Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_04668 LG1 66282878 66285103 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 66282918 synonymous_variant p.Leu253Leu
G/A 66283059 missense_variant p.Pro206Ser
G/A 66283175 missense_variant p.Ser167Phe
T/C 66283252 synonymous_variant p.Glu141Glu
T/G 66283253 missense_variant p.Glu141Ala
C/T 66283346 missense_variant p.Ser110Asn
G/C 66283589 missense_variant p.Ser29Cys
C/T 66283784 intron_variant
A/G 66283832 intron_variant
G/C 66283860 intron_variant
G/A 66283928 intron_variant
C/T 66284185 intron_variant
G/C 66284419 intron_variant
G/T 66284452 intron_variant
G/T 66284468 intron_variant
G/T 66284472 intron_variant
A/T 66284473 intron_variant
G/T 66284485 intron_variant
G/T 66284577 intron_variant
G/T 66284597 intron_variant
C/A 66284615 intron_variant
A/C 66284723 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_04668.1
MAAAGRDSLSSKSGSVVLKDVPPSQIDKLSLLAFSGNISTSPPFPYFNWSDSLDCCAWEGITCDGDLRVTHLLLPSRGLTGFISPSLTNLSSLSHLNLSHNRLSGGLQHQLFSLLNHLVVLDLSYNHLSGELPPFGIDNSGKNSNGAGIQELDLSTNFFNGTLPNLVQNLAAAAAGGSLVSLNVSNNSFIGHIPTSLFCINDRNSSSLRFLDYSSNDFDGAIQPGLGACSKLERFRAGFNFLSWPIPSDLFDAVSVTEILPTLDT*


CDS Sequence:
>Vu_04668.1
ATGGCAGCAGCTGGAAGAGATAGTCTTAGCTCCAAATCTGGTTCTGTGGTGTTGAAGGATGTTCCACCAAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCAACCTCTCCTCCTTTTCCTTATTTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTCTCTGTCTCACCTTAATCTCTCCCATAACAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAATCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGAAAAAATAGCAATGGTGCTGGTATCCAGGAGCTGGATTTGTCTACCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTTGGTCCAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTGTCACAGAAATTTTACCAACATTGGATACCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_04668::LG1:66285103-66287103(-)
AGCATATTAGAAGCCCCCAAGACTTAAACCTCATGCTACTCTTCACCACATGTGTCAATCCTCTCTACTTGAGAATGAAAGACCATTAGAGTTCAGATTAATCCCAAAATTGAGCTCCTTGCATTCATTCTAAACATACTTGAACCTCACCAAGAGATTCCACTCACTACAAGAAATAATGGAATTAGATACGGAATATTATATACGGATCTAGAGTTGTATGTAAAGTGGGAATTATATACGGAAATTATGTACGGATGTTAAAGAAAAGCGTTATATACGGATATTATATACGGAATTTTATATACGGATTATCCGTATATAATATCCGTATATAATGTTGGCGCGGGGTGGCGGGAAAATTACCCTAGAATAGGATCTGTATATAACCTGTATTATCCGTATGTAGTTGGAACCAAATTTTATCTGCAGATATTACATACGGATTTGGGTTATAATATTAGAAAAATATATTTCTAATTACGCTGAAGCTGGAACCCTACACTCTCAGCTCGAGCTTTCCTCTCATTTGAACCTGGTGCTTTGTTTTCACTTGAACCGTGGTGCATTCTTATCTCTCTCGAACCCTGTCGTATCCCTTCTTTCGAGCCCTTTCGGTCTGGTTGTTGTTGTCTCCATCCCTCTTCGGTGTGGCTTTGGTTCTTCGTCGTCTCTCTGTTTCGAACTGTGACTTTTATCAATCCTTCATCAAACACTATCGTTGGGCCTCATTGTTCTGTGCGGTGCCGTAGTTGGGCGCTGAAAGAGTAGCTTCATCTGGTAAGTAAATTGTAATGCTTAGTAATTGTTTAATGGTGAAAATCGTGAACCCTAATCTCATTTTTGTGTGTTTTATTTGTCACATCTATGGTTCGGGTCGCAAGCCGTGGTTGGAGTGTTTGGAAGCATCGATTGAGGCTACTGTGTGGCGGGTTAAGTAGATTCGTACTGGTTTTATGGACTGAGACATATAGCATCTGGAGTTGCGAATGTGAGTGAGTTCGTTTGCATTTAAAGTTTGTTAGAAGTAGAAAAATGATTTGTATTGTGTTATTTTGCTTCATTTGGTAAACAATATGTTGTTTTGTATTTGAATTGTATAGACTGGTACGATTCTTTCTTCTTTAGTGTCCAGTGACTAAGTCTCTTTCCTTGTCAAGTGGCTGGGCCTGTAAATATTTAATGCAGTGCTAGAATGTTCTGTATCAAAATTTAGTATTGCAACGTACTGAAGTAAGCTTAAGTCCCTTTTGAGGTTGTCATAATTGGTGTGGGTTGGTAGTAAAGGAAGAAGTTGGTTTCATGCATAAGTTCTTTGTATCAAGTACTGGTTAGGTTATATATATATCACATAGTTGGAAGAAAAAGGAAAGAAGGGTAGAGTGAGGTGTGAACATTGAAGGGAATGAGAGTCGATTGGTAGAATAATTATGGAGAAAGGAGGTGGTGGGTGTAGGTGTTGTGGAAAAGGAGTATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTAGCATGAATGAAATAATGTGTGAAGGGCTTAGTTTCTCATCGTGGTTATGTTGGGAAAGAAAGATAATAAGAAAGGGTTCGGCATGTGCAGGGAACATGCAAGGAATATTGTAACTAGGAAATATAGTTGGTTTTAGGGTGGAGATGATTCCAGGGGTCATAGTGAGTTTAAGGGTAAATTATTTGGGAAGAATAATGGTGGTATAGGGGTATAAGGGATTATAGAAGGGTTGAGCAGGGAATGGGTATACACATTCATTATATTGTACTAACTAACCCTAAACATATATATAACTAAGCTTAATTAGGTGTATAACCAGCCATAACAAACCTCTGAAACGCCATTGTGAAGGGTTTCAACTCTTGAAACGATGCATGTATTGTTCATGTGTTTTTTCAAATCATAATTGTAAACAAAAGCATTACAATTACTAGAACTCTCCACTGTTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_04668(-)
ATGGCAGCAGCTGGAAGAGATAGTCTTAGCTCCAAATCTGGTTCTGTGGTGTTGAAGGATGTTCCACCAAGGTCTACTACTGTTAAATGTTTAGAAGTATTTTAGAAGTGCCACTCTATTTTAGATAAAATTTAGAAAAACTTGGCATCACCACAACTTTGTGACGTTAGTCTTGATGATATTGATGATCAACACTTCCTGTGCTAATTAGTTGTTTTTAGACCATTATTAGTGTAGTGTCTTAAATTGATAGATTTCACTCACTTAGTTTAGTAGTAGTTTAAATTGTTTGGCTTTTCATTCTAAAATTGATTTGAATTTCACCAAAAGAAGTACTTCTTAGTTGTGTTAGATGAACATTAAAAACTGTTTTAGACAACTTAGTGGATTTTTAGATTACCCTTAGATAGATTTTGTTGTAGTTAGTGTGCATGTTAGTTGAACTGACTTTGTGGATGCCCACATTGGCCACCTGCTAGCAAGGTTTAGCTCTGCAACTCCTTTCTCTGCCTCATCAAAAAACATCCTTGTCCTCTTTATTTGTCCCTTCATGAATTTACTAGGTTTATCTATAACTTTACCCAAGAAAATGTCATCATCTAAAAGCCTAGCTTTTGCCAATTCATCTTGTCCCTCCTCCTAGTTTACTTCCCCTTTGTTGATAATGGCATAGTACCTTATATGCTACTCTTCTTTCTCTTAATTAGGAATAATCTTCTGCAGATCAAGCTTTGTTTGTCAAATCTGCTTCTCCTTCTTTTACTGCATTATTTGTTTAGGTGGATGATATTGTTTTAATTAGCAATGATATGGCAGAAATTAATCATCTTAAGCACATCTTAGATACCAAATTTAAAATCAAAGACCTAGGATCTTTAAGATACTTTCTCGGTCTTGAAATTACAAGGTCCAAATCTGGAATTCACATGAATAGGAGAAAATATATTCTTGAACTTCTCGATGACAGTGGTTTGATTGGTTCTAAACCTACTAACACTCCTTCTGATCCTTCTATTAAACTTATGGCAAATCATGGACAACTTTTATGTAATGCTGCTGGTTACTGGCAGTTAGTTGGCAAACTTTTGCACCTCACCATCATCAAGCAAGATATTGATTATGTGTACAACAACTCAGCCAATTTCTATGCAAACCTCTTGATACTTATTACAATGCTGCTCAAAGAATCTTTCATTAGCTCAATGGATCCCCTGCTCATGGCTTGTTCTTCTTTGCTTCATCACACCTTAGAATCTTGGCCTTTGCCAATTTAGATGAGCTTGCTGTTTGGATACCAGAAGGTCTATCATGGATCCCCTGCTCATGACCAACCATCACTTCAAACACACCATTCTGTCAGTTTTTATCATGCCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCGAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCAACCTCTCCTCCTTTTCCTTATTTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTCTCTGTCTCACCTTAATCTCTCCCATAACAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAATCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGAAAAAATAGCAATGGTGCTGGTATCCAGGAGCTGGATTTGTCTACCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTTGGTCCAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTGTCACAGAAATTTTACCAACATTGGATACCTAA