Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05339 LG1 80110946 80112119 PREDICTED: transcription factor bHLH95-like
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SNP Position Effect Amino acid change
T/C 80110947 start_lost p.Met1?
G/A 80110948 start_lost p.Met1?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05339.1
MLFMSEDQSLLHDTNLLWEKTNSQKQKNEKVEGLMNKKRNRELNKVSSAEGNAEKSRESDHEMHIWTERERRKKMKNMFASLHALLPHLPSKADKSTVVDEAVSYIKNLETTLEKLEKQKEERVRCGPTFWNESSPSMFTARGLSSDYGFSNAIMGTSSNALLFPAQQQPVAFDKTWASSNMVLNVCGDEAQFCICAAHKPGLVSTIVYVLDKYKIELVYAHISCLGNGNAIMIQAHGKRASHQFLDANSVEEIYRQAAGEILLWIA*


CDS Sequence:
>Vu_05339.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05339::LG1:80108946-80110946(+)
TATGTAATTTTATGTGCTATATATAAAATACTATTTATATATAAATAGTATAAATAGTATTTTATATATATATATAGCACATAAAATTACATAATGAACTATAATATAATTTTTATATACCGTTAATTAGGATGTATTATATGATTTTAATAAAATTTAATAACAAAATATTTTATAATTTATGGAACACAATTTTTTATAATAATTTGGTAATAAAAATAATATTTAACTCTTATAACTATAAAATAGTTTAAATCTATATTTATTAATTTGATGTTATGAGATTGAGTTAAATTTAATTGTTTTTATAATATCAAAGTTTATTTTAATAGTATTTCTTAGATATAGGTTTTATGGCTTAATATGAAACTCTCTAAGTAGAATGTAAATATTATTATCTTATAAACTTATTTCTAAAGTTGAATTGCTCTTAAATAAAATTTTCAATATGATGTTAAAATTTATCTTAATGAAATTTATTCGAACCCTTATATCTTCTATTATGACATCTTGATTATGATTTGTGAAGTTAGATTCTCACGCACAATATATAAATAAAATACGAATATTAGTTACTAAACTAATAGTTTTATGATATTGAATTAAAATTAAAGTTCACAATTCAATATTTTATTTTATTTAATGTTTATATATGAGCTACTCACATAATGGCAACAAACTGCATCAAAATCATGATTACTTTTTAAAAATAACGTTAGCATCTTTTTCTCTAATGAGGAAAGTTAAGATTGTATTCATTACCTAATACGTAAATTTCTGTCCAAAAACACCATCATTTGCACTTGCAGATAAGAACAAAATTTGTTACAGGGGATATTATTTAATCATTGAAAGATAATATAAATAATTTGTTAAATAAAGTTGATCAGTTTAGATTTTCTAAAGTAACGCAAATAAGAAGCACTAAAATATATATAATATATATATATATTATATATATATATATATATATAAACAAGTACAGATGTGAATATCTTAATTCAAAAGAGATTGTTATTTAACTCCTAAAATGTGAGTTTCAATATATTTTTTTATATCTGTGAAATGGATATGTATTATTAATAGGTCAGAACTAATGTTAAACTATACATAAATCATTCAGTTAAAAACGCGTGTCATTATCATTTATTGATACAAATATTTATAGCTGTAAAGCTCATTAATTATTTACTTTTTTAGAAAGAAGAATTTAATGGGATGCATATTTATTAGGATTTGAACGCACTAAAGATCATAAACATGTTTCTTCACTATTTATCAAAACCAATAAATGTTTTTTTACTAAACTTTTTTATTAAAAATCAATTGTTCACAATAAAACCTGTAATTTTAATGAAAATTATGACCATTTTTTTAACATTTAAGTGATTTTTATTATGTGCGTATATAAAAATTAGTATATTTGAGATAAGAGTTTTGAGAAAAATGTCTTTTGCTATCATAAATGTTAATCTTTCGAAAATTACCATTAAATGAAAAAGCACCTAAATGAAAAACAAAATATCCAATAAAGAAAAAATAATTTATAACCTCTTTACACCTAAAAGATAAATTGTTATTGGCTTCATTGACGCCAAAGTTTATTTACATCTCTCAATAATAGATATAATATAATTTATTAAAATTGCATTTATATCAGCAAAAATTAAATTACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAATGAAATAAATTAAATGAAAGTGTTTCTAAAATCATGGTAATTAACATATCTAGCGGGAGCCTAAGGTATAGTATTTTAGCATAATTATGATGTTAATATATTTGTTGTGAGGCAAAGTAACTGCATTGTGTTATGGTTAATCATCATCATTCATATCTCTCTTGCATCTTCTGCTGTAAGCTCTCTCTCTCACTTGTATATAAACGTGTCTTCTCCATTCTTCTGATTATCAAATCTGCTCTTAATTTTTTTCTTCTCTCTCAATCTATCA


Gene Sequence:
>Vu_05339(+)
ATGCTCTTCATGTCAGAAGATCAAAGTTTGTTGCATGATACCAACTTATTGTGGGAAAAAACGAATTCACAAAAGCAGAAGAATGAAAAGGTCGAAGGTCTCATGAATAAGAAGCGAAATCGAGAGCTCAACAAAGTTAGCAGTGCAGAAGGAAATGCTGAAAAGAGTCGCGAATCTGATCACGAAATGCATATATGGACTGAGAGAGAAAGGAGAAAGAAAATGAAAAACATGTTCGCTAGTCTTCATGCATTGCTTCCCCATCTTCCTTCTAAGGTCAAATATTTTCAATCGGATTCGTTTTCATTCTTAGGTTACTTCGTTTCCCTCTTTCTCTAAGGTGCTTCGGTGTTCGATCATGATTTTGCAGGCGGATAAATCAACGGTCGTGGATGAAGCAGTGAGCTACATCAAAAATCTTGAGACAACCCTGGAAAAGCTTGAGAAGCAGAAAGAAGAAAGGGTCCGATGTGGGCCCACGTTTTGGAATGAGTCATCACCGTCCATGTTCACTGCTCGGGGACTTTCTTCTGATTACGGCTTTTCGAACGCGATTATGGGAACTTCTTCAAACGCACTTTTATTCCCTGCACAGCAGCAGCCCGTAGCTTTTGATAAAACGTGGGCCTCTTCAAACATGGTCTTGAATGTTTGTGGAGATGAGGCCCAATTCTGCATTTGCGCGGCCCATAAACCAGGTCTCGTGTCCACCATAGTTTATGTGCTTGATAAATACAAGATAGAGCTTGTATATGCCCACATTTCGTGCCTTGGGAATGGAAATGCAATCATGATTCAAGCTCACGTAAGTTTCAAACTCTCATGCACTTTTCATTTATTATTTCTGTAGAAAACTAAACGTTTATAATTATTCACACGCAATTTCCAAATTATTAAAAATGATTTTTTTTAAATTTATTAATTACTGTAGCTTTAATAAAAAAAAAAAGTCACGCATTCACACATTTACTTTAAAAGAATTCAACATTTTTCTTATACTTCTTTTTTCTAATACACAAGCATTCTATATTAACATGAAATTAGGGTTACTTTAACTTATATGAAGTTTTTGATGATTCAGGGAAAACGAGCTTCACATCAGTTCCTGGATGCAAATTCAGTGGAAGAAATTTACAGGCAAGCTGCCGGAGAGATTCTTCTATGGATCGCTTAA