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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05480 LG1 82197004 82199629 serine/threonine-protein kinase SRK2E isoform X3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05480.1
MAVGPGMDMPIMHDSDRYELLRDIGSGNFGVARLMRDKLTEELVAVKYIERGEKARFFFQQLISGVSYCHAMQVCHRDLKLENTLLDGSPAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLLKKEYDGKIADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPEEPKNFRKTIHRILNVQYSIPDYVHISPECRHLISRIFVADPAKRISIPEIRNHEWFLKNLPSDLMDGNSNNQFEEPDQPMQSIEEIMQIIREATIPAAGSQSPNHDLTGSLDIDEDMDTDPDLDLDSSGEIVYAM*


CDS Sequence:
>Vu_05480.1
ATGGCTGTTGGGCCAGGAATGGATATGCCGATCATGCATGACAGTGATCGCTACGAACTCCTGCGTGACATTGGTTCTGGCAACTTCGGTGTAGCAAGGCTCATGAGGGACAAGCTCACCGAGGAACTTGTTGCTGTTAAGTATATTGAGAGAGGTGAAAAGGCACGCTTCTTCTTCCAACAACTTATATCAGGGGTTAGCTATTGTCATGCAATGCAAGTATGCCATCGAGACTTGAAGTTGGAAAACACATTGTTGGATGGTAGTCCAGCTCCTCGTTTGAAGATTTGTGATTTTGGCTATTCAAAGTCCTCAGTGCTACATTCTCAACCAAAATCTACAGTGGGAACCCCTGCATATATCGCTCCAGAAGTTTTGCTTAAGAAGGAATATGATGGCAAGATTGCAGATGTGTGGTCTTGTGGGGTGACCTTGTATGTCATGTTGGTGGGAGCATATCCATTTGAGGATCCCGAGGAACCTAAAAATTTCCGCAAGACAATACATAGGATTTTGAATGTTCAGTACTCAATTCCAGACTATGTTCATATATCTCCCGAGTGCCGTCATCTGATATCAAGGATTTTTGTTGCTGATCCTGCAAAAAGAATAAGTATTCCTGAAATTAGAAACCACGAGTGGTTTTTGAAGAACCTTCCAAGTGATCTGATGGATGGGAATAGCAACAACCAGTTTGAGGAGCCTGATCAACCAATGCAAAGCATTGAAGAAATCATGCAGATAATCAGAGAGGCTACAATTCCTGCAGCTGGATCTCAGTCTCCCAACCATGATCTTACTGGTAGCTTGGATATTGATGAGGACATGGATACAGATCCTGATCTTGACTTAGATAGCAGTGGAGAAATAGTGTATGCCATGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_05480::LG1:82199629-82201629(-)
CTACTGCGTCGCCACCACCACCGAAGCACCTTCTTGTACCATGTACCACTAGCACAAGACCACCTTCTTGACCACCAAACTCTTCTAGGAAACTCTCCAACCTCCAAACAAACACACCACCACCACAAAGAACCACCATGACAAGAAGCACAACAACATAGCACAGTGAAGTGAAGGAAAAAGATGACGAATGTGATTTTCGTGAGTGTGTGGGGATGCATTTTATGCTGTGGGAACCGCTTAAATAAGATAATTGAATATTGGTGAAAAGTACATTTTTTTAACCACCATCTTTAATTTACTAACGAGGATAAATTGAAAATGAGGAAGTGCAGAAAGAAAATGTGGTGGTGTAGGGAGAAACCCTTTGATATTTTTATAAAGTAACATTAGTGAGGGATTAGTCCACACAATTTTTAAAAATATATAAAACTTTAAAGGGCTTAGCCCTCTTAAGAACAATATTTTTAAAAAATAAAATTTTATTGAGGGTTTAGCACACACAAACAGCAATTTTTTAAAAGAAAAAAAAAATTCAAGGAGGTCTTAGCCCTAATTACTATTAATATTTTCTCATAAATAGAAAATAGACATGATGATGAAGCTTGAATTTCACAGTCCGACAACTCTCATTATAATAAATTTGCTACCCCAGTTTAAAGAAGTGTCCGTTCCACATACTAAGTCGTCGCATAAGCATTGGTAGTTGGGTCAGACCGAGGGTTTTATTGGAACGCTTTTTGATGTTTTCTTGTAGTAATTGAGTGTACCTATAAACGCTTAAGAAAATATAAATTGCTACTAAATATCACGACCATTACAGAGTTATTGTTATATTTTACAGATATAACAACGGCAATTCAAGAATTATCGTAACATATAAAATTATTACAATAGTTCTGACTTTCATCAAAACCTTTTTTGACAACAGTAGTGGTTAATGTTGTGAAATTTTTTAGTTATTGTTAGCAGTTTTTTTGTAATAGATCAACATTGAAAATAAATAAAATAGCTAAATAAGGAGGCCATTTCTGCCTTTATGTTACGATACCAAATAATTCAAATGCAAATAACTAATCATTACAAAAAAATAAAGAACTGTAAAAGCCTTCTTTACAAGATAAAAAAGCTATGAGTTATTTAATTACAATTCTTATAATTATAAAAAGCCATGTTAATATTAAAATGTGTACAAGTGTTAATAAATCACTTTCAAAACTTCACATTCATAAAAAATCTAGAATTGTTTTCGTGTTTTAATACATTATTTTCATTTTTTATTTTAATATCGTCTAACGTTTAAACCATATTTTTTAAGGAAAAATCTTATGGTTTTCTTCAAGAATTTGACAATGCGAAATTATATTTTACGACTTAAATCCGATTGATCCCTTACACTTTGTTTAGTTCGTGGAAAATAAGAGAATAGAGGACGGGAACGAATGAAAATGAGGGAAAATGAAATACTAAAAGAGAAAAACAAAGTGCGAAGAAATGTTTTAAGAAATAAATAAAATCTGTTGGAAACGAAAGAAAACGTAAAGTTTGCAGTAGTAACATATAAAAGAAGTAAAATCTTAAGAGCACCGAACAGAAAGACAGCATATAACACAGAAGCATCTAGAGAGAGACAGTTCACGAGTGTGTCACCGCCAATTTGCAGCTGGAATCAATCAAATTGTACTGCTTCTACTACTATACTATGCATGGTGTACATATCAAACTTCTGAAAATCCCAAATGCTCGTTTGGGTTGGTGAAGCTTTCACGGGGTGGAACCATTTCTGGTCTCTTTCTTCACCCACCAGCTCTAAATCCTGTGGCCCACACCCAACCACGTCAAAGCCCACGCATTTCTTCCTCCTCAGCCGGGGCTTCGGTGTCACCTTTCTGCTTTTGCTTTATCTTTCGGAATGCTAATAATGTGAGAGTTTAGCTTCTTGTTGGGGGTGCTGTGCTTCAATAAAACTTCTTTTTTTAAACCAAATAGATCTGTCTGCT


Gene Sequence:
>Vu_05480(-)
ATGGCTGTTGGGCCAGGAATGGATATGCCGATCATGCATGACAGTGATCGCTACGAACTCCTGCGTGACATTGGTTCTGGCAACTTCGGTGTAGCAAGGCTCATGAGGGACAAGCTCACCGAGGAACTTGTTGCTGTTAAGTATATTGAGAGAGGTGAAAAGGTTTGTCATCTACGTTCTCTATCCTTCTTCTGCTACTTATAGCGCAAATCAATCAACCAACAAAAGCTAGTCTCTCGTAACCAACAACCTCTGTTGAACGAGGTGTCTAGTTATAATGTTTGATTGTATCTCAATCGGAAGCCTTCCGGAAGATATATAATACATGGGGAAACCAAAAATAAAAAACGTGCATATCAATGATGTTTGTGCTGTATGTGGGGGTAGAAGTTTGGAACTGAGTTTTTCGTAGGATTTCTGCTTTAAGTGTTTTGATTAACTAAAGATTATCATTTGAAGGATCACTTGATTTGGTTAACTGAGCTTCTCTCTTCAGTTTCTTTCATAGAATTCATGTTGTTGTTACTTCTTTTGGTTACTACTAACGCAAGTTGAATTAAGCGTAACTTTTGCTTGTTATGATCTCGTCAATGTAAAAATTTGGATGATGGCCTTGTTGGTAAAATTGGTTTGGTAGACCTGACGGCAGGGTCATGCTGATTCTTAACAGATAGATGAAAATGTACAGAGAGAAATTATAAATCACAGATCTCTGAGGCATCCTAATATTGTGAGGTTCAAGGAGGTGTGTAAACTCCTAATGTCTCATGCTATTTGTTCGTATGTTAGAAGTATTGTAATTGGTCCTTTGCTTATGTGAGTTTAGGTTATATTGACACCAACACATTTGGCAATTGTAATGGAATATGCTTCTGGAGGAGAGCTATTTGAGCGAATATGCAATGCAGGGCGATTCAGTGAGGATGAGGTTCTCATCTGTTGCATTCATTCATTTGTGTAATGCTACTGCATATGCCTTTAATCTCTGTAATTGTGTGCTGCAGGCACGCTTCTTCTTCCAACAACTTATATCAGGGGTTAGCTATTGTCATGCAATGGTACTTGAACATACACTCTTTTCTTTTACTAGTTATGTTTAGCTCAGAAAAAGGTATCATGAGATAGCTGACTTTTATTTCTATATTTTCTGGTCTTCTTTATTGAAGCAAGTATGCCATCGAGACTTGAAGTTGGAAAACACATTGTTGGATGGTAGTCCAGCTCCTCGTTTGAAGATTTGTGATTTTGGCTATTCAAAGGTATATGTAGTTTCATTCTCTACGATGCTTTTTCATTTGTAGTATCTGCATTGAAGGCTGTGGCGCTAAAATTTCAACTGGGCATTGTTTAGAAAGTTAATGAATTTGTAGGTTTCTTCAAGTCCAAGATCAAGCATTCTTTTTTTATCTGACATTTGTTGATAATGGATAAATTTGCACTACCAATGCATCTTGATTGTCCTACTTCTTCAGTCCTCAGTGCTACATTCTCAACCAAAATCTACAGTGGGAACCCCTGCATATATCGCTCCAGAAGTTTTGCTTAAGAAGGAATATGATGGCAAGGTATGTTGTAACTTCTATCACTTGGAATTTAGTTAACTTGTGACACTTTCAAAATTTCCCATGAAGATGCTGTTGATTTAGGTTGAGTTTTAATAGAAAATTTTAATGTCCATAAATACCTTTTATTTATGGGTAGAATAAAAGATTTGTGATAACACTAGCTTGGTATACATTAAAACATTTGAAGCCCTGATGTTGATAAACCAGCACTGCATTCTGACATAGCTTTTTAATTGTTTACTTCATACTAATGTTGAGACTCAATTTTGAGACAGATTGCAGATGTGTGGTCTTGTGGGGTGACCTTGTATGTCATGTTGGTGGGAGCATATCCATTTGAGGATCCCGAGGAACCTAAAAATTTCCGCAAGACAATACATGTAGCTAACTGCATTTTTTTTTCAGTCAATGTGGTGTACTTTTATGAAATTACTTTTCCTAAACTGATGCATGTTTGTTGCAGAGGATTTTGAATGTTCAGTACTCAATTCCAGACTATGTTCATATATCTCCCGAGTGCCGTCATCTGATATCAAGGATTTTTGTTGCTGATCCTGCAAAAGTAAGTGTTTTTGTCGTTACATTTGTTTAATCTTCATGTATTATCATCATTAAACAATGAACCGAATAGAAATCATTACGAATGCGTTTCAAGCTAATTATTATGATAGCCAACAAACTTATCATCGATAGCAGTTTTTAATCGGACGATCTCCTTTTATTGGTTTCAAGGATGATGACATTGACATTTAACATAGAAACTAAAATTGTTTGTACAACAGAGAATAAGTATTCCTGAAATTAGAAACCACGAGTGGTTTTTGAAGAACCTTCCAAGTGATCTGATGGATGGGAATAGCAACAACCAGTTTGAGGAGCCTGATCAACCAATGCAAAGCATTGAAGAAATCATGCAGATAATCAGAGAGGCTACAATTCCTGCAGCTGGATCTCAGTCTCCCAACCATGATCTTACTGGTAGCTTGGATATTGATGAGGACATGGATACAGATCCTGATCTTGACTTAGATAGCAGTGGAGAAATAGTGTATGCCATGTAA

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