Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05985 LG1 88915657 88919118 PREDICTED: probable disease resistance protein At5g66890
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   response to light intensity, defense response to fungus, response to lipid, hormone-mediated signaling pathway, hormone-mediated signaling pathway, hormone-mediated signaling pathway, defense response to fungus, defense response to fungus, hormone-mediated signaling pathway, response to alcohol
Cellular Component   located in   cytosol, endomembrane system, nucleus
Molecular Function   enables   ubiquitin binding, ADP binding, ADP binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05985.1
MAMVLDAVIGQVLDELLSTVIAMKDRAVKFRATLENLHSILKKVEPMAREIDGLNKRLDKPATETQKLIDEMEKGKELVIECSKVDWWNCCYKASSQEKLQDVIDSITRYFQLDMQGNINVIVLENQQLLKKLVESVPRRIAGLCSPPEPPAFTVGLDVHLGALKFKLLENHHEGSVLTVTGAGGSGKSTLAKKFCSDEEVNGKFKDNIFFISLVESPKLSTIVERLFEHNGYEKPQFQSDEESASVVEKFVFQIPNYKILVTSRFTIKGFGQPYLLKSLNEADALHLFRHSASLDQTSSNIPDTIVQKIAKGCSGSPLALIVTGKSLSLEEPVVWHNRARILSRGHSVLYYSSSSDGLLTCLQKSFDDLDAKLAESFMDLSLFPEAQKIPAAALVDIYAEQRDEDDDIAMENIHDLVKRNVADLVVTRNTTSGTVDYNYHYVTQHGLLRDLAIHQTRNLPTEKKHRLIIDLRGNNIPKWWTTQNEYHIAAHSLSISTDEEFTSEWCNLQPNEVKVLVMNLREKKRSLPPFMKKMNKLKVLTITNYDVNRAELENLELLDYLSDLKRIRLEKVSIPFLSKTGVPLKNLHKFSFFMCNVNEAFKNSTIKVSDVLPNLKEMNIDYCDMEELPAGLSDTVSLKKLSITNCHKLSKLPTGIGKLVNLESLRLTSCTKLEELPDSITSLHKLNFLDISDCVSLRMLPENIGELGSLERLNCRGCNRLSELPYSVKDLESLRVVVCDEERAALWEPIRSMFSDLKLEVVLTDFKLDPLL*


CDS Sequence:
>Vu_05985.1
ATGGCTATGGTTCTGGATGCTGTTATTGGACAAGTGCTTGATGAACTGCTGAGCACTGTTATTGCAATGAAAGACAGGGCAGTGAAGTTCAGAGCCACCCTGGAAAATTTGCATTCTATCCTCAAAAAAGTAGAACCGATGGCTAGGGAGATAGATGGTCTTAACAAGCGATTGGATAAACCAGCTACAGAAACGCAGAAGCTGATCGATGAGATGGAGAAGGGGAAGGAGCTTGTTATTGAGTGCTCCAAAGTTGATTGGTGGAATTGCTGTTATAAGGCCAGTTCCCAAGAGAAACTTCAAGACGTGATCGATTCTATTACTCGGTACTTTCAATTGGATATGCAAGGAAATATAAATGTCATTGTATTGGAGAACCAGCAGCTGCTGAAGAAGCTTGTGGAGAGTGTTCCGAGAAGGATTGCAGGCTTGTGCTCTCCACCTGAACCCCCAGCTTTCACTGTTGGGCTGGATGTTCATTTGGGGGCGTTGAAGTTCAAGTTGCTGGAGAATCATCATGAGGGGTCGGTGCTCACGGTAACTGGAGCAGGAGGTTCGGGAAAGTCAACGTTGGCCAAGAAGTTTTGTTCTGATGAGGAAGTTAATGGTAAATTCAAGGACAACATATTCTTCATCTCCTTAGTGGAATCGCCCAAGTTGAGCACCATAGTGGAGAGACTGTTTGAACACAATGGTTACGAGAAGCCACAGTTTCAAAGTGATGAGGAGTCAGCATCCGTAGTTGAGAAATTCGTGTTTCAGATCCCAAACTACAAGATTTTAGTGACATCAAGATTCACAATTAAAGGATTTGGGCAGCCATACTTGTTGAAATCACTGAATGAAGCTGATGCTTTACACTTATTTCGCCACTCTGCATCCCTGGACCAGACCAGCTCTAATATTCCCGATACTATTGTGCAGAAGATAGCAAAAGGGTGCAGTGGTTCTCCCTTGGCACTTATAGTAACTGGAAAATCTTTAAGTCTTGAAGAACCAGTGGTTTGGCACAACAGGGCGAGGATATTGTCGAGGGGTCACTCTGTTCTTTATTATAGTTCTAGTAGCGATGGGCTTCTTACTTGCCTCCAAAAAAGCTTTGATGACTTGGATGCTAAGCTTGCTGAGAGTTTTATGGACCTGAGCTTATTTCCTGAAGCACAGAAGATACCCGCAGCAGCACTTGTTGATATTTATGCAGAACAGCGTGATGAAGACGATGACATTGCAATGGAGAATATCCATGACCTCGTCAAAAGGAACGTGGCTGATCTTGTTGTCACAAGGAATACTACGAGTGGAACAGTTGACTACAATTACCACTATGTTACGCAGCATGGTCTTCTTCGGGACCTAGCCATCCATCAAACAAGAAATTTGCCGACTGAGAAGAAGCATAGGCTAATAATTGACCTCAGAGGGAACAATATCCCCAAATGGTGGACTACACAGAATGAGTATCACATTGCAGCCCACTCATTATCCATATCAACTGATGAAGAATTCACTTCAGAGTGGTGCAACTTGCAGCCAAATGAGGTCAAGGTTCTAGTGATGAACCTTAGAGAAAAAAAGCGCTCTCTACCACCGTTCATGAAGAAAATGAATAAATTAAAAGTCCTGACAATAACGAATTATGACGTCAATCGTGCTGAGTTGGAGAATTTAGAGCTGCTTGATTATCTTTCTGATCTCAAAAGAATCAGGTTAGAGAAGGTTTCAATTCCTTTCCTTAGCAAGACTGGAGTGCCACTGAAGAATCTGCACAAGTTCTCTTTCTTTATGTGCAATGTGAACGAAGCCTTCAAAAACAGCACCATCAAAGTTTCTGATGTGCTTCCAAATTTGAAGGAGATGAACATTGATTACTGTGATATGGAGGAATTGCCGGCTGGACTCTCCGATACTGTTTCCCTAAAGAAGCTAAGCATCACAAACTGCCATAAACTTTCAAAACTTCCTACAGGAATTGGAAAGTTGGTGAATTTGGAATCATTGAGGCTTACTTCTTGTACGAAATTAGAAGAGTTGCCAGACAGCATCACAAGCCTTCATAAACTGAACTTTCTTGACATTTCTGACTGTGTAAGTCTTAGGATGTTACCAGAAAACATAGGGGAGCTGGGTAGTTTAGAAAGGTTGAATTGCAGAGGTTGCAACAGATTGTCTGAATTGCCATACTCAGTGAAGGACCTTGAGAGCTTAAGAGTGGTAGTATGCGATGAAGAGAGGGCTGCATTATGGGAACCTATCAGATCCATGTTTAGTGATCTAAAGCTAGAGGTAGTCCTAACCGATTTCAAACTAGATCCTCTTTTATAA


Promoter Sequence:
>Vu_05985::LG1:88913657-88915657(+)
TTAAATTGAAAAGAAAAAAAGCGAGTAATAATATGTATAAAATAGGACCACTTAAGAAGTAACTTTCATTTGTTTTGGTAAAAAGTAGGACACACTAATTAATACCTTTATTTTTCTTTCTATTGCTCTTAATAAATGGATATACGTATTAAACGTGTGGAGGTAATATAACGTTTGAAATATTATATAAAAATACTGTAATAATGTTTCACAGGCGCATCCGTATTCGATTCGTGTCGGTTCCGTATATGTTTTATTTGTGATTTTTTAACAATAACAATACGCTGGCGTAGCCTAGTACATAAATTTGCCTCTATATATTCACACACACAAAAATGAGATACAAAGTTCAAATAAAGAAGGAAATGGAAATAAAAAATAACTTAACAAAAGGAAAGAGAAGAAATAGATAGTTGAGGCTTGAAGAAAAAGAACAGCAGATGAAAGAGAAACGTGCGAGAAAAAAGTAATAACTAGCCTAAAAAACCTAATTGCATTCATAGTTTTATATGAATGTTATTAAAATAAGGTAAAAATTTGGTCCAAACCTACTAAAAAATTATTTAATCTAACATAATATACAAAACTCCTTTTATCCTACGTTACTGCATCCACAAGCAGCTGCAGTGAAATTTTATTTAATCTAAAACAATTTCTCCTCTCCCTTTTGCCTTTGCCCACCAACAACCACTACTGTGACTGCCACCAGCCACCCTTTTGCCTTTTCTTTTTCAATTTTGTTATTCTTTTTTCTAGTTCTCTACTTTCACTATAATTATTTTGCAAAAAAAATATACTTATTTTCCAACAACAATAATGGCTAATGATCAGATAGTCCAAGAACATCTCATAAAAGTGACTCGGGTTGGAAACATTGTCACCCGATGGATGAATCAAATTTAAATACCAGTGTTTGTAATTATTGTGGGAAAGTTATGAAAGGAGGAGTATTAGACCAAAAGAACATATAATGGCAACGAAGGGTAATGTTGTTGCTTGTACCAGCCTTCCACTTAATAATAAATTATATTAAAAAATAATTATATTAATTTTTTTTTTCATTTTATTAAATTATAATTTTCTTAAATTTTTAAAATTAATTATAATAATCAATTTTTAATTTTTTCTTTTTATAAATATTTTTATCCATAAATATAATATTAATAATTATAATTTCATATTATTTTAATAATTAAAAATATTTTGACAATTTTTAATTTCTATTAATTAAATAATTTCTTTTATTTGTTATAATGTCAAATTTTATATTAATTTTTACATTTTTTTTTTAAATTTATTCTAAAAATCTTTGCTAGTGTTAAATTGTCTTCAATGTTATGCAAATTTTAGCTCAAGAATACTACCATTTTTTTAAATAATAATGATAATGTGACGTATTTTTATATTTATTTTACAGAAAATATACTATAAAATAATCATAAAAGATAAAATTTTACATTTTTTCAAGGAAAAAATGAATAAAAAAAATTTAAAAATAGTTTCAAATAAATATAAAAATTTTGTGTGTAAATATCAGTATTGTTTCTCTAATTATTTATTTATAATAAGCACGATTATTTAGACAATTTCTTACTGTATGTCCATGTGAACATTAAAGAGTGCGTGAACCTCAACTTGCTAAGTCATAGCCAGTTGATCTCACTCATCCCAAAGTCATGTCAACTAAAAGCTTTGTAGGAAACTTCTGCTTAACACGAAACACGGTTTGGAGGGAAAGGGCAGAATTTTGATGTGAACAAAAATATCTGGTACCTGGTTCTTCAACGAAACAGCATCTTAGAAGGAAAGAGAAAAAAAAGTAAAAATTCTTCGGAGCATTATTGTTGGCATTCTTTGTTATTTCACCACACTTTTTCTATTTTCTTAATTCCGGTACCTTATCATTGAGTTTGTTTGGTTTACATACCAGTGTTAGAACTTAGATCAAAGTTTCTGGTTTTGGGTGTTTTTAGTTAATTAGTTTCTGTGTGCAGTAGTCA


Gene Sequence:
>Vu_05985(+)
ATGGCTATGGTTCTGGATGCTGTTATTGGACAAGTGCTTGATGAACTGCTGAGCACTGTTATTGCAATGAAAGACAGGGCAGTGAAGTTCAGAGCCACCCTGGAAAATTTGCATTCTATCCTCAAAAAAGTAGAACCGATGGCTAGGGAGATAGATGGTCTTAACAAGCGATTGGATAAACCAGCTACAGAAACGCAGAAGCTGATCGATGAGATGGAGAAGGGGAAGGAGCTTGTTATTGAGTGCTCCAAAGTTGATTGGTGGAATTGCTGTTATAAGGCCAGTTCCCAAGAGAAACTTCAAGACGTGATCGATTCTATTACTCGGTACTTTCAATTGGATATGCAAGGAAATATAAATGTCATTGTATTGGAGAACCAGCAGCTGCTGAAGAAGCTTGTGGAGAGTGTTCCGAGAAGGATTGCAGGCTTGTGCTCTCCACCTGAACCCCCAGCTTTCACTGTTGGGCTGGATGTTCATTTGGGGGCGTTGAAGTTCAAGTTGCTGGAGAATCATCATGAGGGGTCGGTGCTCACGGTAACTGGAGCAGGAGGTTCGGGAAAGTCAACGTTGGCCAAGAAGTTTTGTTCTGATGAGGAAGTTAATGGTATGAATGTGTCTATCTGATCATCTTTCACTTCTCGCATTCGTATTGTTTGAAAAGTTGTTTGAGGGTCTTTTTGGTCCTATTGATCTCAAACCATTAGGTGGTTATTTAACTTCATTACTAGTTACTGGATACTATTGCTACCGAATCTAGTGAGGTTGACACTTTTAGTCATAGTACGCAAGCTATTAACTACAAGTGAATGTTTTGATATCAGAATGCAACAAATGGGTTTTAGGCTGTATTTGGAAAGCCGTTACAGTTTTATCAAAGGGACCTTTTACCCATTTTGAGGCAGAAACATTGAACTTGATGAAAATACAAGAACACTTAATCCATTAGGGGAATATCTGTGTGAATGTGGAGAGAATAAAATGATTTAAGTAGTTGAGAAATGAAAGTACTTTATATGTTCTTGATGATGTCCAAAATAATTGGCCTAAGAAGCTAGATTTTATTTTCTGTGAAGGTCATATTTTCACTTGTTTTGTAAACTTGTGTGAGGAATAGTAACTTTAGAATGAATATCCAGAGCTCTAAACATGTTGAAATTTGTTTAGGTAAATTCAAGGACAACATATTCTTCATCTCCTTAGTGGAATCGCCCAAGTTGAGCACCATAGTGGAGAGACTGTTTGAACACAATGGTTACGAGAAGCCACAGTTTCAAAGTGATGAGGGTGCAGTTTATCGATTGGAAAATTTGCTAAAACAGATTGGAAAAAAAACCCATATTATTGGTCCTGGACGGTGTTTTGCCAGAGTCAGCATCCGTAGTTGAGAAATTCGTGTTTCAGATCCCAAACTACAAGATTTTAGTGACATCAAGATTCACAATTAAAGGATTTGGGCAGCCATACTTGTTGAAATCACTGAATGAAGCTGATGCTTTACACTTATTTCGCCACTCTGCATCCCTGGACCAGACCAGCTCTAATATTCCCGATACTATTGTGCAGAAGGTATACTCTCTATTGCTCAATTATAGTATTGCAAATGTGGTGTGTAAAATCATAACTACGGAATGCTTGTCTAAAAAGTTTTCACCTTCCAGTAATGGTAATAGCAAAATAATGCTAAATGTTTTAGTAGCAATCTCTGATTTCATTGAACATATCAAATAAATTGCAGATAGCAAAAGGGTGCAGTGGTTCTCCCTTGGCACTTATAGTAACTGGAAAATCTTTAAGTCTTGAAGAACCAGTGGTTTGGCACAACAGGGCGAGGATATTGTCGAGGGGTCACTCTGTTCTTTATTATAGTTCTAGTAGCGATGGGCTTCTTACTTGCCTCCAAAAAAGCTTTGATGACTTGGATGCTAAGCTTGCTGAGAGTTTTATGGACCTGAGCTTATTTCCTGAAGCACAGAAGATACCCGCAGCAGCACTTGTTGATATTTATGCAGAACAGCGTGATGAAGACGATGACATTGCAATGGAGAATATCCATGACCTCGTCAAAAGGAACGTGGCTGATCTTGTTGTCACAAGGTATGGCGAATTACTGCTTCTCATTGGAGAGCATCCATGCATTAAACCATACAAAGTCATTCCAAGTCATCTTGAAAAAGATTTGATATTTGAGTTATTCTCTAGATAGAAACCATTATCCTATTGGCGCTTTCTCCTATAACTGTTACAAAATTTACTTCTGCTAGATGAAGAGAATATTGTTTGTGCTGTTTACTGTGCATTGACTAATGAGCGATTGATTTATTTTCATTGATCAGGAATACTACGAGTGGAACAGTTGACTACAATTACCACTATGTTACGCAGCATGGTCTTCTTCGGGACCTAGCCATCCATCAAACAAGAAATTTGCCGACTGAGAAGAAGCATAGGCTAATAATTGACCTCAGAGGGAACAATATCCCCAAATGGTGGACTACACAGAATGAGTATCACATTGCAGCCCACTCATTATCCATATCAACTGGTATGTTCATCTTTCTATCTCGGTGCACATATGGTATGCACACATGCTGACAGAGTTCTCAAACACTAATTATTGAGTCTGATTTTGCAGATGAAGAATTCACTTCAGAGTGGTGCAACTTGCAGCCAAATGAGGTCAAGGTTCTAGTGATGAACCTTAGAGAAAAAAAGCGCTCTCTACCACCGTTCATGAAGAAAATGAATAAATTAAAAGTCCTGACAATAACGAATTATGACGTCAATCGTGCTGAGTTGGAGAATTTAGAGCTGCTTGATTATCTTTCTGATCTCAAAAGAATCAGGTTAGAGAAGGTTTCAATTCCTTTCCTTAGCAAGACTGGAGTGCCACTGAAGAATCTGCACAAGTTCTCTTTCTTTATGTGCAATGTGAACGAAGCCTTCAAAAACAGCACCATCAAAGTTTCTGATGTGCTTCCAAATTTGAAGGAGATGAACATTGATTACTGTGATATGGAGGAATTGCCGGCTGGACTCTCCGATACTGTTTCCCTAAAGAAGCTAAGCATCACAAACTGCCATAAACTTTCAAAACTTCCTACAGGAATTGGAAAGTTGGTGAATTTGGAATCATTGAGGCTTACTTCTTGTACGAAATTAGAAGAGTTGCCAGACAGCATCACAAGCCTTCATAAACTGAACTTTCTTGACATTTCTGACTGTGTAAGTCTTAGGATGTTACCAGAAAACATAGGGGAGCTGGGTAGTTTAGAAAGGTTGAATTGCAGAGGTTGCAACAGATTGTCTGAATTGCCATACTCAGTGAAGGACCTTGAGAGCTTAAGAGTGGTAGTATGCGATGAAGAGAGGGCTGCATTATGGGAACCTATCAGATCCATGTTTAGTGATCTAAAGCTAGAGGTAGTCCTAACCGATTTCAAACTAGATCCTCTTTTATAA