Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05280 LG1 78063715 78073402 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 78064011 missense_variant p.Asn1702Tyr
A/G 78064159 synonymous_variant p.Ala1652Ala
T/A 78064512 stop_gained p.Lys1535*
A/G 78064616 splice_region_variant&intron_variant
T/C 78064649 intron_variant
T/C 78064650 intron_variant
A/T 78064652 intron_variant
A/G 78064724 intron_variant
T/A 78065109 synonymous_variant p.Ser1429Ser
C/A 78065272 missense_variant p.Ser1403Ile
A/G 78066045 missense_variant p.Leu1176Pro
A/T 78066101 intron_variant
G/C 78066340 intron_variant
A/G 78068031 missense_variant p.Val984Ala
C/T 78068225 synonymous_variant p.Arg919Arg
C/T 78068399 synonymous_variant p.Leu861Leu
A/G 78070116 intron_variant
A/G 78070349 missense_variant p.Leu555Pro
T/A 78070563 missense_variant p.Glu528Val
A/G 78070590 missense_variant p.Leu519Pro
A/T 78072357 intron_variant
G/A 78072435 intron_variant
A/T 78072485 intron_variant
G/A 78072486 intron_variant
G/A 78072504 intron_variant
T/C 78072649 missense_variant p.Arg192Gly
G/T 78072954 missense_variant p.Ala90Asp
A/T 78072982 stop_lost p.Ter81Argext*?
C/T 78073138 intron_variant
G/A 78073195 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05280.1
MEGEACSEGENNRKRGGTDDDSNENNNNNDSNHGISSKIVNSNEGQSKPKRQMKTPFQLETLEKAYAVDNYPSETMRGELSEKLGLSDRQLQMWFCHRRLKDKKDLTSKKVPRKVVAEPLPESPTDDPMLGPPELGNEYGSGSGSGSSPYARVEPLNIVPRGVPGYYESPRAMMESRAIACVEAQLGEPLREDGPILGVEFDPLPPDAFGAPLATEQQKLPSFAYDSKIYERHDSRANKAMARTFRDYRSLPTQAGTRSDTSGPFSKSHLHDAMEGPARNLHLALGNETVPRIRPSQGQFRARLLSQQDKQLIPYQSPMRDDNAAPTRELDPTILNVGTSSHFADHQIVVPENLHAQPSGQVLHNNNAIRIEKKRKSDDVRDVEAHEMKIRKEIEKQDNLRRKNEERMRKEIEKQDRERKKEEERLMRERQREEEKARREQKREIERREKFLLKENIRAEKMKIREELRKEKEAERRKAALEKATARRIAKESMELIEDEQLEMMELAASSKGFSSIIHLDFDTLQHIESFRDSLCVFPPKSVKLRKPFAIKPWINSEKNVGNLLMVWRFLITFADVLELWSFTLDEFVQAFHDYDSRLLGEIHVALLKVVIKDIEDVARTPSTGLGSNQNGAANAGGGHPEIVEGAYAWGFDIRNWHKHLNLLTWPEIFRQLALSAGYGPQLKKRSATCSYANNKDEGRSCEDIISKLRNGSAAENAVAKMHERGLLAPRRSRHRLTPGTVKFAAFHVLSLEGDKGLTVLELAEKIQKSGLRDLTTSKTPEASISVALTRDTKLFERIAPSTYCVRQAFRKNPADAESILSEARKKIQIFENGFLAEEDTDDVEREESESDEIDEDPEVDDLVNSSSANKTSEPCDDFSSNGKQNLGHDVGLQGEFDKDLPHVPESSSKKVDTPIAVTGRKPGACEVLNVGNLGEDNMEIDESKLGESWVQGLAEGEYSDLSVEERLSALVVLVGVANEGNSIRVVLEDRLEAANALKKQMWAEAQLDKFRLKDDIFSKSDFPSLNGNKVEIQYSCPAAEGNQSPSLLGINIGNNSNIVPSPSTAENQKATPGVQSLSVEKHSSVQDLCTGPDNPQIQTFAQYSKRSRSQLKSYIFHIAEEMCAYRSLPLGQDRRRNRYWQFVASASSNDPGSGRIFVEFLDGNWRLIDTEEAFDALLNSLDSRGVRESHLRLMLQKVEGSFKENVHNNTQCSKAGSRGETCVKNEADETDSSPDRHTGSDSPSSTLCGLNSDSLETSSSFKIELGKSESDKKSALRRYQDFQKWTWKECYNSSILCAMKYGKKRCKPQVVVCDICLNPYFYEDSHCSCCHRTFPSNNGFNFSKHAFQCGDKLSKEICILDSSLPLRTRLLKALLAYIEVSIPPEAFQSTWIEDIRRHWSVKLSKTSSVEELLQILALLERALKRDFLSSTFSTTGEQLGLNTMSESAAQTSADPESVAVLPWVPLTTSAVSLRLFEFDDSIVYVLHEKPEPREEKEDRQYIKLPSRHSASKSIKVSETADMGRDEFMKVKSNTVKIVQSNNKRGRGSALKGRSKSISKTKQNNGRRHSAKVAGNLNQRVKQQGGGSQGQAGGRGRRTVRKRRMEKKAVEDLLLGHRGASRNNNIARESLRNLDEDWDDQKGSPMTPIHMGTANISNSTEEAESDDNVQAMESDDNVQAVESDDNVQAVESDDNGQAMESDDNGQAVESDDNGQAVEYDQGNWEIGFNGNPSRWQGDLVGTSDEDVEASEDDNHNDNGIEENEEEDSEGDVMSEGSDGTANRIVNEEESSDSDVSEDSSD*


CDS Sequence:
>Vu_05280.1
ATGGAGGGAGAGGCTTGTTCCGAGGGAGAGAATAATCGGAAAAGGGGTGGCACAGACGATGATAGCAATGAGAATAACAACAACAACGACAGCAATCACGGAATTAGTAGCAAAATTGTGAATTCTAATGAGGGGCAGAGCAAGCCCAAGCGCCAGATGAAAACCCCTTTTCAACTTGAAACCCTCGAGAAGGCTTATGCTGTGGATAATTATCCGTCGGAGACGATGAGGGGAGAACTTTCTGAGAAATTGGGTTTGTCGGATCGGCAGCTTCAGATGTGGTTCTGCCATAGGAGGTTGAAGGACAAGAAGGACTTGACGTCCAAGAAAGTGCCACGGAAGGTGGTGGCAGAACCTTTGCCGGAATCACCTACAGATGACCCCATGCTTGGCCCCCCGGAGCTTGGTAATGAGTATGGATCCGGGTCCGGTTCAGGGTCCAGCCCTTATGCCCGAGTGGAGCCCCTGAACATTGTTCCCCGGGGTGTGCCTGGTTATTACGAGTCCCCACGGGCTATGATGGAGAGTAGAGCAATTGCTTGTGTTGAGGCGCAGTTAGGGGAGCCGTTGAGGGAAGATGGACCAATTCTAGGAGTAGAGTTTGATCCATTGCCACCAGATGCCTTTGGAGCACCTTTAGCTACCGAACAGCAGAAGCTACCTAGTTTCGCCTATGACAGTAAAATATATGAAAGACATGATAGTAGAGCCAATAAGGCTATGGCAAGGACATTTCGTGACTATCGATCTCTTCCAACCCAGGCTGGCACTAGGTCTGATACTTCTGGACCGTTCAGCAAATCTCATTTACATGATGCAATGGAAGGTCCTGCCAGAAATCTTCATTTGGCCCTTGGAAATGAAACTGTACCTAGAATTCGTCCTAGTCAAGGTCAATTCCGTGCTCGTCTTTTGTCGCAACAAGATAAGCAATTGATTCCATATCAGTCTCCTATGCGGGATGATAATGCCGCCCCAACTAGGGAATTGGACCCAACCATACTTAATGTTGGAACGAGCTCTCACTTTGCTGATCACCAAATTGTTGTGCCAGAAAATCTCCATGCTCAACCTAGTGGTCAAGTTTTGCATAACAACAATGCAATACGGATTGAGAAGAAACGAAAGAGTGATGATGTTCGTGACGTAGAAGCGCATGAGATGAAAATCCGGAAAGAGATTGAGAAGCAAGATAACCTTAGACGAAAGAATGAAGAAAGGATGAGAAAAGAAATAGAGAAACAAGATCGTGAAAGAAAGAAGGAAGAAGAGAGGTTAATGCGTGAGAGACAACGAGAAGAGGAGAAAGCAAGACGGGAGCAAAAACGCGAAATTGAGCGAAGGGAAAAGTTTTTGCTGAAAGAAAATATAAGAGCAGAAAAAATGAAGATAAGAGAAGAGCTTCGCAAAGAGAAAGAAGCAGAGAGAAGGAAAGCTGCCCTTGAGAAGGCTACTGCTCGTAGAATAGCTAAGGAATCTATGGAACTTATTGAGGATGAACAGCTGGAAATGATGGAGTTGGCTGCCTCAAGCAAGGGGTTTTCCTCTATTATTCACCTTGATTTTGATACTCTGCAACATATTGAGTCATTTAGGGATTCATTGTGTGTTTTCCCACCAAAGAGTGTCAAGCTAAGAAAACCATTTGCAATCAAACCGTGGATCAACTCAGAGAAGAATGTTGGCAATCTTCTCATGGTTTGGAGATTTTTGATTACTTTTGCTGATGTTCTGGAGTTATGGTCTTTTACTCTAGATGAGTTTGTTCAAGCATTTCATGACTATGATTCAAGACTATTGGGTGAGATACATGTTGCTCTTCTTAAGGTGGTAATAAAAGACATTGAAGATGTTGCAAGGACACCTTCTACCGGATTAGGATCGAATCAAAACGGTGCTGCTAACGCCGGAGGTGGTCATCCAGAGATTGTGGAAGGCGCATATGCATGGGGCTTTGACATACGGAATTGGCATAAGCACTTGAATCTATTGACATGGCCAGAAATTTTCCGACAGCTAGCTTTATCTGCCGGATATGGACCACAGTTAAAGAAAAGAAGTGCTACCTGTTCATATGCAAATAATAAAGACGAGGGAAGAAGTTGTGAAGATATCATTTCTAAACTTCGTAATGGTTCAGCGGCTGAAAATGCAGTTGCAAAAATGCATGAGAGAGGTCTGTTAGCCCCTCGAAGATCTAGACATCGATTAACTCCTGGTACAGTTAAATTTGCAGCATTTCATGTTCTATCCCTTGAGGGTGACAAGGGATTGACAGTACTGGAGCTTGCAGAAAAAATTCAGAAATCTGGTCTTCGAGATCTGACAACCAGCAAGACACCTGAGGCATCAATTTCTGTTGCTTTAACAAGAGATACCAAGCTTTTTGAAAGAATAGCTCCGTCAACATATTGTGTACGTCAGGCATTTAGAAAGAACCCTGCTGATGCCGAGTCCATTCTTTCAGAAGCAAGAAAGAAAATTCAGATATTTGAAAATGGGTTTCTAGCTGAGGAGGATACTGATGATGTTGAAAGAGAAGAGTCAGAGAGTGATGAAATTGACGAGGACCCTGAAGTTGATGATTTGGTAAATTCGTCAAGTGCAAACAAAACATCTGAACCGTGTGATGATTTCTCATCAAATGGAAAACAAAATTTGGGCCATGATGTTGGACTTCAGGGTGAGTTTGATAAGGATCTGCCTCATGTTCCTGAGAGTTCTTCCAAGAAGGTTGATACTCCAATTGCTGTAACCGGGAGGAAACCTGGTGCTTGTGAAGTTTTGAACGTTGGAAATCTTGGTGAAGATAATATGGAAATTGATGAAAGCAAGCTTGGAGAATCATGGGTTCAAGGGCTTGCAGAAGGAGAATATTCTGACCTCAGTGTAGAGGAGCGTCTAAGTGCCCTTGTTGTGTTGGTTGGTGTGGCAAATGAAGGAAATTCAATCCGTGTTGTTCTTGAGGATCGTTTGGAAGCAGCAAATGCTCTGAAGAAACAAATGTGGGCAGAAGCACAACTGGATAAATTTCGATTAAAAGATGATATTTTCAGTAAATCTGATTTTCCATCTCTCAATGGGAATAAAGTTGAAATACAATATTCTTGTCCTGCCGCAGAGGGAAACCAAAGCCCTTCATTGCTTGGTATTAATATTGGCAACAATAGTAATATTGTGCCCTCTCCCAGCACTGCAGAAAATCAAAAAGCCACTCCAGGTGTACAGAGCCTGTCTGTTGAAAAACACTCTTCAGTTCAAGATCTTTGCACTGGCCCAGATAACCCTCAGATTCAGACATTTGCACAGTATTCAAAAAGGTCACGGTCTCAGTTGAAATCTTATATTTTCCACATAGCAGAGGAGATGTGTGCCTACAGATCCTTACCCCTTGGGCAAGATAGAAGACGTAACCGTTATTGGCAATTCGTTGCATCTGCTTCTTCCAATGATCCTGGCTCTGGCCGGATCTTTGTCGAATTTCTTGATGGCAATTGGAGGCTTATTGATACTGAAGAGGCCTTTGATGCGCTTCTGAATTCCCTTGATTCGCGTGGGGTCAGGGAATCTCATTTGCGACTAATGTTGCAAAAGGTTGAGGGTTCCTTTAAGGAAAATGTTCATAATAATACACAATGTTCTAAAGCTGGAAGCAGAGGCGAAACATGTGTTAAAAATGAAGCTGACGAAACAGATTCCAGTCCTGATCGTCATACTGGATCTGACAGCCCCAGTAGTACCCTTTGTGGCCTGAACTCTGACAGTTTGGAAACTTCCTCATCCTTCAAAATTGAGCTTGGGAAAAGTGAGAGCGACAAGAAATCTGCCTTGAGAAGGTATCAAGATTTTCAAAAGTGGACATGGAAAGAATGCTATAATTCATCAATATTATGTGCCATGAAATACGGGAAGAAAAGATGCAAACCTCAGGTTGTCGTCTGTGATATCTGTCTCAATCCTTATTTCTATGAAGACTCCCATTGCAGTTGTTGCCACAGAACTTTTCCCTCAAATAATGGATTTAATTTTTCTAAACACGCATTTCAATGTGGAGACAAATTATCAAAAGAGATTTGTATTTTGGATTCGTCTCTTCCCTTACGGACAAGATTGCTTAAGGCCCTGCTAGCTTATATTGAGGTTTCCATTCCACCCGAAGCATTTCAATCAACTTGGATCGAAGATATTAGGAGGCATTGGAGTGTGAAGTTGAGCAAAACATCTTCTGTAGAGGAACTGCTACAGATATTGGCCCTACTCGAGAGAGCATTGAAGCGGGACTTTCTATCATCAACCTTCTCTACAACAGGGGAACAGTTGGGGTTGAACACTATGTCAGAGAGTGCTGCACAAACCTCTGCCGATCCTGAATCAGTTGCTGTACTTCCATGGGTTCCACTGACCACTTCAGCCGTGTCTCTCAGACTTTTTGAGTTTGATGACTCAATTGTCTACGTACTGCATGAAAAACCTGAACCTCGTGAGGAGAAAGAAGATAGGCAGTACATAAAGCTTCCTTCAAGACACAGTGCTTCCAAATCTATTAAAGTGTCTGAAACAGCCGACATGGGACGTGATGAATTCATGAAGGTTAAATCTAATACTGTGAAAATTGTGCAAAGCAACAATAAACGAGGACGAGGTAGTGCTCTCAAAGGACGGAGTAAAAGTATATCTAAAACCAAACAAAATAATGGCCGTCGGCACAGTGCAAAGGTTGCTGGGAATCTAAATCAAAGGGTAAAACAACAGGGAGGGGGATCACAAGGACAAGCTGGTGGACGTGGTCGTCGAACAGTCCGGAAAAGAAGAATGGAGAAAAAGGCTGTTGAAGATCTGTTGCTAGGCCATAGGGGTGCCTCTCGTAACAACAACATTGCTAGAGAATCATTAAGAAACTTGGATGAGGATTGGGATGATCAAAAAGGAAGTCCCATGACTCCTATCCATATGGGAACTGCTAACATTAGTAACAGCACTGAAGAGGCTGAATCTGATGA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Promoter Sequence:
>Vu_05280::LG1:78073402-78075402(-)
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Gene Sequence:
>Vu_05280(-)
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