Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05168 LG1 76596093 76599798 PREDICTED: scarecrow-like protein 21
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 76598798 intron_variant
A/T 76598860 intron_variant
A/T 76598885 intron_variant
C/T 76599755 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05168.1
MDSQQLFSFGVASAGLPYVPSFPTVPSLPNRLLGSLKYDIGNSPNSPFSTYFDSDTLSALSDGQEQYSPGEILSGVSSSCNSSLETNQYMYKSISSVDFIDNFPLYSAWNSLPQNVNSNQKIQHALLELETALMAPDDDQVTTPNTLAGSSRPMASGHRYKPWRHENDGSQYAQPSYVPSSRLSSEVVHVEKRQKLTEEPSLQAFPPNDLKQLLIACAKALHENNIKDFDQLVGKARDAVSINGEPIQRLGAYMVEGLVARKEASGKSIYHALRCREPEGEELLSYMQLLFEICPYLKFGYMAANGAIAEACRNEDRIHIIDFQIAQGSQWMTLLQALAARPGGAPHVRITGIDDPVSRYARGGDGLDIVGKRLGLMSEKFGIPVEFHGVPVFSEEVTREMLDIRPGEALAVNFPLQLHHTADESVHVSNPRDGLLRLVKSLSPKVTTLVEQESNTNTTPFFNRFIETLDYYLAIFESIDASLLPRESKERINVEQHCLARDIVNIIACEGKERVERHELLGKWKSRLTMAGFTQSPLSSYVNSVIGILLKCYSEHYTLLEKDGAMLLGWKDRNLISASAWHC*


CDS Sequence:
>Vu_05168.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05168::LG1:76599798-76601798(-)
AAGTGGCAAAAATGAGTTGAGTTGGGCTTGACGGATCAAAATTGGAGGCAGTCGAGTCTGATCATTGGTAATTTTTTAATTAAAAATTAAAATAAAAGATAATTAAAAAAATTAAATTTTTATATTATATTTTTTAATAGTGTAAATATATATTAATATTGTAAATTATATTATTAATATTTACAAATTAAGTAATTATTAATATTAATGAAATTTTTTTAACATGTAATAATTATTTAAATTTATTTAATTAAAAATATTAACAATTAAAAGTTTAGAAAATATTTTATATGATTAAATATGTTTTTAATATTCATTTATATATATAAATAAAAAATGAAAAACAAAATATTTAAAAAATAAAAAACAAAATATTTAAAAAATTGAAAAAAAAATAATGGGTCAGCTCGGTCTACCTGTTAACTAATATTGTACGGACATTTCTTCTTTGGGGGCTAAAATATCTTTGCTGCCATAGTACATTTTGAAGGATATTTATTAATTAAAGTTATGTTTACACTATTAAAGGTCAAATGTCTTCTTGTTTTTCTTCACAATTTACGTGCTAAGCCATTTTATGCTGGCAAATGATCTAAAGAAGTTTTTAAACTCATGTGAAGATAATCTAAAAATATTGGCTCTTATACCGTGATTTATTTGCAATCGTTCTTACTCAATAATCACTCAGAAGCTATTTTATTGATTGATAAAATTGCAGTTTATGTAGAACATACATCAAAAATCAGTAGAGTCAACATTAATAAACAAAAAAGGACACTTTAGGAGGTTTCACATGTTCCAAATCAGCCGCCTTTATCCAAAACAGTAAATTTCTTAAATATGAGAATCAAAAGGCATAGAATGGGTCAGCCAAGAGCCGTGATCTGGTAGAAATAACGTAAAAAGTAAAATATTTTGTTTTTAGTTAAATATATTTTTAATTCTTATAAAATAAAATTAGTCTTAAATTTGATATATTTTTATTTTTAAATTATAGAAATATATAAATATAATTTTTAATTCAACTATATTAAATCTTTTTATGTGTTAATTACTATTTTAAATTAGTATTTACTTTTTGACACATACTAATTTAAATATCAGTTTAAAACATTATTTAGTATGTAAAATTTAATATTATTAAATTAAAATATTATATCAATTTAATTTTCAAAGATGGACACCAAATATATCAAAATTTAAAATATAAATAAATTTTAATTTTTCATCTAAATTTAAAAATTACAGATATATTTTACTTTTTATTTTTTTAGGATAAAGGTAAATCAATGAAATTCCAGCTTTTCTTTTTGTTTTGTTCAATTACTCCTCAAATACCCAAATGGTCAATTTCACAAATATCAAAGATTATTATAACTTGAAAATATGTTTAACAGCTGGCGATAAGCGAGATTAAGCGGATAATACGAATTGAAAATGTGGGCCCGGGTCATTCAGATCCGAAAGTGTGGTGTGGGTTACACCCACAGGATTGGATATTAATGCGGTCCACGACCATAGAAAACCGTAGAAGGGAGCATGTGAGAGCTCGCCACGTAAGTAAAGCAGTCAAATCAAGCGTCAGAAACCGACACGTGTGTGACCGAGCGAGAGATTAGTGTTACGGGTATGGAGGCATTTCGTCACGCGCTTTTCTACTGTTACCGCACCAAATGACAATAAAAGTAATTAATAATTTGATACAACGTCACCCATGAGTCATGTGGCGCGTGTGAACTGATCATTATTTAATGCGTTACTTCGTGCTCTTCGCTCTAAGCTTTGGACCAAGTCTTTCTTTCTTCATACAAATATCATACTTTCGAGATAACATTTAATCGTTAATATTTATTTTCTTTTATGATATGAAACAAGCATCAAATTAACATTTTAATCAGTGGTAATAAAATTAAAATTAATTTAGTAGAATAATTGCATGAGTTAATATCTAGTTAATTAATTAATTAATTTATTTATTAGTGAGGAGAGAGTGGAAGCTG


Gene Sequence:
>Vu_05168(-)
GACCCGTGTGAGAAGAGAGTAGAAAAGCCAGGAATGTGGGACTGCACTTTCCTAATGTGTGGTCGGCTCCGTTTAAAATAAGCGGCGTAAGTAAACACTGATATTATGATGATATCATCGTAGACAACCGCCGTTACCGTCACCATTGTTATCCGTACCGGTCTTCGGTCTTACCCAAACACTTGCTTCTTTCTCTATATAAAACGTTCAGACACCCTCCTCAACTTCATCCAAACCAAAAAACACACACAACAACACACAGTCGTTAATAAAACATCAACATCATCATCATCGAAGCTGCACAAATTCCCAACACTCAACAAAGCTCAATTTAGATTATCCTTTTTCGGTAATTTCTTTAACATTCCTCAGAGAAGTGGTTTTGTTCTGTTTCTAAAATGAGCATACCCATCCCCTTGTATGTGTACGTTTCTGTTTTCCCTCTCTTACCGTTCACGAATGTTTGAATTCAATACAACGTGGGTGGTTCTCTGGAATAAGCATGTAGATGTATCTGATTTTATTTTTTAATTTTCTCTATCTTAAAAAAAAATACCAAATAATTCGGGTTTCAGCATTTGATTGTTTCTGGTCATGATTTCAGCGTCTTGCTTCTTCTTTAATTGGTTTGCTTTCTTTTTTTAATGAAAAGATTACGTTATGGATTTTAACTACAATTTCATTGATATTAAACTATTTTTTTTTTAGTTATTGAAGTTTTGGTTTGGATAGTGATGGGAGAGGTTTGAATTAGGAGAATGATTCCTGGGTTTGGAACAATTTCTTTTGCTGTCAGGTGGAAACTATTTTATTTTTTATGTTGTATCCATATGAAACCTACCTGCCAACGGAAGTTGGAGCAAATAACAGTTGTGAAAGAACAAATACAGATGATATTATTAATTCGTAGAGGTTTGCTTCGATTTTCATGATTTGGGTATGTAATCAACAGAGAATTTTCACTTGCTGTTTGGTATCTAATAAGAAGCAACCTTTTTATTAATCACATGGGAGGGCTGTTGAAGTTGCTTTCTTTGGAATTTTTAATAAATTTGTGACATTGTACGATTCCCAGTTCAGATGTTTTACTAGTTGAACATTTTAAATACCAACAAGCTTAAACCTCTTGTTTTTGTTTTTCAGTGTCGTTGTATGTTCGTGTATGATCATTTTTCTTTTTCCTGTATGCATCACTGTAAACCCAACCACACTCTACTTAGCCATTCCAGGCTTCGATTACCTCTAGTGGTGGCAAAAGAGTTATGAATTTAATTTTTCACACTTCATCAACATAAGTTTTCTAGTGTTCGATCGCTTTCTTTATTTCTTGTGTGAGCAGTTGTTATCTTCTCTACAAATTGCAGTTGCACTAGATTAGTGGTACAATGAACTTGTGATTTAGCTATTATTATACTTATTAGTACCTGTCTATGTTGTCCTTGCAGGCTCATACTCTTATATTGAAACTGTTGGGGTTCAAGTGTGAAGCAAAGTGTTGAGAAGCTTGCAGAGGGTGGTGTTTTTCTGATTTGCTACTCAGATTAATAAATCCCCCCGTCACATAAATCAGCTGATGCCATCTTAGGATGGACTCACAACAGCTTTTCAGTTTTGGTGTTGCAAGTGCAGGATTACCTTACGTGCCATCTTTTCCCACTGTTCCATCCCTACCCAACAGGCTGCTTGGATCCTTGAAATATGACATTGGCAACTCACCTAATTCACCATTTTCCACTTATTTTGATTCTGACACCCTTTCTGCATTGAGTGACGGCCAAGAGCAATACAGCCCCGGAGAAATCCTCTCGGGTGTCAGCTCCTCTTGTAACTCTTCACTGGAAACCAACCAATATATGTATAAATCAATCTCTTCTGTAGACTTCATAGACAATTTCCCACTATATTCTGCTTGGAACTCTCTTCCACAGAATGTGAATAGTAATCAGAAAATCCAACACGCTTTGCTAGAGCTAGAAACTGCTCTGATGGCCCCCGATGATGATCAAGTTACCACTCCAAATACATTGGCCGGGAGCAGCAGACCAATGGCATCTGGCCACAGATACAAGCCCTGGAGGCATGAGAACGATGGATCACAATATGCTCAGCCATCATATGTTCCCAGCAGTAGGCTATCAAGTGAAGTTGTGCATGTAGAGAAACGCCAAAAGTTGACGGAGGAACCATCACTACAAGCTTTCCCACCAAACGATCTGAAGCAACTGCTGATTGCATGTGCCAAAGCCCTTCATGAAAACAACATCAAAGATTTTGATCAATTGGTAGGAAAGGCTAGAGATGCTGTGTCGATCAACGGGGAGCCAATCCAGCGGCTTGGCGCTTACATGGTAGAAGGGCTTGTTGCAAGGAAGGAAGCATCAGGAAAGAGCATCTATCATGCCCTTAGGTGCAGAGAGCCTGAAGGTGAAGAATTACTCTCTTACATGCAACTGCTGTTTGAGATTTGCCCCTACTTAAAATTTGGTTACATGGCTGCCAATGGAGCCATTGCGGAAGCCTGCAGAAACGAGGATCGCATACACATCATAGACTTCCAAATTGCTCAAGGATCTCAGTGGATGACACTTCTTCAAGCCCTTGCAGCAAGACCTGGTGGTGCTCCACATGTTCGGATAACGGGGATTGATGATCCTGTTTCTAGATATGCACGTGGCGGCGACGGATTAGATATTGTTGGTAAAAGGTTGGGCTTGATGTCTGAGAAATTTGGCATCCCAGTTGAGTTTCATGGAGTGCCTGTTTTTAGTGAAGAAGTGACAAGGGAAATGCTAGATATCAGGCCTGGAGAGGCCTTGGCAGTGAACTTCCCCTTGCAGCTCCATCACACAGCTGATGAGAGTGTTCATGTGAGTAACCCAAGGGATGGACTATTGAGGTTGGTGAAGTCACTTTCTCCCAAGGTGACCACACTGGTGGAGCAGGAATCAAACACCAACACAACCCCTTTCTTCAACAGGTTTATCGAAACCTTGGATTACTACTTGGCAATCTTCGAGTCTATTGATGCCAGCCTACTCCCAAGAGAAAGCAAGGAGCGGATCAATGTGGAGCAACATTGTCTGGCCAGGGATATAGTGAATATTATTGCTTGTGAAGGCAAGGAAAGGGTTGAGAGACATGAACTATTGGGGAAGTGGAAATCCAGGTTAACAATGGCTGGATTCACTCAGTCTCCTTTGAGCTCTTATGTGAATTCTGTCATAGGAATCCTTCTCAAGTGCTATTCAGAACATTATACTCTGTTGGAGAAGGATGGAGCCATGTTGTTGGGGTGGAAGGATAGAAATTTGATATCAGCTTCTGCCTGGCATTGCTGAAACATGGCTGAAACATAGATAGGAAATACTGTCTAGTAGTAATGGTAGTACAAGTATCATGATGATGGAAGCCACATGGTGCTTGGAGGGATAAAGTTTAAGGTTTATGTTCACTGTTAGTGCTATGAATTTCATCATTCTTCTATAGGACTTTGCCGTACCTTAACATTTGTCCATAAAGAGAGACCTAGTATATTCATTCTTTTATAAGATTTCAAGTGTTTCAGATGTTTTTCTTCTTTAGATATTTTGAACTTGTGCCTGAGTTTGAATTACTAATTATAGGAATCTCAAATTTTGAACAGCGTATAGCTTCGTATATTTAGGAATGAAAATAAATAAATTCGTACCTATGAGGATAAAGATAC