Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05366 LG1 80543091 80548695 "putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 family, partial "
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 80543654 intron_variant
G/C 80543707 intron_variant
T/A 80547193 downstream_gene_variant
A/G 80547363 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05366.1
MLYGLLPLLGMLAFLGMQLPVIMAVMIVFPVIGKLQCDEKGLTDCPLNFTGSNFTLASSLCSNHGDRGKCCRYINTNVAIAVSRFANATGNLGVSQNATDICLQTIFQTLQLNGVAQNATAFCGFGTKIPVNYEFLESTPSLPAPKASPSPPVSDGPSQPLLSAPLKGKHHSYRLTLVPGIAIAVTAVAVITLIVLIVLIRQKSRELDKPDNFGKPCSKTLPPCTTWKFQEGSSSMFRKFSYKEIKRATEDFSTIIGQGGFGTVYKADFSDGLVAAVKRMNRISEQGEDEFCREIELLARLHHRHLVSLRGFCIQKRERFLLYEYMGNGSLKDHLHSPGKTPLSWRTRIQIAIDVANALIADFGLAQASKDGSVCFEPVNTEIRELRVIWILRRRAIQDNKNLVEWAQPYMESDTRLLELVDPNVRESFDLDQLQTVISIVAWCTHREGRARPSIKQVLRLLYETSEPMHSEFLQTVEDEECQGSQHRGRRSKGKMLRNEALFHSGEGRYLASSSSTSRSYCSRSFLLETGSPQSPPNMFSV*


CDS Sequence:
>Vu_05366.1
ATGCTCTACGGGCTTCTCCCTTTGTTGGGAATGTTGGCTTTTCTTGGAATGCAGCTTCCTGTCATAATGGCTGTTATGATTGTTTTCCCCGTTATTGGGAAACTTCAATGTGATGAGAAAGGATTGACAGATTGCCCTTTGAATTTTACTGGTTCAAACTTCACACTTGCATCCTCTCTATGCTCTAACCATGGTGACAGAGGAAAATGCTGCCGATACATCAATACTAATGTTGCAATTGCTGTTTCTCGTTTTGCTAATGCAACAGGCAACCTAGGGGTCTCTCAAAATGCGACTGACATCTGCCTCCAAACCATATTTCAAACCTTGCAACTTAATGGAGTTGCACAAAATGCAACAGCTTTCTGTGGTTTCGGAACAAAAATTCCTGTTAATTATGAATTTTTAGAGTCAACCCCATCCTTGCCTGCTCCTAAGGCTTCTCCAAGCCCACCTGTTTCTGATGGCCCAAGTCAACCATTGTTAAGTGCACCTTTAAAGGGAAAGCATCATTCATATCGTTTGACGTTAGTTCCAGGTATTGCTATTGCAGTTACAGCTGTTGCTGTTATCACACTCATAGTCTTGATAGTTCTAATTCGCCAGAAAAGCAGAGAGCTAGACAAGCCTGATAATTTTGGTAAACCCTGTTCGAAAACCTTACCACCTTGTACAACATGGAAATTTCAGGAAGGTTCTTCATCTATGTTCCGAAAATTCAGCTACAAGGAGATAAAAAGGGCTACAGAGGATTTTAGTACTATCATTGGTCAAGGGGGATTTGGAACTGTGTATAAAGCTGATTTTTCTGATGGCCTGGTCGCAGCAGTAAAACGGATGAACAGAATATCTGAGCAGGGAGAGGATGAGTTCTGCAGAGAAATTGAGCTTCTTGCCCGGCTGCACCATCGGCATCTTGTTTCCTTGAGAGGCTTTTGCATTCAAAAACGTGAGAGGTTTCTATTGTATGAGTACATGGGAAATGGAAGCTTGAAAGATCATCTTCATTCCCCTGGTAAAACACCTTTAAGTTGGCGAACAAGAATCCAAATTGCCATTGATGTGGCCAATGCCCTGATAGCTGATTTTGGTCTTGCACAAGCTTCAAAAGATGGATCGGTATGCTTTGAACCTGTAAACACTGAAATTCGGGAACTCCGGGTTATATGGATCCTGAGAAGACGAGCCATTCAAGATAATAAGAATCTAGTAGAATGGGCCCAACCATACATGGAATCAGATACGAGATTATTGGAGCTAGTAGATCCCAATGTGAGGGAATCTTTTGACTTGGATCAGCTCCAAACAGTAATATCTATAGTAGCATGGTGCACCCATAGAGAAGGAAGGGCAAGGCCTTCAATAAAACAGGTACTTAGGCTTCTGTATGAAACATCAGAACCAATGCACAGTGAGTTTCTACAAACTGTTGAAGATGAAGAATGTCAGGGAAGTCAGCACAGAGGCAGAAGAAGCAAGGGGAAAATGCTCAGAAATGAAGCATTGTTTCACAGCGGAGAGGGAAGATATCTTGCTTCATCTTCGAGTACATCCCGGTCATATTGCAGTAGAAGTTTTTTACTTGAGACTGGCTCTCCACAGTCTCCGCCAAATATGTTCTCTGTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_05366::LG1:80541091-80543091(+)
GCACCTTATCAATTTTTCTCAAAGTTCTGACGAAATGTTAAAGTATGACCGTAGAAAGTAAAAAAAAAAAGAAGTGACATTTTATTATCAAAAAACAGCGTGTTTTGACTTATATTATTTTTTTATGGCACATTATCATTTTGTTTCAAAATTAATAGATTAGAAAATGTACATGTAATTCAAAAGTTTCAAAACTAAAAAGAAATTTAATGACAAAATTTGTAAAAGGATGATAACTGAGTAGTAAAGGGGAACATTAAGAAGAAATAACCCTAACACAAATGAAAACAACCCAAATTAAAAACACTAAAATTTAATTAACCAGTTGGACAAAATTGCATATTAATTTAGTAAACAGAATAGAAAAATAAGACTATGAATAGTGTAACACTTTCATAATTTCTTGTGTTGTATGAAATAAGTCGGAGATTTTTCATATGTCAAACAGAAACAACTATGCTATAAAAGTTGGATTGTAAGTTGGATTCCCATACAAGTTTTTATTATATAAACTTGGGTATGAAAGAAAGAAGAAGAAAAAGAATGTTCAGAGTTTTAGTATGAGGATTAAGTATTCCATTAACTAAAAATAAATAAAAAAAAATTGATATCTATTTATAAGAAATTGATGTGTTTTTTTTAAGAGGATAACAAATTACCAATTGGTTATGAATTTAATTTACATAAAATATTAATATCATTTTTAACTTAAAATTTTAAGAAAATAATTTTATAATTTTTTTCAAATAATTTTTAATCACTTTTATTTTAATGTGAAACTTAGGTTTAAAATTCACTTATGTTAGAATGATATAACTCATTAATAGGAAAGTTTGAAGAAAAGGATGTATGGTAAATATTTAGATTTTAAAGAAACGTGGTGTGTTGGTTTTTTTATATTGGTAATGGTAGGGATGGATTTCCAGAGTGTAAAAAAAATGTGCAGTGGTTGATTTGAAGAGAATATGGAGGGATTGGAGGATGACATTGTAGGGCAAGAGAAGAGAAGAAGCACATAATATAGGCACATGTATGAAGTGATAGGTCCCACACATGCTCACATGCTCATTGCAACTAAATCCATGACATTTTTCTTCCATCATTCATATGCTGATGGAGACTTATGAGACAAAACCAAATATCAATAACAAACACTCAACATTTTTTATACTTTTACCTTCCATAAGAAAAGAATCTCACTGCCGACGCTCCCAACATTTTTTTATAAACAAAATTATTTACAGAAAAGCTTATAAATCTTTTAAACTAATTTGGTTCTAGTAACAAATGCTTTGTTCATGTGAAATTTTCAGATTTTCTTGTGTGGTATCAAACTAAAATGATAAACTACTCAAATGGTAAACTTAATCTAATTAACGTTATAAAATCAAATAGTAATCAAATTTAGCCTCATAAATGCAACACCACCATTTCACAGGTCTTTCTCCTTTGTGTTGGTTTCAACTCTTCCTCACTTATCAAATCAACCGTTTGTAAAGAGAGAATTTTACATCTATATTATAATTTGTTCTTATTACGTGCTCCATTAAACACCGTAAAGATTTAAAATTTAATTTAAAAAACTGATATTTATTAAGAATGAATTTCTTTTTGGTGTGTGCAGTGTCTTTGAGAAGTTTGATGAAGAATGAGAAAAATGAAAGGGAGAGCCTCTGGTGTACTGTGGAATATGAAACAAATAAAGGTATACCCCACGAAAGCATCAATTAAAATTGTTGTTCTTCCTCATCAGTGCGCATTTATTCAGAGCCAAACAAACAAAAGTACAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACATTCACACGCCCACACACCCACCGGTCTTTCTGAAAAGTCTAATAAAACCTATTGTAGCAGCCAGAACGGTGAATGGTGTTCCCAAAATGGGTGGTTAAGACACACAATACACATAAACACACTCTTTCATTTCAAGTCCTCATCTTTCTTCTCTACCAACTACTCCACCA


Gene Sequence:
>Vu_05366(+)
ATGCTCTACGGGCTTCTCCCTTTGTTGGGAATGTTGGCTTTTCTTGGAATGCAGCTTCCTGTCATAATGGCTGGTTAGTTCCTTCAAAAGTTCTTTCCTTTTTTAGCTTTGCTTCAATATCTTCCACCCTTTTGCCTTATTACGATACTGGGTACACAAACTGCTGCATTCATTTCTGGAATATGTCTTTTACCCATCACGGGTAAGGAATGGTGTCGAGGTAGGAATTAATGATAACGGCTATTTAATAATGCTAACACTTGGAACTTGTGGGTGATGTTCTTGGCGCATTTATACGTTGGTCTTAGTTATGATTGTTTTCCCCGTTATTGGGAAACTTCAATGTGATGAGAAAGGATTGACAGGTGTTAATGAATCTGGACAGTTATGCACATTGTCAATTTGTTACTAACATTTCTCTCACCTTGTTTCTCTTCCCTTTTTCTACACCAAAGTCACATTTAGGACCAAATATCTTGATGGAATTGTGGTACAACAAAAGCTTTTACCACCTGAATGGTTGCAGAAATTAATATGCAAAAGCTTTTATCACAAATTCACATTTGCTCTAGGTTTGCCCATAGAGAAACCTGAGTTTTTACCTTCTAAAAGAGCAGAAAGCAGAAGCATTTGGCCACATTTAACCTATATTAGAAATAGATAAGGCTATCCTGCAAATCCGATATTGTGTTGTACTTTTTACTGGTATATAAACTCTAGAAAATGGAACTGTTTTGAACTCTGATGAAATTGAAAACATGTTATCGGTGACATAGAATAGTTACAACGCCTTTCCCAATTGTCAAGAATTTCATCATTGCTGTCCCTATTATTTTACTTCAATTAATGTAAAATACACCCTTATCCCGCAACTTCTCAGTTAAAAAGTTACACTCATCTCTATTCAGAGATCAATAAGTGTTTCACTTTACCCCGTTTTAGTATAATTAGTGTGTGTGAGGATGATTAACTGTGAATTGGCCTCCTAAGTTTGTTTTTCTTTTTATTCCAATTTTTACAATCACTGATAACTAATTTTGTGATTATTATGAATTTTTGGACTTCAGTAAATGAAATGATGGTTTGTGAATTCATATTATTAACTTGAAACTTCCTTAAAAGTGTTCATTTAATCTTCTATACTCTCAATGTTCACGGTAAAAGATTCAAAATCAGTTTCAAACAATGTTGACAGTCAGTAAAAGAGAAACATTTGACCTTAAGAGGTTTCTTTAAGTAAAGATGGACTAAATTGTAGCACATATTATTAATCTGAGGGGAGGAAAGTGTAATTTTAAAATATGAATAGAGGATGGTATAATTTTAGCGTCTCTCTAGGAAGGGGCTTTAATCTGTTCATTTAAATTATAATTTCAGATCAGTATTTATTTGGCTTGTGCTTTGAGTCCAAAAGTCATTTGCTTGCATTTTAGGGATATAAATCACGTACAATCTTATTGTTTTCCACAGCAAAAGGAAAATAAGTGAATTGAAGAACTCGCCGTAACCATCCTATAAGAATGCTCACGAGTAAAAAAAAATCCATAAAATTGTAATAAGTTCATTTTCATTCCATTATATGTCAAAGTATATCTTTACTCCAATATAATATATACCTATTGCCTATTGAACATCAGGCCCAGAGCTTGCACTGCAAACCTAAGCAGTAAAATCATTTTATTGAGATAGACGCTCTTCCACAATATTTTGACATGTTCAAGATTTATTCTAGGGGAATCATGACATGGTCAAGGTGCCAAAAACTTTCATGGTGCACATATTGTGACTGTAAAGACTAAACAGTAATAATCATAGAACTATGTATTCAAAACTAATACTGCAAGAATGTCATGAAATGAACTAAGATTGGACCTGTTTTGTGGTGTAGTTTTTATCTCATGCATTCTGAAAACTTCCACAGAAACTGAATATGTTTTTACAGTTTCTCTAACCGTTGCCATGAGGGAAATGATTAACAAATAGAAAGATTTTATTGGAAATCATGGTAGAGATGCAATGGTAATATTTGGAAGTAATATTTTATAGTAAATTTTTCCCTTTTGATTCTTGAACCATCCATTTCCTTTAGCGTAATGGTTAGCAAAACTGCCATCCTTATATTAATAATCTCAGCTTGACTAGTCAATCTTTTAATTGTACTATAGTAAATTGTTGGCAATTCAGGTGAAGGATTAAATGTGGTTTAATGGTCTAATATTGCTCCTCCTTTTGCAGATTGCCCTTTGAATTTTACTGGTTCAAACTTCACACTTGCATCCTCTCTATGCTCTAACCATGGTGACAGAGGAAAATGCTGCCGATACATCAATACTAATGTTGCAATTGCTGTTTCTCGTTTTGCTAATGCAACAGGCAACCTAGGGGTCTCTCAAAATGCGACTGACATCTGCCTCCAAACCATATTTCAAACCTTGCAACTTAATGGAGTTGCACAAAATGCAACAGCTTTCTGTGGTTTCGGAACAAAAATTCCTGTTAATTATGAATGTAAGGGGAGAACTAGTGTTGTCCAAATGTTGCAATCCCCCAGATTTACGGAGGTCACAAAAAATTGCAAAGCGCCACTTGGAGAGGAAAGTAAATGTAAGAAGTGTTTAAATGCTGGCATTGGTTATCTGCATCATATCGGAATTGAAGATAATATAACACTTAGTACATGTCGTGATGCCACTTTTGCTGCATTAGCAAGCCAAGTTGATGAGATATCTACCATTGACATTGCAATTTGTTTCTTTGGGGTTCAAGGACTTCTCAAGCTTCCTGGTAAGAATTTTATAAAGTAAAAAAGCTAATGATAATCAGTTTGATCTGCTCCCTCTTCAGGTCACTGTGTGAATGAGTTCCTTCACGTGTTAATTCTACTGCATAGATTAAATGATTATGGCCTTGAGATTTATTATGATGTAAAGCCAATAAAATGGATGAGATCTCTACTTCAGAATGTTGTAGTTCCTCTTTGTAATTGCTTCTAAATAAACAAGCAATTGTTGCACATATACTTTCCATTGGTATGAATGACAAGGATAGAAAACAGTATAACTAAACTACGCATTGAAAAAACTGTGTAAAGGGTACTAGTTAGTAGTTATAACAATTAATGTGTGCCAAATGAAGCATGTGTATTATTTTCTTTTTACACCAATAAATATTCATTCCAGGAATGCAATGAAGTCTGTGTATAGTTACCAATAAACTAAAATTTTATAGCTGATCATGCTTTTTTGCAACTGTGATGCCAGTTTTAGAGTCAACCCCATCCTTGCCTGCTCCTAAGGCTTCTCCAAGCCCACCTGTTTCTGATGGCCCAAGTCAACCATTGTTAAGTGCACCTTTAAAGGGAAAGCATCATTCATATCGTTTGACGTTAGTTCCAGGTATTGCTATTGCAGTTACAGCTGTTGCTGTTATCACACTCATAGTCTTGATAGTTCTAATTCGCCAGAAAAGCAGAGAGCTAGACAAGCCTGATAATTTTGGTAAACCCTGTTCGAAAACCTTACCACCTTGTACAACATGGAAATTTCAGGAAGGTAAGGTTTTGGTTGATCATTCTTGTTAGTGATATATTATTGAAACTAGCACACCATTTTTTCTTATTTTGCTTCCTGGTTGGGGTGTGTTGAGCAGGTTCTTCATCTATGTTCCGAAAATTCAGCTACAAGGAGATAAAAAGGGCTACAGAGGATTTTAGTACTATCATTGGTCAAGGGGGATTTGGAACTGTGTATAAAGCTGATTTTTCTGATGGCCTGGTCGCAGCAGTAAAACGGATGAACAGAATATCTGAGCAGGGAGAGGATGAGTTCTGCAGAGAAATTGAGCTTCTTGCCCGGCTGCACCATCGGCATCTTGTTTCCTTGAGAGGCTTTTGCATTCAAAAACGTGAGAGGTATCTGTTTCTGTGTTTTTTATATTCTTCGACATATATACCAATGAATCAAACTCTTCTGAATGTCTATGGCAGGTTTCTATTGTATGAGTACATGGGAAATGGAAGCTTGAAAGATCATCTTCATTGTATGCCTCTCGATTTCCATAGATTGTTGTTCCTTAAAAAAAAAACAAATAAATACATTCACGCTCACTGTTTTGAATAATATTCTACTTTCGATAATATTTGGTCAAATTACAAATGGCACTTCTATCTGCATCCCTTGTGCTTGTATCTATTATGTGGATCTTATGTGCTTTCTTTCCTGCATCTTTTTTCTAACTCAGTACCTTCAGCCATATTAAACATGACAATTCAACATGTGCAACAAAACTATAGCATTTGAATAGCGAGGAAACAGATAATTATCATTGCTTCTTTTCCCTGTTAACCCCTTAATCTCACGTAAGATACTTTTGTTCATTTGTACAGCCCCTGGTAAAACACCTTTAAGTTGGCGAACAAGAATCCAAATTGCCATTGATGTGGCCAATGCCCTGGTAATAACTGCCATTGGTTTAATTTCAAGCTTATCAAAATCGAGTGGCTGAATGTTTTTCATCCTTTATTCTCTTTATGCATGGATTTTACTTTTTAACCTCACATTCTTTCACGTGCAGGAGTACCTCCATTTCTATTGCGATCCTCCTCTGTGTCACAGAGATATTAAATCTAGCAACACTTTACTGGATGAGAACTTTGTTGCCAAGGTTGGATGATTTTCGCACTGTATGCCAGCATTTCACCTGTTAATATTCACTGTCTTTTCAGCCCGAGTTTGAAACATTGCAAAGAATTTTTGATTTATGTATGGATAGGGTAAGATGCTGTCAATTGTTAACTAATTCCTTTATACCTGTATTACATCATTTTCACAGATAGCTGATTTTGGTCTTGCACAAGCTTCAAAAGATGGATCGGTATGCTTTGAACCTGTAAACACTGAAATTCGGGAACTCCGGGTAACAAATTCTTTTCTTCACTATATTTTACTTAGCTGATTTTAGATTTTTACGTGATTTAAAGGAGGGTTCTATATCCAGGGAACTACAGCTATAAACCTTCATCATTGACAATACTTAATTTTGGATGTTAAATTCAATTCCAGGTTATATGGATCCTGAGTATGTTGTTACTCAAGAGCTCACCGAGAAAAGTGACATATACAGTTTTGGGGTATTACTACTTGAAATTGTAACAGGAAGACGAGCCATTCAAGATAATAAGAATCTAGTAGAATGGGCCCAACCATACATGGAATCAGATACGAGATTATTGGAGCTAGTAGATCCCAATGTGAGGGAATCTTTTGACTTGGATCAGCTCCAAACAGTAATATCTATAGTAGCATGGTGCACCCATAGAGAAGGAAGGGCAAGGCCTTCAATAAAACAGGTACTTAGGCTTCTGTATGAAACATCAGAACCAATGCACAGTGAGTTTCTACAAACTGTTGAAGATGAAGAATGTCAGGGAAGTCAGCACAGAGGCAGAAGAAGCAAGGGGAAAATGCTCAGAAATGAAGCATTGTTTCACAGCGGAGAGGGAAGATATCTTGCTTCATCTTCGAGTACATCCCGGTCATATTGCAGTAGAAGTTTTTTACTTGAGACTGGCTCTCCACAGTCTCCGCCAAATATGTTCTCTGTGTGA