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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05345 LG1 80210075 80215678 "putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g06840 family, partial "
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   extracellular region, plasma membrane
Molecular Function   enables   kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity, protein kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 80210516 intron_variant
A/T 80214343 downstream_gene_variant
T/C 80215016 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05345.1
MLYGLLPLLGMLAFLGMQLPVIMAVMIVFPVIGKLQCDEKGLTDCPLNFTGSNFTLASSLCSNHGDRGKCCRYINTNVAIAVSRFANATGNLGVSQNATDICLQTIFQTLQLNGVAQNATAFCGFGTKIPVNYEFLESTPSLPAPKASPSPPVSDGPSQPLLSAPLKGKHHSYRLTLVPGIAIAVTAVAVITLIVLIVLIRQKSRELDKPDNFGKPCSKTLPPCTTWKFQEGSSSMFRKFSYKEIKRATEDFSTIIGQGGFGTVYKADFSDGLVAAVKRMNRISEQGEDEFCREIELLARLHHRHLVSLRGFCIQKRERFLLYEYMGNGSLKDHLHSPGKTPLSWRTRIQIAIDVANALIADFGLAQASKDGSVCFEPVNTEIRGTPGYMDPEYVVTQELTEKSDIYSFGVLLLEIVTGRRAIQDNKNLVEWAQPYMESDTRLLELVDPNVRESFDLDQLQTVISIVAWCTHREGRARPSIKQVLRLLYETSEPMHSEFLQTVEDEECQGSQHRGRRSKGKMLRNEALFHSGEGRYLASSSSTSRSYCSRSFLLETGSPQSPPNMFSV*


CDS Sequence:
>Vu_05345.1
ATGCTCTACGGGCTTCTCCCTTTGTTGGGAATGTTGGCTTTTCTTGGAATGCAGCTTCCTGTCATAATGGCTGTTATGATTGTTTTCCCCGTTATTGGGAAACTTCAATGTGATGAGAAAGGATTGACAGATTGCCCTTTGAATTTTACTGGTTCAAACTTCACACTTGCATCCTCTCTATGCTCTAACCATGGTGACAGAGGAAAATGCTGCCGATACATCAATACTAATGTTGCAATTGCTGTTTCTCGTTTTGCTAATGCAACAGGCAACCTAGGGGTCTCTCAAAATGCGACTGACATCTGCCTCCAAACCATATTTCAAACCTTGCAACTTAATGGAGTTGCACAAAATGCAACAGCTTTCTGTGGTTTCGGAACAAAAATTCCTGTTAATTATGAATTTTTAGAGTCAACCCCATCCTTGCCTGCTCCTAAGGCTTCTCCAAGCCCACCTGTTTCTGATGGCCCAAGTCAACCATTGTTAAGTGCACCTTTAAAGGGAAAGCATCATTCATATCGTTTGACGTTAGTTCCAGGTATTGCTATTGCAGTTACAGCTGTTGCTGTTATCACACTCATAGTCTTGATAGTTCTAATTCGCCAGAAAAGCAGAGAGCTAGACAAGCCTGATAATTTTGGTAAACCCTGTTCGAAAACCTTACCACCTTGTACAACATGGAAATTTCAGGAAGGTTCTTCATCTATGTTCCGAAAATTCAGCTACAAGGAGATAAAAAGGGCTACAGAGGATTTTAGTACTATCATTGGTCAAGGGGGATTTGGAACTGTGTATAAAGCTGATTTTTCTGATGGCCTGGTCGCAGCAGTAAAACGGATGAACAGAATATCTGAGCAGGGAGAGGATGAGTTCTGCAGAGAAATTGAGCTTCTTGCCCGGCTGCACCATCGGCATCTTGTTTCCTTGAGAGGCTTTTGCATTCAAAAACGTGAGAGGTTTCTATTGTATGAGTACATGGGAAATGGAAGCTTGAAAGATCATCTTCATTCCCCTGGTAAAACACCTTTAAGTTGGCGAACAAGAATCCAAATTGCCATTGATGTGGCCAATGCCCTGATAGCTGATTTTGGTCTTGCACAAGCTTCAAAAGATGGATCGGTATGCTTTGAACCTGTAAACACTGAAATTCGGGGAACTCCGGGTTATATGGATCCTGAGTATGTTGTTACTCAAGAGCTCACCGAGAAAAGTGACATATACAGTTTTGGGGTATTACTACTTGAAATTGTAACAGGAAGACGAGCCATTCAAGATAATAAGAATCTAGTAGAATGGGCCCAACCATACATGGAATCAGATACGAGATTATTGGAGCTAGTAGATCCCAATGTGAGGGAATCTTTTGACTTGGATCAGCTCCAAACAGTAATATCTATAGTAGCATGGTGCACCCATAGAGAAGGAAGGGCAAGGCCTTCAATAAAACAGGTACTTAGGCTTCTGTATGAAACATCAGAACCAATGCACAGTGAGTTTCTACAAACTGTTGAAGATGAAGAATGTCAGGGAAGTCAGCACAGAGGCAGAAGAAGCAAGGGGAAAATGCTCAGAAATGAAGCATTGTTTCACAGCGGAGAGGGAAGATATCTTGCTTCATCTTCGAGTACATCCCGGTCATATTGCAGTAGAAGTTTTTTACTTGAGACTGGCTCTCCACAGTCTCCGCCAAATATGTTCTCTGTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_05345::LG1:80208075-80210075(+)
ACGCACCTTATCAATTTTTCTCAAAGTTCTGACGAAATGTTAAAGTATGACCGTAGAAAGTAAAAAAAAAAAGAAGTGACATTTTATTATCAAAAAACAGCGTGTTTTGACTTATATTATTTTTTTATGGCACATTATCATTTTGTTTCAAAATTAATAGATTAGAAAATGTACATGTAATTCAAAAGTTTCAAAACTAAAAAGAAATTTAATGACAAAATTTGTAAAAGGATGATAACTGAGTAGTAAAGGGGAACATTAAGAAGAAATAACCCTAACACAAATGAAAACAACCCAAATTAAAAACACTAAAATTTAATTAACCAGTTGGACAAAATTGCATATTAATTTAGTAAACAGAATAGAAAAATAAGACTATGAATAGTGTAACACTTTCATAATTTCTTGTGTTGTATGAAATAAGTCGGAGATTTTTCATATGTCAAACAGAAACAACTATGCTATAAAAGTTGGATTCCCATACAAGTTTTTTATTATATAAACTTGGGTATGAAAGAAAGAAGAAGAAAAAGAATGTTCAGAGTTTTAGTATGAGGATTAAGTATTCCATTAACTAAAAATAAATAAAAAAAAATTGATATCTATTTATAAGAAATTGATGTGTTTTTTTTAAGAGGATAACAAATTACCAATTGGTTATGAATTTAATTTACATAAAATATTAATATCATTTTTAACTTAAAATTTTAAGAAAATAATTTTATAATTTTTTTCAAATAATTTTTAATCACTTTTATTTTAATGTGAAACTTAGGTTTAAAATTCACTTATGTTAGAATGATATAACTCATTAATAGGAAAGTTTGAAGAAAAGGATGTATGGTAAATATTTAGATTTTAAAGAAACGTGGTGTGTTGGTTTTTTTATATTGGTAATGGTAGGGATGGATTTCCAGAGTGTAAAAAAAATGTGCAGTGGTTGATTTGAAGAGAATATGGAGGGATTGGAGGATGACATTGTAGGGCAAGAGAAGAGAAGAAGCACATAATATAGGCACATGTATGAAGTGATAGGTCCCACACATGCTCACATGCTCTTGCAACTAAATCCATGACATTTTTCTTCCATCATTCATATGCTGATGGAGACTTATGAGACAAAACCAAATATCAATAACAAACACTCAACATTTTTTATACTTTTACCTTCCATAAGAAAAGAATCTCACTGCCGACGCTCCCAACATTTTTTTATAAACAAAATTATTTACAGAAAGCTTATAAATCTTTTAAACTAATTTGGTTCTAGTAACAAATGCTTTGTTCATGTGAAATTTTCAGATTTTCTTGTGTGGTATCAAACTAAAATGATAAACTACTCAAATGGTAAACTTAATCTAATTAACGTTATAAAATCAAATAGTAATCAAATTTAGCCTCATAAATGCAACACCACCATCACACAAAGTCTTTCTCCTTTGTGTTGGTTTCAACTCTTCCTCACTTATCAAATCAACCGTTTGTAAAGAGAGAATTTTACATCTCACCTGTGTATTATAGTTTTTGGTCTTATTACGTGCTCCATTAAACACCGTAAAGATTTAAAATTTAATTTAAAAAACTGATATTTATTAAGAATGAATTTCTTTTTGGTGTGTGCAGTGTCTTTGAGAAGTTTGATGAAGAATGAGAAAAATGAAAGGGAGAGCCTCTGGTGTACTGTGGAATATGAAACAAATAAAGGTATACCCCACGAAAGCATCAATTAAAATTGTTGTTCTTCCTCATCAGTGCGCATTTATTCAGAGCCAAACAAACAAAAGTACAAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACATTCACACGCCCACACACCCACCGGTCTTTCTGAAAAGTCTAATAAAACCTATTGTAGCAGCCAGAACGGTGAATGGTGTTCCCAAAATGGGTGGTTAAGACACAATACACATAAACACACTCTTTCAAGTCCTCATCTTTCTTCTCTACCTACTACTCCACCA


Gene Sequence:
>Vu_05345(+)
ATGCTCTACGGGCTTCTCCCTTTGTTGGGAATGTTGGCTTTTCTTGGAATGCAGCTTCCTGTCATAATGGCTGGTTAGTTCCTTCAAAAGTTCTTTCCTTTTTTAGCTTTGCTTCAATATCTTCCACCCTTTTGCCTTATTACGATACTGGGTACACAAACTGCTGCATTCATTTCTGGAATATGTCTTTTACCCATCACGGGTAAGGAATGGTGTCGAGGTAGGAATTAATGATAACGGCTATTTAATAATGCTAACACTTGGAACTTGTGGGTGATGTTCTTGGCGCATTTATACGTTGGTCTTAGTTATGATTGTTTTCCCCGTTATTGGGAAACTTCAATGTGATGAGAAAGGATTGACAGGTGTTAATGAATCTGGACAGTTATGCACATTGTCAATTTGTTACTAACATTTCTCTCACCTTGTTTCTCTTCCCTTTTTCTACACCAAAGTCACATTTAGGACCAAATATCTTGATGGAATTGTGGTACAACAAAAGCTTTTACCACCTGAATGGTAACAGAAATTAATATGCAAAAGCTTTTATCACAAATTCACATCTGCTCTAGGTTTGCCCATAGAGAAACCTGAGTTTTTACCTTCTAAAAGAGCAGAAAGCAGAAGCATTTGGCCACATTTAACCTATATTAGAAATAGATAAGGCTATCCTGCAAATCCGATATTGTGTTGTACTTTTTACTGGTATATAAACTCTAGAAAATGGAACTGTTTTGAACTCTGATGAAATTGAAAACATGTTATCGGTGACATAGAATAGTTACAACGCCTTTCCCAATTGTCAAGAATTTCATCATTGCTGTCCCTATTATTTTACTTCAATTAATGTAAAATACACCCTTATCCCGCAACTTCTCAGTTAAAAAGTTACACTCATCTCTATTCAGAGATCAATAAGTGTTTCACTTTACCCCGTTTTAGTATAATTAGTGTGTGTGAGGATGATTAACTGTGAATTGGCCTCCTAAGTTTGTTTTTCTTTTTATTCCAATTTTTACAATCACTGATAACTAATTTTGTGATTATTATGAATTTTTGGACTTCAGTAAATGAAATGATGGTTTGTGAATTCATATTATTAACTTGAAACTTCCTTAAAAGTGTTCATTTAATCTTCTATACTCTCAATGTTCACGGTAAAAGATTCAAAATCAGTTTCAAACAATGTTGACAGTCAGTAAAAGAGAAACATTTGACCTTAAGAGGTTTCTTTAAGTAAAGATGGACTAAATTGTAGCACATATTATTAATCTGAGGGGAGGAAAGTGTAATTTTAAAATATGAATAGAGGATGGTATAATTTTAGCGTCTCTCTAGGAAGGGGCTTTAATCTGTTCATTTAAATTATAATTTCAGATCAGTATTTATTTGGCTTGTGCTTTGAGTCCAAAAGTCATTTGCTTGCATTTTAGGGATATAAATCACGTACAATCTTATTGTTTTCCACAGCAAAAGGAAAATAAGTGAATTGAAGAACTCGCCGTAACCATCCTATAAGAATGCTCACGAGTAAAAAAAAATCCATAAAATTGTAATAAGTTCATTTTCATTCCATTATATGTCAAAGTATATCTTTACTCCAATATAATATATACCTATTGCCTATTGAACATCAGGCCCAGAGCTTGCACTGCAAACCTAAGCAGTAAAATCATTTTATTGAGATAGACGCTCTTCCACAATATTTTGACATGTTCAAGATTTATTCTAGGGGAATCATGACATGGTCAAGGTGCCAAAAACTTTCATGGTGCACATATTGTGACTGTAAAGACTAAACAGTAATAATCATAGAACTATGTATTCAAAACTAATACTGCAAGAATGTCATGAAATGAACTAAGATTGGACCTGTTTTGTGGTGTAGTTTTTATCTCATGCATTCTGAAAACTTCCACAGAAACTGAATATGTTTTTACAGTTTCTCTAACCGTTGCCATGAGGGAAATGATTAACAAATAGAAAGATTTTATTGGAAATCATGGTAGAGATGCAATGGTAATATTTGGAAGTAATATTTTATAGTAAATTTTTCCCTTTTGATTCTTGAACCATCCATTTCCTTTAGCGTAATGGTTAGCAAAACTGCCATCCTTATATTAATAATCTCAGCTTGACTAGTCAATCTTTTAATTGTACTATAGTAAATTGTTGGCAATTCAGGTGAAGGATTAAATGTGGTTTAATGGTCTAATATTGCTCCTCCTTTTGCAGATTGCCCTTTGAATTTTACTGGTTCAAACTTCACACTTGCATCCTCTCTATGCTCTAACCATGGTGACAGAGGAAAATGCTGCCGATACATCAATACTAATGTTGCAATTGCTGTTTCTCGTTTTGCTAATGCAACAGGCAACCTAGGGGTCTCTCAAAATGCGACTGACATCTGCCTCCAAACCATATTTCAAACCTTGCAACTTAATGGAGTTGCACAAAATGCAACAGCTTTCTGTGGTTTCGGAACAAAAATTCCTGTTAATTATGAATGTAAGGGGAGAACTAGTGTTGTCCAAATGTTGCAATCCCCCAGATTTACGGAGGTCACAAAAAATTGCAAAGCGCCACTTGGAGAGGAAAGTAAATGTAAGAAGTGTTTAAATGCTGGCATTGGTTATCTGCATCATATCGGAATTGAAGATAATATAACACTTAGTACATGTCGTGATGCCACTTTTGCTGCATTAGCAAGCCAAGTTGATGAGATATCTACCATTGACATTGCAATTTGTTTCTTTGGGGTTCAAGGACTTCTCAAGCTTCCTGGTAAGAATTTTATAAAGTAAAAAAGCTAATGATAATCAGTTTGATCTGCTCCCTCTTCAGGTCACTGTGTGAATGAGTTCCTTCACGTGTTAATTCTACTGCATAGATTAAATGATTATGGCCTTGAGATTTATTATGATGTAAAGCCAATAAAATGGATGAGATCTCTACTTCAGAATGTTGTAGTTCCTCTTTGTAATTGCTTCTAAATAAACAAGCAATTGTTGCACATATACTTTCCATTGGTATGAATGACAAGGATAGAAAACAGTATAACTAAACTACGCATTGAAAAAACTGTGTAAAGGGTACTAGTTAGTAGTTATAACAATTAATGTGTGCCAAATGAAGCATGTGTATTATTTTCTTTTTACACCAATAAATATTCATTCCAGGAATGCAATGAAGTCTGTGTATAGTTACCAATAAACTAAAATTTTATAGCTGATCATGCTTTTTTGCAACTGTGATGCCAGTTTTAGAGTCAACCCCATCCTTGCCTGCTCCTAAGGCTTCTCCAAGCCCACCTGTTTCTGATGGCCCAAGTCAACCATTGTTAAGTGCACCTTTAAAGGGAAAGCATCATTCATATCGTTTGACGTTAGTTCCAGGTATTGCTATTGCAGTTACAGCTGTTGCTGTTATCACACTCATAGTCTTGATAGTTCTAATTCGCCAGAAAAGCAGAGAGCTAGACAAGCCTGATAATTTTGGTAAACCCTGTTCGAAAACCTTACCACCTTGTACAACATGGAAATTTCAGGAAGGTAAGGTTTTGGTTGATCATTCTTGTTAGTGATATATTATTGAAACTAGCACACCATTTTTTCTTATTTTGCTTCCTGGTTGGGGTGTGTTGAGCAGGTTCTTCATCTATGTTCCGAAAATTCAGCTACAAGGAGATAAAAAGGGCTACAGAGGATTTTAGTACTATCATTGGTCAAGGGGGATTTGGAACTGTGTATAAAGCTGATTTTTCTGATGGCCTGGTCGCAGCAGTAAAACGGATGAACAGAATATCTGAGCAGGGAGAGGATGAGTTCTGCAGAGAAATTGAGCTTCTTGCCCGGCTGCACCATCGGCATCTTGTTTCCTTGAGAGGCTTTTGCATTCAAAAACGTGAGAGGTATCTGTTTCTGTGTTTTTTATATTCTTCGACATATATACCAATGAATCAAACTCTTCTGAATGTCTATGGCAGGTTTCTATTGTATGAGTACATGGGAAATGGAAGCTTGAAAGATCATCTTCATTGTATGCCTCTCGATTTCCATAGATTGTTGTTCCTTAAAAAAAAACAAATAAATACATTCACGCTCACTGTTTTGAATAATATTCTACTTTCGATAATATTTGGTCAAATTACAAATGGAACTTCTATCTTCATCCCTTGTGCTTGTATCATTATGTGGATCTTATGTGCTTTCTTTCCTGCATCTTTTTTCTAACTCAGTACCTTCAGCCATATTAAACATGACAATTCAACATGTGCAACAAAACTATAGCATTTGAATAGCGAGGAAACAGATAATTATCATTGCTTCTTTTCCCTGTTAACCCCTTAATCTCACGTAAGATACTTTTGTTCATTTGTACAGCCCCTGGTAAAACACCTTTAAGTTGGCGAACAAGAATCCAAATTGCCATTGATGTGGCCAATGCCCTGGTAATAACTGCCATTGGTTTAATTTCAAGCTTATCAAAATCGAGTGGCTGAATGTTTTTCATCCTTTATTCTCTTTATGCATGGATTTTACTTTTTAACCTCACATTCTTTCACGTGCAGGAGTACCTCCATTTCTATTGCGATCCTCCTCTGTGTCACAGAGATATTAAATCTAGCAACACTTTACTGGATGAGAACTTTGTTGCCAAGGTTGGATGATTTTCGCACTGTATGCCAGCATTTCACCTGTTAATATTCACTGTCTTTTCAGCCCGAGTTTGAAACATTGCAAAGAATTTTTGATTTATGTATGGATAGGGTAAGATGCTGTCAATTGTTAACTAATTCCTTTATACCTGTATTACATCATTTTCACAGATAGCTGATTTTGGTCTTGCACAAGCTTCAAAAGATGGATCGGTATGCTTTGAACCTGTAAACACTGAAATTCGGGGAACTCCGGGTAACAAATTCTTTTCTTCACTATATTTTACTTAGCTGATTTTAGATTTTTACGTGATTTAAAGGAGGGTTCTATATCCAGGGAACTACAGCTATAAACCTTCATCATTGACAATACTTAATTTTGGATGTTAAATTCAATTCCAGGTTATATGGATCCTGAGTATGTTGTTACTCAAGAGCTCACCGAGAAAAGTGACATATACAGTTTTGGGGTATTACTACTTGAAATTGTAACAGGAAGACGAGCCATTCAAGATAATAAGAATCTAGTAGAATGGGCCCAACCATACATGGAATCAGATACGAGATTATTGGAGCTAGTAGATCCCAATGTGAGGGAATCTTTTGACTTGGATCAGCTCCAAACAGTAATATCTATAGTAGCATGGTGCACCCATAGAGAAGGAAGGGCAAGGCCTTCAATAAAACAGGTACTTAGGCTTCTGTATGAAACATCAGAACCAATGCACAGTGAGTTTCTACAAACTGTTGAAGATGAAGAATGTCAGGGAAGTCAGCACAGAGGCAGAAGAAGCAAGGGGAAAATGCTCAGAAATGAAGCATTGTTTCACAGCGGAGAGGGAAGATATCTTGCTTCATCTTCGAGTACATCCCGGTCATATTGCAGTAGAAGTTTTTTACTTGAGACTGGCTCTCCACAGTCTCCGCCAAATATGTTCTCTGTGTGA

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