Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05243 LG1 77553157 77555997 serine/threonine-protein kinase SAPK2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 77553344 intron_variant
A/T 77553345 intron_variant
T/C 77554928 splice_region_variant&intron_variant
C/T 77555156 missense_variant p.Ser126Phe
A/G 77555633 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05243.1
MERYEILKDIGSGNFAVAKLVRENRTNELFAVKFIERGQKARFFFQQLISGVSYCHSMQICHRDLKLENTLLDGSTAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLTRKEYDGKIADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPADPRNFKKTIGKILSVQYSVPDYVRVSMECRHLLSQIFVASPEKRITIPEIKNHPWFLRNLPIELMETGSWQVNDVNNPSQSVEEVLSIVQEARKSLNVPIVGGLLNGGTMDLDDLEADEEDLEDVETSGEFVCPL*


CDS Sequence:
>Vu_05243.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05243::LG1:77551157-77553157(+)
TTCTATGTAACCATCAAATTTCATCCTAAATAAGAAATTGAAAAATGTTCCTCCTCATATCGTAATCCCAGATTTTAAAATTCTCAGTTTAAGTTCTCTAAACTTCTTTTTCTAAGTTTTAAAATTATTTTTACATTAAATTTTATCATAATTATTTTTACATTAAATTTATTTTAAGGAGTTACATAAGTTAGCAAACCTCTTATTTAAATTATTAAAAATAATAAAAATTTGAGAGTTTCAAGGAAACAATATAAAAAAACAAACAAAATTTAACTCATTCCAAAATAAAGTGGCTAAAAAGACAATTCTAGCCTTCAATTTTTTTTCTTCAATTGGTCTCCACAATTTTGAAAATAATGTTTTTAATCTAATTGTCTAAATTAACAGATTGATTGTTAAGATATTGATATGGGTTCCAGTTAACACACTTTATTTGTGCAAATAACAGGAAAGTAATTGCTAAAATAATTCTATTGACATTGAAATAAACAAATAATTTAAGTTTAACCTCATGTAGAAAGTATCACCTGTAAGTCCACATTAAAATAACATCTTAATGCGAACATTTGGACTAAAATTACTGATTGAGAATATACAAAACTAAATATCTTATTTTAATATACAAAACTAAAACTATGTATTCAAAATTAAGAAACTAATCATATTCTAGCCAAATACAAAATACAATTAAAACTGATTAAATAAAAATAATATGTAGGTACCTCAATTTCATTTAGAACAATTGAAATTAATCCAACATTTTGGTTCCGAATTCACCGTTTTATAGTAATGGGAATTAATTGTGAGAATCCGATGATCTATATGTCATTACTCAAAACCGTTCTTTGTCGAAAAATTCTTATATTGTCAAAATAGTATAATTTAAAATCATTGAAATCTTTATAGGTAAATATGATCCAAATTATTAGTAAATTTGAGAATAAAATTTTAATTGCCTCTAAAAGTACTTCATGGTTAAGTCTTGAGAATTGATTACAGAGCGAATAATTATCAGAGAAGCGCAAGTGAAAGAGGAAGACAAATTTGGATAGCCATCACTATTTTTTTAATCGTAAATTACAACTATTCTTTTCGTATTCTAACATAAAAAATAATTTTAAAAGATTGGATATATATACAAGAAACATAGGTAGCGTATCTACATAACTAATTTTTTAAAAATAAAATTCTTTTCACCACTCGTATTGATATCATTAAATATTACAAAAAAAAAAAAATAGAAGCATACAAATTAAGAAGAGTCTTTTGGTCATAAATACTTACCTAACAATAATAGAAGTATGGCTAAAAACTAGAAATAATATTTTTTTGCCTCAGAAATAGTCACCTAAAAATAAATAGAAGTATAAATGTTTGAAGGAATATTTTTCCACACACCAGTTCTACCACAAGTTCTTCTAAGTTTTCAACAAATGACTGGCTGAAAATATTTAATAAAAGTAAGTACAAAATACAGTACTTTTTTTTTATCATTCTGAAATATTAATATGTTTATTTTCCTAACTAGGAAACCCAGTAAGCAATTTCTTAGAAAGAGGCAGCATTTAAGAAGTTCAGCAGTAGATATGAACAGGAAGTTTAATTTTAATTGGAAAATAGTATACCAAAAAAAAAACATCTTAAAAATTATGTTTTGTCCTATTTTCATAATTAAATTCAAAACGTGTCAAATGTTATGAGTTTGATTTATGCATTTGTTTTCTTTTTCGAATTTTTCTGTTCTCTGTTTTCCTATTTGTCACCCCGTGATTGTGGACAGCAACGTTCGTACTGAAGTCAAAGGGTGGGTTGGATTCCGTCTTTATTAAGACTTGATGGGCATTTTCACAAACCCGAGAACCTACTTTTCTGTCTCGTATGAATAAGACATTCATTTTGAGTTTGGCTTTTAATTCTTCATTCCTTTTATGTTAAAAAACGCAGCACACTGGTGTGTAGTGTAGTTGAATTGCAGTGAAATTGGCAATACTAAAACA


Gene Sequence:
>Vu_05243(+)
ATGGAGCGCTATGAGATTCTCAAAGATATTGGCTCTGGGAATTTTGCTGTCGCCAAACTGGTTAGGGAAAACCGCACCAATGAGCTTTTTGCTGTCAAGTTCATTGAGAGAGGCCAGAAGGTCTGCTTCATCTTCTTCGTCCTTTCAATTTCAGTTGCATAACTTTGTTTCTTTTTCTCTTTTTTGGCAAATTATTCATCTGGGTATGTGTTTTTTTTTTTGCTCACTGTGGGACATTGGAATATGGGCTGCAGATTGATGAGCATGTTCAGAGGGAAATCATGAACCATAGATCATTGAAGCATCCCAATATTATTAGATTCAAGGAGGTTAGTAAAAGAATACTCACACTTCTAATAATGAGTGAAGGGTGGCTTCTATTTTTTTGGTTTTATGTTTAGCTCAATGATGAAATTCTGCAAAATATAAAATTCGCTTTTGGTCTTCATCCTACTTTTGAACAGCCTTTCTGTTTTGTTAATCTGTGCTATTTAGATGTAATATTTTAAGCATTCTTGGTTTAATTCTCTGACTACTTTTTATCGTTAAATGTTTTTTAACGTTTGAGGATCTGAATATTGGCCTAAAGAAAAGATGAGAATGTGAGATGCAAAGATTGTGTGGTGGTGGTGGTGGAAAGTAGTTACCACTCATGAAAGATGGGGAACTTGAGAAGTTAGCTTTGGAAACACTCATCATTATGACTTTGAATATTGATATACTTTTTATATTTTGGTCTCCTGTTTTGTTATTCTACCATGTATTGAAGTGGGTTGGGAATCAGAATTGAATTTAGCATAATACAAAGGTCCCCGCACCAAACTTTTTCGGATGTATTTATCCACTTTTTTTTTCAGTTTTCTTTTTTGCCCCCTTGATGTTTTTAGTTTAGACTGTGTGATTAGAAAAACCCATCCTACATTTTAGTTTTCTCTAATTTTCTATTTTTTATTTTCTCCTTTTCCTGTGTTTTGTGAATGGTATTGTTAATGTTTTGTGCTTCTGTTCGGAAAAAATTTAAATTTTATGATGAACTATGCACTAGGTATTTTACAATCTGAACATACTTACAATTGGAATCATATTCCAATCAGTTTCAAAAGAAGGAAAAAGATCCTTTGCGTGAGCTTTGATGAGTCTACTTGTAGGTCTTGCTGACACCAACTCATCTAGCAATAGTAATGGAGTATGCTTCTGGAGGAGAACTATTTGAGAGGATATGCAATGCTGGTAGATTCAGTGAGGATGAGGTAATATAGAAAGTGAGGTACTATTTGATTAGTTTATCTAGATCTATTTCAGTATAATGTTGTCTAGTTTTTATATTGTTGTTTAGGTTCCATTTGATAAGTCCAAAAGTTGAACTTAGTCTACTACACTTTTATTAATTTGGTCATGTTATGCTAGTGTATGCATTATTTCATTCAGAACTTGGGTCCTCAAGTCCTTGTTACTTTTTACCAGGCAAGATTTTTCTTTCAGCAACTGATATCTGGAGTCAGTTACTGTCATTCAATGGTATGAAACTAAACCTAACATGTGTCATGAACCATGTTCCTTCACAAAGAACAGATATTTATGGTAATGTCTATGCAGCAAATTTGTCATAGAGATCTGAAGCTTGAAAACACACTCTTGGATGGAAGCACTGCTCCACGACTTAAAATTTGTGACTTTGGTTACTCAAAGGTAGTATATAATGTTAACAAGGATTACAGCTTTAGATGATGATGCCCTTCTTCATGTGACATTAATTTATTATTTTCTTGTGTTTAGTCATCAGTATTGCATTCTCAACCTAAGTCAACGGTAGGAACTCCAGCTTATATTGCACCTGAGGTTCTTACAAGGAAAGAATATGATGGAAAGGTAAGGTCTTGTTTTTCCTCATTGCTTATGCTTGGTTTTGGCTTTTTGTAACTTAGATACATGTGGTCCTTGCTGCTTTATTTTCTACTTATAAGTTTTCATTGGAAGCTATAGATTGCAGATGTATGGTCTTGTGGAGTCACCTTATATGTGATGTTAGTTGGGGCTTATCCTTTTGAAGACCCTGCAGACCCAAGAAACTTCAAAAAAACCATTGGTGTGAGTAAAATAACTGATGGCTGCAAATTTGTTGAATCCTTAAACAATTTTAGTATTAATATAAGAGTTTTTCTCACGATATGGTGTTTCAATTGGACCCTTTGTGGCTTATACAGAAGATACTTAGTGTCCAGTACTCAGTCCCAGATTATGTACGAGTTTCCATGGAATGTAGACATCTTCTATCACAAATATTTGTGGCAAGTCCTGAAAAGGTAACGGATTTAATATCTAGAATCTTAATTGTTTTCTGCATCTATAAAATACTTATTAGATAAAAGATTTAATTGCTTAATTTCTGGAGCAAAATGCTTATATAGATGCTCTTCATATTTATTCTCAGCTAACTTAATAGTTCCATGTTTTGGCTTCTTCATGTTTTGGGCACAATTCTAGCAATGCTTATTGTTTCCTGTATTGAAATGCATTTAGACTCCTTTCCCATTGTATTGATCCATTTAAGGCATTTTACAGAGAATAACAATACCAGAAATTAAAAACCATCCATGGTTTTTAAGGAACTTACCCATAGAACTGATGGAAACTGGAAGCTGGCAAGTAAATGATGTAAATAATCCATCACAAAGTGTTGAGGAAGTGCTGTCTATAGTACAAGAGGCAAGAAAATCTCTTAATGTTCCAATTGTTGGTGGCCTTCTTAATGGGGGCACCATGGACCTGGATGACTTGGAGGCTGATGAAGAAGATCTTGAGGATGTAGAAACAAGTGGAGAATTTGTGTGTCCTCTTTGA