Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05340 LG1 80115189 80119751 PREDICTED: transcription factor bHLH95-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 80115474 downstream_gene_variant
A/G 80115485 downstream_gene_variant
C/T 80115573 downstream_gene_variant
T/C 80115702 downstream_gene_variant
A/C 80116042 downstream_gene_variant
T/C 80116185 downstream_gene_variant
A/T 80116285 downstream_gene_variant
T/C 80116292 downstream_gene_variant
G/A 80116293 downstream_gene_variant
C/T 80116490 downstream_gene_variant
T/A 80116838 downstream_gene_variant
A/G 80116874 downstream_gene_variant
T/C 80117100 downstream_gene_variant
C/A 80117140 intron_variant
C/A 80117147 intron_variant
T/C 80117196 intron_variant
T/C 80117371 intron_variant
T/A 80117433 intron_variant
T/C 80117437 intron_variant
T/A 80117443 intron_variant
T/C 80117684 intron_variant
G/C 80117713 intron_variant
A/G 80117783 intron_variant
T/A 80118154 intron_variant
A/G 80118193 intron_variant
G/A 80118271 intron_variant
A/G 80118302 intron_variant
A/G 80118445 intron_variant
A/G 80118743 missense_variant p.Ile104Val
C/T 80119143 intron_variant
C/A 80119447 downstream_gene_variant
A/T 80119622 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05340.1
MSNDDVVDENEKKILTSGEESYDPETNNEMHLSIERGRRKKMKEMFDDLSALLPQLPSKADKATVVNEAVDYIKVLQETLEKLERKKKERAQHVLKQIMGTSSIAGSVSEKQKGFDKTWAASNMVLNIRGNEAQFSICSVHKPGLMTNIASVLEKHNIELISATISANGNGSTCMIQVHGKQASDANSMEETYRKAAEEIMPWIS*


CDS Sequence:
>Vu_05340.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05340::LG1:80113189-80115189(+)
TGTTTCACATTTTTATGGATGCATTTGGTGAATAATGCTTTCTATAAGGATGGTTTTTTTTGCATATTGAATTACAATGAAGTTAAAACAGGAAAGCTTTTATAAAAAAATATTTCTTATATTCAAATAAATAAATATATTTTTACCTTTTAAATATATAATATAACTAATAATTTTATAACATAATAAAACTAATATTGTAAGGTGGATTTAATACGTATGAATAGTTTTTGTGTAGATTTCATTGTGCAAATATTTTTAGTTCCTTCGCTGAAATTTATGGAAACAGTTACATTGTGATTTGTAAGTGAAAACACAATTAAATTAAACTACATATATAATAAATTATATTGTCAAAATAACAAATATTTTGAAGTATTTTTGTATACATAATTAATTATGAGTCAGAATAACGTAACTCGTAATAAATTAGGAGTGATGTTATATTATTATAATAATAAATAATTACAAAAATGTTATTAAAAATAATAAATAAAGTTTTTAATGAAAAATAAAATTATTTGATCTTTTATCGTTTTATATTTTCTTTTAATTTATTTAAAGAATCTCTCTTTTCACTTTTTTTCCCTCTCTCGCATTCTTTCCTATCATTGAAACTTTAATGTTGTGTTTTTAAATAAAACAGTATTTTTTATATTAACTTTCGTGTCTTTTTTTACAAGAAATTTCAATAATTTTAAATAATTAAAATATATAGTATTTGGATTACTTATAATTAAATTTTTTTTCATCTTTTAAATATTTTATTTAGATGAAATAATTAAAATATCTTAAATTTTAATTCTTTTAATTGGATAAAACAATTTAATTTCTATTTTAACGAAAACTTAATTGTTTTACTGAATTCAAGTTGGATATCTTAACCTTAGGTTTAGAGAAATTTATTTTAACTTTCAGTTTGGATTAATTTCTAAATATTTAATATAAATTAATTAGGCTCAAATTTCGATACGTATTGATTTGGCTCGATCTAATTAATGCTAAATAGTTTTTGTTCTTAATAAATTTAATTATAATTTAGTTTTAAAAATTTTCAAAACTAAACAACTTGTTTTGTCTACTATATAAATACATCCAAATAACGTTAAAGTATTAAATACATCCAAATAAATATAGATTATAATAAAAAAGGAGAACAAAAATAATTTTTATTGTTTTTATCATATATCTTTATGGACAATAAAGAAAAGTTTTTCTTGTAAAGAGGTTAAAGACTTAATACGATGCTGATAAAAAAGAAAAAAAAACTTAATATTGAGAAGAAAACAGAAAGATAAAGAAAATTCAATACATTTTATATGCCCAATATAAGAATTTTGATCAAAATAATTGTTAACATCATAATTGTTAAAGCTTTCAAATTTATTATCGGGTAGGATTTAGACAAAAAAATATTGAAAAAAAGTGGAAAGGAAAGAAGAAAAAAATTCAGAATTACATGTAAAATGATTTTTTTTTATTGCTACTCCTCTATCTTAATAATATGAGCAAAATATTTGAAGTTTCAAAATGATGAGAAATGTGATAAAATGTATTAAATATATTCATAGTATTAAAAAAACTATATTTTTGAAGAATGAAATAAATGAAGCCAAACCTAAGAAGCAAGTGGGTCAATATGTGGTGGGATATGAGGATAGATTGAAGTACACAACATTAAACTATATATTTAATGTATTTAATATAATTCAACGTAACGCCATGTTCTTACGAATGTATTTTGGGTTGTTCTTAGTAATTTTGACATTTATATTTTGTCTTTGTACCTTGGCAAACTTAGCCACCTTAGTATAAATAAACCATTCTTCAATCTTTCTCCCTAACCTCAAACTCCTCATTTCTTTCTCTCCACACTTTCTAGCCACAAAATCAGCTTTTATTTCTTATGGATTTCTTATTGGAAAATCATACAGATACTTCTTCTAGTTCTAATCGTTCCAGTGAAATTAAAACAAACCAAAACCTTGTTGTGAATACGA


Gene Sequence:
>Vu_05340(+)
ATGTCGAATGATGATGTTGTTGATGAAAATGAGAAGAAAATTCTTACTAGTGGTGAAGAGTCCTACGATCCGGAAACTAATAATGAAATGCATCTATCCATCGAAAGAGGCCGAAGAAAGAAAATGAAAGAAATGTTCGATGATCTTAGTGCTTTACTTCCGCAACTTCCTTCAAAGGTATATATTTCATTACTCAAGGTTTTAAATATTTAATAATTTTATTTTTATCAACAAAAAAAATGTACCTTAAAAAAGTGAAAAAAAATCCCTTTCTTGAAAAAAAAATGTAATCTCTTATTACATTCTTACATAATCATTGATTGTAAGCCTAAACATATAATTAACATTATGGGCCTATCCTTCAAATTATTTAGTGTATTATTGCTCCCTATCTCCATATATTGAGATTATATGATATTCTTGTATTCATTATAATTATAAACATTCTATTGACAAAGTAAGAATAACTTAATACGAATACTATAAGAGCATTGAATAATACTCTTCTTTTATTGATTTCTAGGAATAATTTTTAAAGGAATACTACCTATGATGACGGTTAAATTAAATTATGACCATAACAAATAATTTGAACAGATCTTTTAAAAAAATAATTAATGCATATTTTCTCCGCAAAAGAGGCCGAATAAAGGGTACGCACAAATATATATTATATATATCAAACACGAGTCCTTATGTGGGGTTTGATAAAACACAATGGAGAGAAAACTAAAAGAGAAATATTTTATCGAAAATATAAAAACTTAGTTATTTTACAATAGAAAAATATATTTAAATATAAAAGAAAAATACAAGCAACAAAAAATCAAAACAAAAAAATCATAATAAAAGAATTAATAGAAAATTATAATAAAAAACGGAAAGAAGATATAAAATATTTATAACACCCGGTTTCAAGGTGGGTATGAAAATTATGAAGGCTTAACTTGAAAGTAGCATGTTTGAAATGTAGTAGGATGAAAGAATCTTGATATCTTGAGAAATTTGAGAATCTTGAAATTTGAGAATCTTAAAAATTTTGATATTCTCGAGAAATTTGAGAAACATCAGAACTTGAGAATCTTGAAAAAAATTGAAAACTTTGAAAAAAAACAAGAATCTACATTATTGATAACGAGAGTATTGATAATAAGAATCAATAATATTGAGAATGACAATATTTAAAAATCGAGAAACTAAAGAAATTAAGAAACCAAAAAATCGAGAAACTAGAGAAATCAAGAAACTGAAACCCGAGAAACTAGAGAATCGAGAAAATGGAGAGTCGAGAAACTGGAGAACTGAGAAACTGAGAAACTGAGAATCAAGAAACTAGAGAAACCAAGAAACTAAAGAATTATTGATGCTTTTTTTTTAATTGCTTCAATCATCTAAAAGGTATTGATATGAGTGTTGTACAATATGTTGACTAAAAATAGTGGCAGAAGAAAAAGCATTTTGTGAATTTTATAGGAAGGCAAAAATAACTTTATTAGTTTTTAGAGAAACCAAAGAGAGCATGAATTTTGTCATTCTTCACGGCAAAAAGATCAATGGCAAAAGATCAATCAGTGTCAACCATACTAACAAAACTCATCCCTACAAAACTAGCTTGATTTGTAAGGTGATGAGAAGTAGAACTTGCCATATCAGAAATAAGTGTACAATATGTACATGCATTGAATAATCTATATGTTGATATAGTGTTAAAACATGTTTCGTAAAATAAGTGTTTAGTGCAAGTCTGAGTTTTTTCAAGTAGTGACAATTGATATAATACATGACAGTTATGCCTTCTTTCACCAGACGTTTGTCAATATGTTGTTTAATCTTTTATATTTGACACGTCATAGTTTGTCTTATAAGCATTTCATAAGAATGTTTTGTTGTGCTCATTGACCAAATGTTATTTTTCTCTAAACAATATTTTGTTCACTGTTGTTTGTTAAACCTTAAAACTTGAGATGTTTATTCTCTTTAGACATTCTTGTCTTAACACGTTTCGCTTAATACAAGTGTTTTAGTTCTCTTCAAAATTTAAAAACACAATCAGTGTATGATTACAAGTACAAATTAAGTAACTCTCAAAGAGAGATCAATACAATACAATTTGTGAAATTGTGATGTTCTTTTCGTTAGGTTGAAGAGCTTCAAATGATATAAACTTTGAGGTAGAGTAGAGTTAATGATATTTCTTGTATATTTTCTCTCTCTTTCTCTCATCTTTTCTCGTCTACTTTCACCTTCTTCAACTTCAACAACTACAAGTTCTGGAATCTTCTTTATATAACCCTTTGAGAAATGACCATTGGACATAAAGTTGACTTCAGATAGACTTCATGGCCTTCTTTAAGTAACTGGTCAAACTCAGGTCTATGTTTTAGGGTGATAATATTTTATCAGTGCTTTCTTTCTTGAGTAACTTATACAGTTTTCCAAATTTAAAGGCTTTTAGGAAACATTCCAGTAATGTCTTTTTATCTCTTAACGTCTTTTTGTCCTTTGTGTTGCGCTTTTGAATAAAGCTTATTATTGACATTACCTGTAGAGAGAACAAGAGCAAAGTATGCAATCAAAATACTTTTTTGTACACCATTAAATGTTTTAAATGTTAATGGTCATTTTGCACATTGCATGTTTAAAACATTTTGGAATGTGTCAACACTGTTTGATAAGAGCATTATTTGAAGGTAAAATGTTTGATGTGTTATACTTAGATAATGTGATCTTTTAAGCTCTTGTATCACAAGGTCATCTAAGCTTAAGTATATCGGTTAGTAATGCTTAACAAAACTTGAATTTCATACGATTTATTATTTTGTTCAAGCGTTATGGTGATTAGACACTCTGTTAGGGGTTCTATAGTGTTTGACACTTTGTATGTCTTATGTCTTGGACATGTTGACATATCAGATAGTTATATATCTTTTGATAACCTTTAACACATTGTACTAATATCCTAAAATATTTGTTGGGTCAGACACTTAGTGATTCAACGCATTTGAATATTAACTCTTAAACATCAGTGTATAGTTCAGCATCAGGTGTTGTTTGTGTTTAGACTGATTTTAGTTCAAGTAATGTATTCTTTATAAATGTTCATCTTATTCAATACTCTAGATATATTGTTATGACTGATAGACAAATGTTTCATCCAGTACAATCCTGTAACGTTTAAATATTAAAACCACCACCATCATTATTTTTATTAGTATTATTAATATAATATAAGTATTTAATGATCAGAAAACAGATGATAAAAGTTAAAACACAATATTTTTGGGATAGAACTCTAAAGTGATAGTTTTTAATGTATTAAAAGAAAAGAGCCATTACTGTGTGTGGGTGTCCCACTTGAGGACAAGTGAGAAAGTTAAGGTTAGAATGTTATTCTGAGATGGTTCTGATATGCTACTTCTTAGGCTGATAAAGCAACCGTAGTGAACGAAGCAGTGGACTACATAAAAGTTCTGCAGGAAACTCTGGAAAAGCTAGAGAGAAAGAAAAAAGAAAGGGCACAACATGTTCTGAAACAAATTATGGGAACGAGTTCTATTGCGGGTTCAGTGTCTGAGAAGCAGAAAGGTTTTGATAAAACTTGGGCTGCTTCAAACATGGTCCTGAACATTCGTGGAAATGAAGCTCAATTCTCGATTTGCTCAGTGCATAAGCCAGGACTCATGACCAACATTGCTTCTGTGCTTGAAAAGCACAACATAGAACTCATTTCTGCAACCATTTCGGCCAATGGAAATGGAAGTACATGCATGATTCAAGTCCATGTAAGTTTTAAACTTCATTCCCACCATACATCTATGTTTCTTATTCATAATTTCTCAATGCATGTTTAAGGACTATGTTACGCACCTAAATGCCTTTTCTTACGTTTAAAGTATGACTTTTTAAAATACCTATTTTCTTTTTTATATTTTAAAACACCATTTTTTAATTAAACAAGTCAATTTTATTCTGTTTATGTATTTCTCTACTTCTTATTTTAAATCTAGCAGTTTTGTAATTTTTTAATAAGTAAATTTTGATTTGTTTCTTGAATAAGTGTTTTTTACTTATTTACTTCATAAACACTTATTTTAAATTTAAAGAAATTAACTAAGATTGACTTGTTAAATAAACATAAAAGTAAACATTAAAACAAATAAATTAAAAAACATAATACCCTATTTTATAAAATAAATATTTTTTAATCAAGTACACGAAACTTACCAAAATTTATATTTTCTATAAATTAAATATTACACTTAATATGAATTAAATATTACAATTACAAAAACACCAAGAGAGTAAATCGAGTTGATAATTGTGTCTAAAATAAAATTTAAATAAAAATATTTGAAAGAGATTTTACTAATTTATAAACAAATTATTTTTACTTTATGAAAATATGTGTTTCTTTTTTAAAGAATCTTTTACTAACATATTCTTAGTTAAATTTATTAACTTATTGAATTGTTTATGGTACAGGGAAAACAAGCTTCGGATGCAAATTCAATGGAGGAAACTTACAGGAAAGCTGCTGAAGAAATTATGCCATGGATCTCTTAA