Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_05003 LG1 73110335 73110664 hypothetical protein LR48
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SNP Position Effect Amino acid change
G/A 73110337 start_lost p.Met1?
C/A 73110387 missense_variant p.Ser18Tyr
A/G 73110404 missense_variant p.Arg24Gly
C/T 73110458 missense_variant p.Pro42Ser
G/C 73110499 missense_variant p.Trp55Cys
A/G 73110552 missense_variant p.Asp73Gly
G/A 73110572 missense_variant p.Val80Met
C/T 73110597 missense_variant p.Ser88Phe
G/A 73110601 synonymous_variant p.Ala89Ala
G/T 73110616 missense_variant p.Lys94Asn
G/C 73110625 missense_variant p.Arg97Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_05003.1
MGYLAPELTRTGKPTTSSDVYAFRVLLEVVCGSRPIEVKALPEELVLVDWVWERWRMGAPLAVVDPRLGGAFDEVEVLVVIKVGLYCSAEAPEKRPRMRQVVRYLEREV*


CDS Sequence:
>Vu_05003.1
ATGGGGTACCTTGCACCTGAACTCACACGAACGGGGAAACCCACCACCAGTTCTGATGTTTACGCTTTCAGAGTGTTGTTGGAGGTGGTGTGCGGGAGCAGGCCCATTGAGGTGAAGGCATTGCCGGAGGAGCTGGTGCTGGTGGACTGGGTCTGGGAGCGGTGGCGCATGGGGGCGCCGCTGGCAGTGGTGGACCCCAGGTTGGGTGGGGCGTTTGATGAGGTGGAAGTTTTGGTAGTGATTAAAGTGGGGTTGTACTGTTCCGCGGAGGCACCAGAGAAGAGGCCCAGGATGAGGCAGGTGGTGAGGTATTTGGAGAGGGAGGTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_05003::LG1:73108335-73110335(+)
ACTTGTCAATCCATCAACAAGGTGCGACGAGCAAGGGAGGTGTCGGAGGAGAGACGGTACCCGATGGAGCCGCTGTAGGGAGCTTGGCATTGAGGGAACAAAATGCCTCAGCTACATAAACCCTTATTTGCCTTGAGGGGTTAATGCGAGGTGAGAAAAGTGGAGAATTAGCTCTAAAAATTAAGAGATTTGACTGTTGAAAAATGATAAACAAGAAATTGGAAACCATTAATATGAAAAAAAGAGAAAAAGTTGGACAGCAGAGGAAAGAATAGAAAAAGTACACCACATCAGCACGAAGTTAACGTCGTTGCTGCCAACTTAATGGATAGGACTTCATTCATACAATTTTTACAACTTTAGGACCTAATCTATGTACTTTTAAAACAGGATATTAAGCTGAAAAAAAACCACTTAACATAGAAACCAAGTAAACATTTAATCTTTTTTTTAAACTCTTTTGACGTCGAATGTGAGAATGACTAACATTATTAAGAGAGAGAGGAGCGACCGACGTTAAACTCTCATTTTGTAGTTATCTTCTTTTCAACTCTTATTTCAAAGTCATTTTATAAGTTAATTAAAAAAATTGAATAATTTTTATTAGATAATTGTACGTACCTAATCCGATAAATATACTAAGTACTATAACCTAATAAGGTTTATTCAACATTATTAACCTAAATTTTTTAAATTATTTTCTAAGAGATATTTGTTGGTATAATTATAATATATTAATATAATATGTGATTAAAATCCGATAGTTTGATTATATTATAATATTTTATAATATCATATATTAATAAAATATATTGTTAGTAAAGTAAAATATTACATTATTATTATAATTATGATAATTTAATATTTAATTGATAAATTTGATATTTTCTTAATATTATTAGTTTATCAATCTAATAAAGATTCATAAATCTAGAAAATACATATATTCACTATCTTTTATTAAAAAAAATCTAAACTTTCTTATTATTAATTTGAGTATCCAAGTAACTTTTAAATATTTAACAACAAAGTAATATATTTATGACCCTTTAATAAATTTAAAGACTTTTTTAATGAATACGCAATCCACCCAGAACTAGTTTTAAAAATTAAATGTTTCTTTTGATTATTACAAAGTACCCTCTTTCGTTTATCAATATTTGTAAACAAATTGTGACTGTCAAAAGAATTTATATGCCAATGATCTATTCATGTAAAATCCAATCGAATTTATTTAATTGTTTGTTAGCTTTGATAAGATGGGGATGAATTATATAATTAAACAGATTGTTCGGATGCAAAAAGTCATCAATCTATGTTTCCATGTAGAAAAGTTGTGATGTTACAGATCAAGTTGAAGTCGACAGGGGTAAAAAGGTAATTTCAATCACGTTGACCTTTATTAAACTAAGACTTAAACTTTTCTTATCCTATATATATTGTTTTTCATAAATTCATAAATTTAGTCTTTAAATAATTCAAATTATAAATTTAATCTTATCATATTTTAAAATTAAACAATTTTATTTTAATATTAATATATAACCTAATTATTTTGAAGAACATTACATATTTATGCTCATTTTTGTAATAGATTTAACAATCAATTTAATATATTCCACTTTCATGAATACGTTAATAATTTAATAATATATTAAGAGTAGATTAAAATTACTTAATTTTAAAATTAGAAGACTAAATTTGGTTTAATACCCAATTTTGTCCCCAGTTTGGTTCGGAAATCTCAATTTAGTCCCTCGTTAGAAAAGTAATTGTAATGGATCCTTACTTGTACATTTGTGAGTCAAGTTAGTCTCTTCAGTTAAATATAAGCAAATAGCGTTAATGGGATGATGATGTGGCAATAGTTAGTGGTTAGGTGTCAAAACGCAATAGTGTATGTGCTTACGTGGTGTTGAATTAGAGAAGTTTGGATTTTATTAGAAATTGAGTTTATTTTAATTGGGGATAAATTAGCAGCTAAACTCATGTGGGAAGGA


Gene Sequence:
>Vu_05003(+)
ATGGGGTACCTTGCACCTGAACTCACACGAACGGGGAAACCCACCACCAGTTCTGATGTTTACGCTTTCAGAGTGTTGTTGGAGGTGGTGTGCGGGAGCAGGCCCATTGAGGTGAAGGCATTGCCGGAGGAGCTGGTGCTGGTGGACTGGGTCTGGGAGCGGTGGCGCATGGGGGCGCCGCTGGCAGTGGTGGACCCCAGGTTGGGTGGGGCGTTTGATGAGGTGGAAGTTTTGGTAGTGATTAAAGTGGGGTTGTACTGTTCCGCGGAGGCACCAGAGAAGAGGCCCAGGATGAGGCAGGTGGTGAGGTATTTGGAGAGGGAGGTGTAA