Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05432 LG1 81537135 81540787 PREDICTED: putative transcription factor bHLH107
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 81537216 3_prime_UTR_variant
G/C 81537676 missense_variant p.Thr158Ser
C/A,* 81537777 missense_variant p.Leu124Phe
C/A 81537856 intron_variant
A/T 81537929 intron_variant
T/C 81538487 intron_variant
C/A 81538562 intron_variant
T/A 81538564 intron_variant
G/C 81538598 intron_variant
T/C 81538722 intron_variant
T/G 81538963 intron_variant
T/G 81538966 intron_variant
T/A 81538981 intron_variant
G/A 81539148 intron_variant
G/A 81539193 intron_variant
G/A 81539237 intron_variant
T/A 81539291 intron_variant
A/G 81539374 intron_variant
G/A 81539502 intron_variant
T/C 81539533 intron_variant
G/A 81539614 intron_variant
G/A 81539794 intron_variant
C/T 81539932 synonymous_variant p.Glu70Glu
T/C 81540007 synonymous_variant p.Leu45Leu
A/T 81540157 5_prime_UTR_variant
C/G 81540226 5_prime_UTR_variant
G/A 81540374 5_prime_UTR_variant
T/A 81540461 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05432.1
MVHSFYEKSSPSGSDISGLFNPTLQSVGASNGEVAKGGLSSSHSLVYESEKGELVKCSSAAKVGKNEICEAKALAALKNHSEAERRRRERINGHLATLRGLVPSTEKMDKATLLAEVIKQVKELKKTAVEASKGFPIPMDADEVKVEPCEGSMSYSATICCDFRPEIISDLRQTLDSLPLHLEKAEISTLAGRMKNVFVFTCCKGNIDIHTEACQALARTVHQALCSVLEKASASLEFSPRTSHANKRRRLCFIETSTSSCNHGSCSC*


CDS Sequence:
>Vu_05432.1
ATGGTTCACTCCTTCTATGAGAAAAGCTCTCCTTCTGGCTCTGATATTTCGGGGTTGTTCAATCCCACTTTGCAAAGTGTTGGAGCTTCCAATGGTGAAGTTGCGAAGGGTGGCTTGTCATCGTCACATTCTTTAGTTTATGAGAGTGAGAAGGGAGAGCTGGTGAAGTGCTCTTCAGCTGCAAAGGTAGGGAAGAATGAGATTTGTGAGGCCAAAGCTTTGGCTGCTTTGAAGAATCACAGTGAAGCAGAGAGAAGAAGGAGGGAGAGAATAAACGGTCATCTTGCAACACTACGTGGCCTTGTACCATCCACTGAAAAGATGGATAAAGCCACTTTATTGGCTGAAGTGATAAAGCAAGTGAAGGAATTGAAAAAAACTGCAGTAGAAGCAAGCAAGGGTTTTCCAATCCCAATGGATGCTGATGAAGTGAAAGTTGAACCATGTGAAGGATCCATGTCTTACAGTGCAACTATTTGCTGTGATTTTCGACCTGAAATAATATCTGACCTAAGACAAACCCTTGATTCTCTTCCACTGCATCTAGAGAAGGCAGAAATTTCAACTTTGGCAGGAAGAATGAAGAATGTATTCGTCTTCACATGTTGCAAAGGGAACATTGATATTCATACTGAAGCATGCCAAGCTCTTGCAAGAACTGTTCATCAGGCCCTGTGTTCTGTACTGGAAAAGGCTTCTGCCTCACTTGAGTTCTCACCCAGAACATCTCATGCTAACAAGAGGAGAAGACTGTGCTTTATTGAAACATCCACTTCCTCATGCAACCATGGATCTTGTTCGTGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_05432::LG1:81540787-81542787(-)
CTCTTCATTCAAATAAAGGACATTTTGCTACCTCATAAAATGAAAAAGATCCTTTACTTTTCGGATGCGTCAAGAGTGCAAATTTGACATGGTGAACGAACTAATTAAAACACATTAATGGTTAATTTAAGTTAGTAACTGTGTAAAAAAAAGTCAGTCATTTAATTAATAGTGTTAAATTTGTTTGTAATTATACTTTCTCTTTTCAAAATTACTCTTAAATGATTAATATATGGAGACAAAAATGCAATTAGGAAATTTTACTTTTAAAATCTCCTATTTTCACAAGAAAGATGAATAAAAATTCATAACAATTATATTTACAAACTAAAACAATTTAGTAAAAACTAATTAATATTAAGGACAATTAGAATTCTCTTATAGGAAAAAAAAAATCAAAACTGTATCTTATTATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATTTTCTGAGCCCGCCCTTAAGTTAAAAGCAATAACAATTTGCTAATTGTTGTTAAGTATACTTCTAAGAGATTAATTCTTTAAGTATATGATTAAGTTGCATGCATATTTGTAGGGCTCATAAAGTTGTATCTTAAAAGGGGAAGTTGAAAATTCACTAGTATATTAGAGGGATCATGACGAACTAAATCATGATTATTATTCGTATATGTGTGAATATACGAAATTGTGATTGTCAAATCAAATGCATAGCTAAAAAGTTGAATCTATAGATAATAAAGGAAGTGAAGGATACATGCATCATTAAAATTTACAAAGAAAGAACATCATGGAATGTCCATATAATTTAATTGAAATATTAATTACACTATGAACAAGAAAAAGTCATCAAAGATAAGATTAGGTATTTGTCGGAACCCTTCTTATCCTACTTGTTTAATCTCTTTTCCTCCCCTTTTTATTAAATTATTGTAGGAATCTCCATGGAAATGTTAAGCATGATGATATATGGGTTGCTTCGTCCTCTTCACCCTCCTACTTTTTTTTTTAAGTTTGAAATAACTACCATTGAAGGAAGTATGTAACAACTGTACTATCACTACAACAACCTATATGCATTGTATGTGAGAACAAAAATATTACTTCTATGCAACACTTCTAATTCTCGTATATTTCACGTTATTCACGTGCTTTCTTAAATAATTATATAAGCATATTTTTATATTAACATACTTTTTGGATATAATCAAGGTGGAGGAGATTTTTTATATAACAGCGAGTTTCTTTTTTTAATGTAATGAACGGTGTAACATTTGTTATACTAGTTTATAAAATGTATCTTAGTTGTATATAGTTGAATATTTCTTCAATTTTATGATTTAACTATACATATCGCGTTAAAACTAAATAAATTGGTGGTTGGGTTTGGGTTTAAAAAATTATTCCAATGAAAAGCTCCATTTTTGGTCCTTATTTTAGTTTAGGATTAATGTTGTTAATAATATTAAGACAATAATGATCAAAGGCGTCACAAAATAATACGTAGTGATTAACGTAGTTACGATTTTATCGTCGTATAAAGTGTAGTTCTACAGAGTATTATAATAGTTTAGTGTGAAAAAAGACATGAAAATTATATTTTTATTGAAATTGCGTTATTAAAAATAGGCGTAAAAAATATTATAATAGACCCTTTAATAATGGCTATATGACTAAGCTGCGACGAAGCAACACGACTTCAAGCATCCAACCACAATGTTACCTTATCTCGCTCGCGCCACCCAAAAAGAAAATATAATTAATTATTTTGAATCAGCAATCCAATAAGTTTATATATTTATTTATTTTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATAATAAAATCACACTTTGAGAAGGAAAATTTAAGCTTGCACGCATCTAAATCCGAAGCAGCAAGAAAAGAAAAGAAATAAAAAAATATTAAATCCAATGGGTTGGTTTCCACTACTCTGAATGAATAATTCAGTAGTAACAGTGTCAGCAGAGGAGGGTGGCTATAACACATTGACCAAATAATGAACAT


Gene Sequence:
>Vu_05432(-)
AAATATAAAATATTTAGTCAACATTACGCACCACATGGATGTTTTGGTTCAAACTAAGCATATATGAGTAAGCTCAAAAATCAAGATCATTGTTCAGTGGTGATCCTCTTCTGAATTCTTTCTGCACTTTCAAGACATCAAGCATAGCATAACCTTTGTTTCTTGTCAGTACTCAAACTCACTGAAATCCAAGTCAGAGTCAAGTCTCACTTCCCAAAGTTCTTCACCCTTTTGGCCTTTTCTCATTTGGAAATGGTTGAGCTCAACACCACCAAGATGAAAACGTGGATGTTTTCACACTGATCTTCCACCCCTTTAACCCTTTCAACCCTTTTCCCTTGCCTAATGGAAGTTATGTCCAACACCATCACCAAACAGACCACAGTAACACCTTCTCAAGGCACCATCCACTTCCAAAAGCTTTCTTTCTGGTTTGCTCCTCGAACTCGTCCACCCGGTTAACTTCTTTCTTCTCTTTCTCTTGTGCCTCCACTCCCCTAAAAAGGGTTTTAACAAAAACGGCTCATGATCACAGTTTTGGTCCAAAAATCAAGCTTTTTAGAGTTTCCCTGATCGTAATTTTCCTAACCACTGCAATTCTATCTGCATAGACTGTGTTTGTCTGCAATTTAAAACCTTTAATATTATGGTTCACTCCTTCTATGAGAAAAGCTCTCCTTCTGGCTCTGATATTTCGGGGTTGTTCAATCCCACTTTGCAAAGTGTTGGAGCTTCCAATGGTGAAGTTGCGAAGGGTGGCTTGTCATCGTCACATTCTTTAGTTTATGAGAGTGAGAAGGGAGAGCTGGTGAAGTGCTCTTCAGCTGCAAAGGTAGGGAAGAATGAGATTTGTGAGGCCAAAGCTTTGGCTGCTTTGAAGAATCACAGTGAAGCAGAGAGAAGAAGGAGGGAGAGAATAAACGGTCATCTTGCAACACTACGTGGCCTTGTACCATCCACTGAAAAGGTATGTTTTTGTTCCTTCCTTTTCCTCCTGTTGGAAATTTGTTCTTTTATTGTGCATGCCTTATTACATCACTGAATTATTTCGGCTCCTTACTTTCCTGATTTCACTTTGATTCTATAATTGGACAGCGACTGATTCAGAAATTTTAAGTGAGAGGACTGTAATCATATATATAAATTTGTGGGGACAATACAATACTCACTTTTCTGTGCTAAATGTGGGGCAATATTTCACTGCATTCAAATTTAGGACGAGATTTGTTATTATACATGTATATTGGGAACCTTAGTTAATCTAAGTAAGACTTTTTTAAAATTGCCCTACTTATGCTAAAAATGGATTTAATCATATAGCATTTCTAAATTTTTCTATCTAGCCAGTTCTTTCATAAGAACAGTGACAAGTTTCAATGAAACACGTATTCTGTTGGTGATATGAAAAAGGAATAACAGATTTGATAGAAGGATGAAGCAGGGTGAAAAACCATTATGCAGACTTCGTGTTACGTTGAATCAGTTTAAGTTGAAGGAAGATGGAAATGCAAACTATTCTACCGGGGAGAGTTGAAAATAAAAAATTAGAGCAAGAAAACATATTTTGAGTTATCAATGAGCTACTTGACAAAAACAAAATACTGACTTTTGACACATTAGGACAGTTTTAAACACAAAGCTCGCTTATGGTAATTTTATTTTCAGTTATGTCATAATGCTTGTGGCTGTGAATGCACGTTTCCCTTTCGGGCTCCATGTTAATTTTGGAAATAGAATGGAGCTCAGAGTCTGCTGTATATAAGCACCACAAGTTGAGATTTGAAGCACATTATTGTAATTAAATAAAGGGCTTTTGATTGCATCATAGTTGTCCTTATGTGGTCAACTAGGTGTATGGTAGTTGCTCCTTGCTAGAGTCAACTACCAATATGCATCAGTTGATTATGTAATGTGGAGTTATTTATTATGAATCCTCACTTATTATACTTCATGTTATAATATATTGTTTTAGGATTTCATATTCTATACTTCTAAACCGAAAACCCTTCATTTATTATTCTATAAGTTATGCACATGCAAACCAGATGTTTCCTCTCTGTGCACCATGTCATTAGGTGAGTATTACTGCTGTAGATTATTGTTCATTTACTTGTGCTAGGTGCCCAAATATAGCTTCTGATATTAATACTACTTTATTTGTTAAAAGGTTACTGGTTTAGTTGGATTGCCACTTTTTTCTGGGTTTTTCCTTTAACAAGTCATATGAATCAAATTATAAAACATTAAACACAGTAGAATGTCAATTTTGACCAAGTATTTTAATTTGATGGTCCTTATCAAAGGAAAAAAAATAAAGGAGCATAAATGTCATCTCTCAATCAGATTGATAGGATATTCCTATCAAGTGTTGTCGTAGACGTGCCAGCTGTTCTTCTGGGTGTCATATGGCAGAGTCAGTGTATTTAAATATTAAGCGATAGTTTGTGTTTTGCATGTTTTGTCTTGTATTGTTGAACAGACATATTCTTTTTGTTGGCTAACTGATAATGGTGACGAAGGACATGGAGGGAAAACTATCATATGTTTTTTAAGCATTGGTTAACCAAAACTAAAGAGTAGTTAGAGACTTAGTTTAATCAAATACCATAATTAGTATAATTACTGGATTTGGCTTCATTTGTAATGAAGTTATCATACTTATTCAAGCCACCATCACCACAGTATCAATCAACTTGAGTTATCACTTATCACTCTAATTGGCTTAAGCTGAAGTCATGTTGATAGGTACGAGAGGTGATAATGAAAACAATAATGGTAGTAATTAATCCATGAGGTCACTGTCCCAGTCATAAAAAAACAGTAGCACTGTTTTTATTTTTTTATTGTCTGACTAGAAATATTATTGTACTTTTTATTTCTGATCATACTCTCTTTGCTTTAGTAAAACATTTGTTAAAATCTGTTGATTTTGATTTTGTGGGTCAATGGTTATTCCTTAGATGGATAAAGCCACTTTATTGGCTGAAGTGATAAAGCAAGTGAAGGAATTGAAAAAAACTGCAGTAGAAGCAAGCAAGGGTTTTCCAATCCCAATGGATGCTGATGAAGTGAAAGTTGAACCATGTGAAGGATCCATGTCTTACAGTGCAACTATTTGCTGTGATTTTCGACCTGAAATAATATCTGACCTAAGACAAACCCTTGATTCTCTTCCACTGCATCTAGAGAAGGCAGAAATTTCAACTTTGGCAGGAAGAATGAAGAATGTATTCGTCTTCACATGTTGCAAAGGGAACATTGATATTCATACTGAAGCATGCCAAGCTCTTGCAAGAACTGTTCATCAGGCCCTGTGTTCTGTACTGGAAAAGGCTTCTGCCTCACTTGAGTTCTCACCCAGAACATCTCATGCTAACAAGAGGAGAAGACTGTGCTTTATTGAAACATCCACTTCCTCATGCAACCATGGATCTTGTTCGTGTTGATGTCAACAATTTCATGTGTTATGTTCTTTATTTCATGTGTTACAAAGTGTGGCATTAGTAGCATCACACTTCACTGTATGTTGTCAAACATATTTTCTATTACTGGGTCAATCTCATTAAGTGATAAATGAGATTCATTAAATAAGATGTTATACCATCATGAAAATCGCGTTTATCCAATAATAGAAATTGTGTTATAGAGTTTAT