Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04864 LG1 70321771 70323974 PREDICTED: transcription factor BPE
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category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   regulation of transcription, DNA-templated, petal morphogenesis, regulation of transcription, DNA-templated, regulation of transcription, DNA-templated, petal morphogenesis, petal morphogenesis, regulation of transcription, DNA-templated, petal morphogenesis, petal morphogenesis
Cellular Component   is active in   nucleus
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   DNA-binding transcription factor activity, protein dimerization activity, DNA-binding transcription factor activity, DNA-binding transcription factor activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 70321811 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T 70322073 missense_variant p.Pro52Ser
G/A 70322579 intron_variant
T/A 70322847 intron_variant
T/A 70322916 intron_variant
C/G 70323355 intron_variant
A/G 70323509 missense_variant p.Tyr228Cys
G/A 70323892 3_prime_UTR_variant
T/A 70323915 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04864.1
MDPGGMMNEGSFANNGSGNTAPYSLAEIWQFPQAINGGGGLGLRSPQFEHGPGQFGDLPPRPNNGLGTSNTRKRRDSEDDSAKTVSTSNAVNEGDGKRVKATANGDGNGKGEGEVSSGKPAEQSAKPPLEPPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCDKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRLNSEAFPPKDFGQHAYDPAGMPFGSQAPREYSRGSSPEWLHMQVGGGFERTT*


CDS Sequence:
>Vu_04864.1
ATGGATCCGGGTGGGATGATGAACGAGGGTTCCTTTGCGAATAATGGGAGCGGCAATACGGCGCCGTATAGCTTGGCGGAGATCTGGCAGTTTCCCCAAGCGATTAATGGCGGCGGAGGATTGGGTCTCCGGAGCCCGCAGTTCGAACATGGGCCGGGGCAGTTTGGGGATTTGCCTCCCAGGCCCAACAATGGGCTTGGGACGAGTAACACCAGAAAGCGGCGAGACTCAGAGGACGATTCAGCTAAGACCGTGTCCACCAGCAATGCCGTGAATGAGGGTGATGGAAAACGTGTTAAAGCAACGGCAAATGGTGATGGTAATGGTAAAGGTGAAGGAGAAGTCAGTTCAGGAAAGCCTGCGGAGCAAAGCGCAAAGCCTCCATTGGAACCTCCCAAGCAAGATTACATTCACGTCCGAGCCAGAAGGGGTCAAGCCACTGATAGCCACAGTCTTGCAGAACGAGCTCGAAGGGAAAAGATTAGTGAAAGGATGAAAATTCTTCAGGATTTGGTCCCTGGTTGTGATAAGGTTATCGGGAAAGCGTTGGTCCTTGATGAAATAATTAATTATATCCAATCTCTTCAGCGCCAAGTTGAGTTTTTGTCAATGAAGCTTGAAGCAGTGAATTCGAGACTGAACTCCGAAGCCTTTCCTCCTAAGGATTTTGGTCAGCATGCATATGATCCCGCGGGCATGCCGTTCGGTTCACAAGCTCCAAGAGAGTATAGCAGAGGATCTTCACCTGAATGGTTACACATGCAGGTAGGAGGAGGTTTTGAAAGAACAACGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_04864::LG1:70319771-70321771(+)
AACATTGATTGAGCTCAATAAAAATAATCCATAAATGTGATGTTTGACTTTTCTTTATTTTTATTTTCTCTTTTTTCCTTGTATAAACACTTGAACTTTAATACAACATTATTACAATTTACAATACACAAATACAATGTGATACATAATAGGAATATAATTATATTTTCACCTTTATTACCCTAAAATATCCTTAATTGAAGAGAGATAAAAATCTTTGCATCCTACTAATCGTGTCCTTCTCACTCACTCTTAAATCCATTAAAAAGAACATATATATCACTCACAAATCATTCCTTTCCTTATTTAAGGGAATGTTTTATAAATAATCATTTTATTGTTGTCCGTAATTTAATAGTTTTTAAAATGTAAATATCACTTTTAACAACAATAAATTTCACTTTTGATGTAAAGATAAGATAGTTTGTAACTACAGAAATAAAAAGAAAATGCTATATGATTTAAATAAAAATTAGGGTTAAAAACCAAGTGCACCCACCAATGCCATTACCAATCATTAAAAACCAAGTGTCTCAACACTTTTTTTTCTCTCCCTTCGCTTTCTTTTATGCTTTCCCTCTACCAAATTTAAGTGCAATCAAACCAAACATAATGTCCTGTTTTTGGAGCACAGTTAATTAAGTGCAATCAAACCAAACATAATTCAAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATATTTATATATATATTTTTCTTTTTTGATAAAGACTGAATCACAATATTGTTCTTCTCTTACGAAATGCTGCACTTAATCACGTGCTGATGTCCAATTGGGCCAGTCTTCCACAGCGTACGCGCTTGCTTCTTGTCAATGTTGCTACCCACAACAGCTTCAAAACGCAAACATAAGATTATGTAACGATGAGCGATGAAAACATGATAATGCAGGATTCAACAACGTTTAACTTCCAAAACTTAAGATAATACAGTTTTGTAACCCTAATCCTCCCGAAAACCTTTTAAATTTGATTTCTTCTATCATTTCACTCTCCTTTCACAGTTATGAAATGGGACCATCCATTGCATTATTATGCAACAAAATGAGGACATCCTGGTACAACACACGTCAAGGGAAAAAAATTTAAATCAGATAAGCCCAAAAATTAAAACGGATCACTGTAACGGGACTAGTTTAGTGTCACCATCAAAACCTAGCTCCATGCCGAAACAGTTAGCTTGTGGGCCTTCTAAATATGCATCCAATGTTCTCCTGTTCGTATTATCCTTTGACGTCCCCAAAACGCACTCAACAAAATTCCATGCCAATTTTTAAATTATATAATTTTCGTGCATTATCTATATTTGTGCCCCAAATCTATTCCAAGTACAACTCATATGCGTCGGAATCATTTTTTATACATATTTTAAACCCTTTGCAATTAGTTTAAACGTCTCCTCTAATCAATTTTTTTAACACATTCATCTTAATGCTTTCACTTGTTAAACAAAATTATGAAGTTTTGTAAGTTTTACTTCCTATTGTTCAATCCGTTTCATGCATACCATATACTGTAATTAGTTAACCAAACAAAAGCGTTGAATATTCTCCTGATTCTAATTAAATTCTTAAAAATTCCATAACCATCATTATTAGAAACTTTACCACAAATTGACCCCTCTCACTCTCATTCTGTCTGCTCACATCACATACTCACTCACTCCTATTATTTAAATCCAAACAATGATTAATTACTCCAAAACCTTTTCGTAACCCAACCGCACCTGTTACGAGTTTCAGATCCCGAATGCATTAAAACCCTTACCACGTGGCACAACTGCATTGGGTGGGGGAATTCAATGGTGAAGATCTTTTAGAGGACCAGGCAGGGTAGTTTGATCGTACGGCAGGGAAGAGAGAACCGCTCAAACCTCAGTGGAAACGACTTCGTACTCTGCCACCGAGGTCTGTGTCCGTGGAACAGTGTGAGTGAAGAGAGAGATATAATATAAACCCACAGCGCGCACCATTCTCCA


Gene Sequence:
>Vu_04864(+)
ACTGTCCAAGGAGATCAAGCACCAAAGCCAAGACCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCTTTCTCTTTCTCTCACTTTTTTTGTTGTTGTTGCGGTTTGGTTATTCCATCGGTGTGTGCGGTTCGGGTTTTCATTATGGATCCGGGTGGGATGATGAACGAGGGTTCCTTTGCGAATAATGGGAGCGGCAATACGGCGCCGTATAGCTTGGCGGAGATCTGGCAGTTTCCCCAAGCGATTAATGGCGGCGGAGGATTGGGTCTCCGGAGCCCGCAGTTCGAACATGGGCCGGGGCAGTTTGGGGATTTGCCTCCCAGGCCCAACAATGGGCTTGGGACGAGTAACACCAGAAAGCGGCGAGACTCAGAGGACGATTCAGCTAAGACCGTGTCCACCAGCAATGCCGTGGTACATATTCGCTCACTCGGCGTTTGTTATTTTGTTTTGTTTACTTGAATTGATTGAGGATGTGGTTAAGGGTTGTTTGGATTGCGCAGAATGAGGGTGATGGAAAACGTGTTAAAGCAACGGCAAATGGTGATGGTAATGGTAAAGGTGAAGGAGAAGTCAGTTCAGGAAAGCCTGCGGAGCAAAGCGCAAAGCCTCCATTGGAACCTCCCAAGCAAGATTACATTCACGTCCGAGCCAGAAGGGGTCAAGCCACTGATAGCCACAGTCTTGCAGAACGAGTAAATTTTTGTTCTTTTGTTTGTTTTCTTAATGGGTTGTTCTGTTAAAAATGTAAAGTGAAGATATGGTAGTATGGGTTTGCCTTTTTTATGTTAATTTAAAGGGGAAATTGAGTTTAAGGTGTGATTGGATGAAGTAAAGTTCTTGATTGTGATTTCTAATTGGGACTTTGGTGGATGCTGCACAGGCTCGAAGGGAAAAGATTAGTGAAAGGATGAAAATTCTTCAGGATTTGGTCCCTGGTTGTGATAAGGTATTGTTTTTGTACAGGTCTAGTTTTGTTGCACGAATGTGTATGCATAATTAAAAAAAAAATTATGGGTTGGAAAAGAACAATGTTATCTTTTGGATGTTTATATGTGCACGTCTCTGTCAAGATGACCATATTGATAACACAATGGAAAATTATTCGTGATTATCGGTATGGTTATGAATTTATAATTCATGGAAAGTGTGAATTGACATACGTTCTCTGATTTAGGTTATCGGGAAAGCGTTGGTCCTTGATGAAATAATTAATTATATCCAATCTCTTCAGCGCCAAGTTGAGGTAGATATCATTGCTTTTTATTATTTTCTTATTTTTGCTCAATTAAAATCTTTCTTAAATTTATTTATGTCTGTTTTGAAACTGATTTCGAGGATTTTGATGTTACTGGATGGATGTCACAGTTTTTGTCAATGAAGCTTGAAGCAGTGAATTCGAGACTGAACTCCGAAGCCTTTCCTCCTAAGGATGTAAGTCTTAAACACTCTTGCTTTTTATATTGAATTTCTGAATGTTAAATTCTTCTTTTTGACAAGACATCTGTTCAATTCTACCTGTTATGTTTCTAGGATTGCTGTTAGGGTTGAACTATCGCTTTTATAGATACTGTTTCTGTCTTAAGAGTTTGTTTCATTTGCAAACTTGTTTATTGGGTACTTGGGAAATTTTTTGGGTGAATGTTAGTAGAGTTCAGTTTTTCATCGTTGTTGAAAGATCTTGAGTATTAAAAGCCATGAATTTTGATTCCAGTTTGGTCAGCATGCATATGATCCCGCGGGCATGCCGTTCGGTTCACAAGCTCCAAGAGAGTATAGCAGAGGATCTTCACCTGAATGGTTACACATGCAGGTAGGAGGAGGTTTTGAAAGAACAACGTAGTGTATGAGATCCATGGTAATAAATACAGAAAGCAGAGGTATTTGGTCCTTCATTAGCTTCCAGAAACAGGCATGATAGACTCAAGAAGCAAGTCCAATGGGCACCTCATTCCCATTTTCTACACTAGGCATGGAGCTGTTACTGTGTTTCACAGGACTGCTTCAGTTTTTATTTAAGCATCTCCATATGTTTGGTGTGTTGGAAAATGAATTCATTTACTCAATATGTAGTATAGTGGACTTTTTAGGCTTTGTATTCTGTACTCAACACGGCCCTTAAAATGATCATTCTTCTTGTAAAAGAATGCTGCTTCTTCTTAATACATGATGCTTACATATTGTGTAATAGTCTCA