Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05904 LG1 87713532 87715407 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   DNA binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein homodimerization activity, protein binding, protein binding, transcription cis-regulatory region binding, DNA-binding transcription factor activity, protein binding, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 87713995 synonymous_variant p.Thr240Thr
G/A 87714447 missense_variant p.Pro90Ser
G/T 87714497 missense_variant p.Pro73His
A/G 87714541 synonymous_variant p.His58His
G/C 87714700 missense_variant p.Asp5Glu
T/A 87714708 missense_variant p.Met3Leu
T/A 87714750 5_prime_UTR_variant
T/A 87714988 5_prime_UTR_variant
T/G,C 87715116 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
A/G 87715118 5_prime_UTR_variant
C/A 87715123 5_prime_UTR_variant
G/A 87715135 5_prime_UTR_variant
T/C 87715169 5_prime_UTR_variant
A/T 87715334 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05904.1
MDMRDQDKVIEMPSTLGYNLSNRNSSSSKLSSPIGERSDQPPQSHTLIFSDPPQTTSHHHHPLNPPNSLPPNPLQLPHPHRPRRDPDPTPISPPVITTPRTQPHSTPTFTTTFRYRECLKNHAATMGGHVTDGCGEFMPNGEEGTPESFKCAACECHRNFHRKEPEGESSQHVLNYHLTYPNKNNRNIVIHSPQSHLQLPTPHLHGVVATPSGGPVQPAMLGFGGTPAESSSEDLNMFQTDDAGQLLSVPPLSSSKKRFRTKFSQQQKDKMMEFAEKVGWKIQKQDEQELHQFCSQVGVKRQVFKVWMHNSKQAMKKKQM*


CDS Sequence:
>Vu_05904.1
ATGGACATGAGAGACCAAGATAAGGTAATAGAGATGCCTAGCACTTTGGGTTATAACCTCTCCAATAGAAATTCGTCTTCCTCCAAGTTATCATCACCAATAGGGGAAAGAAGTGACCAACCTCCTCAATCTCACACGTTGATTTTCAGTGATCCACCCCAAACAACTTCACATCATCACCATCCCCTCAACCCCCCTAATTCTCTTCCACCAAACCCTCTTCAACTTCCACATCCTCACAGACCCAGAAGAGATCCAGATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTGTCATAACCACCCCAAGAACACAACCACACTCAACACCAACTTTCACGACAACATTCAGATACCGAGAATGTCTGAAGAATCATGCTGCCACCATGGGGGGTCATGTCACAGATGGGTGTGGGGAGTTTATGCCAAACGGAGAAGAAGGCACCCCAGAATCCTTCAAGTGTGCAGCTTGTGAGTGCCACCGCAATTTCCACAGAAAAGAACCTGAAGGCGAATCATCACAACATGTTCTCAACTACCACCTCACTTACCCCAACAAAAACAACAGAAACATTGTCATTCATTCTCCGCAATCTCATCTTCAGTTACCTACACCCCACCTTCACGGGGTGGTGGCTACCCCTTCAGGTGGGCCGGTTCAGCCCGCGATGTTGGGCTTTGGGGGGACCCCAGCTGAGTCCTCAAGCGAAGATCTCAACATGTTTCAGACCGATGATGCAGGGCAATTGTTATCAGTGCCACCACTGTCATCATCCAAGAAGAGGTTCAGGACAAAGTTCTCACAGCAACAAAAGGATAAGATGATGGAGTTTGCTGAGAAAGTGGGGTGGAAGATCCAGAAACAAGATGAACAGGAACTGCATCAGTTTTGCTCTCAGGTCGGTGTAAAAAGACAGGTTTTCAAGGTTTGGATGCACAACAGCAAGCAAGCCATGAAGAAGAAGCAAATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_05904::LG1:87715407-87717407(-)
GTTTTTATATTTTCTCAGCATTCAATCTCTATTTTATAGTTACCAATGTAAATTATATTTCAAGATTTTATTAATAAAATTTTATTATGGTTTTGTTAGTTTCTTTCAAGAAATTAAAAATAAAAAATTGGTTTCAGAGCTATACTTCCTTTGGAGCATGTATTTTAACAACCTTTTAATGTTTACTCCTCTATTATTAACATCAGAGTAAACTTTCAAAATATTGTAAAAACAAATTATTATTATTATACTTTTAAATTAAAAAACATATTTTTTATTAAATTTATTAATATTTCTATTCATTTTATTTTAAAAATATGTTTTTTCTAAATTATTTAAACTAGATAACTGAAAAACTATTTAAGTTTAATATTTATCATTTTTAAAATTTTATTTACTTTTAATTTTATATATAAATTAGTTTGATATTGAGTTTTATTTTTTAGTTTTAATTGTGTATAGCTTTTACTCTATCTTACAGTGAAACTCTGGTTAGTTTAATATAATGTTAAATTTTTTCAATTCGAACATATTAAAAGTTTAAAAAAATATAATGATTCTAAAAAATAATACAATAATAAAAATAAGTATGCAATGTTTTTAATTAAAAATATAAGATGTAAAATAAATTAAACATAAAACTATTAAAATAATAATAATAATAATAATAATAAGCAATTAAATAATTTAATTAAAATAAATTGTAACTTATAAGTTATAAATTAAAATAAATTAAAAAAACTAAAAGAAAGTATTTAAAATATTTGCTAAATATTTTTATAAAAGTTAAATTAATCAAATAATTTGATATCTACCTAATTAAACTCAGGAACTCATCAAACAAATTTCAGATATTTAAGTGTTAAATTTTATTTCATAAAATTGAAGAAAAGGGATATTAATTATAATGTAATTTCTAAAACACTATCTTATTTCCTTTTGAAATATGGATGAAAAAATTTATCTTTGAAGAGACTAGTATTTTTTAAAAAAATTCTAGAACACAAACACTATTATAATTTAACGCGTGTCATGGTACATAAAAAAAATGAAAGCAACCAATGTTAAAGTATTACTCATTAAACAATTTAAAAGTGTATTTTTTTCCCACAGAAAGAAAAAGCTAATTTACAACAAGAATTTACAATTTTGACAAAAAACTTTGTTTTAAAATATTTTAAATGGGCAGAATTAGTGTCCTTTAATTAACACACCAAAATGAAAGAGAGTGTGGCTTAATTGATGGAACAGAGGGAATGTATGGTTGTAAATTCTCACATTTATTTAATTCCTACCATAAAAGAATACACCAAATCACTCTTTTTTATCATAACACGCAACATTTATGTGATGGAATCTATATAATGTTTTATTTAGAAAAACTAAACCAAATAGATACTTTAACATAACATACAGAATCTAAAAAAAGTCAAATAAAACATACTAATTTATATCTATAGTATAACATTGTACACATTCATCTATCGTAATATGATATTTTAATATTTTTTTTTGACATGTTATTATTTTATTTATACGTATATTTAAAACAGATCAATTACAAATTACTTGATGTATTATTATAAAAAAAAGGTTGCTAAAGAGATTATCTGTACGTAGTTAACATAGTGGGAAAAAAAGTTTTGGTGTTTTACCTGTAATTTGCAAGTAACATGGTTAATCCTAATGCGAGACTTTGGTGAGACCAAAATTGGTGGTAAAAAAGGTGTATCTCTCTGGCATTCCCCACACATTGAAAATGTTATTATTTGAAGGGTTTTAGTTTGGGTTTAGGTTTAGGTTTAGGGTTTGAAAGAGTGGCTGAGAAAGGCAATAATTAGGAGCTGGACCAGCGTGCAGGGTGTGGGAGAGATAGAGAACCAACATGACCTCTTGTCGGTTGTTCTGCAAGACAAAACTTGCAGTGTAGTCATCACTCTCCGTGAGTGCAAAACAACCCCACTGTTCCTTTTTTTTAGCTCATTTTTCTGCTGCTTGAT


Gene Sequence:
>Vu_05904(-)
GGATGCTAGGAAACAACACCTTCTTCTATGCCCTCTTATTCCCCATCTCATCAATTAACATTCACTTCACAATTCTCTCTCTCTTGTTCTATGTCAAAACCTGTTCTAGTCTTTAATTTCCAGGTTCTCTCTCTCTCTTTTGCTGGTGCAATTAAGCTTCCTGCATTTCTTATTTTCCTGAGGGCTCCCTAGGGACCCAGTTGATAGGCTCATCTAGCTTCCTTCAATTTCCAACAGTATATCAGTTTATTTTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTGTCTTTTAAGAATTTTCTCTTTCACAAAAATTGTACTCTTACTACTTTGTTTACACTTTTTCCGTGCTGGTGCTGCTACTATATACGGTTAATAGTGTTATTAATACTGACCACTGAAATTTAATGGGTAGGTTTACCACACACAACGTCAATATCAAGATGAGCACAGGAAAGAACATTGTTATTGGTGTGCAAGTCACCTTTCTTTGATTAAGTCTGTTCTTAATTAGAGGGGATGAATTAGGGTTGAACACACTACAGGATGATCCACAATCACAGTTAAGGAAAATTCACTTGCCAGATTGTGATCATTTCTACAGGAAAAAGCTTAGACTAGATTATTATTAAAATAAGAAAAAAAAAAATAGAGGGGAATGAGATTAAGTTTAGATCTTGGCCTTCTTTATTGATGGACATGAGAGACCAAGATAAGGTAATAGAGATGCCTAGCACTTTGGGTTATAACCTCTCCAATAGAAATTCGTCTTCCTCCAAGTTATCATCACCAATAGGGGAAAGAAGTGACCAACCTCCTCAATCTCACACGTTGATTTTCAGTGATCCACCCCAAACAACTTCACATCATCACCATCCCCTCAACCCCCCTAATTCTCTTCCACCAAACCCTCTTCAACTTCCACATCCTCACAGACCCAGAAGAGATCCAGATCCAACTCCTATTTCTCCTCCTGTCATAACCACCCCAAGAACACAACCACACTCAACACCAACTTTCACGACAACATTCAGATACCGAGAATGTCTGAAGAATCATGCTGCCACCATGGGGGGTCATGTCACAGATGGGTGTGGGGAGTTTATGCCAAACGGAGAAGAAGGCACCCCAGAATCCTTCAAGTGTGCAGCTTGTGAGTGCCACCGCAATTTCCACAGAAAAGAACCTGAAGGCGAATCATCACAACATGTTCTCAACTACCACCTCACTTACCCCAACAAAAACAACAGAAACATTGTCATTCATTCTCCGCAATCTCATCTTCAGTTACCTACACCCCACCTTCACGGGGTGGTGGCTACCCCTTCAGGTGGGCCGGTTCAGCCCGCGATGTTGGGCTTTGGGGGGACCCCAGCTGAGTCCTCAAGCGAAGATCTCAACATGTTTCAGACCGATGATGCAGGGCAATTGTTATCAGTGCCACCACTGTCATCATCCAAGAAGAGGTTCAGGACAAAGTTCTCACAGCAACAAAAGGATAAGATGATGGAGTTTGCTGAGAAAGTGGGGTGGAAGATCCAGAAACAAGATGAACAGGAACTGCATCAGTTTTGCTCTCAGGTCGGTGTAAAAAGACAGGTTTTCAAGGTTTGGATGCACAACAGCAAGCAAGCCATGAAGAAGAAGCAAATGTAAGCCTAGATTAATCAATTCCATCTCTTTCAAATTAATTGTTGATTTTTTTTTAAATTTGTGTTTAATAAAAACACTCAGACTTTAAAATCTTAGATGTGAATACTATCACGTATAAGAAAATAGGTCGCTGAGCTAGCTAGAGACGTTAGTTGAAAGCTGCCATGCTATTGTGTATTCTCATCTGTATGTTATTAATCAAATTAACCATTCAATTTCCATC