Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04678 LG1 66498095 66501797 PREDICTED: receptor-like kinase TMK4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 66498257 synonymous_variant p.Ser45Ser
C/T 66498275 synonymous_variant p.Val51Val
G/A 66498612 missense_variant p.Ala164Thr
T/C 66499166 synonymous_variant p.Cys348Cys
C/T 66499191 missense_variant p.Pro357Ser
T/C 66499235 synonymous_variant p.Tyr371Tyr
C/A 66499333 missense_variant p.Ala404Glu
C/T,* 66499749 missense_variant p.Arg543Trp
T/C 66499840 missense_variant p.Val573Ala
A/T 66500012 missense_variant p.Leu630Phe
C/T 66500169 missense_variant p.Leu683Phe
C/T 66500336 synonymous_variant p.His738His
T/C 66500444 synonymous_variant p.Thr774Thr
T/A 66500504 intron_variant
C/T 66500562 intron_variant
G/A 66500684 intron_variant
T/C 66500690 intron_variant
G/A 66500766 upstream_gene_variant
T/A 66501781 3_prime_UTR_variant
G/T 66501782 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04678.1
MLLPPSLNASRLYDPNQPTTLTDKPLSHTLPTQIMLFVKALLQLSYFFLSVVMTTTLVAAADDAVMSNFLKSLKPPPPGWSQTTPFCQWKGIQCDSSNRVTSISLASKSLTGTLPSDLNSLSQLRSLSLQDNALSGPLPSLAQLSFLQTAYLNRNNFSAVPFAAFASLNSLQTLSLASNPSLSHWTFPTDLTSSTNLIDLDLASVSLSGALPDIFHKFPSLHSLRLSYNNLTGSLPSSLAISTIASLWLNNQATGLSGTLSVLSNMTQLSQAWLHKNQFTGSIPDLSQCKGLFDLQLRDNRLTGVVPISLTTLSSLKNVSLDNNVLQGPVPAFGKGVKVTLDGINSFCLDTPGDCDPRVMVLLQIAEAFGYPIQLANAWQGNDPCNGWNFVVCSTGKIVTVNFAKQGFSGTISSAFSQLTDLRSLFLNGNNLTGSIPESLTSLPQLQTLDVSDNNLSGEIPKFPSKVKLMTTGNARLGKAPNPGGGVSGSTPSGSPSGGSGSESAKGSASLSPGWIGGIVVIVLFFTGVVLFLAWKCYAKRQRRKFRRVNGRENGTGSFKIESINVYNGYGGVPSELQSQSSGDRSDVLAAFEGRNGSISIQVLLQVTNNFSEENILGRGGFGVVYKGELHDGTKIAVKRMESVAMGNKGLNEFQAEIAVLSKVRHRHLVALLGYCINGNERLLVYEYMPQGTLTQHLFEWQGHGYAPLTWKQRVTIALDVARGVEYLHSLAQQSFIHRDLKPSNILLGHDMRAKVADFGLVKNAPDGKYSIETRLAGTFGYLAPEYAATGRVTTKVDVYAFGVVLMELVTGRKALDDTVPDERSHLVTWFRRLLINKENIPKAIDQILNPDEETTESMYKVAELAGHCTAREPYQRPDMGHAVNVLVPLVEQWKPISHEEEDSGNGDFQMSLPQALRRWQADEGTSSIFNDVSISQTQLSIPSKPVGFANSFDSLDCR*


CDS Sequence:
>Vu_04678.1
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Promoter Sequence:
>Vu_04678::LG1:66496095-66498095(+)
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Gene Sequence:
>Vu_04678(+)
ATCCATCTCTTGCTTGTTCCGCTCTTGCATGTTATTACCACCTTCCCTCAATGCTTCTCGTCTATATGACCCCAACCAACCAACCACATTAACTGATAAACCCCTCTCCCACACTCTCCCAACCCAAATTATGTTGTTCGTAAAAGCCCTACTTCAGCTCTCCTATTTCTTTCTTTCCGTCGTGATGACTACCACCTTGGTGGCCGCCGCCGATGACGCGGTGATGTCCAATTTCCTTAAATCGCTGAAGCCACCACCTCCAGGTTGGTCTCAGACAACCCCATTCTGCCAATGGAAGGGTATCCAATGCGATTCGTCCAACCGCGTCACCAGCATAAGCCTCGCTTCAAAGTCCCTCACTGGAACGCTCCCCTCCGATCTCAATTCCCTCTCTCAACTCCGTTCCCTCTCTCTCCAAGACAATGCACTCTCGGGCCCCCTCCCCTCGCTCGCCCAACTCTCCTTCCTCCAAACGGCCTACCTCAACCGCAACAACTTTTCAGCCGTTCCCTTCGCCGCCTTCGCCTCCCTGAACTCCCTCCAAACCCTCAGCCTAGCCTCCAACCCTTCCCTCTCACACTGGACTTTCCCCACCGATCTCACCTCCTCCACCAACCTAATCGACCTCGACCTCGCCTCTGTTTCCCTCTCCGGTGCCTTACCCGACATTTTCCACAAATTTCCCTCTCTACATAGTCTTCGCCTCTCCTACAACAACTTGACTGGTAGTTTACCCTCCTCTCTCGCCATTTCCACAATCGCCTCGCTCTGGCTCAACAACCAGGCAACCGGCTTGTCCGGTACTCTCTCCGTTCTCTCCAACATGACGCAGTTGAGCCAGGCCTGGCTCCACAAGAACCAGTTCACCGGTTCCATTCCAGATTTGTCCCAATGCAAGGGCCTGTTTGACTTGCAGCTCCGAGATAATCGGCTAACCGGCGTGGTTCCTATTTCCTTGACGACTCTTTCGAGTTTAAAGAATGTTTCGCTGGATAACAACGTGCTTCAGGGGCCTGTGCCTGCTTTTGGGAAGGGTGTGAAGGTGACTCTCGATGGAATTAATAGCTTTTGTCTCGATACTCCCGGTGATTGTGATCCCAGGGTGATGGTTTTGCTTCAGATTGCTGAAGCGTTTGGGTATCCCATTCAGTTGGCGAATGCGTGGCAGGGGAATGACCCTTGTAACGGCTGGAACTTTGTTGTGTGTTCCACTGGGAAGATTGTTACTGTCAATTTCGCGAAGCAGGGTTTTTCTGGTACCATCTCGTCTGCATTTTCGCAATTAACTGATTTGCGCAGCTTGTTTCTCAATGGAAATAACTTGACCGGTTCTATTCCTGAGAGTTTGACCTCTTTGCCTCAGCTTCAGACTCTTGATGTGTCCGATAACAACCTCTCTGGAGAGATTCCTAAGTTCCCGTCCAAGGTGAAGTTAATGACTACCGGTAATGCTAGGCTTGGGAAGGCTCCTAATCCTGGAGGTGGAGTAAGTGGGTCTACTCCTTCAGGGTCTCCATCTGGTGGAAGTGGTTCTGAATCTGCAAAGGGTAGTGCTTCTTTGTCGCCAGGTTGGATTGGTGGTATAGTTGTTATTGTTTTGTTTTTTACTGGAGTAGTATTGTTTCTGGCTTGGAAATGTTATGCCAAAAGGCAGCGGCGGAAGTTCAGGAGGGTTAATGGTCGTGAAAATGGCACAGGAAGCTTTAAAATTGAGTCTATCAATGTTTATAATGGTTATGGTGGTGTTCCCAGTGAGTTGCAAAGCCAGAGCAGTGGTGATCGCAGTGACGTTCTTGCTGCTTTTGAAGGTCGAAATGGGTCAATTTCTATTCAAGTTCTTCTACAAGTTACCAATAATTTCAGTGAGGAGAATATTTTAGGTAGGGGAGGGTTTGGAGTAGTTTATAAGGGCGAGTTACATGATGGAACAAAGATTGCTGTTAAGAGGATGGAATCTGTTGCAATGGGAAATAAAGGACTTAACGAGTTCCAAGCAGAGATTGCAGTTCTCAGTAAAGTTAGGCATAGACATTTGGTTGCTCTTCTTGGGTATTGCATCAATGGAAATGAAAGGCTTTTGGTATATGAGTATATGCCTCAAGGTACATTAACACAACACCTGTTTGAGTGGCAGGGACATGGCTATGCTCCCTTGACATGGAAACAAAGGGTAACAATAGCTTTGGATGTTGCACGAGGGGTGGAATACTTGCATAGCTTAGCTCAACAAAGCTTCATTCACAGAGACTTAAAACCCTCAAATATACTACTTGGTCATGACATGAGAGCAAAGGTTGCAGATTTTGGATTGGTTAAAAATGCACCAGATGGAAAGTATTCTATTGAGACTCGGTTGGCTGGAACATTTGGATATCTTGCACCTGAATATGCTGGTATAGAAATCTCTGATTTTTGTTTTGTACAAATATGCCTTAATCTTGTAGTTCATATTTATTTATTCTTCTTTCGGTGGTTTTAGCTGTCGATTACTACTTCAATATCATGAAAGTATCGTACTGCGCTTTTCAGAAAATTGAAGTACCCTAAACCTTATGAATAACCACACAAAAATAAGTTGAAATAATTGACGCTCATTCCCATCAGAGTAGGCAATTCATTTTGTCTACTTTGCAATTTTATATTCGGCTGGGTGTAGAGTTTTCTGGATGGTGTAGTGGTCTATATACCTCAGGATTTTTTGAGCCATTTATAGAAAGCTATCAGAGTCTGAATCCCAATGCCGATTATCCTTTATGATGTGATGAATGCTCTGATTGCATAAAATGTTGGATTACTGAATATTGTCATCGCCTTGGGTGGTAGTTCTCTGTTGCTAAGAATCACTTTTGTGAACTTTATCCGCCCATCCCATATCCTTGGTGCATTGGCGCATCTTTTGTTAAAATTTACTAGTTTTGATCCATCTACATATAAAACCTATGTAGCATAAAACTTACTAAAATGTTGCTCTGCTTCACTTATCTAATTTTAAAAGTTAGATTATTGTTGCAGTGAATGTGAGTAGATGCACTTGATTAATGCTAGACTATTAATTGGATTATGTATAATGTTATCTTGTTTCTTGCCAGCCACTGGAAGAGTGACAACCAAAGTGGATGTTTATGCATTTGGTGTAGTTTTGATGGAACTTGTTACCGGTAGAAAGGCATTGGATGATACCGTGCCAGATGAAAGGTCTCACTTGGTTACATGGTTCCGTAGACTACTAATTAACAAGGAAAACATTCCAAAGGCAATTGATCAAATTCTCAACCCCGACGAGGAAACTACGGAGAGCATGTATAAGGTGGCTGAACTGGCTGGCCATTGCACTGCTCGTGAACCATATCAAAGGCCAGATATGGGTCATGCAGTGAATGTCTTAGTTCCTCTTGTGGAGCAATGGAAACCTATTAGTCATGAAGAAGAGGACAGCGGTAACGGTGACTTTCAGATGAGCCTTCCTCAAGCTCTACGAAGGTGGCAAGCCGATGAAGGCACTTCCTCGATATTTAATGATGTATCCATCTCACAAACCCAATTAAGCATCCCCTCTAAACCTGTCGGATTTGCAAACTCCTTCGATTCACTGGATTGCCGGTGAATTTCACAAACCACAATTATTCGAAGGCATCTTTAGTCCATATGACGGGAATGGAAGGGTTGGTTGTAACTTTATTTTTAAATGGTATTATTTTGGGCG