Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05986 LG1 88940450 88943922 PREDICTED: probable disease resistance protein At5g66900
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 88943562 missense_variant p.Tyr684Asn
C/A 88943564 stop_gained p.Tyr684*
T/A 88943610 missense_variant p.Leu700Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05986.1
MAMILDAVVGRVLDELLSTVIAMKDRAVKFRATLENLHSILKKVEPMAREIDGLNKRLDKPATETQKLIDEMEKGKELVIECSKVDWWNCCYKASSQEKLQDLIDSITLYFQLDMQGNINVIVLENQMLLHQIHEKLVENVPRRIAGLCSPPEPPAFTVGLDVHLRALKFKLLNNHHVGSVLTVTGTGGSGKSTLAKKFCSDEEVKGEFKDNIFFISLAEVPKLSTIVERLFEHNGYEKPQFQSDEGAVDRLENLLKQIGKNPILLVLDGVLPESASLVEKFVFQIPNYKILVTSRFTIKGFGQPYVLKSLNEADALNLFRHHASLDQTSFKIPDTIVKKIAKGCSGSPLALIVTGKSLSLEEPVVWHNRARTLSRGQSVLSYSSNSDGLLTCLQKSFDDLDAKLAESFMDLSLFPEAQKIPAAALVDIYAEQRDEDDDIAMENIHDLVKRNVADLVVTRNTTSGTVDYNYHYVTQHGLLRDLAIHQTRNLPTEKKHRLIIDLRGNNIPKWWTTQNEYHIAAHSLSISTDEEFTSEWCNLQPNEVKVLVMNLREKKRSLPPFMKKMNKLKVLTITNYDVNRAELENLELLDYLSDLKRIRLEKVSIPFLSKTGVPLKNLHKFSFFMCNVNEAFKNSTIKVSDVLPNLKEMNIDYCDMEELPAGLSDTVSLKKLSITNCHKLSKLPTGIGKLVNLESLRLTSCTKLEELPDSITSLHKLNFLDISDCVSLRMLPENIGELGSLERLNCRGCNRLSELPYSVKDLESLRVVVCDEERAALWEPIISMFSDLKLEVVLTDFKLDPLL*


CDS Sequence:
>Vu_05986.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05986::LG1:88938450-88940450(+)
AATTCATGATAATAACGTTACATTATTATATTATAGTAAATGAAATATCATTCTACAATTGTAATAGTATAATTAGTTTGAGAATGAGTTATAAAATAAAAAAAATTATATAAAAAATCATCAAAACACTATACAATAAATAAAAATATTAAAAAAAGTATAAATGATAAGATGTGTGCTTTACAAACTATTTGGTACATTATTAAATAAAATCGTATAAAGAAAAAAAAAATGTGTATGATAGAATGGAAAATATCTTGAATTTTTTTTTTCAAATATCAAACTAGTGAATCAATTAAAATATGATGGAAATGGTTTTAGCGAAAAAAAAAATCTCAAATGAAAGAAAAAGAAAGAATCAAAGACAGTAAAAAAAGGCAGGTTTTATATTACTTCCAAATAACCTAATGTTAGGCATCATCATGACACCTCGTTATGTTTATACCTAAACATTCATAAATAATTTGTCATTATATAAAAATTTATTAAAAAGAAAATAAAATAAAATTGTCAGAGGTGGTTACTGTCCTTAACAAATCAAAAAGATGAATTGATTTTAAATAATACCTTTAATAATTTTTTCGTAAAACATAAATTCTTTAATAACAATTTAAACAAAAAGAGTAAAAAAAAAAAGAAAATCACACAAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTATTTACAAAATTTCATAAATTTTTTTTATCGAGTTTTATCCTTTTTTTTAATCCAAACAACCACTTCTCCAATTTTTTTTTCCCTTCAACTTCATTTTATCTTCTTTTTTTCAAATTATCCTCGTTCCAAATACGTGCTTCCTGTTTGAACGTGTGGGTATCAACATTCTCAATAAAGTGATGCAAAATTCTTAATTAAATCATGCAAAATTCTCGAGTTTATAAAACTATAATATTTTGGTATTTCCATGGTGGAAACAATTCAATCTGTATACTCGTAGCTACTTACACCCATAATGGGATTGGGTCAAGATACACAAGTTTTCATATCACATAAACACTGACGACATGTAAATGCTTATGTAAACTAATTAGTCACTACAAATAAGATTAACTGGTTATCTTTATATTATTAATTAGTCACTACAAATAATCTTATTTTTTATGTCAACTGATGTCACATAAAATATATAAAAAAAAAAAATCTCTTGGTTTTTACATTTTATTTATTTTTTTTACTTAATAAAATATATTATTGACAAAATATAAACATGTGATATTTCGGTGAGACCTATTCAAGAAAAAGGATGCTTAATTGAAAAGAATAATATATTAAAAATGGTTAAATTGAAAAGAATGAAAGGTGAGATGTTATTAGTTTTGAACTGTCGAACAAAACGAAATCCTTTCATTATTAAGCGAGTTGTCTCTAGAATACTTGACTTAGTAATTGAGGGAGTGATTTTGTCAACTTAGTCGAAGTCAGGATTCATAAAAGTCTTTGCCTGTGCCAAATTGTCTTCAATGTTCTCACTAAATTTTACTACAATAATACCACCATTTCTCTAATTATTTATTTATAAGAAGCACGACTATTTAAACAATTTCTTGACTACCTTATATCAATGTGAACATTCAAGAGTGCGTGAACCTCAACTTGCTCAAGTTATAGATTCTTGATCTCACTGATGTCAAAGCCATGTCAACACGAAACACGGTTTAGAGGGAAAGGGCCTCGTCAAAAGAAAGAAAACATAAATCCTATAAATCCAAGAGAATTTTGATGTGAACAAAAATATCTGGTACCGGGTTCTCCAACGTAACAGCGTCTTAGAAAGAAAGAAAAAAAAAACTTCGGAGCATTATTGTTGGCATTCTTTATTATTTCACCACACTTTTTCTATTTTCTTAATTCCGGTACCTTATTATTGAGTTTGTTTGGCTTACATACCAGTGTTAGAACTTAGATCAAAGTTTCAGGTTTTGGGTGTTTTTAGTTAATTAGTTTCTGTGTGCAGTAGTCA


Gene Sequence:
>Vu_05986(+)
ATGGCTATGATTCTGGATGCTGTTGTTGGACGAGTGCTTGATGAACTGCTGAGCACTGTTATTGCAATGAAAGACAGGGCAGTGAAGTTCAGAGCCACCCTGGAAAATTTGCATTCTATCCTCAAAAAAGTAGAACCGATGGCTAGGGAGATAGATGGTCTTAACAAGCGATTGGATAAACCAGCTACAGAAACGCAGAAGCTGATCGATGAGATGGAGAAGGGGAAGGAGCTTGTTATTGAGTGCTCCAAAGTTGATTGGTGGAATTGCTGTTATAAGGCCAGTTCCCAAGAGAAACTTCAAGACTTGATCGATTCTATTACTCTGTACTTTCAATTGGATATGCAAGGAAATATAAATGTCATTGTGCTGGAGAACCAGATGCTGCTGCATCAGATTCACGAGAAGCTTGTGGAGAATGTTCCGAGAAGGATTGCAGGCTTGTGCTCTCCACCTGAACCCCCAGCTTTCACTGTTGGGCTGGATGTTCATTTGAGGGCGTTGAAGTTCAAGTTGCTGAATAATCATCATGTGGGGTCAGTGCTCACAGTAACTGGAACAGGAGGTTCGGGAAAGTCAACGTTGGCCAAGAAGTTTTGTTCTGATGAGGAAGTTAAAGGTATGAATGTGTCTATCTCATCATCTTTCACTTCTCGTATTCGTATTATTTGAAAAGGTAGTTTGATGGTCTTTTTGGTTCTATTGATCTCAAACCATTAGGTGGTTATTTAACTTCATTACTAGTTACTGGATACTATTGACTACCGAATCTAGTGAGGTTGCCACTTTTAGTCATAGTACGCAATCTATTAGCTTCAAGTAAATGTTTTGATGTCAGAATGCAACAAATGGGTTTTAGGCTGTATTTGGAAAGCCGTTACAGTTTCATCTAAGGGACATTTTACCCATTTTGAGGCAGAAACATTGAACTTGATGAAAATACAAGAACACTTAATCCATTAGGGGAATATCTGTGTGAATGTGGAGAGAATAAAATGATTTAAGTAGTTGAGAAATGAAAGTACTTTATATGTTCTTGATGATGTCCAAAATAATTGGCCTAAGAAGCTAGATCTTATTTTCTGTGAAGGTCATATTTTCACTTGTAAACATGTCTAAGGAATAGTAACTTCAGAATGATTATCCAGAGCTCTAAACATGTTGAAATTTGTTTAGGTGAATTCAAGGACAACATATTCTTCATCTCCTTAGCGGAAGTGCCCAAGTTGAGCACCATAGTGGAGAGACTGTTTGAACACAATGGTTACGAGAAGCCACAGTTTCAAAGTGATGAGGGTGCAGTTGATCGATTGGAAAATTTGCTAAAACAGATTGGAAAAAACCCCATATTGTTGGTCTTGGACGGTGTTTTGCCAGAGTCAGCATCTCTAGTTGAGAAATTCGTGTTTCAGATCCCAAACTACAAGATTTTAGTGACATCAAGATTCACAATTAAAGGATTTGGGCAGCCATACGTGTTGAAATCACTGAATGAAGCTGATGCTTTAAACTTATTTCGCCACCATGCATCCCTGGACCAGACCAGCTTTAAGATTCCGGATACTATTGTGAAGAAGGTATACTCTTTGTTGCTCAATTATGGTATTACAAATGTGGTGTGTGAAATAGTAACTACGGAATGCTTGTCTAAAAAAGTTTTCACCTTCCAGTAATGGTAATAGCAAAACAATGCTAAATGTTTTAGGAGCAATTTCTGATTTCATTGAACATATCAAATAAATTGCAGATAGCAAAAGGGTGCAGTGGTTCTCCCTTGGCACTTATAGTAACCGGAAAATCTTTAAGTCTTGAAGAACCAGTGGTTTGGCACAACAGGGCGAGGACATTGTCGAGGGGTCAATCTGTTCTTTCTTATAGTTCTAATAGCGATGGGCTTCTTACTTGCCTCCAAAAAAGCTTTGATGACTTGGATGCTAAGCTTGCTGAGAGTTTTATGGACCTGAGCTTATTTCCTGAAGCACAGAAGATACCCGCAGCAGCACTTGTTGATATTTATGCAGAACAGCGTGATGAAGACGATGACATTGCAATGGAGAATATCCATGACCTCGTCAAAAGGAACGTGGCTGATCTTGTTGTCACAAGGTATGGCGAATTACTGCTTCTCATTGGAGAACATCCATGCATTAAACCATACAAAGTCATTCCAAGTCATCTTGAAAAAATATTTGATATTTGAGTTATTCTCTAGATAGAAACCATGATCCTATTGGCGCTTTCTCCTATAAACTGTTACAAAATTTACTTCTACTAGATGAATAGAATATTGTTTGTGCTGTTTGCTGTGCATTGACTAATGAGCGATTGATTTATTTTCATTGATCAGGAATACTACGAGTGGAACAGTTGACTACAATTACCACTATGTTACGCAGCATGGTCTTCTTCGGGACCTAGCCATCCATCAAACAAGAAATTTGCCGACTGAGAAGAAGCATAGGCTAATAATTGACCTCAGAGGGAACAATATCCCCAAATGGTGGACTACACAGAATGAGTATCACATTGCAGCCCACTCATTATCCATATCAACTGGTATGTTCATCTTTCTATCTCGGTGCACATATGGTATGCACACATGCTGACAGAGTTCTCAAACACTAATTATTGAGTCTGATTTTGCAGATGAAGAATTCACTTCAGAGTGGTGCAACTTGCAGCCAAATGAGGTCAAGGTTCTAGTGATGAACCTTAGAGAAAAAAAGCGCTCTCTACCACCGTTCATGAAGAAAATGAATAAATTAAAAGTCCTGACAATAACGAATTATGACGTCAATCGTGCTGAGTTGGAGAATTTAGAGCTGCTTGATTATCTTTCTGATCTCAAAAGAATCAGGTTAGAGAAGGTTTCAATTCCTTTCCTTAGCAAGACTGGAGTGCCACTGAAGAATCTGCACAAGTTCTCTTTCTTTATGTGCAATGTGAACGAAGCCTTCAAAAACAGCACCATCAAAGTTTCTGATGTGCTTCCAAATTTGAAGGAGATGAACATTGATTACTGTGATATGGAGGAATTGCCGGCTGGACTCTCCGATACTGTTTCCCTAAAGAAGCTAAGCATCACAAACTGCCATAAACTTTCAAAACTTCCTACAGGAATTGGAAAGTTGGTGAATTTGGAATCATTGAGGCTTACTTCTTGTACCAAATTAGAAGAGTTGCCAGACAGCATCACAAGCCTTCATAAACTGAACTTTCTTGACATTTCTGACTGTGTAAGTCTTAGGATGTTACCAGAAAACATAGGGGAGCTGGGTAGTTTAGAAAGGTTGAATTGCAGAGGTTGCAACAGATTGTCTGAATTGCCATACTCAGTGAAGGACCTTGAGAGCTTAAGAGTGGTAGTATGCGATGAAGAGAGGGCTGCATTATGGGAACCTATCATATCCATGTTTAGTGATCTAAAGCTAGAGGTAGTCCTAACTGATTTCAAACTAGATCCTCTTTTATAA