Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05932 LG1 88075371 88081412 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase HT1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   plasma membrane
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, ATP binding, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein serine/threonine/tyrosine kinase activity, ATP binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 88075414 missense_variant p.Lys395Met
A/G 88075453 missense_variant p.Leu382Ser
G/T 88075650 missense_variant p.Asn316Lys
T/C 88075725 synonymous_variant p.Pro291Pro
G/A 88075781 intron_variant
T/C 88075809 intron_variant
T/C 88075856 intron_variant
T/A 88075863 intron_variant
C/A 88076127 missense_variant p.Cys238Phe
A/T 88076232 intron_variant
A/T 88076427 intron_variant
T/A 88076480 intron_variant
C/T 88076517 intron_variant
G/C 88076624 intron_variant
G/A 88076652 intron_variant
A/T 88076740 intron_variant
C/G 88076916 missense_variant p.Met129Ile
C/G 88076925 missense_variant p.Glu126Asp
T/A 88076966 intron_variant
G/C 88076974 intron_variant
T/C 88077102 intron_variant
A/G 88077181 intron_variant
C/A 88077424 intron_variant
T/A 88077515 intron_variant
G/A 88077578 intron_variant
C/T 88077969 missense_variant p.Ser104Asn
A/T 88078270 intron_variant
T/A 88078423 intron_variant
C/T 88078459 intron_variant
G/A 88078931 intron_variant
G/A 88079200 intron_variant
T/A 88079229 intron_variant
A/C 88079711 intron_variant
A/T 88080532 intron_variant
T/A 88080625 intron_variant
A/C 88080644 intron_variant
A/C 88080652 intron_variant
A/T 88081046 intron_variant
A/T 88081098 intron_variant
G/T 88081141 intron_variant
A/C 88081143 intron_variant
G/T 88081264 missense_variant p.Ala50Asp
G/C 88081358 missense_variant p.Leu19Val
G/T 88081364 missense_variant p.Leu17Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05932.1
MAQERRFVSLCDPALILHLSLSMLGSAYTESDDDAIQEDDDDFVFDIDPAVLVDTRKLIIDEQIAEGLHSIVYKGWYELNPVSIKVMLPMQTSNVPSSCKAKFQREVNLISKIKHKNIIKFIGASVEPTMMIITELLEGCSLHKYLESIYPNALSLEQSISFALDISQAMEYLHANGIIHRDLKPGNLVLPKDKMQILLTNFETAREEISGEMTSEAGTYRYMAPELFSKDPLSKGAKKCYDHKVDVHSFAMVLWAIVKNQIPFKGRSDLLAAYATAKKMRPSLEGFPEVLLPLLQSCWAEDPKLRPEFSEISQILENLLHNYHSTGISAEEKACPTTSVQELFPNYVEDNSEHEHEHETQNLNTSVCLEGQSEVITQNSSPVLAQTKHKRTLKKCKGLWLCFRKCFHIG*


CDS Sequence:
>Vu_05932.1
ATGGCGCAAGAGCGTCGATTCGTCTCTCTCTGCGACCCTGCTCTCATCCTCCATCTCTCACTATCAATGCTTGGTTCCGCTTACACTGAAAGTGACGATGATGCTATCCAAGAAGATGATGATGATTTTGTCTTCGACATAGATCCTGCCGTGTTAGTGGATACTCGTAAACTTATAATTGATGAACAGATCGCAGAAGGGTTGCATTCAATTGTCTACAAAGGATGGTATGAACTGAATCCTGTATCTATAAAGGTTATGCTTCCAATGCAAACATCAAATGTTCCTTCTTCTTGTAAAGCAAAATTTCAGCGGGAGGTTAACTTGATATCCAAAATTAAACATAAAAATATAATAAAGTTTATTGGCGCTTCTGTGGAGCCAACAATGATGATAATTACAGAACTTTTGGAAGGTTGTTCGCTACATAAATACCTAGAGAGCATTTATCCAAATGCTCTTAGTTTAGAGCAATCCATAAGTTTTGCTTTGGATATTTCTCAAGCCATGGAGTATCTGCATGCAAATGGCATAATTCACCGCGATCTAAAACCTGGTAATTTGGTTCTTCCCAAAGACAAAATGCAAATATTACTTACAAACTTTGAGACAGCTAGAGAGGAGATATCTGGTGAGATGACTTCTGAGGCTGGTACATATCGATACATGGCTCCTGAGTTATTCAGCAAGGATCCACTTTCTAAAGGAGCCAAGAAATGCTATGACCATAAAGTAGACGTCCATAGCTTTGCTATGGTTCTATGGGCAATAGTTAAAAACCAGATTCCATTTAAAGGAAGGAGTGACTTGCTGGCAGCATATGCTACTGCAAAAAAGATGAGGCCTAGTTTGGAGGGTTTTCCAGAAGTTCTACTTCCATTGCTGCAGTCTTGTTGGGCAGAAGACCCAAAGCTACGACCTGAATTCTCAGAGATCTCGCAAATCCTTGAAAACCTTCTCCATAACTATCACTCAACAGGTATATCAGCTGAGGAAAAAGCATGTCCAACTACAAGTGTGCAGGAACTTTTCCCCAATTATGTTGAAGACAACTCAGAACATGAACATGAACATGAGACTCAGAATCTGAATACCAGTGTCTGCTTGGAGGGACAATCTGAGGTCATAACACAAAACTCTAGTCCAGTCTTAGCCCAAACCAAGCACAAAAGGACTCTTAAGAAGTGCAAGGGTTTATGGTTATGCTTTCGAAAATGCTTTCACATTGGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_05932::LG1:88081412-88083412(-)
AGAATATTTTACTAACAATATTTTCAGTATTTAAACTGAATTTAATTTTTTTCTATGTGATATTGTATTTAAGGAATTGTGTTTTTGTATACCATAAATAAATGTGGTAAATTAGTTAACAAGTTCGGCGGCTTTACTTTAATGTTTTGAATGAGGTTACACGTGAAAGTTAAAAGAAAAAGGATGAAAGTGGGTAAATTAGTAAGCAAGGAATTCACTAGAATTTTGTTAATTCTTCTTTATCATTTTATTCTCTATAAATCTATTTTATTTTTCTTATTAACGTGGAGGATCAAAATAATATACTCAACATTTATATATTTAATTATTTTAGGTTTGAGATTACAATCAAAACATTTTATGTCACACTTTTCTTCAAATTTCCTAAAGTTAGGTTTTCATAAGTCTATAATGTTTCTTTTTCAAGTCGTACAGAGGTATATAATAAAGGTAATTTGACACTCAAGTTAGTAATATAATTTTTTTAACATAGTAAAATCTTAAATTCGCAATAAATACAATCACCTACCCATTTGTTATATTGATTCTACATTCCATGAAACCTTGCATGTGAAAAACAAATGACTATAGCACATACTGAGTATGTTCTATTATCCATATCTATTCCTTTGCTACTTAGATTAACTTTGTTGGTACTCTCTTGATTACAACTCTTCATGCCAAGTGTTGAGAAAATGGGAGAACTTCGACTCTATACAAAATATAGAACACTTGAGATGCACTGCCACTGATATTATCCTATAGTCTTTTCTCTTCTACTTCAAATTTCACTTCCAGTTTCTTATCTCATCCACTACCTCTTATTCATTCAAGGATTGGATTTTGAGTGTCTTTAGGAATTTAATATTTTAATAAAGCATATTATAATTTACATTAATTATTTGCCATATAAATTCTTTGGTTGTGACCTAGTTACATTGTATGACTTTAAATGTAATGGTATCGTGTTTGACTTCTTAGATAACATAATTCCACTTTAGTGTGAGTTTTAATTGCTTAAATAAGTTAGGCTACCAATTTCAAGTAGTAAATTTTTGTGTCAATGGTATTATGGATAAAAAGAGTTAATGTATGATTTTTAATTTGAACAAATATGTTTTTAACCCATAACTTAGGCATTTAGGGGTCTCACAAGTCATAAATGACCCAATAATAAATCCTAAACACTCCATTTGACTTCAATCCATTGACTTGAAATCTCACCGCTCAAAACCTCTAAAATAGACCAAAAACAACTTGAACTCATTCACTTTGCAGATTTACCAACTCAACATCAGAGTTTTTGCCAACTAAAAGTCTAAACAAGTTTCAAATAATCAAATAAGATCTTTTAACCCACCAATTCTCACATTAGACCAACAGTTCTAAAATTCAGTTATCAAACCTTCATTTTTATCCAAAATGACCTATAACTCTACTAGCTTCTTCATTTTTAAAATTTTAACCAGAATTAACACCAATACAAGCATCCTAACAAATTCACAAGAGTTCCACAAGCCAACACAAAATTTATACAAAGCGCCAAACTACATACAATTAATTATTGTCCTTCAAACACAATTTTCAACCAAATAATCATCTTAATTTACAATTTACAAATCATATCACAATATCAATCATCACTCATATTTCATAAATTCAAGTTAAAAACAAACGCCAGTTTCCTTTACCTTTAATCTCGATTGTTTAACAGAAGACATCCAGAGTTTGAGTTAAGAAGCAGTTCCTCTTATTTTACGTGTAAGTTGAAGCATAATCATTAAAAGGGGAGGGCAGTTATATGTTACCTCGACGATGTTTTACCGCCTATTCACTTATTGGAAATAAATGATTACGCTGAGTCTGCAGATGCTTCCAAAAGCATTATATGCTACACTCACGTTTTTTTTTATAGTCTCAGCGTCATCTATAAATCAGAAGTTTGTGTTGCTGCTGTTACTTCTTCAATTCTGTAACTCAACATAACAGGGGCTTCAATA


Gene Sequence:
>Vu_05932(-)
ATGGCGCAAGAGCGTCGATTCGTCTCTCTCTGCGACCCTGCTCTCATCCTCCATCTCTCACTATCAATGCTTGGTTCCGCTTACACTGAAAGTGACGATGATGCTATCCAAGAAGATGATGATGATTTTGTCTTCGACATAGATCCTGCCGTGTTAGTGGATACTCGTAAACTTATAATTGATGAACAGATCGCAGAAGGGTTGCATTCAATTGTCTACAAAGGATGGTGGGTATTCCAATTGCAAAATCGAAGATATATATCAGTTTGTGCTTCTGTCTATGTTTTTTGTTTTGTTTTTGCACCTTGTTTGGTTGACTTTCTTGATCTGCATATTTTCTCTACCATGTGATTCAAGCGTTATGCGTTTCATAAATTTTTTCCTTGAAAAATGCTTTTCATTTATTGATCTGAGACACCTGTTTTTTTAGCTTTAATGCTACTGATTTTGACTTCCTACCTGGATCTCTCTGGGGCTAACTCTGATTTTATTTATGCTGTAAATAATGGAAAATTAGAAATATGCATTTCATTATTTCAAGGCATAAGTGATATTTGTATGTAAACATGTCAATATATAATTGTTTTAATTTTTCTCTAATATTTTTAGAAATCTTTTTATATACCTTTTCAATGATGATAAGTATATTTTGTCATAAATCTTAATTTAAAATTCATCAATTTCGAAATGAATAAATTGGGGTTTAACTTATAGTGAGTATGCATAACACACATAATACATATCTTTAAAAGTTGTTCTATTTTATGGTGAAATGTGATTAACAATTAAAGAGTTACCTCAATAGATTTTCCTGCACAGCATTATTTTTCCTTCCTACAAATATCATTACCTTTTTTTTTCTATTTTTATAATAAAATATTATTGAAAAATAAATGAATTTAATATTTTACAAATATAAATCATATTAAAAACTTACCATGTAAGGAAGTAGAAAACAAGAATAGAGCAGGGAAATGGATAATATCTAGCAAGTCAATTTGTTCTTTTGCGAAGTAAGCATGCAAGTTAGAGAGTTCACTTAAAAAAATCACTTTATTATTTCAAAAAATATATAAACTACAAGTCTTATGAATATCATCCTTGATAACTTCTTATAATTACCTTACACAATTGCATATGTCAAAACATTAATTTAAAACTTTATATTTAAATTTTTAATTATTTTAATATTTGTTAAAAAATAAAATAGACTTAACTTGTATTTTCAGATGAATAAACTATTTAAATCACTATCTCGTAATGAGTTAAACAAAATTAGTTTTTTTTTGGTTTACAAAAGAAGTGAATCGTTTGTGATAATTATTTTTTTAAAAAAAATAATCCACATGGTAAGGTAACTTGGATGAATTGTTCCCTTTGAAAATTATAGTTAATAGAAAGATGTTGAAAGAAATTTAGAATTAAAAGAATAATGTATATCTTTGTAAAAAAAGGTTGCAAGATCATAATTAATGACAGTTACATTTACTGTTGTATTAAGAAATTTAATGCTCATTATACAAGACACAAATAATTAATGTTTTTAAGTAAAATGTATTTAATGCTAAAATAATATAATTGCTTTGAAAATTGTTCCTTTTAATTATTCATTAAAATTATTCAATTATTTAGTTTAAGTCAATAGAATCCTGGGTGAGTCATACTTTGTTTTCCATTTTTGTAAAATCTTTTTTAAACAGGTTCTTTATTATTAACATTCCAAATTCTGGTAATATATTTTATTAACATATTCCAAATAGTTAAACATTCCAAATGCTATACCTCCCACATGATAGTATTTTGTGATATTATTTAAAACATATTTTTTATTATTAAATAAAATGAAATAAAAGAAACTCTGAATTTAGTAATTTTTAGTTTTTATTTAATGAGTTTTGTAATTTTCAATGTATTTAAAAATGTTAAAATAGCTTAGAAAAGATTGTTTTCATAGCACTCACCCCTCTCAAAACCAGTTCAATAAGAAAGAGTGAAGGAAAAATTGCTTCCTTCATGTGCGATGACTTGAAATTGAAGGGTGTACGCATCTGCAGAAGCATGACTAAACACCATGGCTACTGAAGATGTCAATAAGTTTCATCATCACTTGATGAAGGTGCGTGAAAGAGCAATGGATAATTATCAGTAACCATGCTTGCCAAGTAAGACAGAACCATCAATGAAAACCATATGATATAGGTTACTTAGTTCACCAAAATGACTGAGTGTCTTTTAACCGACCTATACTAAACACCAGTGCTTCTTAGGTTACTTTTATGGGAATTAAGCTTAAAACCAGATGCAATTCAAGACATCTAAACACATTCTTTATAAATACTATGTTTTGTATTTCCGTTGTGCATACAATATAATATCATTTATAAACTGCAATGTACTATGTTTTTTATTGTCTCTATTAATAACGCACTCTATCAGCACAAAGTCAATTATAAATATATAATTTGTTTTACTTTTTCATCACCAATATTTTTATTAAATTCTAATGCAGATTAGAATTCAGCAAGTTAGCACTAAATTTACATCTAATGTGTGGTGAGAATGAGATGAGATGGATACTTTCTATGATAATTGATTGTTACTTGGATTAAATCGTTTAAGCACATGTGATAGCACACTCATTAGAAGTTATAAAATTTACTTGATTGTTTATAATGTATTGATTGGCTTCATTTAAACTTCAATTAATCTATTCCTCAAAATCAAGAAAACTATGCAATGTTATATCCTTATATATATATATATATATATATATATAAAATATTCAAAAGACAATATTCCTATAGCATAGTATTTTTTTTAATGTATGACATTTAGAATAGAATGAACTTTGGAAGAGTTATAGGAAAAGATATAGAGTTGTTAAGTTGTATTAAAAACAAGTTGTAGTAAGAACGGTTGAAGGATAAAGGCGAAGTCAAATTAATAACTCTCAGACATGTATGCACAAAAATCCTAAGTGTGACAAAGGAGGGTAAAAGGAAGCTTTTAGAAAGCTGTGTTTATTATGTTTGTTGCACATAGTCTTTATGCCATTGATTTTTGTGTTTGTTTAATACTGCAGAAACAAGTAACCCTTGTATTCTTTCTATTCTGTTGCAATAAAGTGACAAGTTGCAGAATTTTAAGTATTTTGGCCTTCTATATTCTTTTCCAATATTATTTTGTAGCTAAATCATTGTGACAATTCATATACCTAAAATTATTTAGGCCAGCAAAATATTAAGGCAAATTGTTATCTTGTTAACCAAATTGATTAGTTGTAATTAACGTGAAATCATATTTATTTTTTCAAATACCCTGTATTTTTAATTAGACTTTGTTGTTTGCTTGTGGTTTAGGTATGAACTGAATCCTGTATCTATAAAGGTTATGCTTCCAATGCAAACATCAAATGTTCCTTCTTCTTGTAAAGCAAAATTTCAGCGGGAGGTTAACTTGATATCCAAAATTAAACATAAAAATATAATAAAGGTACTTCTCAATTTCTTTTCTTACTTAAGTGCTTCATGATTTGTCTTCTTCTCTGCACTCTTTGTCCTAATTATTCTTCTAATGGTTATAAAACAAATTTAATTACCAAAGAATTGGGTAGTTGTTGGGAAATACATAATAGATAGAACACGTGATGTGGTTGCTTTTGTCTATTATGAAGAAATTCGTTGTTTTTAAAAGTGTTTTACATCAACCATGATTAGAAGAATTTTAATCCAATTTGAATTATGTATTACTAATTAAACTTAAAGACCACTTAGGAGTTACGAGAAATGATAAAAACACTTGTTAGAGGAGATTTACTCACTAGTGTTCACACGCCCATTTGCATTTGCTTTCTTCTCTTACACATTCATTTAGAATTATTATCTTAACATGCTCTTTATATAGGAATAAATTCAGATTCCATCTTAAATGAAAAATATGGATACTGACGGTCTTACATTTTTCACAAATATTCATTAATTATAATAGTGGATTCTCCATAAATTAAGAAACATGTACCTTTAAACTTTCCACTTAATTTTATTTATTTAAATATTTTTCAACATTTTTCTGTCAAGTTTTCATGTAAACCACATGAGAGAATTTTACCTATTTTTCAATTTTACTCTCACCATTGTGTGGATCCAATAAAATCTTAATTCATCCGTCACTGCATATATAAAAGAGACATCATATTTTACTCAAAATCTGTAATAGATTTATAGTTTTTCTTTTATATATAGTTCATTCACTATTTTTATTCTATATGAGAGTTCTAACTATACATTTAAATTCCTCACACATATATAACTATTTAAGTTCATAACAATTTGCTTCTTAAGATTTACTGTGGTTAGTCTTAAAGGATGTTAGAATGATCGAACTCTAAAGACTTTTTTGGTTAACTGGATGATTGATTAGTGAGAAGTAATTTAGCTAACTATTACGAAATTTAAACTCATTTTGCAGTTTATTGGCGCTTCTGTGGAGCCAACAATGATGATAATTACAGAACTTTTGGAAGGTTGTTCGCTACATAAATACCTAGAGAGCATTTATCCAAATGCTCTTAGTTTAGAGCAATCCATAAGTTTTGCTTTGGATATTTCTCAAGCCATGGAGTATCTGCATGCAAATGGCATAATTCACCGCGATCTAAAACCTGGTAATTATTTGGTTATAATGATAAGTATCTATACAATGTGCTATTTGAATGACTTTTTACGTTTTGTTGTATATTTTGTCTTCTCTGAAATTTAGTACGTCTTTTAAATTAACTCTTTTTGTTAACTTATGGAATGTCTAATGTAGATACAGACCAATTAAAGGGATCCAATAAATATAAGTATTTTTATTTCTTTACCTTTACAATAACTAGTTCATTCACAGTAGTCAAGGAAACTCATTAACACTGATTGATTTTCATATACATTTATTTTTCTGAGCACAAGAGGTGCAGTCCTTTCAGTTACAAGTTATCCATGACTTATTTAGGTAATTTGGTTCTTCCCAAAGACAAAATGCAAATATTACTTACAAACTTTGAGACAGCTAGAGAGGAGATATCTGGTGAGATGACTTCTGAGGCTGGTACATATCGATACATGGCTCCTGAGGTACATGCTATGCTAGATTTTTCTCTGCATATAAGTATCTACCATCACTATATCTATATATGTTTATGTATCCATTTACTAGAATTTTCTTCGTGTGTTTTGATGTATAATCCTTACATTATCTGCATCAGTTATTCAGCAAGGATCCACTTTCTAAAGGAGCCAAGAAATGCTATGACCATAAAGTAGACGTCCATAGCTTTGCTATGGTTCTATGGGCAATAGTTAAAAACCAGATTCCATTTAAAGGAAGGAGTGACTTGCTGGCAGCATATGCTACTGCAAAAGTAAGTCATACCAGTTACTCTTAGTTCTGATTTTAGTAATAAGAGTGTCATTTTTCTTCCTTAAGTAGTCCTTTCTTTCCATTTTTAATATATTTTGCTTTAGAATAATGTTTGTTTTCATGATCTTGTGTTACCAAATTAGTCCTTCAACAATTAATGTAATTTTTTTGCTCTTTAAATCAAAACTATTATCCTTCTAAGGATTGGTTGTGGTATGTTTATGTTGTTATCGGTGGTTGCAGAAGATGAGGCCTAGTTTGGAGGGTTTTCCAGAAGTTCTACTTCCATTGCTGCAGTCTTGTTGGGCAGAAGACCCAAAGCTACGACCTGAATTCTCAGAGATCTCGCAAATCCTTGAAAACCTTCTCCATAACTATCACTCAACAGGTATATCAGCTGAGGAAAAAGCATGTCCAACTACAAGTGTGCAGGAACTTTTCCCCAATTATGTTGAAGACAACTCAGAACATGAACATGAACATGAGACTCAGAATCTGAATACCAGTGTCTGCTTGGAGGGACAATCTGAGGTCATAACACAAAACTCTAGTCCAGTCTTAGCCCAAACCAAGCACAAAAGGACTCTTAAGAAGTGCAAGGGTTTATGGTTATGCTTTCGAAAATGCTTTCACATTGGTTAA