Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05675 LG1 84771113 84774108 PREDICTED: cyclic dof factor 3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 84771446 3_prime_UTR_variant
G/T 84771476 3_prime_UTR_variant
A/G 84771525 3_prime_UTR_variant
A/G 84771601 synonymous_variant p.Arg467Arg
T/G 84771706 missense_variant p.Glu432Asp
C/T 84771736 synonymous_variant p.Ser422Ser
T/C 84771904 synonymous_variant p.Ser366Ser
G/A 84771992 missense_variant p.Ala337Val
G/A 84772115 missense_variant p.Ser296Phe
T/G 84772272 missense_variant p.Lys244Gln
T/C 84772273 synonymous_variant p.Arg243Arg
G/A 84772418 missense_variant p.Ala195Val
C/T 84772688 missense_variant p.Arg105Lys
G/A 84772750 synonymous_variant p.Asp84Asp
C/T 84772773 missense_variant p.Asp77Asn
G/T 84772799 missense_variant p.Ser68Tyr
C/T 84772821 missense_variant p.Val61Ile
T/G 84772897 intron_variant
C/A 84772923 intron_variant
T/G 84773020 intron_variant
C/T 84773072 intron_variant
C/T 84773088 intron_variant
A/C 84773097 intron_variant
A/T 84773231 intron_variant
C/A 84773266 intron_variant
A/G 84773267 intron_variant
C/A 84773269 intron_variant
T/G 84773270 intron_variant
A/C 84773280 intron_variant
G/A 84773301 intron_variant
T/A 84773307 intron_variant
G/C 84773315 intron_variant
C/T 84773340 intron_variant
T/C 84773359 intron_variant
T/C 84773365 intron_variant
T/C 84773373 intron_variant
T/C 84773416 intron_variant
C/A 84773531 intron_variant
A/T 84773635 intron_variant
G/A 84773639 intron_variant
T/G 84773686 intron_variant
T/C 84773702 intron_variant
G/C 84773899 missense_variant p.His20Asp
T/A 84773905 missense_variant p.Thr18Ser
C/T 84773990 5_prime_UTR_variant
A/G 84774035 5_prime_UTR_variant
C/T 84774038 5_prime_UTR_variant
T/A 84774108 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05675.1
MSQVRDSAIKLFGADIHTTHTPIKPTTPFPDLHSLTRIQPLPQPIIVMNGLEESVNDEVDVPLNEEVSSKQIDPQEDGNDTPRDICKNPTLKLVGKVVHRTNEHRNAKRNIDQEKVFKKPDKVLQCPRCNSLETKFCYFNNYNVNQPRHFCKNCQRYWTAGGAIRNVPVGAGKRKNKHSALQYYQKPVTPDGESAIQTHSSGSSDDMILSSNELSVTSRPIREREENPLSESVETVLSLNGQRKFDVDFSTVKDDGEDPSSSSMRSNEMEQVGLAQHFNGLIPLHSFHYHPVPSWSYQWNPCWNVKEFRSSSTSYTGSPTMMAVSGFSIPTVMPPAAPYSYSGFMSNLAGQEEESSLIGSAFSGISLSSSSVSNSTSSGNRSPALGKHSRDGSTPKEGAMKQNLWVPKTVRINGPEEAANSSIWTTLGTKSEQNKIIIKGSVFKSFESKTSADDNQIRRTNPAAFSRSESFQESM*


CDS Sequence:
>Vu_05675.1
ATGTCCCAAGTTAGAGATTCTGCAATAAAGCTTTTTGGAGCAGATATTCATACTACACATACTCCCATTAAGCCAACCACACCCTTCCCAGATTTACACTCATTGACTCGGATTCAGCCTCTGCCTCAACCCATCATCGTCATGAATGGACTTGAAGAATCAGTTAATGATGAAGTGGATGTTCCTTTGAATGAAGAAGTTTCTAGCAAACAGATTGATCCTCAAGAAGATGGTAATGATACTCCAAGAGACATATGTAAAAATCCTACACTGAAACTGGTGGGAAAAGTAGTTCATAGGACTAATGAGCACAGGAATGCTAAAAGAAATATTGATCAGGAAAAGGTTTTCAAGAAGCCAGACAAGGTCCTGCAATGTCCTCGCTGCAATAGTTTGGAAACAAAGTTTTGCTACTTCAACAATTACAATGTTAACCAACCTAGACATTTCTGTAAAAATTGCCAAAGGTATTGGACAGCTGGAGGGGCGATTAGAAATGTTCCTGTTGGGGCTGGTAAGCGTAAGAATAAGCACTCAGCTCTGCAGTATTATCAGAAACCTGTGACTCCTGATGGTGAATCTGCGATCCAGACACATTCCAGTGGTTCTAGTGATGATATGATTCTCTCATCTAATGAACTTTCTGTGACTTCAAGACCTATCAGAGAAAGGGAGGAAAATCCTCTTAGTGAATCTGTAGAAACTGTGTTGAGTCTCAATGGCCAAAGAAAATTTGATGTGGACTTTTCCACTGTCAAAGATGATGGTGAGGACCCTTCCAGCTCCTCTATGAGATCTAATGAAATGGAGCAGGTTGGTTTGGCACAACACTTTAATGGTTTAATTCCCTTACATTCATTTCATTATCATCCTGTCCCTTCATGGTCTTATCAATGGAATCCATGTTGGAATGTCAAGGAGTTTAGGTCCAGTAGCACTAGTTACACAGGTTCTCCAACCATGATGGCAGTTTCTGGCTTCTCCATACCAACAGTAATGCCACCTGCAGCACCTTATTCGTATTCAGGTTTCATGTCAAACTTAGCTGGCCAAGAGGAAGAGTCTTCATTGATTGGATCTGCATTTAGTGGCATCTCATTGTCTTCATCTTCTGTCAGCAATAGTACTAGTTCTGGTAATAGATCCCCAGCCTTGGGAAAACATTCCAGAGATGGAAGCACACCAAAGGAAGGTGCAATGAAACAGAACCTTTGGGTGCCTAAGACTGTTAGAATTAACGGTCCAGAAGAGGCTGCAAACAGTTCGATATGGACAACTTTGGGAACAAAATCTGAACAGAACAAAATCATTATAAAAGGAAGTGTCTTTAAATCATTTGAGTCTAAGACAAGTGCTGATGATAATCAAATTCGAAGGACAAACCCTGCTGCTTTCTCACGTTCTGAATCTTTTCAGGAAAGCATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_05675::LG1:84774108-84776108(-)
CAAAAACACAATTTCATGCATATCATAGATTTAAATCTCAATTAACCAAAATCACATACCAATAAAGCATAAATTGCTTAAAAACACTATCATATTCCGTTAAGTATAGCAAAAAAACCTTTGATTAAAAGAGAATTTTAAAACTTTATTCCTTACATAATGTTTTAACTACCTACACAAATAAAACTAAGCATATCACTACCATCACAACTAGACATAAATTCATTTTGAACTGTTTTGAGACATATACCAAACTAGAGTCACATGCACTAAAAAAATGCTAAAATGGAGAAAAAGTGAGTTTATCCTCGTTTCAATTTTGTTTGACAAATATGTAAAATTCTCTATTATGACTCTAGTGGTGATTTTTGATTGTCGAATTAATGACCGGTGAAATCAGAAAACTTAGAAAAGATAGTAAAAAGTTTTAGAAATTTTTTTTAGAAAAATTATGTTTTTTATAAAAATAAAATTTGATTAATTAAAATTTTATTTATAATTTTAGTTTTTGTTAATAAAATAATTAGGTGTTATTTACAAATCACTTGTAAAAAAATCAAAATAATTACAATTTAACGTAATATCATTATTTATGATCCAACTATAGTGTTTTTTTTTAATGAAATTGATCTTAAATTATTACAAATGATTGTATGTTCAAATTAATTCTCATTAACAGTGAATTATACTTATAGCTCTTAAGTTTCATAAAATTTTACAAATTCTTTACTTATTTTTTCAACAACTTTTTTCATAGAGAGACACCATATACATTTTAAAAATAGTTAAGAATGGTTACAATACTCAACTTATCATAGTTTTTAAACACTTAAATGAATATGAATGTACAGGTAGAATAAAAAAAACTGGAGAGTTTCCCAATCACACGAGACGTTATAAGGAGGTTGAATGAAGAGAGATTAACTTTTCTTGACGATTTTTTTAAATTGGATTTTGATGATAATTAAAGTCTCAGCTAAAAGAAAGTTTAACGTGAAAAAGATCTTATGACATTCAAGTTACTAAAAATGTGACATTGTTAAAATTTACATAAAGATAATCTCTTACATGAAACCACATGTAAAAATAAAAGTGTAATATAAATTTAATTTGGTTTGATATCTCAAACAAAAATATTATTATTTAGCATACAAGATAAATCTTCTAAAAAATTTTCTAGATAAAATTATAAACAGTGACCTGCAACTAATTAAATCTTCTATAGACTCTAAACAGAAAATTATGATGACAACTCTCAATACAACCCTTATCTTTTTTGTATAAAACTTTTATATTTCTATTTTTATATTATTCGAAGTAGAATTTTTGTAAAACTTTTATATCTTGCACCGACATATAAAATTTTAGGGAATTTTCATTGGAGAACCAAAATGTTGAGAAATGGGTATATTTCAGACCTTCCCATATGCCTATATTGTTGAACCAAAATGCCATTCTTTTTCATCTGCTTCCTCATTTTAATATCACCATCGATACGACTGCGAAACTCATTTTCTCTTGTTTTACATTTTCTTTAAACATACAGTTAGTCGGACGTAATCAATTAAGAATAAATCATGCTTTTATGAAAAACATGTGAAATTAGTTAATTTTAAAGTTGTTCCTTTGTTGAGGAAAATTTTGCAGTAAACATAATAATTGAAAAAAAGAAGTTTATATGAGTCTTGTAATTGTCCAAGTAAAACAGCGAAGGAATGATAGTTATTAGTGCCTTTAGGTGTGAAAACAATTTATAAAAATAGTCAAACTTCAATGAATGAAGTGTAATTTACTAAAAATACTATTAATGAAAACAAGTCACAATAACTCTAATTAAGAAATAAAAAAGAGAAGTTTTCTTAAATATTATATAAAAATATGTTAAAATTATTAAAAATATACACTTTTGCGCATGAATAAGAAAAAAAAAATCAATTTTCGTTCTGTGGGCAGGTTAGGATATGTCTTTAAAAAACTACTCTATGGCATAAGGCATAAGC


Gene Sequence:
>Vu_05675(-)
ATAGGCTAGAATCTTAAAAGGGTTAATTCCAATATCCATTGAGTTCTTATTTTGGCAAGTAAAACAGATTGGTTCCTATGGTTGTGGATTATGTTGTTCCATCATAAGACACTTTTTGGGTCCTAAGGGAATGGGTTTCATAGGAGGGAGGCATGTCCCAAGTTAGAGATTCTGCAATAAAGCTTTTTGGAGCAGATATTCATACTACACATACTCCCATTAAGCCAACCACACCCTTCCCAGATTTACACTCATTGACTCGGATTCAGCCTCTGCCTCAACCCATCATCGTCATGGTCATGCCATTCAACCCTTCTTCTCTACTCTTTCATTTTCCATCTCCTCATTCTTCTCACGTGCTGCTCTTTTCTTGTGAAAAATTTCAGTAAGGTTCATGCTAAAGTTTACATTTTTAAACTCACAAAAAGCCTGGAGCTTTATTTGCCTTACTGAAATGGGTATATGAAAGCTGTTCCTGATTTATTTTTTGTTTGTTTAAGTGGTAGAAAACTTTTTTTCTTGCACCTAGATGTATTCTGCATATGCGAGCTTAGATTTGTATAATGAGTATTTGGATGTGGTCCGCATGTCCATTACCCCCAAAATTTTCTGAAGATTTTTTGCTTTCTTAATTTCTTTTTTAAAAAGAAGGTATTTAGTGAGATTAGTGGATTGCATTGTTTTTAGACACTAAAGAAAATTTCTGAAAGGGATGGATGGTGAATAATATTCCTGAGACTTTGATCTTTAATTGAATCTACTAATACTGTGGGATCTCTGAATCTGACTCCACCTAATGGAATAAGACTTTTGTTGATTTTATAAAAGTGGTGAATGAAGTTGAAATTTTGTTAAAGAAAATCAGGTTGTAGTTTTCTGGTGCTACGTAAATGTAAGTGGTGGAATTTGATTTGAATTTTGTATTGGATTCAATTCTAACTTGGACTTCATGATTAACAAGTAATTAACATGATACTGTTTAAATGAGGCCAAAGGTTGTGTTATAACAACTGTAGCAATGAAAATTCTTATTCTCGTGTTGTTTTAGAAGTTGAAGGTTGATGGCATTGCAGGAGCTTAACCATGAAATAAATACTGAGATGTTGTATTATTTTCTGTATTGGAATGAATATTTTGTGCCAGCCCTTACATTCTGTAACAGAGTTAGTAGTAGTACTTTGGTCTGAACTCTTAATGCAAGTTGCTTGTTTAATGTATTCCTAATTGACACAAAATGTTCCTCCATTGCAGAATGGACTTGAAGAATCAGTTAATGATGAAGTGGATGTTCCTTTGAATGAAGAAGTTTCTAGCAAACAGATTGATCCTCAAGAAGATGGTAATGATACTCCAAGAGACATATGTAAAAATCCTACACTGAAACTGGTGGGAAAAGTAGTTCATAGGACTAATGAGCACAGGAATGCTAAAAGAAATATTGATCAGGAAAAGGTTTTCAAGAAGCCAGACAAGGTCCTGCAATGTCCTCGCTGCAATAGTTTGGAAACAAAGTTTTGCTACTTCAACAATTACAATGTTAACCAACCTAGACATTTCTGTAAAAATTGCCAAAGGTATTGGACAGCTGGAGGGGCGATTAGAAATGTTCCTGTTGGGGCTGGTAAGCGTAAGAATAAGCACTCAGCTCTGCAGTATTATCAGAAACCTGTGACTCCTGATGGTGAATCTGCGATCCAGACACATTCCAGTGGTTCTAGTGATGATATGATTCTCTCATCTAATGAACTTTCTGTGACTTCAAGACCTATCAGAGAAAGGGAGGAAAATCCTCTTAGTGAATCTGTAGAAACTGTGTTGAGTCTCAATGGCCAAAGAAAATTTGATGTGGACTTTTCCACTGTCAAAGATGATGGTGAGGACCCTTCCAGCTCCTCTATGAGATCTAATGAAATGGAGCAGGTTGGTTTGGCACAACACTTTAATGGTTTAATTCCCTTACATTCATTTCATTATCATCCTGTCCCTTCATGGTCTTATCAATGGAATCCATGTTGGAATGTCAAGGAGTTTAGGTCCAGTAGCACTAGTTACACAGGTTCTCCAACCATGATGGCAGTTTCTGGCTTCTCCATACCAACAGTAATGCCACCTGCAGCACCTTATTCGTATTCAGGTTTCATGTCAAACTTAGCTGGCCAAGAGGAAGAGTCTTCATTGATTGGATCTGCATTTAGTGGCATCTCATTGTCTTCATCTTCTGTCAGCAATAGTACTAGTTCTGGTAATAGATCCCCAGCCTTGGGAAAACATTCCAGAGATGGAAGCACACCAAAGGAAGGTGCAATGAAACAGAACCTTTGGGTGCCTAAGACTGTTAGAATTAACGGTCCAGAAGAGGCTGCAAACAGTTCGATATGGACAACTTTGGGAACAAAATCTGAACAGAACAAAATCATTATAAAAGGAAGTGTCTTTAAATCATTTGAGTCTAAGACAAGTGCTGATGATAATCAAATTCGAAGGACAAACCCTGCTGCTTTCTCACGTTCTGAATCTTTTCAGGAAAGCATGTGAAGTGATGTATTTTTGTTCTAGTTGTATGTTGTGATCAGCTCAACCATGTCAATTTGGCATTTCTTGTTAGATGAGGCATAGAAGGTTTCTAAAAATCCTTTTCTCTACCTGGGATGGTTTCATGTATCGATGTTCAAGAAGACAGCCATGACAATAACCTTAAAGTTTAAGCTATGTGTTCAGCAGCAGTAATTAGTCAATAAGAATCTGTCTCAAGCTTGTGTCACCATTTGCTTCATGGCAAAATAAGAGTCATGAACATGAAACCTGACTGAGGTATGATATTTAGGCTTCAAAATAGATGCAATCAAGACATTAGTCCTGTGAATTGATTCTTCATCTTTTTATCATTGTCTAGTCAATATTCAGTTAGAAAATTTTGGTGTCATTGACGTCTGTGTACTGTTTTTCACACTTTTGAGGAATTTATTTTACTGTTTCTTTCCTATTTCCAACAGATT