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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05526 LG1 82856230 82858266 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 82856288 missense_variant p.Asn540Lys
T/A 82856912 missense_variant p.Lys452Met
T/A 82857379 missense_variant p.Leu296Phe
C/A 82857386 missense_variant p.Gly294Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05526.1
MAFFSSSSCSNQTQKQTSFFICIIFFTLFHNTVESVSFNFSSFQQSNLNNQINFTGDAFPSNGVLQLTKNQLDGPITSSVGRASYEQPVRIWDKKTNNLTDFKTHFSFIMKAVNESFIGDGLAFFLAPFDSSIPNNSSGGFLGLFSPDSAFDTKKNQMVAVEFDSFKNEWDPSSDHVGINVNSIQSVANVTWKSNIKNGSVANAWVWYNSTSKTLSVFLTYAKNPTFNSSSSLSYVIDLRDVLPEFVRIGFSAATGKSVEIHNILLWSFSSTLDEVGGKKVKVGLVVGVSVGLGCLACAAGLIWFTFWRRRNRLRGGNEEEIGVDAIDDEFERGTGPKRFTYRELSNATNNFAEEGKLGQGGFGGVYKGLIVNSNLEVAVKRVSKGSKQGKKEYISEVTVISRLRHRNLVQLIGWCHEQGELLLVYEFMPNGSLDSHLFGNRVMLSWVVRYKVAIGLASALLYLHEEWEQCVVHRDIKSSNVMLDGNFNAKLGDFGLARLVDHELAPLPSLPSKLPVPMYFAPPMEITQFSYSSSAVTTTTKDSSPYSSISIGSRKSPL*


CDS Sequence:
>Vu_05526.1
ATGGCTTTCTTCTCCTCTTCTTCATGCTCTAATCAAACCCAGAAACAAACATCTTTCTTCATATGTATCATCTTCTTCACTTTGTTCCATAACACTGTAGAGTCAGTTTCCTTCAACTTTTCCAGCTTCCAGCAGTCAAACTTGAACAACCAAATAAATTTCACGGGTGATGCTTTTCCCTCAAACGGTGTTCTTCAGCTCACGAAGAACCAACTCGATGGCCCCATCACAAGTAGCGTTGGTCGAGCCTCGTATGAACAACCAGTGAGGATATGGGATAAAAAAACAAACAATCTCACCGATTTCAAAACCCATTTCTCTTTTATCATGAAAGCTGTGAACGAGTCATTTATTGGTGATGGCTTAGCCTTCTTCCTTGCACCCTTTGATTCTTCCATTCCCAACAATTCTTCTGGTGGGTTCCTTGGCCTGTTCAGCCCGGATTCCGCATTCGACACGAAGAAAAATCAGATGGTGGCAGTTGAGTTCGACAGTTTCAAGAATGAATGGGATCCGAGCTCAGACCACGTAGGGATCAATGTTAATTCCATTCAATCAGTTGCAAACGTCACTTGGAAGAGCAACATTAAGAACGGGTCTGTTGCTAATGCTTGGGTATGGTACAACTCCACATCCAAAACTCTATCTGTCTTCCTTACCTATGCTAAAAATCCAACCTTCAATAGCAGTTCCAGTCTTTCTTACGTTATTGATTTGAGGGACGTGTTGCCAGAGTTTGTTAGAATAGGCTTTTCTGCAGCAACGGGAAAATCGGTTGAGATACACAACATTTTGCTTTGGTCATTCAGTTCAACCTTGGATGAGGTTGGTGGGAAAAAGGTAAAGGTTGGCCTAGTGGTTGGTGTAAGTGTTGGTTTGGGTTGTTTAGCTTGTGCTGCAGGTCTAATATGGTTTACCTTTTGGAGAAGGAGAAATAGACTAAGGGGTGGAAACGAGGAGGAAATTGGTGTCGATGCCATAGATGATGAGTTTGAGAGAGGAACTGGTCCAAAGAGGTTCACCTACCGGGAACTAAGCAACGCAACGAACAACTTCGCTGAAGAAGGGAAGCTGGGACAAGGAGGGTTTGGAGGAGTTTACAAAGGTTTGATTGTGAATTCCAACCTTGAAGTGGCAGTGAAGAGGGTTTCGAAAGGGTCAAAGCAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTGACAGTCATCAGCCGTCTGAGACACAGAAACCTGGTTCAACTCATAGGGTGGTGCCATGAACAAGGTGAGCTCCTTCTTGTATATGAATTCATGCCAAACGGAAGCCTTGATTCTCATCTATTTGGAAACAGAGTGATGCTTTCGTGGGTGGTGAGATACAAGGTGGCCATAGGTTTGGCATCTGCACTTCTTTATCTTCATGAAGAGTGGGAACAGTGTGTGGTCCATAGAGATATCAAGTCAAGCAACGTGATGTTGGATGGAAATTTCAATGCAAAGCTTGGTGACTTTGGTCTTGCAAGGCTGGTAGACCACGAACTGGCCCCTTTGCCAAGTCTTCCATCCAAGTTGCCAGTGCCAATGTACTTTGCACCTCCCATGGAGATTACTCAATTCTCCTACTCTTCATCTGCCGTCACAACCACAACCAAAGATTCCTCCCCGTACTCCTCAATTTCTATTGGCTCCCGAAAGTCTCCCTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_05526::LG1:82858266-82860266(-)
AGTGAGAAAACGAACCTGAAAAGCGTAACCCTTAAAGAGAAAACGCGACGAAGATGATGAACAATGAGTGCGCGTAACGGCTGTCTCGCGTTCACGATGTTTTAATGCCAAAATTTAGATGTCGGTTCCCCCAATTAACAGACGTCTAAAGTGCTTTAGAAGTCAGAGTGGCAAGATCAGACGTCTAAATAGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGATTTAAGGTTTAGACGTCGGTTCCCCTAATTAACAGATGTCTAAAGTGCTTCAAAAGTCGGAGTGGCGGGATCAGACGTCTGAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGATTTATGGTTTAGACGTTGGTTCCCTCAATTAACAGATGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCGGGATCAAACATCTAAATGGAGTCAAAAAGTTACTTTTTTAAATTTATGGAGTTAGGGTTTAGACGTCGGTTCCCCAATTAACAGACGTATAAAGTGTTTCAGAAGTCGGAGTAGTGGGATCAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTTTGGAGTTAGGGCTTAGACGTAAGTTCCCCAATTCACAGACGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCAGGATCAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAGATTTTTGGAGTTAGGGTTTAGACGCCGGTTTCCCAATTCACAGACGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCGGGATTAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGAGTTAGGGTTTAGACGTCGGTTCCTTCCATAACAGACGTCTAAATAGAATAAATTTTTTTTTTTAACTTTTTCGTTTAGTTTTGACGTCTATTCGGGGAAGCCGACGTATATGAGTATTTAGACGTCAGACTCTTCCATAACCGACGTCTAAATAGTTATTTTATTTACGAAAAATGTCATCGCTCATTTTTTACGTTGAATATTCGAGGGTCAATGTCTAAAGAGTAATATTAAAGGTCTTTTTTGCACTAGTAGTTTACAATAAGACACATTTGAACTTTCCATGTCGGTTTCAACATGTCACCTTCAATTTTAACTAAGCAATTTTCACCGAATGTATAACCTCCATCTCTATATATTATTTCATTGATCATTTGATAAAGTTACCCTCAATCATTTATTTAGTTTACTCTTTATATGTTTGGCTTAGCGAACCAATATATTTAATAATAAATTGATAAAAAAAAGCCTTTTGATTTTTGTTTACTCGTTAATTGTCACTTTAATTGTGTAATATTATTGCTGCTATTAGGAATAATATTAATGTTTTCTTATATAATTTAAAATTTAAAAATAAACACTTTTAAATATATAAAATATACATTTTAATTAAAATATATTGTAATAAGAAACCTAAGCATACAAATTATATTATGTTTAGAAATTTATATTATGTTTTATATTATAACAAAAGATTATTTTTAATCATAGCTATTTTTAAATATTTTAAAATTCAATTATAGAAAGTGTAGGGAAAATATAGTATAAAAATTCATGGAGGGAAGCTACTTAAAAAGAAAAAACTCTTGTTATTAAAAATAGTTCCTAAAATGCTTTGATTTAGTATTATGATTTTGATTTTATACATAAAACGATGGTAGGTTATCCCTAGACACGGGAAAAGACAAAGGAGTGAAATTTCGCATCGCTGAACATGTTGTCTAGGGCCAGGACAATAGAGAAGTTTAGAACGATTCTCCAGAAAAGGTGTAAGAGTATGTATGTTCATGTATTAGTAATTAATTCGTGAAAGCAACATATTTTTAATTCACCAAATACCTACTTAGGAACAGTTCAAAACATGTTTTGTTATCATCATTATTCCATTAATTTAATCGACAAACTTTGAAATTGGATGCATATAGTTGCTATATTCTTTGTTCACATCAACACCATCAAAATCTTCTATCCCTCTCTACC


Gene Sequence:
>Vu_05526(-)
ATGGCTTTCTTCTCCTCTTCTTCATGCTCTAATCAAACCCAGAAACAAACATCTTTCTTCATATGTATCATCTTCTTCACTTTGTTCCATAACACTGTAGAGTCAGTTTCCTTCAACTTTTCCAGCTTCCAGCAGTCAAACTTGAACAACCAAATAAATTTCACGGGTGATGCTTTTCCCTCAAACGGTGTTCTTCAGCTCACGAAGAACCAACTCGATGGCCCCATCACAAGTAGCGTTGGTCGAGCCTCGTATGAACAACCAGTGAGGATATGGGATAAAAAAACAAACAATCTCACCGATTTCAAAACCCATTTCTCTTTTATCATGAAAGCTGTGAACGAGTCATTTATTGGTGATGGCTTAGCCTTCTTCCTTGCACCCTTTGATTCTTCCATTCCCAACAATTCTTCTGGTGGGTTCCTTGGCCTGTTCAGCCCGGATTCCGCATTCGACACGAAGAAAAATCAGATGGTGGCAGTTGAGTTCGACAGTTTCAAGAATGAATGGGATCCGAGCTCAGACCACGTAGGGATCAATGTTAATTCCATTCAATCAGTTGCAAACGTCACTTGGAAGAGCAACATTAAGAACGGGTCTGTTGCTAATGCTTGGGTATGGTACAACTCCACATCCAAAACTCTATCTGTCTTCCTTACCTATGCTAAAAATCCAACCTTCAATAGCAGTTCCAGTCTTTCTTACGTTATTGATTTGAGGGACGTGTTGCCAGAGTTTGTTAGAATAGGCTTTTCTGCAGCAACGGGAAAATCGGTTGAGATACACAACATTTTGCTTTGGTCATTCAGTTCAACCTTGGATGAGGTTGGTGGGAAAAAGGTAAAGGTTGGCCTAGTGGTTGGTGTAAGTGTTGGTTTGGGTTGTTTAGCTTGTGCTGCAGGTCTAATATGGTTTACCTTTTGGAGAAGGAGAAATAGACTAAGGGGTGGAAACGAGGAGGAAATTGGTGTCGATGCCATAGATGATGAGTTTGAGAGAGGAACTGGTCCAAAGAGGTTCACCTACCGGGAACTAAGCAACGCAACGAACAACTTCGCTGAAGAAGGGAAGCTGGGACAAGGAGGGTTTGGAGGAGTTTACAAAGGTTTGATTGTGAATTCCAACCTTGAAGTGGCAGTGAAGAGGGTTTCGAAAGGGTCAAAGCAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTGACAGTCATCAGCCGTCTGAGACACAGAAACCTGGTTCAACTCATAGGGTGGTGCCATGAACAAGGTGAGCTCCTTCTTGTATATGAATTCATGCCAAACGGAAGCCTTGATTCTCATCTATTTGGAAACAGAGTGATGCTTTCGTGGGTGGTGAGATACAAGGTGGCCATAGGTTTGGCATCTGCACTTCTTTATCTTCATGAAGAGTGGGAACAGTGTGTGGTCCATAGAGATATCAAGTCAAGCAACGTGATGTTGGATGGAAATTTCAATGCAAAGCTTGGTGACTTTGGTCTTGCAAGGCTGGTAGACCACGAACTGGGTTCACAAACGACTGTTTTGGCTGGAACCATGGGGTACCTAGCCCCAGAGTGTGTGACAACAGGGAAATCAAGCAAGGAATCTGATGTGTACAGCTTTGGTGTTGTGGCACTTGAGATCACATGTGGTAGAAAACCAGTGGAGGTGAAAGAAGAGGCTGGTAAAGTTAGGCTTGTGGAGTGGGTGTGGAACCTCTATGGAAAAGGGAAAGTACTAGAAGCAGCTGATGAGAAACTGAATCGGGAATTTGAAGAACAGCAAATGGAATGTTTGATGATTGTGGGGTTGTGGTGCTGTCACCCTGATCATACAATGAGGCCTTCCATTAGGCAAGTGATAAGTGTGCTTAACTTTGAAGCCCCTTTGCCAAGTCTTCCATCCAAGTTGCCAGTGCCAATGTACTTTGCACCTCCCATGGAGATTACTCAATTCTCCTACTCTTCATCTGCCGTCACAACCACAACCAAAGATTCCTCCCCGTACTCCTCAATTTCTATTGGCTCCCGAAAGTCTCCCTTGTAG

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