTGAATGATGACCAAGTGGTGTTTGACATCTGGTTGCGGCTTTATGCTTTGGGCAACCAGGTTGGTTTAGTTTATAATACTAGTGTAGGATTGTGCATCGGGAATTTCGGGGATGAGGTTTTTTAAGTGGGGGAATCTCTGAAAGATCAGTGTGTGCTTTATCAAGGTTCACAATGGGAATATTTGATTTGTTAGGGGCATGGGCGGTATGTAGATTTAAGCATAAAGTTCAATATTTTGATTATTGTGGACCCATTTGGACCATGATGATATTGATTCTCTTTCTGGGTGTGGGTGTTGGTTTTTGAGTTAATGGGTGATTAGTGACCCAGAATTTCGCAGAGAATATGGAAGAATGGAACTGTTCAATGCTAGGCTTGATATGTTTTTGTTTTGAAGGGTAATCTGCGTAGGAAATAATTCTTCAGAAGTCAACATGCTCTCATGGTACCTTTGGATTATTTATGGATCAAAATGGTAGGTAAAGCACATGTCTGGTAGGATGGATTTGAATTTTTTTTTATTCTATATTATAAGTGGTCAGAGGGGAGAGAGTGGTGCCAAATACATTTATCAAGTGGGGAAGTAGGAAATGAACCTAATATTACATGTAACTTCTTAGTTCAGGACATCACCGACCGACGCTTGTTGCTTATCATTTTTTCTTTTTCCGACACTAGAAGTTGAAGTTGAGTGTGATACGAGTCATTGGAAAACTAAAATTAAGTAAACATCTTCTTTGACGCAATCTATAAGGAATATTATTGAAGGCACGACAGATCCGGTTAGAATTGGTCAGTAGATACACGGATATGAACTCACCGACAGGTTGTAGATATGAATAATGCCATGATATTTAGTTGTTTACTCTATTGTTTTGGTGTCTGAAATAGAATTATGGGTGTAAAAAAATCAGTTGCATCATGCCACAATTCTTGTATTAACTATTTCATTTCATTGGACACTTAAGCTTCTGTGTATTTAATATTGTCGTTTTTCTAATCCCCTTTTTTTCATTTTAGCCTTTTCAGCAGTTCCTCAATGCAAACCTTCAACACTATGGCTTTGCAGATGTAGAAAAGCAATCAAAATCGGTGTCCTTGTTGGAGGTAGAGCCTTACGAAATTCAGCCAATATATGACCCTCTATGTAGTATAGTTCATAGATTTATTTTATTCAATGCTTTCCTGATAAATGGACCTCAGTTTCTTGTTAATAATTAGTTTACCAGTATTGATTATTGACTGCATATCTTTATTAAAAGATACTAAAATAAGCAAAAGTTGGAGAGAACTGAACAAAAAGTAAATCAGCAAGAGTTGGAGAGAACTAAGCACTAACTGGATTTTGTGTTTTTCTTGATTGAATTATTTCTCTATTCCCATTATCCGGATACATAATCGATTCAGTTAAAAACGTGTAGTAGAATCTGAACAAGTGCTGCATTGTTGCTTACAGGGGTGATAATTGTGGCTACCCTGGTGGTTGCTCTGTCTCTTCTATGTTACTTTACTAGGCGTCGTTCCTCTTGGCTGAGAAAACAAGTTACAGTAAAGCGCTTATTACGAGAAGCTGCGGGCGACTCTATTGTTCCTCTATATCCGTACAAAGAAATAGAAAGAGCCACAAGTTTTTTCGATGAAAAACATAGGCTGGGAACTGGGGCATTTGGCACAGTTTATGCTGGACACCTTCACAACGATGAGTGCGTTGCTATAAAAAAGATTAAGTATAGAGACACCAATAGTGTTGACCAAGTCATAAACGAGATCAAGCTCCTTTCTTCAGTGAGTCACCCAAACTTAGTACGCCTCCTAGGTTGCTGCATAGAAGGAGGAGAACAGATACTTGTGTATGAGTATATGCCCAATGGAACACTATCTGAACATTTGCAAAGGGAGAGGGGCGGAATACTTCCATGGACAACAAGACTCACCATTGCTACAGAAACTGCTAATGCTATAGCATATCTCCATTCTGCCATTAACCCTCCGATATATCACAGAGACATAAAATCCAGCAACATACTCTTGGACTACAGTTTTCAATCAAAAGTGGCAGATTTTGGGCTTTCTAGGCTTGGAATGTCAGAAACATCACATATCTCAACCGCCCCACAAGGGACCCCGGGCTATGTTGATCCCCAATACCACCAGAACTTTCACCTTTCTGATAAAAGTGATGTCTACAGTTTTGGAGTGGTTTTGGTAGAGATAATAAGTGCAATGAAAGTGGTTGATTTTTCGCGACCTACAAGTGAAATCAATTTGGCTGCACTTGCAGTTGAAAGGATTAGGAGGGGTTGTCTCGATGATATCATTGATCCCTTCCTTGAGCCACATAGGGATGCTTGGACACTCTATTCTGTTCACAAGGTGGCTGAGCTTGCATTTAGATGCCTTGCTTTTCATAGTGACATGAGGCCTACCATGATTGAAGTGGCTGAGGAGCTTGAAGTTATAAGACGCAGTGAGTGGGAAGCTTTGGAGGAAACCATATGCACAGCTTCATCGGTTGGGTCCGTTTGTTCATCGCCTCGAATAGGAAGAGAGAATTCATTGGTTGGTGTTAGTTTTGAGAGAGTTGCAGGGCAAGGGAGTGAGACATTGATTGTTCCACCCAAGAGTGAAATGTTTTTGCAATCAGTGAAGGAAGTGAAGGACAACTCTCCTGTATCTGTGCATGATGCTTGGCTCAGTGGAACTAGCTCACCTTCAACAAATTGCTAGTTAGTAAATATACTTATTTGGGTGAAATACCCATTATTTGAATGGCAAACGTCATTCAATGGTTTTCTTTTTTCTTTTTCAATTGTAGGATATATAGCCATTTGGATGATGATTGGCATCGAGATTCTTCTTTCTTTCTCTCTGAATCGTACCAACAATGTCCAAGACAATTTAATTATGTTCACCGATCCTATGTACTCAATATACAGAATTAATCTATTCACTATTCTTTGTTCGTT

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1575424