Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05260 LG1 77877333 77882069 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 77878065 missense_variant p.Asp245Tyr
G/A 77878128 missense_variant p.Glu266Lys
A/T 77878135 missense_variant p.Asp268Val
A/T 77878160 missense_variant p.Gln276His
T/A 77878226 missense_variant p.Ser298Arg
T/C 77878490 intron_variant
T/A 77878546 intron_variant
A/T 77878593 intron_variant
T/A 77878789 intron_variant
T/C 77879084 splice_region_variant&intron_variant
T/A 77879230 downstream_gene_variant
T/C,A 77879435 downstream_gene_variant
T/A 77879485 downstream_gene_variant
T/A 77879508 downstream_gene_variant
A/G 77879783 downstream_gene_variant
T/C 77880182 downstream_gene_variant
A/G 77880416 downstream_gene_variant
A/G 77880639 downstream_gene_variant
A/T 77880679 downstream_gene_variant
T/A 77881993 stop_gained p.Tyr574*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05260.1
MRISCGARQNVQTRPTNTHWREDFGYTGGIVANATLPSYITPPLNTLRYFPLSEGLQNCYVIDKVPKGHYLIRIFFGLVGQSRGTIIEPLFDISIEGTQIYSLKSGWTHQADQVFAEALVFLIDDSVSICFHSTGHGDPAILSIEILQIDDKAYYFVPRWSQGLILRTIKRLSCGFGQSKFDVDYAGDPWGGDRFWQRIKTFGEDSESSQPRSVETRIKHASHPPNFYPETLYQSALVSTNNQPDLTYTLEVDPNRNYSVWLHFAEIDYSVTTVGQRIFDIEINGDLAFKHVDIVELSGDIYTALVLNTTVSVNGRTLTIKLKPKEGNHAIINAIEIFEVIMAESKTESEEVSALQALKKALRLPSRFGWNGDPCVPQQHPWSGVGCQLNKSRGSWVIDGLGLGNQGLKGFLPDDISRLPNLQILNLSRNDIHGAIPSSLGTINTLQVLDLSYNFFNGSIPESLGQLSSLQILNLNSNLLSERVPATLGGRLLYRASFNFTDNAGLCGIPGLPTCGSHLSSGGKIGIGLGASFAFFLLTTCSVCWLKRRHNILRAQKIAARAAPYAKARTHFSRDIQLTRHHNNFGKTSTAAENGPILLS*


CDS Sequence:
>Vu_05260.1
ATGCGAATAAGCTGTGGGGCTCGTCAAAATGTTCAAACAAGACCAACTAATACCCATTGGCGTGAAGATTTTGGCTATACAGGTGGCATAGTCGCTAATGCAACTCTTCCAAGTTACATCACCCCACCACTCAACACTCTACGCTATTTCCCTTTGTCTGAAGGTCTACAAAATTGTTACGTCATTGATAAGGTGCCAAAGGGTCACTACTTAATCAGAATCTTCTTTGGACTTGTTGGTCAGTCTAGAGGTACCATTATTGAGCCTCTATTTGACATTTCTATTGAAGGCACGCAGATATATTCTTTGAAATCTGGTTGGACCCATCAGGCTGATCAAGTATTTGCTGAGGCGCTAGTGTTTCTTATAGATGACTCTGTCTCAATCTGTTTCCATAGCACTGGTCATGGGGATCCCGCTATCCTTTCTATCGAGATTCTTCAAATTGATGATAAGGCTTATTATTTTGTTCCCCGTTGGAGTCAAGGGTTAATACTTAGAACAATTAAAAGACTGAGTTGTGGTTTTGGGCAGTCAAAATTTGACGTAGATTATGCAGGGGATCCCTGGGGAGGGGACAGGTTTTGGCAACGCATTAAAACTTTTGGTGAGGATTCAGAGTCTAGTCAACCTAGATCTGTTGAAACTAGAATCAAACATGCTTCACATCCCCCAAACTTCTATCCAGAAACTCTTTACCAGTCAGCGCTTGTTAGTACTAATAATCAGCCTGATTTAACATATACATTAGAGGTGGATCCCAACAGAAACTATTCTGTTTGGTTACATTTTGCAGAGATTGATTATTCAGTGACTACTGTGGGGCAAAGGATTTTTGATATTGAAATAAATGGTGATCTTGCATTCAAACATGTTGACATTGTAGAATTGAGTGGGGATATTTATACCGCCCTTGTGCTTAATACTACTGTTTCTGTTAATGGGAGGACTCTAACAATAAAATTGAAGCCAAAGGAAGGTAATCATGCCATAATCAATGCTATTGAGATATTTGAGGTTATAATGGCTGAGTCAAAGACTGAGTCAGAGGAAGTTAGTGCTTTACAAGCATTGAAGAAGGCATTGAGGCTTCCATCCAGGTTTGGGTGGAATGGTGATCCTTGTGTTCCTCAACAACATCCATGGAGTGGAGTGGGTTGCCAATTAAACAAAAGTCGTGGCAGCTGGGTCATTGATGGACTTGGCCTTGGCAATCAAGGTCTGAAAGGTTTCTTACCAGATGACATATCCAGACTACCTAATCTACAGATCTTAAACCTGAGTAGGAACGACATCCATGGAGCAATTCCATCTTCACTTGGTACAATAAATACCCTGCAAGTGCTTGACCTATCCTACAACTTTTTCAATGGATCAATTCCAGAAAGCCTTGGACAGTTGTCGTCATTACAAATACTGAACCTTAACAGCAACCTCCTATCTGAAAGGGTCCCGGCAACTCTAGGAGGAAGACTACTGTACAGAGCTAGCTTCAATTTTACTGACAACGCAGGTCTGTGTGGTATACCTGGTTTACCTACATGTGGTTCTCATCTTTCTTCCGGTGGTAAAATTGGCATTGGATTAGGGGCTTCATTTGCATTTTTCCTTCTTACTACCTGTTCAGTTTGTTGGTTGAAAAGGCGGCACAATATCCTCCGAGCTCAGAAAATTGCAGCAAGAGCAGCCCCATATGCAAAAGCAAGGACCCATTTTTCACGTGATATTCAGCTGACAAGGCACCATAATAATTTTGGCAAAACCTCAACAGCAGCTGAGAATGGACCTATTTTACTTTCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_05260::LG1:77875333-77877333(+)
GAAACAAAAAAAGTTTTACCTTTAAATCTGAGTATTTGACTAAATTAAAATATAATAGGTAAAATTAAAAGTATAATCACAAATTTGTGAAATTAAAACTTCGATAATAAAAGTTACTAAATTATAAAAATTTAATGATAAATACGTAATTTAACTATCTGTAAAAAGAAAATTGAATGATAAAATTTACAAAATTATAAAATTAAATATCTTTAAATTTTATAATCTTAGTTAATTGTTCTTTGCTGTATAACTGTTTTTGAAATATCCAAAATATACAAGCGTAAATCTCACACACATATTCCGGTGATTGCGCACTAATCACTCCCACTACTACCCAAATGTAGGTCAGAAGTCAAAAAGTTCAATCAAGCATCGATGACCATTCTGAACCGTCTGAGCAGTATCATCATCAACGTCGACAATCATCTTGTTCAGTTCTCAACATTAATAATTATCGTATTTTTTCTTCAATCATAAAACATTTTAATTTTCATTGACGCTTTGAATCCAACAATAAATAACGTCAAATCCCCCTCTAACACGTAATTTACCTAATCTTAAATAAATGAGATCATGAACAAACTTTTAATAAGAATTATTTTGAGAAAAAAAAAGTAAATTTATTTGCAGTTAAATTTAATAGAAACTTATAATATATTTTTTCTATTTTTATAATTTGTGCTTAAGTTAGTTCTAAGGGAAGAAAATTAATTTTTATTTTTTTGTCTGGAAGTTTTAAGTTTTAATTGGAAAAGTTAGTTGAAATAATACATACGATTAATATAGATACGGTGTTGAGTTGACACTTGCAGCAGATCTGCACCATGCGATTGTAAGTGCATGGATTATGATGAAGCTCAGCAGCACGGACACCACTGTGTTCGTTTCTTTGGCGCCCGCGAGTAAACTTAAACGAAGAAGATTTTCCTAGCGTGGTGTGCAAAAGTGCGTGCACCCCACACACATACTCTCTCACATCTTTCTCTCTCTAGAAAAAGCACTCAACAAAAATGGGGACACGATGAATGAGAGAGAAAAAGACAGAAGAGGAAGAAGTTGTGTAGGGAAAAAATCGGGGAAGCCGAATCCAGCGCAATGCTTCTTCAACTTATTCAGCTATGGATGATGCTCTGCTTCGCTAGTGTTTCCTGTTCTGCACGGCAAGGTGAACCTAAGCATTCTCCTTCTTCTCTTTTTTCTCTCCTTTATGCGCCATGAAGTGGAGCTTTACTGTTTTCTTGATCAAATTTGGATTGTGGAAATTTCTCAATGCTTTCATTACTTTCATCTTCAGAGATTAAGAGTAGTAAGCTTGTCCAACCTCTGAAACTTTAAACCGGTTATGACCTCACTTCTATATTTTTTTCTTGTTTTAGCCTTTTCCTTTTGTTTCAAAACTAGGCTATGCAAATGCTATTTTTTTTTTTTTTACTTGTGCTCTTATTTAATGATGTCTACAACAGGGGAGTTTATTACAAATAACTAAATTATTTTAGTTATACTAATATTTCACGTTGATTATGTGTCTCTTTATCTGTGTGCATTAACTTAAGCATCAGTAGATATGAAACAGATGTAGGCATTTTCAACAATTTTCTCTGAACTTTCCTGTTAGTGAAAGTTTGTTAAACACCATTATTATTCTGAATTTCTGATGAATACTAACTTTTACCATATTGAAATTTGTCGGGTATGGTTTGTCTGTTACGCTTTAAATGAGCAATCATGTTAAGGAAACCATTGCATTTAATTCGTCATATTTAAGCCAAGGGATGTAATTTCTTTTTCGCAGTCTATTGGCAATGGACGAAATTTATGTTGACATTTACCACTGAAGTAGCAGTTTTTACATGGTTCTACCTATTATCTTTTCTTAGTGAATCTGAGTGTTAAACTTGCACTTACCATAGAGGATTATTGTTTTCAAAAGCTTTGTATAAATATTTTGTTTTTTCCCAATTTTGATTTGGTTCAAACCACTGCAGATCCATTTGCTA


Gene Sequence:
>Vu_05260(+)
ATGCGAATAAGCTGTGGGGCTCGTCAAAATGTTCAAACAAGACCAACTAATACCCATTGGCGTGAAGATTTTGGCTATACAGGTGGCATAGTCGCTAATGCAACTCTTCCAAGTTACATCACCCCACCACTCAACACTCTACGCTATTTCCCTTTGTCTGAAGGTCTACAAAATTGTTACGTCATTGATAAGGTGCCAAAGGGTCACTACTTAATCAGAATCTTCTTTGGACTTGTTGGTCAGTCTAGAGGTACCATTATTGAGCCTCTATTTGACATTTCTATTGAAGGCACGCAGATATATTCTTTGAAATCTGGTTGGACCCATCAGGCTGATCAAGTATTTGCTGAGGCGCTAGTGTTTCTTATAGATGACTCTGTCTCAATCTGTTTCCATAGCACTGGTCATGGGGATCCCGCTATCCTTTCTATCGAGATTCTTCAAATTGATGATAAGGCTTATTATTTTGTTCCCCGTTGGAGTCAAGGGTTAATACTTAGAACAATTAAAAGACTGAGTTGTGGTTTTGGGCAGTCAAAATTTGACGTAGATTATGCAGGGGATCCCTGGGGAGGGGACAGGTTTTGGCAACGCATTAAAACTTTTGGTGAGGATTCAGAGTCTAGTCAACCTAGATCTGTTGAAACTAGAATCAAACATGCTTCACATCCCCCAAACTTCTATCCAGAAACTCTTTACCAGTCAGCGCTTGTTAGTACTAATAATCAGCCTGATTTAACATATACATTAGAGGTGGATCCCAACAGAAACTATTCTGTTTGGTTACATTTTGCAGAGATTGATTATTCAGTGACTACTGTGGGGCAAAGGATTTTTGATATTGAAATAAATGGTGATCTTGCATTCAAACATGTTGACATTGTAGAATTGAGTGGGGATATTTATACCGCCCTTGTGCTTAATACTACTGTTTCTGTTAATGGGAGGACTCTAACAATAAAATTGAAGCCAAAGGAAGGTAATCATGCCATAATCAATGCTATTGAGATATTTGAGGTTATAATGGCTGAGTCAAAGACTGAGTCAGAGGAAGGTATTGTGCTCATCCCTTCTATTGTTACAGTTTTTTCAACAACAGTTCATACTAGTGTTGTATGGTATTTATTGTATTATTAAAGATAACACATATTGAATTTTGGTAGACAACTCCAATGACTTTGAAATATCCACTATCAAGGTTGGTTTTTGGTCATTGGAGGCGACAGATAGCATTATGTGCATGTGCTTGGAAGTTGTATTAGTCATATGCAGTTTCTTTTTATTTCGAATCAACTAATATATCTCAAGAAACTCCAATTTTTGGGAGAGCTTGTCAAAAGTAGACCATGGAATTTATGCCAATCAAACATATTAGATCTCTTTGTCTCGTTATACTTTTCCTTTACTGACTGCTTTGGAGTTCTTCCTCCTAACCCATATCAGAGACAATATTTATTGATCATATGTTTTATAATACTTCTTCCATTTACTAATTTTCTATTTCATGAACTCCTAATAGTGCTTTAATAGAAAATGCTGCTTTTTGTAATTCGAATGAATATTAACTTTTGCAAGTTTATTATTATCTTTACTCTAGTTAGTGCTTTACAAGCATTGAAGAAGGCATTGAGGCTTCCATCCAGGTTTGGGTGGAATGGTGATCCTTGTGTTCCTCAACAACATCCATGGAGTGGAGTGGGTTGCCAATTAAACAAAAGTCGTGGCAGCTGGGTCATTGATGGACTGTAATTTCTTGTTATCCCTATGTAAATCGTTTTTGTTTTTTTGTTCATTTGATTCCCTGGTAGCCTATAATGCAGTTCTCTTCTTAAAAATTCTTTTATTCTCTTTCACTTAATCAATTTGTTCGCTTTAGTTGGCACCAAATCCAGATGTATTTTATTTGTTCAGCATCAGAGCCTCTAGATTAAGGAAATGGATGCCCTTCTATGAGGGAGAGAAAGAGAAGATTTTTGTGTTTTGGCTGTATGAATTTACATTTGCACGATCACAGCTTACATGTAAACTAGTTAAATATATTTCTTGCTAAAGCCATTCTTTTTAACTTGTTCAGAAAGTGTAACTTAATTTTTACTTTGTTTTCTGATATGCTTTCATTTGGGGGAGTAACCCTTGAATTGGACCTTCCCATTCTTAAATTTCTATAGGTCAATTTCACTTTCTTAAAAAAGGTTAAAAGTTCAAGATGAATTGCTCAAAGTTAGACCCCTATATGAAAATAGTTGTCAAATTAATCCCTCTTTGTATGATCTTTAGAGTTAAAACACATGTTTATGGATGGATCAGGAAAAGTGTTACATATAAGACTTACAAATTCTATATTTTAGATCGTGTACATGGGAATTATTTAGTTTGGTACCTTACTATACTTCCGAGTAATAATATAGTTATCAAATTAAAAATGAGTATCGCATTTATGGGGTAAAAGTATGTTTTAAGTATTAACCCTAAAAAAGTGTAGAACTACAACCACCACAAGCTAAGAGATTGGTTCCACTATGCTACAAAGGCGTTGTGGTTTGTGTTCAGAACTGTTGATTTATTAATCACTTTAAATATTCTATCTCAATATATTGGTTTTTTTTATATATCTAGTTATTGATTGCTTTGTCTGTTGATGAACAGTGGCCTTGGCAATCAAGGTCTGAAAGGTTTCTTACCAGATGACATATCCAGACTACCTAATCTACAGATCTTGTGAGTTCCAGATATGTTTTTTAAGTATTTTGGAAAAAGATATATGCGTGAATATTTATGTCAATGCATGCATGAATCATGTATGCTAATAATGTATTCATTACAAAACCAGCTTAGGAATAAGTTCTGAATTACGAAGTTATAATTCTGTATTAGAAAGTTAATGACCAATTATTTTTATGTCAGTCCAGGTTAGATTTACATATGTCATGATGAGATGGTGGGGATTTATAGGTTGCTTTTCAGATTAACGTAAGATTGCTATTTCTAGCGTTACCTAAATCCGGCCTAAAAACCATATTATTTCTATAATTTATTTAGGATTTAGTTTGTTTATATTTCTTGAATTTAATAATTTGTCCGACATGTTGGATGCCAAGGACCAGGACGGACCCAAAAGTTGAAGGCTTGGTCCAGTATTTTATATATGTAGGGGATAAGTTACTCTAAGAGTAACTTTGAAAGAGTTGTTCCCAATTTTATCTCAGTTTTTTTAAACTAAGTTCTTGTGAGTAACTTACATTTAGACTTCAGTTTTTTAAAATAAATGGTGAGTATAGAGTTACTCTTTCAATTTTACTAATAAAAAAAGTTCTTTCAATTTTTAACTCATTATTCTTGAACATACAGAAGCAACCACCATATTTATTTTCCCATAGCTTGCGCTAATTTGCTTAAGAACTGCAGAAACCTGAGTAGGAACGACATCCATGGAGCAATTCCATCTTCACTTGGTACAATAAATACCCTGCAAGTGCTGTTAAGTAATCTCTTCCTCTTTTTCTTATGATATTGTTTTCATTGTTATATGTTTTCAAAAAAGGTGGGAAACTTGTTCCATGAATTGTTGTCCTGGCCTTGACTATCATGTTATTGTCATTTCTGAATGCCATGTAACGATGCAGTGACCTATCCTACAACTTTTTCAATGGATCAATTCCAGAAAGCCTTGGACAGTTGTCGTCATTACAAATACTGTAAGATTCTCCAATGTTTAACTAACCCATAAAACACATACGAGGAGACAAATCTGTATCAAAATGTCTTCATGCAGGAACCTTAACAGCAACCTCCTATCTGAAAGGGTCCCGGCAACTCTAGGAGGAAGACTACTGTACAGAGCTAGCTTCAAGTATGTTATCAGAGCTTAAACTCCAGACAGTTACTGAAAATGATAAGATATTCCTCACGTACATGTTTGTTCACTTTGTTTTTTGCTAAATAACAAATATTTCTAACTTTTTGACTCGGTGATGTCTGCAGTTTTACTGACAACGCAGGTCTGTGTGGTATACCTGGTTTACCTACATGTGGTTCTCATCTTTCTTCCGGTGGTAAAATTGGCATTGGATTAGGGGCTTCATTTGCATTTTTCCTTCTTACTACCTGTTCAGTTTGTTGGTTGAAAAGGCGGCACAATATCCTCCGAGCTCAGAAAATTGCAGGTAAGGGATAGTCATAAATTGTAGACTACAGTTACACTAACAAAGCATTCTATGTTCTACTTTCACCTCTATTTACCATGTTTGGGTCTATTTAATTTTTGTAGAATAATCATTTTAAATATCTTGGAAAGTTTAAGAGATAATAGGTTATTGACAAAGTACAAATTTTGCACCGTCATTCAATCACACATAACATGTATGTATGGTAAACTGGTTAACTTCTATAATAAATACTTTAAAATTACCAATTTAAGATGTTATGCACTGTTGTTACCTATGGATGTATCTCTGTTCTTTTACTCAAAGTTTACTGCCTAGTACTATATTTAATCAGTCTAACTTGTTGGCCAATTTTACCAATATGTTCTTTAGTAACTCCACGGATGACCTTGAGAAGCAATAAGCATTAAGAGTGTTGAATTTAAATCTGTTCTCCTTTGTTCTTGCAGCAAGAGCAGCCCCATATGCAAAAGCAAGGACCCATTTTTCACGTGATATTCAGCTGACAAGGCACCATAATAATTTTGGCAAAACCTCAACAGCAGCTGAGAATGGACCTATTTTACTTTCATGA