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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05619 LG1 84106288 84108268 "PREDICTED: protein kinase 2A, chloroplastic-like "
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 84107872 intron_variant
A/T 84107972 missense_variant p.Ser208Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05619.1
MVPFLCLWFTRREEEEEGDGFQRPPDCVGIGMKMMEIVRFLRFDSGGSKSRSKTKENSKSTEGKAPLKTLGSNVDKRISSILKSFTFNQLKEATKNFRQENLIGEGGFGFVYKGWIDENTYAPTRPGTGVVVAIKNLKPESFQGHREWLAKVNYLSQLHHENLVKLIGYCSDGKNRLLVYEFMHKGSLENHLFRKGVQPIPWTIRINIAVAVARGLTFLHTLDRNVIYRDLKAANILLDSDFNPKLSDFGLARDGPTGDNTHVSTRAGLLLF*


CDS Sequence:
>Vu_05619.1
ATGGTTCCATTTTTGTGTCTTTGGTTTACACGGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGGCGATGGTTTCCAAAGGCCTCCAGATTGTGTGGGTATTGGTATGAAAATGATGGAAATTGTGAGGTTTCTTCGCTTTGATTCAGGAGGCTCAAAGTCTCGAAGTAAGACAAAAGAGAACTCAAAATCTACTGAAGGAAAAGCTCCTTTAAAAACTTTAGGATCAAATGTTGACAAACGCATCTCCAGTATCCTAAAGTCCTTCACCTTCAATCAACTAAAAGAGGCCACTAAGAACTTCAGGCAAGAAAACTTGATTGGAGAAGGAGGGTTTGGGTTTGTATACAAGGGATGGATAGATGAGAACACTTATGCTCCCACAAGACCAGGGACTGGAGTTGTTGTGGCCATCAAAAACCTTAAACCAGAAAGTTTTCAAGGCCACAGAGAATGGCTGGCAAAAGTCAATTATCTAAGCCAGCTTCACCATGAAAATCTGGTGAAACTTATTGGTTACTGCTCAGATGGAAAAAACAGGCTTCTAGTTTATGAGTTTATGCATAAAGGAAGTTTGGAAAATCATTTATTTAGAAAAGGTGTTCAACCTATTCCCTGGACTATCCGGATCAACATTGCAGTTGCTGTTGCAAGAGGATTAACATTTTTACATACCCTGGATAGAAATGTTATATATCGTGATTTAAAGGCAGCCAACATCCTACTTGATTCGGATTTCAACCCAAAGCTTTCGGATTTTGGCTTGGCAAGAGATGGTCCTACAGGAGACAACACTCATGTTTCAACCAGAGCTGGGCTTCTTTTATTTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_05619::LG1:84104288-84106288(+)
CTTTCACAAGTTGTGCATGCAACATACATGCAAATATTTCTACATCAAGTAGTGGCTTGTGGATGGGTAGAATAAATTTCACACCATTAGAATCGATTTGTGAAGGTGGGAATCCATTCCCTGCCATAAATGATTTTGTGGAGGTGAGAATCTATTATCTATCACGAGACTGAATTTTTGTTAATATGTTTAGTTTTGTAAGTTTTATTTTTCATTTTTAGGAGTTTTAACTAGTTAAATTCTAAAGTATAGGGTTTATAATGAAAGTGAAGGTTTGAAGTCTATTTTTGGACTATTTGTGACTTGTTTAAAGGTTAAGTTCATCAAATTGTTAAGGAATCAGTAAAAATTAACTTTTGAACTTTTAGAATGATGTTTAGTTGTTTGAGTTAGAATTTTTAAAAATGTTAACTAACGAGTTCAATTAAGGTCTGAAATAACAAATGGGGTGTATCGGCGAATGTGGAAGCGTGAGAGTTGGAAAATTTAAGGTTAGTAGGCTCAAATTATGTAAAATTTTCATTCTGCATAATTCTGCATTCTAACTAAGTGAGTATGGTTGTTGAGTGAGTAGAACGAAATTCAGTTGAACGAATGTAAGCGTTGAGCGAACAGAACCCATTGTTTTTGTATTTGTAGAGCGAGTTAGTTTGAGGGATAATATTCTTGTAACAATGGATGAGCGAGAGTCCTCGTCGAGCGAGAAAGTTTTCTTTTCATTGAGTGAGTGCAGGCATTGAGTGAGAAAGTTTTCTTTTCGCTAAGCGAGTGTAAGCGTTGAGTGACCTGTTCAGATCATGTCTTGAGTCTTTCTTTCTTTTGCTTTCTTGTAACTTTTAACTATATTAGGGCTTTGAGGATTGTGTAAAAGTATTTATTGAATGATATAATGGCTTATACATGATGTTATGTTTGTATTCAAGGTATGGTTAGACAATAATTTTTAAGGTGAAATTCTAATTGGTTGTTTCAAGTATTGTATGTATGAATGTAGGAAACTCAATCTTGAGGTTATCATGACACTCTAATGATCACTCATTCTCAATTAGAGAGGGGTAGTGTATATGGTTAGAGTAGTAAGAAATTCTAGTCACTAGTAGAAAAATGACATTTTATAACAAACCTATTATGACGGATAAAAATTATCCATCATAATAGGGAGATATTATAACGTAGTTTTTAAAATCAGTTATAATATGAGACGCGGTGGCAAACTTGTAAATAAGTTTAAGACATATTATAACGTAGTTTTGAAAATCAGTTATAATATGAAAAGCGGTGGCAAACTTGTAAATAAGTTGAAAACCTATTATTGATGTATTATAACGGATTTTTAGAAATCAGTTATAATATCTCACTATCCCTCTCACTCTCATTCCTCTCTTCACGTTCCCTCTCACTCTCATTCCTCTCTTCACGTTCCCTCTCACTCTCATTCCTCTTTTCCTCTTCGTCTCATTGCTCTCTTCACGTTCTCACTCTCATTCCTCTCACGCAGTGGCTCTTCGTCTCATTCCTCTCTTCACGTTCCCTCTCACTCTCATTTCTCTCACGCAGTGGCTCCGCTGCCTCTTTCCTCTCACGCAGTGGCTCCGCTGCCTCTTCCTCGAAATCTCTGAAGTCTAACCAAGTAGGTTTTATGTTTTTCCCTAATTTGTTATGTTTTTCTTCTATTAATTTCACTAATTTCTTAGATTGGTGGGGATTGTGTTTCGTTTGGTGGAGATCTTTTCATTCGCACCCTGTTCGCCATTGGTGTTGTTGTTCTCTCCTCTGATACAAAAGATTAAAACTTTGATCATTGGAAACAGCTGCAGAAAACCAGTGGCTCATGTGTCTTCCACAAGTTTCTTTGGTCAGTTTTAATTTGGTTGTTTTAATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCCTCATTTTTCTTTAGTGCAAAATATAAATAAGCCTTGATTTGTTTTTCTTCTGCTTTGATGCTTTGAATTTTGATATTTGTTTTGTCATGGTGGA


Gene Sequence:
>Vu_05619(+)
ATGGTTCCATTTTTGTGTCTTTGGTTTACACGGAGAGAAGAAGAAGAAGAAGGCGATGGTTTCCAAAGGGTAAGAGTTAAAACAATAGTTCACAGGCTGTAACCTGGAAGATTACTGGACTAGCTATTTTTCTATGAACCTTCTTGTTCTGTTTTCTTGTTTTTTAGTGTTCTCAAGGCCTTGGTTTCGTAGAACTGGATGGATTTTTTTGTCTTTTTGTTAACTTAAATGTAAGCCTCCAGATTGTGTGGGTATTGGTATGAAAATGATGGAAATTGTGAGGTTTCTTCGCTTTGATTCAGGTTCTAAATAATGTTGAATGATTTTCGCCTTTTATTTCTTCTTAGAAGCAGTGACTGGTGTGAATTAACATTCTTAGTTGCCTTTCAACTCTTTGATTTCATCTCTCTCAAAGAAGTGACAATATTTGCGTATATACATGTGTGCCAAATTAATATTTAGACAGTGTTTCAGATTAATTTACGCATAATAGTACAATCTTCTGTACAGAAATAGAGAAGTTACTGTAGTGGCTGATTGTAACTTGCATTTCATTTACTCTCAGGAGGCTCAAAGTCTCGAAGTAAGACAAAAGAGAACTCAAAATCTACTGAAGGAAAAGCTCCTTTAAAAACTTTAGGATCAAATGTTGACAAACGCATCTCCAGTATCCTAAAGTCCTTCACCTTCAATCAACTAAAAGAGGCCACTAAGAACTTCAGGCAAGAAAACTTGATTGGAGAAGGAGGGTTTGGGTTTGTATACAAGGGATGGATAGATGAGAACACTTATGCTCCCACAAGACCAGGGACTGGAGTTGTTGTGGCCATCAAAAACCTTAAACCAGAAAGTTTTCAAGGCCACAGAGAATGGCTGGTATGTCCAAGTCCTACACAAACTCTTAAACTGTTGTATAACTTCTTGGTGTTGGTAAGCCTTGACTCATTTTCTGCCCATTATGTTTGCAGGCAAAAGTCAATTATCTAAGCCAGCTTCACCATGAAAATCTGGTGAAACTTATTGGTTACTGCTCAGATGGAAAAAACAGGCTTCTAGTTTATGAGTTTATGCATAAAGGAAGTTTGGAAAATCATTTATTTAGAAGTAAGTAGTGCATTTACTCTTCAACATATTTAGTCTGAAATGATGCATTGGGTACCATTGTACAAAGGGGTTGAAATAGGCAAGACTAAGCTTTGGTTGTAGACCTGAACCTAATCTGTTCTAGTTTGAGTTTAGGCCTACCACCAAAGCTTAGTCTTGCTTATTGTATAAAGGAAGTTTGGAAAATCATTCATGCAGAGGTTGTGCATTCACTCAACATATTTAGTCTCCATTAAGCCATTTGAATACTAATGTACAAAGGGGTTAGAATGAGATTAAGCCAAACTTTGGTAATCTTAAACCTGGTCTAATTCATAATTGCAAAATCTGAGTCTGATCTGATTGTCTATTATATGTCAATGTTAAAGTCATAACTTTGCTTGTTTGAACGCTCGGCTTAACCTCTAATTCAGACCCTAACATAACTTCTGACTTGTTTAGTATTTACACCCTTATATTCAACATAGTTGTTTTTGAACTGAACCATAGTTTCCTCCTGATTCATAATACCTTAATTTTGGTTTTATATTTCTGCAGAAGGTGTTCAACCTATTCCCTGGACTATCCGGATCAACATTGCAGTTGCTGTTGCAAGAGGATTAACATTTTTACATACCCTGGATAGAAATGTTATATATCGTGATTTAAAGGCAGCCAACATCCTACTTGATTCGGTATTTAACACTAAAAGTTTGGCTTGTGAATTTGTGAAGAAAACAACACCTGTTGTTTGCATGTATGTCTTCATTCTGAAAGAGTAGAACTATGATATATGTAGGATTTCAACCCAAAGCTTTCGGATTTTGGCTTGGCAAGAGATGGTCCTACAGGAGACAACACTCATGTTTCAACCAGAGCTGGGCTTCTTTTATTTTAA

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