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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05099 LG1 75046692 75054675 PREDICTED: homeobox protein LUMINIDEPENDENS
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   vegetative to reproductive phase transition of meristem, positive regulation of flower development, regulation of transcription, DNA-templated, vegetative to reproductive phase transition of meristem, positive regulation of flower development, positive regulation of flower development, vegetative to reproductive phase transition of meristem, regulation of transcription, DNA-templated, positive regulation of flower development, regulation of transcription, DNA-templated, vegetative to reproductive phase transition of meristem, positive regulation of flower development, vegetative to reproductive phase transition of meristem, regulation of transcription, DNA-templated, vegetative to reproductive phase transition of meristem, vegetative to reproductive phase transition of meristem, vegetative to reproductive phase transition of meristem
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, DNA-binding transcription factor activity, DNA-binding transcription factor activity, protein binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05099.1
MDAWNEDFAEQEIGNSAESFQKFLLSQRDLFHSQIDQFQEIVVTQCKLTGVNPLSQEMAAGALSIKIGKRPRDLLNPKAVNYMQSIFSIKDSISKKELREISALFGVTATQVRDFFTGQRSRVRRLVQLSKERALGSNSCEDPHDDKIIPDPVRLINPASVNSTVPSNAEEASCSTQDASLPDLDDSDKHFVDNIFSLMQQEETFSGQERLMEWILTIQNFSVLLWFLSRGGGITLATWLSKATAEEQTSVLLLILKVLCHLPLHKAIPMHISAILQSVNKLRFYRTSDISNRARILLSKWSKLLARNQVIKKPNGVRPSSDGHKELISQSIGQFVGSESWHSNIDVPEDFLSLSSESLDNFRKVGSPQAAKLLPPSLDDSNKKSTLGVSSSQSRERRKVQLVEQPGQKSVSRSSQVTRAGSVSQGRPMSADDIQKAKMRALFMQSKYGKSGSKESKETKIDSLNKQPQTIPASIAACSSKVPTPPKIDENKKPLLLASKTSNRLEAYSKPNVKEPLWEKCMRIQIPWKTPADVTQVINTFLKFLEPIFLSKEVDVQRNRDRREKETIYKTIQEIPPNPKEPWDLEMDYDDTLTLEIPIEQLPDGDGADITVSPNQVAEHTVQGVASTSSTSVAPAEPDLELLAVLLKNPELVFALTSGQAGSIPGEDVVKLLDMIKRGGANLGLSENTNGSYGTSVKAPDKVEVSLPSPTPLSDPRTNGWSSEASKNPFSRRSVASDRIIQNHAAVTTTNLLTQIPMTSTTALRQQPAVVVSSSRHLSSTTVSPYSLHQATNVNPEKQQPLGHVQIPSSNVGLTMKKNLITTNAPSVNYSGIHSAVAMRGNGTNYVKPVHSMNVQHEGVSNSFPQSSFKLPSPTPSNSASQQQRHQQHIVQEAHYTEPPYRNPSRSYPPQTEKSDHGSESAWRIRQDVPFSSQRNPNNYNTMVGGSRQSGFWDRNNQGGEDFESWSPENSPTRNPRYIPGRNYPDSRVNHGRNHRPEWSRQRGSSEHWDPDRQGNRKWHDQRR*


CDS Sequence:
>Vu_05099.1
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Promoter Sequence:
>Vu_05099::LG1:75054675-75056675(-)
AATTAATATTTACATGTTAATTATATATTGATTTATTTATATTATTGGTATTAATTTTTTGTCCATGTGTTATATAGATAAAGAAATAAAATTAACCACTTTATTTTATTAGAATTTTCATAAGATCAAATATATTCTGTTGAAACTCTAAAAGTATTTTGAACTCTTCAAACTTTCGATTGCAAATGTATTCATTCTTATTAAGCTGGGTAAGAAGTATGTTTGTATAAGACACTGGTTTTTTAATTGAAAACTAATGACATTGGTTTATATTTTGAAGAAGATAATGGTTTGAGTGAAAAGAAATTATAATGACTGCCTTGTTTAATGAATTACAAATGACAAATTTGTATAGGTCAAATGATGATGATTGACATTAAATATATTATAAGAGTGACATTAAAAATAAGATATATAATAAGTGTAATTTATTATAAAAAAGGATTGGTTGAAAATAATTTTAATTAAATATTAAATTATAAAAGAATTGATATTATTATTAAGTACTTGTTTTCTGTTAGTACGAAATAGTAAAAGAGAAACATTTAAACAATTTGTCTGTTTTCACATGCATTTGAAAAGGGGAAATATCATATTATTAGTTAATTAACTGATAATAGCTTTTAATAATTATTACCCTTAAAGTGAATTGAATGAAACAGAAAATGAAAATAAATATACAGAGAGGGCATAGAATTGAGGAGAGAAGTGTAAGACTATTGCAAATTTTGAGAAATGGTGGTTAATGGTGGAATATAAGTGTCTAATGCAGCCTTAATTCAAACAAAAGTAAGGTCATTTAGATAAAAGAATTGGCCTTGTTCTTTTGAGTAGATTTGACGGGATTTGAAGATAAATTTTTTTATCGTTTATTTGAGTGAATTTATAAGTAAATGAGAGTGAATTTGGAAATAAATTTTTTAATTTGTCACAAATTTTATTTCTAAATTCACTCTCATCTACTTCCAAATTCACTCAAATAAAGACAAAAAAATTTATCTTCAAATCCCCTTAAAAGAACAGGTAAATCATCTCTCACAGATAAATTGTCATAGACAAACAACAAAATATTTGTTTTTCCCTCCGTAATAAAAATAAATCAGTAGAAAAAAAATATAATATTATAGACAAAATGTATAAAATTTTGGAACAAAGACAGATTTTAGTTTCACAACAAATTTAGAACTACAAATACATTTATCTATTAAAAAATAAAAACACAACAAACATAAATTCCCAATATGCAACAAGAATACCATACCTAATATTAATAAATACATTGACTAACATCATCAACAAAAGATTCATAATAATTTAACAAAAACAACTCATTTCACCTTAAAGAAAGTTCTAATGTGTTTTCAAAATTAAACAAAAATATTATTTACAGAAAAAAGAAGAAGAATTTATCATGAACATTCTATATTTTATGCCATTTCCATGTCAAATTAATTACAAATTAAAATGTTTTTTATTATCTCCACACATAAAAAATTATGTTTATTTATATTTTAAAATAATAAAATGTCAGATTACTTATACATTTTTGGTTCAAATCATTAGATAATTTTTTTTTATGTTTTTTAATGGTACAATAAATAAAAATTATCTAATTTTCGGTACAATAAATTATTTTAGTTTTGATACAGTAAATTATTTAGTTTGTGGTACACAAATTATTTGTTTTAATTAGTTTTTAAACATAAATTCAGTATAAAATACACAAATTATATTTTTTAACATCAATGGTCATAAGCCTAAAAAATAATTCCTGAAATTCGACCCAAGTCCCGAACATGGCCTAATTCTCTCTCGTCTCATCCGACACAGCAGTACTCTATCTGACTTTCTCTCTCCAAAATTAGCTCCGAGCCAAACCCTAACCAGTTCCGTTCCGAACTGGAAACCAGAGAGAAACATTGAGATTCATTCAATCACCTTAACTTAAATGCGTGTAGCTACGCATTGCGTCGAGGGAACTTCGATCTTCGTTATCAACG


Gene Sequence:
>Vu_05099(-)
ATGGATGCGTGGAACGAAGATTTTGCGGAGCAGGAGATTGGGAACTCCGCGGAATCGTTCCAAAAGTTTTTACTTTCGCAGAGAGATCTCTTCCACAGCCAGATCGATCAGTTTCAGGAAATCGTCGTCACGCAATGCAAACTCACCGGCGTCAACCCTCTCTCTCAAGAAATGGTGCGTTCTCAAACATTTTCATCTCTCTCTTTGGTTTGTTTAGCTTTGTTTATAATCTCATTGTTTACTTTTGGTTAATGGAAAAAGTGAAGAGCCTCTTAGTTTCGTTTCGTTTCTAGAGTTATGCTGTGTACTCGGAATCATTTGAACTCTTTGAAGCGTTCGTAGAATTAGTTGTGAACTCATTCGGGTTATAATTTTGCTTTTGTAGTAAGCGATTTTAAGGCGTCGTCGTTTAAGTGTCTGATTTTGTTCAAATTTTTGTTTGTTTTTGGTGCAGGCAGCTGGTGCTTTGTCAATAAAAATTGGTAGGTTTTTTTGGTGGTACAAGATTTATTCTTTTTTGCTGGCTTATGCACAATTCTACTCTTTGTTTCATATTGAATGTCTCTCTGACTTAATCCAAATTGGCAGGAAAAAGACCTAGGGATTTATTGAACCCAAAGGCTGTAAATTACATGCAATCAATTTTTTCGATTAAAGATTCTATTAGCAAAAAGGAGTTGCGCGAGATCAGTGCTTTATTTGGTGTCACAGCGACGCAGGTTTATATCACTCTACTTTCTGTTGAGTTTTTTCTATACGACGGTTCGTGTGCAATGATCTATGTATTTGAGATGTTGTATGGAGATATATTATTTTTACTGCCTTTCTTGTTTACTCATTTGTTTGTAGTTTGTTGTCCTTTCCAAGATGTCATTAGATCATTACCTATTATACATTTTTTGACAGAAGAGGGTTGTATTCACTTTTGAATTTTATGTTAAGATTACGTGTTGCTTGGTTCCTGTTTTGCGTAAATTTATGAATCTTTGTATGTTGGTTTTAGGTGCGTGACTTTTTCACTGGGCAGCGCTCAAGAGTGAGGAGACTAGTGCAGCTTTCAAAAGAGAGGGCACTAGGTTCCAATTCTTGTGAAGATCCTCACGATGATAAAATAATTCCTGATCCTGTTAGACTAATTAATCCAGCTTCCGTAAACTCTACTGTCCCATCCAATGCTGAAGAAGCATCTTGTTCAACACAGGATGCATCCTTGCCTGACCTAGATGATTCAGATAAACATTTTGTTGATAATATTTTTAGTTTAATGCAACAAGAAGAGACATTTTCCGGGCAAGAGAGATTGATGGAGTGGATATTGACGATACAGAATTTTTCAGTATTGTTGTGGTACACAATTAGCTTTCTCAATAGCATGATAATATTGAACTATAATAATTTATATTTTCTGATTTAGTTTTTCTGCTGTATGCTTGTAGGTTTTTGAGCAGAGGGGGTGGAATAACTTTAGCTACTTGGTTGAGTAAGGCAACTGCTGAGGAGCAAACCAGTGTCCTTCTTCTTATCTTGAAGGTAAATCTAAATACGTGGTTAATATTTTGTGTTGCATTTAATTGGCACATATCTGAATACTATCTAACACTCTGGTTAATTATTTTACAGGTTCTTTGTCATTTGCCTTTACATAAAGCCATTCCCATGCACATATCAGCTATATTGCAGAGTGTAAATAAACTTCGGTTCTACAGGACATCAGGTGTGTTTATCTTTTTCTGGTTCAGTTCCCATCACACTCGACCTGTTCTGTTCCCAATACTTCCCCTTTCTTCTTGGTGTCTATTGATACTGTCCTTGGATTTACCTGGATAACATGTATTTGATGATAACTGCAACGAGCTAATATTTGATAACAGCCTAGGACATTTTCTTGAAGTAGAAAGAAACACCTTAGCACGTGGTTAGCTTGTTTGGTCATGGCAACTATTCTTATAGTGACAGCTCTGGTTCCAAGTTGTCATATACGCATGTTTCATTGTTTTTGTCTTCATATTGTGGAATGTCGATCAGGAGACCTGTGTTTGGGATTTAATATTCATTTTAAATATGAAGTCCAGGTTTTCATTCATTAGTTGTGGCTTGCTATGCTGTTAGTGATATTTGAAGGAGCGAGATAGGTAGGAGGAAAGAGGAGTTGACAATTGAATCTTATTCTTCCTTTAAATGTTATCAGACAGTAAATAGCAGATAAGATATATCTTAATTTATTCTGAGATGTATAAGTCGTGTTCTGGTTGACTGATGTAACACTTCCTCCTTCTCATTTTGTTCAATGTCTGTTATTATTGTCAAATCTTAATTTCGTACCAGTTCTGTTTGATGCCACTTATTTTAATAACTTGATAAACTTTTTGAATTATAATCTCACTGATTTGGGGATCAGACATATCAAACAGGGCAAGGATTTTGTTATCAAAGTGGAGCAAATTATTAGCGAGGAACCAAGTAATAAAGAAGCCCAATGGTGTTAGGCCTTCTAGTGATGGGCATAAAGAGTTGATTTCTCAGAGGCAAGCTTGCATTCTCTTTTCCATGAACAATTTGTTTAGACATTCTTTCTCAATTATTATGGTTTCTACTTTTTGTAGTATTGGTCAATTTGTGGGCTCTGAATCATGGCATTCCAATATTGATGTTCCTGTAAGTGTTTTCTTATATAAGTTTAAGCTAGCAACTCCTTTTCGGTTTGCATATTTCTTAGCTGCTTCTTTCTTGCTCTCAGGAAGACTTTCTTTCACTTTCAAGCGAATCTCTGGACAATTTCAGGTACTTGTAGGTTGTTCGTGATTGCTTCCATTCATCTGTTTTCATTCATTTGAATAAATCTTTCTCTTAATAGTTTTATGCCATACTTGTTTGAGATAATTGTCTTTGCTTTTGTTAGTTTTGAAAATGCTTTTTGTTTTTCTTCCCTGTTCAGGAAAGTGGGATCTCCACAAGCTGCGAAATTGTTGCCTCCTAGCTTGGATGATTCTAATAAAAAGTCTACACTTGGTGTTTCTTCATCTCGTATCCTTGTATTTGTAATAGGCTTACTAACTGGTGAAATTGGAATTAATGCCCAATTTGATCCTTGAAAGCGTTTTATCAAATTGACTTGCATACCTAATTGGTCCTCAAATAGTATATTTGATTATTGAATGATATCAGTTTGGCTATAGTGAACTATAACATTTGGACTATTTTGATGTCAAATATTATCTTTGAAGAGGACCTATATAGTGTCATAGTGTTTCAAGGACGAAAGTGGTGGGTTATTTGTGATAAATGCTAACCGCACATTATCTGACATGCTTTATTTTAATACATCATTATTGGCTAAATTTTTTAGATTTATGTGTTGATGTTGGCGCTACTTATTTACTGCGATTCTCAATAAATTTTAATCAATAATAATGCATTGAAGAGAATATTGTCAGCACCCCTCTTACTCAAAATTGCTTATGGTTCATGTCAGTTGTTGAGTCATGCGAAATGTAGGTTATATCTCTTTTCTATTCCTTAACCCCTCTAACAGAATCTAGAGAGCGCAGAAAAGTGCAATTGGTGGAACAGCCAGGCCAAAAGTCAGTTAGCAGAAGTTCACAGGTGACAAGAGCAGGGTCTGTAAGTCAAGGTCGGCCCATGTCCGCTGATGATATCCAGAAAGCAAAAATGCGTGCTTTATTTATGCAGAGTAAGTATGGGAAATCCGGTTCAAAAGAAAGTAAAGAAACAAAGATTGATAGTCTGAATAAACAACCTCAGACAATTCCTGCCAGTATTGCAGCTTGCTCTTCTAAAGTTCCTACTCCTCCCAAAATTGATGAAAACAAGAAACCTTTGTTACTTGCCTCTAAAACCAGCAATAGGCTGGAAGCTTATTCAAAACCGAATGTGAAGGAACCTCTCTGGGAGAAGTGCATGAGGATTCAGATACCATGGAAAACACCAGCAGGTACATTTGCAATTCTTTTATTGGTTTCATCAAATATATCAAATTTACGTCCTATAATATTAGGCTAGAAAATTGGGGAAACTCTCAGCCGATAAATGAATGATAAGACATATTGAGAAAATAGCATATTGACAGGACGTTGAATTAAAGAGGTAGATCTTAGTCAATTTCCTGCACATTTTTTTGGAAGACATAGCGGATGCTTCTTTGCTAACTCTATTGACCCTATATATGAATAAATAGAGCAAGAGTCATGGTCTAACCTTATGTTCTGTATATTGAGCAGTTGTAAATACGTCTAAATATTTAGTATTGTTCAAGAGATTAATAAAACATTGCCGTACAAATGTACAACTTGAGTTTTTTAGTTTCAATACTAACACGGATATGTTTGAAGATTTTGGGATTTTCCTCCAATTCTAAAATTTCGGACAATGTTTCTGATTGATTTCCCCTACATCTTATCTGCACAATTGTGATAAAAGGGCGTGATACTCCTAAATCTCTTATAAAGAATGGGCTTAAAAATATGTCGTTTGAGGACTTATAATTGTCTACGACGAGCTATACTAAATATTGAGGTGATCTCAGGGACATGATCAGTTCTACAAAATGGTATTAACATGTAGATCATTGATACAATATTTTTAAGAACAATAATTTTACAATCCGAATTTATTGTAAAAAAATTCACATGTATCGATATTAGAGGCTCTCTGTTCCTTACACATGTTCCTTTACATCTTTGCCATGATTCATGGGAGGGAACAAAAGTTAAAGCATAGATGAATTGGTTTGAGCGTGGCCTGGTATAAATCCATGCTTTTGTTTTTGCTATAATGAGGAAGGCAACAAGGAAATCGGTGCTTCACTAGGATCAATGATCCTGAGATATTGATGTGTAGTAATAGTAATGATAGAAGTATATGCCATAATTCAGGCCAAAGATAAATTAAAATTAAATAATTCTCACTTAAAATACAACAGGGGTTCCAAGCCCCCGTAATTCAGTATTAGGCACAGGTGGAGACACATTTGACTTTCAAAGTTAACTTTAAGCATACACGCGAACACATTAGACTCTAAAATTTAATTTCATTATTTTCTTACATGTAATGAATAAAAATAGGAAGAAATTTGATTTTGATAAAAAAGGGAGCTCTTTTCCATTTGTTATTCCACGTTCAGGTTTATATATGTTTCATTTGGGGGTAGCGATATTCCTTTGTAATTTGCAATATGATCTTAGATCTGAGTGAAGCACTGTTTGTAATTCATATCTGTGGGACGAATGAGTTTGTAATTCATATTTATAAACGTAGTATAGGTTATGACTGCGGTTTTGCAACGTGCAAGTCTCGAGTATATATAAACTGCAACCTGCCATGATATGAATTACAGCACCGAATTAATCCAATCGGAGTGTTGATGGGCGTCTATAACTTTAATTTGGTTAGCCGCGACATATACAGGGACTGTCAACAGCAAGTATCCGTTTTCGTTTGGTGAACTCTGTGGTACTGTCTGTTGTATTTGTCACCCAGCCTCCAATCCTTGAAAACTCATTAAGGGATCGGTGATCGTTATAATAAACGAATATGACCAGCTTGATTATCTTTTATTCCTTTTCCATTTATCATGAAAAAATTGCCTCATCTGGGGCTTGATTTTTGTACATTAATTTCATTAATTTGTAAATCTTGTAATGTATAAATAAAATTAGCAAATGTTGTGATGGGGCAACTTTCTAGTATTACAGTTACAAGGTTATCAGGTCGTGGATTATTTCTAGTTATCACCATAGGAAAACGGCCCAGATTTTGAAATTTCAGTCACTGTTCTTGAATTTGGCTGTGGCGCTGATCGAATGTTTCAGAAACAAAATTGGATGTTTGCTTGAAATAAATTTACACATGATATATTTGAGGTGCTACAAGGTGTGGCAATGAGATATAAATTTTTCTTTACCTATCATTTTTATGGTTCTTCTAAGATGTAACTCAAGTAATCAACACCTTTCTCAAGTTTCTGGAACCCATTTTTCTTAGGTTTTAAATATTTCCCTTTTGGTTCCTTTTTCCTTATTTTGCAGAAGTAGAACTTAAAGATAGCTGGAGCGTTGGGGCGGGGAAAACAGCAAAGAGGTTGATGTCCAGAGAAACAGAGACCGCAGGGAAAAGGAAACTATATATAAAACTATCCAAGAAATCCCACCTAACCCCAAGGAGCCTTGGGACCTTGAAATGGACTATGATGACACTTTGACGTTGGAAATTCCTATTGAACAGTTGCCAGATGGTGACGGTGCAGACATAACAGTTTCCCCCAATCAGGTTGCAGAGCATACTGTTCAAGGGGTGGCCTCCACTTCTTCGACAAGTGTGGCTCCTGCTGAGCCTGATTTAGAATTGCTTGCCGTACTGCTGAAAAATCCAGAGTTGGTATTTGCCTTAACTTCTGGACAAGCGGGTAGCATACCGGGTGAAGACGTAGTGAAGCTGCTTGACATGATCAAGAGAGGAGGTGCGAACTTGGGTTTAAGTGAAAATACAAATGGGAGCTATGGCACGAGTGTAAAAGCCCCGGATAAGGTGGAAGTTTCGCTCCCATCTCCAACCCCTTTAAGCGATCCAAGAACGGTGCGTGATTTGAGTTCATACTACCACTATTTGTCAAAGATCTTATCATCATTCTTGATGTCTCCTATTACAGTGCCATGCACACCCCACTTTAGCCATGTTGGCTTATACGTGTTGAGAGCGGAGAGCGTCTAACACTTTAATATAATAGCATAGACTGGGCCAAATTGAGATAAATCAATTGATTTCTAAGTTTTTCTTGTGCTTTTTATATGACAAGATTTTGCACGGTCAGGTCCTTGCGTGGCACCAAATAAATAGTCTATATCAAACAGCTAATTTAGGCAAAACAAGGTTCCCTACTTCCCTTGGAGTAGTTGTACTGGCATTTAGAGTAGCCCTCAATATTTTCGTACATTTTACAATTTTCAACGTGATAAAATCTTTGAAATCCTTAATATTTTCATCAATTATAAAAAAAAGTATTGGTTACTGTATTAACTAATGTGCTCCCATTTTATTAACTTTTCAGAATGGATGGAGCTCAGAAGCATCAAAAAACCCCTTTTCACGGCGAAGTGTAGCATCTGATAGAATTATCCAGAACCATGCTGCAGTGACAACTACCAACTTACTAACTCAGATTCCCATGACTAGCACTACTGCACTAAGGCAACAGCCAGCAGTAGTGGTTTCATCTTCGAGGCATCTCTCAAGCACAACAGTTTCTCCATATTCACTGCATCAGGCAACTAATGTTAATCCTGAAAAGCAACAACCACTGGGGCATGTACAAATACCATCCTCAAATGTAGGCTTAACCATGAAGAAGAACTTAATCACTACCAATGCACCTTCAGTTAACTATTCTGGCATTCACTCAGCTGTAGCAATGCGGGGTAATGGCACCAATTATGTAAAACCCGTACATAGTATGAATGTACAACACGAGGGTGTGTCTAATTCCTTCCCACAGTCATCCTTCAAGCTACCCTCACCAACGCCGTCAAATTCAGCCTCACAGCAGCAAAGACATCAACAACATATAGTCCAGGAAGCCCATTACACCGAACCTCCTTATCGTAACCCTAGCCGTTCCTACCCACCACAAACCGAAAAATCAGACCATGGGTCTGAAAGCGCGTGGAGAATTAGGCAAGATGTTCCATTCAGTTCTCAAAGAAATCCTAACAACTATAATACAATGGTTGGGGGATCCAGGCAATCTGGTTTTTGGGATAGAAATAATCAAGGAGGGGAAGATTTTGAATCATGGAGTCCTGAAAATAGTCCAACTAGAAATCCTAGGTATATACCAGGTAGAAACTACCCAGATTCCAGAGTGAATCATGGAAGAAATCATAGACCTGAATGGTCAAGACAGAGGGGTTCTTCTGAACACTGGGACCCTGACAGGCAGGGAAATAGAAAGTGGCATGATCAGAGGCGATAA

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